RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563200.5

PPP4C-205, Transcript of protein phosphatase 4 catalytic subunit, human

TSL 5

Gene PPP4C, Length 1,447 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PPP4C-205	ENST00000563200	NDUFAF5	Q5TEU4	345 aa		20.13	■□□□□ 0.81
PPP4C-205	ENST00000563200	OPN5	Q6U736	354 aa		20.13	■□□□□ 0.81
PPP4C-205	ENST00000563200	LYPD8	Q6UX82	237 aa		20.13	■□□□□ 0.81
PPP4C-205	ENST00000563200	RPTN	Q6XPR3	784 aa		20.13	■□□□□ 0.81
PPP4C-205	ENST00000563200	SH2D5	Q6ZV89	423 aa		20.13	■□□□□ 0.81
PPP4C-205	ENST00000563200	PAGE2	Q7Z2X7	111 aa		20.13	■□□□□ 0.81
PPP4C-205	ENST00000563200	COMMD6	Q7Z4G1	85 aa		20.13	■□□□□ 0.81
PPP4C-205	ENST00000563200	OR2M7	Q8NG81	312 aa		20.13	■□□□□ 0.81
PPP4C-205	ENST00000563200	SELENOM	Q8WWX9	145 aa		20.13	■□□□□ 0.81
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF382	Q96SR6	550 aa		20.13	■□□□□ 0.81
PPP4C-205	ENST00000563200	SH2D2A	Q9NP31	389 aa		20.13	■□□□□ 0.81
PPP4C-205	ENST00000563200	SNX6	Q9UNH7	406 aa		20.13	■□□□□ 0.81
PPP4C-205	ENST00000563200	SLC12A4	Q9UP95	1085 aa		20.13	■□□□□ 0.81
PPP4C-205	ENST00000563200	ERVK-19	Q9WJR5	959 aa		20.13	■□□□□ 0.81
PPP4C-205	ENST00000563200	CACNA1C	Q13936	2221 aa		20.13	■□□□□ 0.81
PPP4C-205	ENST00000563200	OR10H2	O60403	315 aa		20.12	■□□□□ 0.81
PPP4C-205	ENST00000563200	SUPT7L	O94864	414 aa		20.12	■□□□□ 0.81
PPP4C-205	ENST00000563200	GLS	O94925	669 aa	Predicted RBP	20.12	■□□□□ 0.81
PPP4C-205	ENST00000563200	GSTA1	P08263	222 aa		20.12	■□□□□ 0.81
PPP4C-205	ENST00000563200	ART3	Q13508	389 aa		20.12	■□□□□ 0.81
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF267	Q14586	743 aa	Predicted RBP	20.12	■□□□□ 0.81
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF791	Q3KP31	576 aa	Predicted RBP	20.12	■□□□□ 0.81
PPP4C-205	ENST00000563200	TCHHL1	Q5QJ38	904 aa	Predicted RBP	20.12	■□□□□ 0.81
PPP4C-205	ENST00000563200	CCNYL2	Q5T2Q4	361 aa		20.12	■□□□□ 0.81
PPP4C-205	ENST00000563200	MRGPRG	Q86SM5	289 aa		20.12	■□□□□ 0.81
PPP4C-205	ENST00000563200	DOLPP1	Q86YN1	238 aa		20.12	■□□□□ 0.81
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF808	Q8N4W9	903 aa	Predicted RBP	20.12	■□□□□ 0.81
PPP4C-205	ENST00000563200	OR52N2	Q8NGI0	321 aa		20.12	■□□□□ 0.81
PPP4C-205	ENST00000563200	L3HYPDH	Q96EM0	354 aa		20.12	■□□□□ 0.81
PPP4C-205	ENST00000563200	PHF12	Q96QT6	1004 aa		20.12	■□□□□ 0.81
PPP4C-205	ENST00000563200	CNPPD1	Q9BV87	410 aa		20.12	■□□□□ 0.81
PPP4C-205	ENST00000563200	CXorf21	Q9HAI6	301 aa		20.12	■□□□□ 0.81
PPP4C-205	ENST00000563200	SDAD1	Q9NVU7	687 aa	Known RBP eCLIP	20.12	■□□□□ 0.81
PPP4C-205	ENST00000563200	TBK1	Q9UHD2	729 aa		20.12	■□□□□ 0.81
PPP4C-205	ENST00000563200	CES1P1	Q9UKY3	287 aa		20.12	■□□□□ 0.81
PPP4C-205	ENST00000563200	EMCN	Q9ULC0	261 aa		20.12	■□□□□ 0.81
PPP4C-205	ENST00000563200	MEMO1	Q9Y316	297 aa		20.12	■□□□□ 0.81
PPP4C-205	ENST00000563200	DCHS2	Q6V1P9	2916 aa		20.12	■□□□□ 0.81
PPP4C-205	ENST00000563200	PKDREJ	Q9NTG1	2253 aa		20.12	■□□□□ 0.81
PPP4C-205	ENST00000563200	ABO	P16442	354 aa		20.11	■□□□□ 0.81
PPP4C-205	ENST00000563200	NR0B1	P51843	470 aa	Known RBP	20.11	■□□□□ 0.81
PPP4C-205	ENST00000563200	RASA2	Q15283	850 aa		20.11	■□□□□ 0.81
PPP4C-205	ENST00000563200	SLC15A4	Q8N697	577 aa		20.11	■□□□□ 0.81
PPP4C-205	ENST00000563200	WWTR1	Q9GZV5	400 aa		20.11	■□□□□ 0.81
PPP4C-205	ENST00000563200	MYO9A	B2RTY4	2548 aa		20.11	■□□□□ 0.81
PPP4C-205	ENST00000563200		A0A1B0GTH9	108 aa		20.1	■□□□□ 0.81
PPP4C-205	ENST00000563200		A0A1W2PPM1	405 aa		20.1	■□□□□ 0.81
PPP4C-205	ENST00000563200	OR6C76	A6NM76	312 aa		20.1	■□□□□ 0.81
PPP4C-205	ENST00000563200	MANBA	O00462	879 aa		20.1	■□□□□ 0.81
PPP4C-205	ENST00000563200	ADAM10	O14672	748 aa		20.1	■□□□□ 0.81
PPP4C-205	ENST00000563200	SHBG	P04278	402 aa		20.1	■□□□□ 0.81
PPP4C-205	ENST00000563200	CCL3	P10147	92 aa		20.1	■□□□□ 0.81
PPP4C-205	ENST00000563200	CNR1	P21554	472 aa		20.1	■□□□□ 0.81
PPP4C-205	ENST00000563200	PIK3R1	P27986	724 aa		20.1	■□□□□ 0.81
PPP4C-205	ENST00000563200	MAPK12	P53778	367 aa		20.1	■□□□□ 0.81
PPP4C-205	ENST00000563200	FUT7	Q11130	342 aa		20.1	■□□□□ 0.81
PPP4C-205	ENST00000563200	FOXO1	Q12778	655 aa		20.1	■□□□□ 0.81
PPP4C-205	ENST00000563200	EBP	Q15125	230 aa	Known RBP	20.1	■□□□□ 0.81
PPP4C-205	ENST00000563200	RNF111	Q6ZNA4	994 aa		20.1	■□□□□ 0.81
PPP4C-205	ENST00000563200	SLC22A9	Q8IVM8	553 aa		20.1	■□□□□ 0.81
PPP4C-205	ENST00000563200	SLC34A3	Q8N130	599 aa		20.1	■□□□□ 0.81
PPP4C-205	ENST00000563200	CDYL2	Q8N8U2	506 aa		20.1	■□□□□ 0.81
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF441	Q8N8Z8	693 aa		20.1	■□□□□ 0.81
PPP4C-205	ENST00000563200	OR4K14	Q8NGD5	310 aa		20.1	■□□□□ 0.81
PPP4C-205	ENST00000563200	AGAP11	Q8TF27	550 aa		20.1	■□□□□ 0.81
PPP4C-205	ENST00000563200	TM4SF18	Q96CE8	201 aa		20.1	■□□□□ 0.81
PPP4C-205	ENST00000563200	HBEGF	Q99075	208 aa		20.1	■□□□□ 0.81
PPP4C-205	ENST00000563200	TTTY12	Q9BZ98	90 aa		20.1	■□□□□ 0.81
PPP4C-205	ENST00000563200	ZDHHC11	Q9H8X9	412 aa		20.1	■□□□□ 0.81
PPP4C-205	ENST00000563200	RYDEN	Q9NUL5	291 aa	Known RBP	20.1	■□□□□ 0.81
PPP4C-205	ENST00000563200	DCDC2	Q9UHG0	476 aa		20.1	■□□□□ 0.81
PPP4C-205	ENST00000563200	ENTPD4	Q9Y227	616 aa		20.1	■□□□□ 0.81
PPP4C-205	ENST00000563200	PCDHA9	Q9Y5H5	950 aa		20.1	■□□□□ 0.81
PPP4C-205	ENST00000563200	KLF2	Q9Y5W3	355 aa	Predicted RBP	20.1	■□□□□ 0.81
PPP4C-205	ENST00000563200	ARHGAP10	A1A4S6	786 aa		20.1	■□□□□ 0.81
PPP4C-205	ENST00000563200	FOXO6	A8MYZ6	492 aa		20.1	■□□□□ 0.81
PPP4C-205	ENST00000563200		G3V3Y1	287 aa		20.1	■□□□□ 0.81
PPP4C-205	ENST00000563200	HSD3B1	P14060	373 aa		20.1	■□□□□ 0.81
PPP4C-205	ENST00000563200	HSD3B2	P26439	372 aa		20.1	■□□□□ 0.81
PPP4C-205	ENST00000563200	TNFRSF8	P28908	595 aa		20.1	■□□□□ 0.81
PPP4C-205	ENST00000563200	XK	P51811	444 aa		20.1	■□□□□ 0.81
PPP4C-205	ENST00000563200	PPIA	P62937	165 aa	Known RBP	20.1	■□□□□ 0.81
PPP4C-205	ENST00000563200	RGS9BP	Q6ZS82	235 aa		20.1	■□□□□ 0.81
PPP4C-205	ENST00000563200	GPRIN3	Q6ZVF9	776 aa		20.1	■□□□□ 0.81
PPP4C-205	ENST00000563200	SLC22A8	Q8TCC7	542 aa		20.1	■□□□□ 0.81
PPP4C-205	ENST00000563200	DMRTA2	Q96SC8	542 aa		20.1	■□□□□ 0.81
PPP4C-205	ENST00000563200	FAM173A	Q9BQD7	235 aa		20.1	■□□□□ 0.81
PPP4C-205	ENST00000563200	SACM1L	Q9NTJ5	587 aa		20.1	■□□□□ 0.81
PPP4C-205	ENST00000563200	VPS29	Q9UBQ0	182 aa		20.1	■□□□□ 0.81
PPP4C-205	ENST00000563200	CREBBP	Q92793	2442 aa		20.09	■□□□□ 0.81
PPP4C-205	ENST00000563200	NIN	Q8N4C6	2090 aa		20.09	■□□□□ 0.81
PPP4C-205	ENST00000563200	C1orf226	A1L170	272 aa		20.09	■□□□□ 0.81
PPP4C-205	ENST00000563200	PRSS44	E7EML9	344 aa		20.09	■□□□□ 0.81
PPP4C-205	ENST00000563200	PRRG2	O14669	202 aa		20.09	■□□□□ 0.81
PPP4C-205	ENST00000563200	CT62	P0C5K7	136 aa		20.09	■□□□□ 0.81
PPP4C-205	ENST00000563200	ESRRA	P11474	423 aa	Predicted RBP	20.09	■□□□□ 0.81
PPP4C-205	ENST00000563200	CPM	P14384	443 aa		20.09	■□□□□ 0.81
PPP4C-205	ENST00000563200	AGA	P20933	346 aa		20.09	■□□□□ 0.81
PPP4C-205	ENST00000563200	SSTR4	P31391	388 aa		20.09	■□□□□ 0.81
PPP4C-205	ENST00000563200	PTGS2	P35354	604 aa		20.09	■□□□□ 0.81

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.2 ms