RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587957.1

EFTUD2-209, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 3

Gene EFTUD2, Length 503 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-209ENST00000587957 ART5Q96L15 291 aa9.89□□□□□ -0.83
EFTUD2-209ENST00000587957 TMEM237Q96Q45 408 aa9.89□□□□□ -0.83
EFTUD2-209ENST00000587957 NTMT1Q9BV86 223 aa9.89□□□□□ -0.83
EFTUD2-209ENST00000587957 ZNF717Q9BY31 904 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
EFTUD2-209ENST00000587957 DDX31Q9H8H2 851 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
EFTUD2-209ENST00000587957 SLC24A3Q9HC58 644 aa9.89□□□□□ -0.83
EFTUD2-209ENST00000587957 PFDN4Q9NQP4 134 aa9.89□□□□□ -0.83
EFTUD2-209ENST00000587957 AHSPQ9NZD4 102 aa9.89□□□□□ -0.83
EFTUD2-209ENST00000587957 SNX6Q9UNH7 406 aa9.89□□□□□ -0.83
EFTUD2-209ENST00000587957 PPIEQ9UNP9 301 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
EFTUD2-209ENST00000587957 TSC22D4Q9Y3Q8 395 aa9.89□□□□□ -0.83
EFTUD2-209ENST00000587957 ASB4Q9Y574 426 aa9.89□□□□□ -0.83
EFTUD2-209ENST00000587957 USP9YO00507 2555 aaPredicted RBP9.88□□□□□ -0.83
EFTUD2-209ENST00000587957 POLEQ07864 2286 aa9.88□□□□□ -0.83
EFTUD2-209ENST00000587957 A0A1W2PS29 197 aa9.88□□□□□ -0.83
EFTUD2-209ENST00000587957 FAM181BA6NEQ2 426 aa9.88□□□□□ -0.83
EFTUD2-209ENST00000587957 WIPF3A6NGB9 483 aa9.88□□□□□ -0.83
EFTUD2-209ENST00000587957 TMEM200CA6NKL6 621 aa9.88□□□□□ -0.83
EFTUD2-209ENST00000587957 FOXO6A8MYZ6 492 aa9.88□□□□□ -0.83
EFTUD2-209ENST00000587957 ACOT7O00154 380 aa9.88□□□□□ -0.83
EFTUD2-209ENST00000587957 SEMA3DO95025 777 aa9.88□□□□□ -0.83
EFTUD2-209ENST00000587957 LRATO95237 230 aa9.88□□□□□ -0.83
EFTUD2-209ENST00000587957 GPR75O95800 540 aa9.88□□□□□ -0.83
EFTUD2-209ENST00000587957 TPOP07202 933 aa9.88□□□□□ -0.83
EFTUD2-209ENST00000587957 SBK3P0C264 359 aa9.88□□□□□ -0.83
EFTUD2-209ENST00000587957 KRT15P19012 456 aa9.88□□□□□ -0.83
EFTUD2-209ENST00000587957 NT5EP21589 574 aa9.88□□□□□ -0.83
EFTUD2-209ENST00000587957 CLCQ05315 142 aa9.88□□□□□ -0.83
EFTUD2-209ENST00000587957 ZNF800Q2TB10 664 aaPredicted RBP eCLIP9.88□□□□□ -0.83
EFTUD2-209ENST00000587957 GGTA1PQ4G0N0 100 aa9.88□□□□□ -0.83
EFTUD2-209ENST00000587957 KRTCAP3Q53RY4 240 aa9.88□□□□□ -0.83
EFTUD2-209ENST00000587957 NDUFAF5Q5TEU4 345 aa9.88□□□□□ -0.83
EFTUD2-209ENST00000587957 RTL4Q6ZR62 310 aa9.88□□□□□ -0.83
EFTUD2-209ENST00000587957 FAM47EQ6ZV65 393 aa9.88□□□□□ -0.83
EFTUD2-209ENST00000587957 GPRIN3Q6ZVF9 776 aa9.88□□□□□ -0.83
EFTUD2-209ENST00000587957 COMMD6Q7Z4G1 85 aa9.88□□□□□ -0.83
EFTUD2-209ENST00000587957 MRGPRGQ86SM5 289 aa9.88□□□□□ -0.83
EFTUD2-209ENST00000587957 SPPL2CQ8IUH8 684 aa9.88□□□□□ -0.83
EFTUD2-209ENST00000587957 SIAH3Q8IW03 269 aa9.88□□□□□ -0.83
EFTUD2-209ENST00000587957 C9orf40Q8IXQ3 194 aa9.88□□□□□ -0.83
EFTUD2-209ENST00000587957 ST13P4Q8IZP2 240 aaPredicted RBP9.88□□□□□ -0.83
EFTUD2-209ENST00000587957 CCNYL1Q8N7R7 359 aa9.88□□□□□ -0.83
EFTUD2-209ENST00000587957 POGLUT1Q8NBL1 392 aa9.88□□□□□ -0.83
EFTUD2-209ENST00000587957 CDC26Q8NHZ8 85 aa9.88□□□□□ -0.83
EFTUD2-209ENST00000587957 SLC22A8Q8TCC7 542 aa9.88□□□□□ -0.83
EFTUD2-209ENST00000587957 FBXL20Q96IG2 436 aa9.88□□□□□ -0.83
EFTUD2-209ENST00000587957 PELOQ9BRX2 385 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
EFTUD2-209ENST00000587957 DEFB127Q9H1M4 99 aa9.88□□□□□ -0.83
EFTUD2-209ENST00000587957 DEPPQ9NTK1 212 aa9.88□□□□□ -0.83
EFTUD2-209ENST00000587957 SDAD1Q9NVU7 687 aaKnown RBP eCLIP9.88□□□□□ -0.83
EFTUD2-209ENST00000587957 A0A1B0GTH9 108 aa9.87□□□□□ -0.83
EFTUD2-209ENST00000587957 PINLYPA6NC86 204 aa9.87□□□□□ -0.83
EFTUD2-209ENST00000587957 PRRG2O14669 202 aa9.87□□□□□ -0.83
EFTUD2-209ENST00000587957 PGRMC2O15173 223 aa9.87□□□□□ -0.83
EFTUD2-209ENST00000587957 DLX3O60479 287 aa9.87□□□□□ -0.83
EFTUD2-209ENST00000587957 CRCPO75575 148 aa9.87□□□□□ -0.83
EFTUD2-209ENST00000587957 ERAL1O75616 437 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
EFTUD2-209ENST00000587957 KRT6AP02538 564 aa9.87□□□□□ -0.83
EFTUD2-209ENST00000587957 KRT6BP04259 564 aa9.87□□□□□ -0.83
EFTUD2-209ENST00000587957 SHBGP04278 402 aa9.87□□□□□ -0.83
EFTUD2-209ENST00000587957 P04436 131 aa9.87□□□□□ -0.83
EFTUD2-209ENST00000587957 CCL3P10147 92 aa9.87□□□□□ -0.83
EFTUD2-209ENST00000587957 MYL2P10916 166 aa9.87□□□□□ -0.83
EFTUD2-209ENST00000587957 ATP5F1P24539 256 aaPredicted RBP9.87□□□□□ -0.83
EFTUD2-209ENST00000587957 SSTR4P31391 388 aa9.87□□□□□ -0.83
EFTUD2-209ENST00000587957 DEKP35659 375 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
EFTUD2-209ENST00000587957 KRT6CP48668 564 aa9.87□□□□□ -0.83
EFTUD2-209ENST00000587957 DNASE1L1P49184 302 aa9.87□□□□□ -0.83
EFTUD2-209ENST00000587957 PPIAP62937 165 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
EFTUD2-209ENST00000587957 IGLV3-21P80748 117 aaPredicted RBP9.87□□□□□ -0.83
EFTUD2-209ENST00000587957 RASA2Q15283 850 aa9.87□□□□□ -0.83
EFTUD2-209ENST00000587957 UNC50Q53HI1 259 aa9.87□□□□□ -0.83
EFTUD2-209ENST00000587957 ZNF678Q5SXM1 525 aa9.87□□□□□ -0.83
EFTUD2-209ENST00000587957 PRAMEF20Q5VT98 475 aa9.87□□□□□ -0.83
EFTUD2-209ENST00000587957 HLA-DQA1Q5Y7H0 255 aa9.87□□□□□ -0.83
EFTUD2-209ENST00000587957 MRM1Q6IN84 353 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
EFTUD2-209ENST00000587957 MTFR2Q6P444 385 aa9.87□□□□□ -0.83
EFTUD2-209ENST00000587957 OPN5Q6U736 354 aa9.87□□□□□ -0.83
EFTUD2-209ENST00000587957 TIFABQ6ZNK6 161 aa9.87□□□□□ -0.83
EFTUD2-209ENST00000587957 GK5Q6ZS86 529 aa9.87□□□□□ -0.83
EFTUD2-209ENST00000587957 CD163Q86VB7 1156 aa9.87□□□□□ -0.83
EFTUD2-209ENST00000587957 GALNT12Q8IXK2 581 aa9.87□□□□□ -0.83
EFTUD2-209ENST00000587957 GPALPP1Q8IXQ4 340 aa9.87□□□□□ -0.83
EFTUD2-209ENST00000587957 MMP21Q8N119 569 aa9.87□□□□□ -0.83
EFTUD2-209ENST00000587957 ARMC10Q8N2F6 343 aa9.87□□□□□ -0.83
EFTUD2-209ENST00000587957 C1orf52Q8N6N3 182 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
EFTUD2-209ENST00000587957 OR2M7Q8NG81 312 aa9.87□□□□□ -0.83
EFTUD2-209ENST00000587957 EPS8L3Q8TE67 593 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
EFTUD2-209ENST00000587957 AGAP11Q8TF27 550 aa9.87□□□□□ -0.83
EFTUD2-209ENST00000587957 RELTQ969Z4 430 aa9.87□□□□□ -0.83
EFTUD2-209ENST00000587957 JSRP1Q96MG2 331 aaPredicted RBP9.87□□□□□ -0.83
EFTUD2-209ENST00000587957 BRINP2Q9C0B6 783 aa9.87□□□□□ -0.83
EFTUD2-209ENST00000587957 EXO5Q9H790 373 aa9.87□□□□□ -0.83
EFTUD2-209ENST00000587957 TRIM45Q9H8W5 580 aaPredicted RBP9.87□□□□□ -0.83
EFTUD2-209ENST00000587957 SACM1LQ9NTJ5 587 aa9.87□□□□□ -0.83
EFTUD2-209ENST00000587957 TRPS1Q9UHF7 1281 aa9.87□□□□□ -0.83
EFTUD2-209ENST00000587957 UTP20O75691 2785 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
EFTUD2-209ENST00000587957 EML6Q6ZMW3 1958 aa9.86□□□□□ -0.83
EFTUD2-209ENST00000587957 GNG14A0A1W2PPG7 69 aa9.86□□□□□ -0.83
EFTUD2-209ENST00000587957 A0A1W2PPM1 405 aa9.86□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23 ms