RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498367.1

PDCD4-211, Transcript of programmed cell death 4, humanhuman

TSL 3

Gene PDCD4, Length 975 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD4-211ENST00000498367 SMG8Q8ND04 991 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
PDCD4-211ENST00000498367 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
PDCD4-211ENST00000498367 CATSPER1Q8NEC5 780 aa6.84□□□□□ -1.31
PDCD4-211ENST00000498367 ENGASEQ8NFI3 743 aa6.84□□□□□ -1.31
PDCD4-211ENST00000498367 HCAR2Q8TDS4 363 aa6.84□□□□□ -1.31
PDCD4-211ENST00000498367 ASB5Q8WWX0 329 aa6.84□□□□□ -1.31
PDCD4-211ENST00000498367 GLYATL1Q969I3 302 aa6.84□□□□□ -1.31
PDCD4-211ENST00000498367 BORCS5Q969J3 196 aa6.84□□□□□ -1.31
PDCD4-211ENST00000498367 OTUB1Q96FW1 271 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
PDCD4-211ENST00000498367 CELF6Q96J87 481 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
PDCD4-211ENST00000498367 MYADMQ96S97 322 aa6.84□□□□□ -1.31
PDCD4-211ENST00000498367 METTL9Q9H1A3 318 aa6.84□□□□□ -1.31
PDCD4-211ENST00000498367 LPAR2Q9HBW0 351 aa6.84□□□□□ -1.31
PDCD4-211ENST00000498367 MCCC2Q9HCC0 563 aa6.84□□□□□ -1.31
PDCD4-211ENST00000498367 CHMP1AQ9HD42 196 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
PDCD4-211ENST00000498367 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa6.84□□□□□ -1.31
PDCD4-211ENST00000498367 PHF11Q9UIL8 331 aa6.84□□□□□ -1.31
PDCD4-211ENST00000498367 WIF1Q9Y5W5 379 aa6.84□□□□□ -1.31
PDCD4-211ENST00000498367 FKBP7Q9Y680 259 aa6.84□□□□□ -1.31
PDCD4-211ENST00000498367 CUX2O14529 1486 aa6.84□□□□□ -1.31
PDCD4-211ENST00000498367 PTPRCP08575 1304 aa6.83□□□□□ -1.32
PDCD4-211ENST00000498367 LOC105371242A0A075B767 164 aa6.83□□□□□ -1.32
PDCD4-211ENST00000498367 A0A087X1B8 175 aa6.83□□□□□ -1.32
PDCD4-211ENST00000498367 LOC107983988A0A1B0GUW6 1196 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
PDCD4-211ENST00000498367 OR2AT4A6NND4 320 aa6.83□□□□□ -1.32
PDCD4-211ENST00000498367 RS1O15537 224 aa6.83□□□□□ -1.32
PDCD4-211ENST00000498367 NADKO95544 446 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
PDCD4-211ENST00000498367 SNAP29O95721 258 aa6.83□□□□□ -1.32
PDCD4-211ENST00000498367 SAGP10523 405 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
PDCD4-211ENST00000498367 IL7RP16871 459 aa6.83□□□□□ -1.32
PDCD4-211ENST00000498367 ZNF26P17031 533 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
PDCD4-211ENST00000498367 PSMC3P17980 439 aa6.83□□□□□ -1.32
PDCD4-211ENST00000498367 BMP7P18075 431 aa6.83□□□□□ -1.32
PDCD4-211ENST00000498367 FDXRP22570 491 aa6.83□□□□□ -1.32
PDCD4-211ENST00000498367 PTGER4P35408 488 aa6.83□□□□□ -1.32
PDCD4-211ENST00000498367 UGT2B10P36537 528 aa6.83□□□□□ -1.32
PDCD4-211ENST00000498367 TGFBR2P37173 567 aa6.83□□□□□ -1.32
PDCD4-211ENST00000498367 TMPOP42166 694 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
PDCD4-211ENST00000498367 NPBWR2P48146 333 aa6.83□□□□□ -1.32
PDCD4-211ENST00000498367 IRF8Q02556 426 aa6.83□□□□□ -1.32
PDCD4-211ENST00000498367 GABPAQ06546 454 aa6.83□□□□□ -1.32
PDCD4-211ENST00000498367 KRT81Q14533 505 aa6.83□□□□□ -1.32
PDCD4-211ENST00000498367 ELAVL3Q14576 367 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
PDCD4-211ENST00000498367 HLXQ14774 488 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
PDCD4-211ENST00000498367 EXOC3L4Q17RC7 722 aa6.83□□□□□ -1.32
PDCD4-211ENST00000498367 SOWAHAQ2M3V2 549 aa6.83□□□□□ -1.32
PDCD4-211ENST00000498367 DCAF4L1Q3SXM0 396 aa6.83□□□□□ -1.32
PDCD4-211ENST00000498367 AASDHQ4L235 1098 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
PDCD4-211ENST00000498367 TIGD5Q53EQ6 642 aa6.83□□□□□ -1.32
PDCD4-211ENST00000498367 TMEM35AQ53FP2 167 aa6.83□□□□□ -1.32
PDCD4-211ENST00000498367 CRB2Q5IJ48 1285 aa6.83□□□□□ -1.32
PDCD4-211ENST00000498367 DDI2Q5TDH0 399 aa6.83□□□□□ -1.32
PDCD4-211ENST00000498367 OR5M10Q6IEU7 315 aa6.83□□□□□ -1.32
PDCD4-211ENST00000498367 TCEAL6Q6IPX3 200 aa6.83□□□□□ -1.32
PDCD4-211ENST00000498367 PLEKHA7Q6IQ23 1121 aa6.83□□□□□ -1.32
PDCD4-211ENST00000498367 VWA1Q6PCB0 445 aa6.83□□□□□ -1.32
PDCD4-211ENST00000498367 TEX38Q6PEX7 206 aa6.83□□□□□ -1.32
PDCD4-211ENST00000498367 LRRN1Q6UXK5 716 aa6.83□□□□□ -1.32
PDCD4-211ENST00000498367 CDHR3Q6ZTQ4 885 aa6.83□□□□□ -1.32
PDCD4-211ENST00000498367 IL17RELQ6ZVW7 336 aa6.83□□□□□ -1.32
PDCD4-211ENST00000498367 NRARPQ7Z6K4 114 aa6.83□□□□□ -1.32
PDCD4-211ENST00000498367 LHFPL4Q7Z7J7 247 aa6.83□□□□□ -1.32
PDCD4-211ENST00000498367 SATL1Q86VE3 508 aa6.83□□□□□ -1.32
PDCD4-211ENST00000498367 LAX1Q8IWV1 398 aa6.83□□□□□ -1.32
PDCD4-211ENST00000498367 ARHGAP24Q8N264 748 aa6.83□□□□□ -1.32
PDCD4-211ENST00000498367 KIF2BQ8N4N8 673 aa6.83□□□□□ -1.32
PDCD4-211ENST00000498367 CPEB3Q8NE35 698 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
PDCD4-211ENST00000498367 BHLHE22Q8NFJ8 381 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
PDCD4-211ENST00000498367 OR7G2Q8NG99 324 aa6.83□□□□□ -1.32
PDCD4-211ENST00000498367 HM13Q8TCT9 377 aa6.83□□□□□ -1.32
PDCD4-211ENST00000498367 NETO1Q8TDF5 533 aa6.83□□□□□ -1.32
PDCD4-211ENST00000498367 NRGNQ92686 78 aa6.83□□□□□ -1.32
PDCD4-211ENST00000498367 FUBP1Q96AE4 644 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
PDCD4-211ENST00000498367 AKR1E2Q96JD6 320 aa6.83□□□□□ -1.32
PDCD4-211ENST00000498367 HARBI1Q96MB7 349 aa6.83□□□□□ -1.32
PDCD4-211ENST00000498367 TEAD3Q99594 435 aa6.83□□□□□ -1.32
PDCD4-211ENST00000498367 UTP23Q9BRU9 249 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
PDCD4-211ENST00000498367 HIPK2Q9H2X6 1198 aa6.83□□□□□ -1.32
PDCD4-211ENST00000498367 WDR54Q9H977 334 aa6.83□□□□□ -1.32
PDCD4-211ENST00000498367 MYOZ1Q9NP98 299 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
PDCD4-211ENST00000498367 ZFP57Q9NU63 452 aa6.83□□□□□ -1.32
PDCD4-211ENST00000498367 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
PDCD4-211ENST00000498367 MYOTQ9UBF9 498 aa6.83□□□□□ -1.32
PDCD4-211ENST00000498367 PPP1R3CQ9UQK1 317 aa6.83□□□□□ -1.32
PDCD4-211ENST00000498367 STARD10Q9Y365 291 aa6.83□□□□□ -1.32
PDCD4-211ENST00000498367 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa6.82□□□□□ -1.32
PDCD4-211ENST00000498367 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa6.82□□□□□ -1.32
PDCD4-211ENST00000498367 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa6.82□□□□□ -1.32
PDCD4-211ENST00000498367 ZNF233A6NK53 670 aa6.82□□□□□ -1.32
PDCD4-211ENST00000498367 H3BN98 237 aa6.82□□□□□ -1.32
PDCD4-211ENST00000498367 M0R036 132 aa6.82□□□□□ -1.32
PDCD4-211ENST00000498367 P2RY10O00398 339 aa6.82□□□□□ -1.32
PDCD4-211ENST00000498367 CLDN5O00501 218 aa6.82□□□□□ -1.32
PDCD4-211ENST00000498367 GOSR2O14653 212 aa6.82□□□□□ -1.32
PDCD4-211ENST00000498367 KIAA0391O15091 583 aaKnown RBP6.82□□□□□ -1.32
PDCD4-211ENST00000498367 MAGEC1O60732 1142 aa6.82□□□□□ -1.32
PDCD4-211ENST00000498367 TM7SF2O76062 418 aa6.82□□□□□ -1.32
PDCD4-211ENST00000498367 TFP02787 698 aa6.82□□□□□ -1.32
PDCD4-211ENST00000498367 PRNPP04156 253 aa6.82□□□□□ -1.32
PDCD4-211ENST00000498367 F13BP05160 661 aa6.82□□□□□ -1.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.1 ms