RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488243.1

NISCH-211, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 2

Gene NISCH, Length 584 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-211ENST00000488243 AGRPO00253 132 aa10.98□□□□□ -0.65
NISCH-211ENST00000488243 PGRMC2O15173 223 aa10.98□□□□□ -0.65
NISCH-211ENST00000488243 DYRK3O43781 588 aa10.98□□□□□ -0.65
NISCH-211ENST00000488243 RAD1O60671 282 aa10.98□□□□□ -0.65
NISCH-211ENST00000488243 ATP1B1P05026 303 aa10.98□□□□□ -0.65
NISCH-211ENST00000488243 ZCCHC18P0CG32 403 aa10.98□□□□□ -0.65
NISCH-211ENST00000488243 COX4I1P13073 169 aa10.98□□□□□ -0.65
NISCH-211ENST00000488243 CALB2P22676 271 aa10.98□□□□□ -0.65
NISCH-211ENST00000488243 IL12AP29459 219 aa10.98□□□□□ -0.65
NISCH-211ENST00000488243 STAT5AP42229 794 aa10.98□□□□□ -0.65
NISCH-211ENST00000488243 ZFP36L2P47974 494 aaKnown RBP10.98□□□□□ -0.65
NISCH-211ENST00000488243 XKP51811 444 aa10.98□□□□□ -0.65
NISCH-211ENST00000488243 PLIN5Q00G26 463 aa10.98□□□□□ -0.65
NISCH-211ENST00000488243 MC1RQ01726 317 aa10.98□□□□□ -0.65
NISCH-211ENST00000488243 NFATC3Q12968 1075 aa10.98□□□□□ -0.65
NISCH-211ENST00000488243 SLC13A2Q13183 592 aa10.98□□□□□ -0.65
NISCH-211ENST00000488243 SPANXN4Q5MJ08 99 aa10.98□□□□□ -0.65
NISCH-211ENST00000488243 MLIPQ5VWP3 458 aa10.98□□□□□ -0.65
NISCH-211ENST00000488243 CPZQ66K79 652 aa10.98□□□□□ -0.65
NISCH-211ENST00000488243 INO80CQ6PI98 192 aaPredicted RBP10.98□□□□□ -0.65
NISCH-211ENST00000488243 FAM198BQ6UWH4 519 aa10.98□□□□□ -0.65
NISCH-211ENST00000488243 C6orf89Q6UWU4 347 aa10.98□□□□□ -0.65
NISCH-211ENST00000488243 CCDC81Q6ZN84 652 aa10.98□□□□□ -0.65
NISCH-211ENST00000488243 DTX1Q86Y01 620 aa10.98□□□□□ -0.65
NISCH-211ENST00000488243 ST13P4Q8IZP2 240 aaPredicted RBP10.98□□□□□ -0.65
NISCH-211ENST00000488243 LRRC25Q8N386 305 aaPredicted RBP10.98□□□□□ -0.65
NISCH-211ENST00000488243 DPP10Q8N608 796 aa10.98□□□□□ -0.65
NISCH-211ENST00000488243 METTL27Q8N6F8 245 aaPredicted RBP10.98□□□□□ -0.65
NISCH-211ENST00000488243 TRIML2Q8N7C3 387 aa10.98□□□□□ -0.65
NISCH-211ENST00000488243 OR7A2PQ8NGA2 310 aa10.98□□□□□ -0.65
NISCH-211ENST00000488243 SNRNP27Q8WVK2 155 aaKnown RBP10.98□□□□□ -0.65
NISCH-211ENST00000488243 ZDHHC19Q8WVZ1 309 aaPredicted RBP10.98□□□□□ -0.65
NISCH-211ENST00000488243 METTL21AQ8WXB1 218 aa10.98□□□□□ -0.65
NISCH-211ENST00000488243 GFM2Q969S9 779 aaKnown RBP10.98□□□□□ -0.65
NISCH-211ENST00000488243 PMEPA1Q969W9 287 aa10.98□□□□□ -0.65
NISCH-211ENST00000488243 ROPN1LQ96C74 230 aa10.98□□□□□ -0.65
NISCH-211ENST00000488243 KLHL29Q96CT2 875 aa10.98□□□□□ -0.65
NISCH-211ENST00000488243 RBM18Q96H35 190 aaKnown RBP10.98□□□□□ -0.65
NISCH-211ENST00000488243 ZNF681Q96N22 645 aa10.98□□□□□ -0.65
NISCH-211ENST00000488243 CCDC115Q96NT0 180 aa10.98□□□□□ -0.65
NISCH-211ENST00000488243 CHST8Q9H2A9 424 aa10.98□□□□□ -0.65
NISCH-211ENST00000488243 EFCAB1Q9HAE3 211 aa10.98□□□□□ -0.65
NISCH-211ENST00000488243 SLC52A3Q9NQ40 469 aa10.98□□□□□ -0.65
NISCH-211ENST00000488243 GID8Q9NWU2 228 aa10.98□□□□□ -0.65
NISCH-211ENST00000488243 NDE1Q9NXR1 346 aa10.98□□□□□ -0.65
NISCH-211ENST00000488243 ARMCX1Q9P291 453 aa10.98□□□□□ -0.65
NISCH-211ENST00000488243 C19orf25Q9UFG5 118 aaPredicted RBP10.98□□□□□ -0.65
NISCH-211ENST00000488243 TAGLN3Q9UI15 199 aa10.98□□□□□ -0.65
NISCH-211ENST00000488243 MAN2B2Q9Y2E5 1009 aa10.98□□□□□ -0.65
NISCH-211ENST00000488243 NBPF19A0A087WUL8 3843 aa10.97□□□□□ -0.65
NISCH-211ENST00000488243 IGKV3D-11A0A0A0MRZ8 115 aa10.97□□□□□ -0.65
NISCH-211ENST00000488243 PMS2P1A4D2B8 440 aa10.97□□□□□ -0.65
NISCH-211ENST00000488243 FAM227AF5H4B4 570 aa10.97□□□□□ -0.65
NISCH-211ENST00000488243 NR5A2O00482 541 aa10.97□□□□□ -0.65
NISCH-211ENST00000488243 B4GALT2O60909 372 aa10.97□□□□□ -0.65
NISCH-211ENST00000488243 DNAJB6O75190 326 aa10.97□□□□□ -0.65
NISCH-211ENST00000488243 ERN1O75460 977 aaKnown RBP10.97□□□□□ -0.65
NISCH-211ENST00000488243 ERAL1O75616 437 aaKnown RBP10.97□□□□□ -0.65
NISCH-211ENST00000488243 BCAS2O75934 225 aaPredicted RBP10.97□□□□□ -0.65
NISCH-211ENST00000488243 HEXBP07686 556 aa10.97□□□□□ -0.65
NISCH-211ENST00000488243 LIPCP11150 499 aa10.97□□□□□ -0.65
NISCH-211ENST00000488243 LAMP1P11279 417 aa10.97□□□□□ -0.65
NISCH-211ENST00000488243 ESRRAP11474 423 aaPredicted RBP10.97□□□□□ -0.65
NISCH-211ENST00000488243 CPMP14384 443 aa10.97□□□□□ -0.65
NISCH-211ENST00000488243 TCN2P20062 427 aa10.97□□□□□ -0.65
NISCH-211ENST00000488243 MAGEA8P43361 318 aa10.97□□□□□ -0.65
NISCH-211ENST00000488243 RASSF2P50749 326 aa10.97□□□□□ -0.65
NISCH-211ENST00000488243 EMP2P54851 167 aa10.97□□□□□ -0.65
NISCH-211ENST00000488243 MANFP55145 182 aaKnown RBP10.97□□□□□ -0.65
NISCH-211ENST00000488243 NME5P56597 212 aa10.97□□□□□ -0.65
NISCH-211ENST00000488243 TXNL4AP83876 142 aaKnown RBP10.97□□□□□ -0.65
NISCH-211ENST00000488243 RHAGQ02094 409 aa10.97□□□□□ -0.65
NISCH-211ENST00000488243 FOLH1Q04609 750 aa10.97□□□□□ -0.65
NISCH-211ENST00000488243 SYT16Q17RD7 645 aa10.97□□□□□ -0.65
NISCH-211ENST00000488243 MMEL1Q495T6 779 aa10.97□□□□□ -0.65
NISCH-211ENST00000488243 MINDY4Q4G0A6 757 aa10.97□□□□□ -0.65
NISCH-211ENST00000488243 VWA2Q5GFL6 755 aa10.97□□□□□ -0.65
NISCH-211ENST00000488243 C6orf163Q5TEZ5 329 aa10.97□□□□□ -0.65
NISCH-211ENST00000488243 OR4F3Q6IEY1 312 aa10.97□□□□□ -0.65
NISCH-211ENST00000488243 BHLHB9Q6PI77 547 aa10.97□□□□□ -0.65
NISCH-211ENST00000488243 HACD2Q6Y1H2 254 aa10.97□□□□□ -0.65
NISCH-211ENST00000488243 TIPARPQ7Z3E1 657 aaKnown RBP10.97□□□□□ -0.65
NISCH-211ENST00000488243 OR9I1Q8NGQ6 314 aa10.97□□□□□ -0.65
NISCH-211ENST00000488243 OR2Y1Q8NGV0 311 aa10.97□□□□□ -0.65
NISCH-211ENST00000488243 GOT1L1Q8NHS2 421 aaPredicted RBP10.97□□□□□ -0.65
NISCH-211ENST00000488243 PSMA8Q8TAA3 256 aa10.97□□□□□ -0.65
NISCH-211ENST00000488243 KIAA1143Q96AT1 154 aaPredicted RBP10.97□□□□□ -0.65
NISCH-211ENST00000488243 EXOSC8Q96B26 276 aaKnown RBP10.97□□□□□ -0.65
NISCH-211ENST00000488243 ANKRD9Q96BM1 317 aaPredicted RBP10.97□□□□□ -0.65
NISCH-211ENST00000488243 MOAP1Q96BY2 351 aa10.97□□□□□ -0.65
NISCH-211ENST00000488243 NSL1Q96IY1 281 aa10.97□□□□□ -0.65
NISCH-211ENST00000488243 ART5Q96L15 291 aa10.97□□□□□ -0.65
NISCH-211ENST00000488243 PTCHD1Q96NR3 888 aa10.97□□□□□ -0.65
NISCH-211ENST00000488243 IP6K3Q96PC2 410 aa10.97□□□□□ -0.65
NISCH-211ENST00000488243 CSF3RQ99062 836 aa10.97□□□□□ -0.65
NISCH-211ENST00000488243 SPSB2Q99619 263 aa10.97□□□□□ -0.65
NISCH-211ENST00000488243 VN1R1Q9GZP7 353 aa10.97□□□□□ -0.65
NISCH-211ENST00000488243 RYDENQ9NUL5 291 aaKnown RBP10.97□□□□□ -0.65
NISCH-211ENST00000488243 CTSFQ9UBX1 484 aa10.97□□□□□ -0.65
NISCH-211ENST00000488243 MKL2Q9ULH7 1088 aa10.97□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.9 ms