RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580170.5

PTPRM-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 5,941 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-211ENST00000580170 STUB1Q9UNE7 303 aa20.44■□□□□ 0.86
PTPRM-211ENST00000580170 RGS9O75916 674 aaPredicted RBP20.43■□□□□ 0.86
PTPRM-211ENST00000580170 RING1Q06587 406 aa20.43■□□□□ 0.86
PTPRM-211ENST00000580170 ALG10Q5BKT4 473 aa20.43■□□□□ 0.86
PTPRM-211ENST00000580170 TMEM69Q5SWH9 247 aa20.43■□□□□ 0.86
PTPRM-211ENST00000580170 ERN2Q76MJ5 926 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
PTPRM-211ENST00000580170 G6PC3Q9BUM1 346 aa20.43■□□□□ 0.86
PTPRM-211ENST00000580170 SCAMP2O15127 329 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
PTPRM-211ENST00000580170 S1PR1P21453 382 aa20.43■□□□□ 0.86
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PTPRM-211ENST00000580170 CTBP2P56545 445 aa20.43■□□□□ 0.86
PTPRM-211ENST00000580170 CYS1Q717R9 158 aa20.43■□□□□ 0.86
PTPRM-211ENST00000580170 NOX1Q9Y5S8 564 aa20.43■□□□□ 0.86
PTPRM-211ENST00000580170 KNDC1Q76NI1 1749 aa20.43■□□□□ 0.86
PTPRM-211ENST00000580170 ACTC1P68032 377 aa20.43■□□□□ 0.86
PTPRM-211ENST00000580170 ACTA1P68133 377 aa20.43■□□□□ 0.86
PTPRM-211ENST00000580170 MAPK15Q8TD08 544 aa20.43■□□□□ 0.86
PTPRM-211ENST00000580170 SERTAD3Q9UJW9 196 aa20.43■□□□□ 0.86
PTPRM-211ENST00000580170 CNOT11Q9UKZ1 510 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
PTPRM-211ENST00000580170 SSX5O60225 188 aa20.43■□□□□ 0.86
PTPRM-211ENST00000580170 PFKLP17858 780 aa20.43■□□□□ 0.86
PTPRM-211ENST00000580170 LRIT3Q3SXY7 679 aa20.43■□□□□ 0.86
PTPRM-211ENST00000580170 FIP1L1Q6UN15 594 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
PTPRM-211ENST00000580170 ARL6Q9H0F7 186 aa20.43■□□□□ 0.86
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PTPRM-211ENST00000580170 CDC123O75794 336 aaPredicted RBP20.43■□□□□ 0.86
PTPRM-211ENST00000580170 RPL13AP3Q6NVV1 102 aa20.43■□□□□ 0.86
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PTPRM-211ENST00000580170 RPLP0P6Q8NHW5 317 aa20.43■□□□□ 0.86
PTPRM-211ENST00000580170 C7orf34Q96L11 122 aa20.43■□□□□ 0.86
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PTPRM-211ENST00000580170 HRASLS2Q9NWW9 162 aa20.43■□□□□ 0.86
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PTPRM-211ENST00000580170 ZNF283Q8N7M2 679 aa20.42■□□□□ 0.86
PTPRM-211ENST00000580170 MMABQ96EY8 250 aaPredicted RBP20.42■□□□□ 0.86
PTPRM-211ENST00000580170 NPLQ9BXD5 320 aaPredicted RBP20.42■□□□□ 0.86
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PTPRM-211ENST00000580170 OR51A7Q8NH64 312 aa20.42■□□□□ 0.86
PTPRM-211ENST00000580170 KCNN1Q92952 543 aa20.42■□□□□ 0.86
PTPRM-211ENST00000580170 FUNDC2Q9BWH2 189 aa20.42■□□□□ 0.86
PTPRM-211ENST00000580170 ERVK13-1Q9NX77 482 aa20.42■□□□□ 0.86
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PTPRM-211ENST00000580170 RBBP9O75884 186 aa20.42■□□□□ 0.86
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PTPRM-211ENST00000580170 VTCN1Q7Z7D3 282 aa20.42■□□□□ 0.86
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PTPRM-211ENST00000580170 OR56A3Q8NH54 315 aa20.42■□□□□ 0.86
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PTPRM-211ENST00000580170 KCPQ6ZWJ8 1503 aa20.42■□□□□ 0.86
PTPRM-211ENST00000580170 DOC2AQ14183 400 aa20.42■□□□□ 0.86
PTPRM-211ENST00000580170 GPAT4Q86UL3 456 aa20.42■□□□□ 0.86
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PTPRM-211ENST00000580170 OR52P1PQ8NH57 321 aa20.42■□□□□ 0.86
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PTPRM-211ENST00000580170 SLA2Q9H6Q3 261 aa20.42■□□□□ 0.86
PTPRM-211ENST00000580170 C19orf25Q9UFG5 118 aaPredicted RBP20.42■□□□□ 0.86
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PTPRM-211ENST00000580170 DNAJC15Q9Y5T4 150 aa20.42■□□□□ 0.86
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PTPRM-211ENST00000580170 GSTM2P28161 218 aa20.42■□□□□ 0.86
PTPRM-211ENST00000580170 SNRPD2P62316 118 aaKnown RBP20.42■□□□□ 0.86
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PTPRM-211ENST00000580170 GRHL2Q6ISB3 625 aa20.41■□□□□ 0.86
PTPRM-211ENST00000580170 SLC15A4Q8N697 577 aa20.41■□□□□ 0.86
PTPRM-211ENST00000580170 IGSF21Q96ID5 467 aa20.41■□□□□ 0.86
PTPRM-211ENST00000580170 F2RL3Q96RI0 385 aa20.41■□□□□ 0.86
PTPRM-211ENST00000580170 WDR6Q9NNW5 1121 aaKnown RBP20.41■□□□□ 0.86
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PTPRM-211ENST00000580170 C6orf120Q7Z4R8 191 aa20.41■□□□□ 0.86
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PTPRM-211ENST00000580170 HSPA12AO43301 675 aa20.41■□□□□ 0.86
PTPRM-211ENST00000580170 H2AFB2P0C5Z0 115 aa20.41■□□□□ 0.86
PTPRM-211ENST00000580170 ACVR1BP36896 505 aa20.41■□□□□ 0.86
PTPRM-211ENST00000580170 LCN8Q6JVE9 175 aa20.41■□□□□ 0.86
PTPRM-211ENST00000580170 GOLM1Q8NBJ4 401 aa20.41■□□□□ 0.86
PTPRM-211ENST00000580170 OR10T2Q8NGX3 314 aa20.41■□□□□ 0.86
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