RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000470201.5

RABGGTB-207, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene RABGGTB, Length 848 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-207ENST00000470201 MATKP42679 507 aa3.94□□□□□ -1.78
RABGGTB-207ENST00000470201 MTIF2P46199 727 aaKnown RBP3.94□□□□□ -1.78
RABGGTB-207ENST00000470201 PMP22Q01453 160 aa3.94□□□□□ -1.78
RABGGTB-207ENST00000470201 ELP6Q0PNE2 266 aa3.94□□□□□ -1.78
RABGGTB-207ENST00000470201 CLPPQ16740 277 aaPredicted RBP3.94□□□□□ -1.78
RABGGTB-207ENST00000470201 HAGHQ16775 308 aa3.94□□□□□ -1.78
RABGGTB-207ENST00000470201 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP3.94□□□□□ -1.78
RABGGTB-207ENST00000470201 C3P1Q6ZMU1 363 aa3.94□□□□□ -1.78
RABGGTB-207ENST00000470201 KIF6Q6ZMV9 814 aa3.94□□□□□ -1.78
RABGGTB-207ENST00000470201 GOLGA7Q7Z5G4 137 aa3.94□□□□□ -1.78
RABGGTB-207ENST00000470201 GPR142Q7Z601 462 aa3.94□□□□□ -1.78
RABGGTB-207ENST00000470201 ZNF573Q86YE8 665 aa3.94□□□□□ -1.78
RABGGTB-207ENST00000470201 ICA1LQ8NDH6 482 aa3.94□□□□□ -1.78
RABGGTB-207ENST00000470201 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa3.94□□□□□ -1.78
RABGGTB-207ENST00000470201 ZNF519Q8TB69 540 aa3.94□□□□□ -1.78
RABGGTB-207ENST00000470201 SLCO2A1Q92959 643 aa3.94□□□□□ -1.78
RABGGTB-207ENST00000470201 VPS39Q96JC1 886 aa3.94□□□□□ -1.78
RABGGTB-207ENST00000470201 GPA33Q99795 319 aa3.94□□□□□ -1.78
RABGGTB-207ENST00000470201 NLNQ9BYT8 704 aa3.94□□□□□ -1.78
RABGGTB-207ENST00000470201 SLC25A19Q9HC21 320 aa3.94□□□□□ -1.78
RABGGTB-207ENST00000470201 B3GAT2Q9NPZ5 323 aa3.94□□□□□ -1.78
RABGGTB-207ENST00000470201 SPHK2Q9NRA0 654 aa3.94□□□□□ -1.78
RABGGTB-207ENST00000470201 YAE1D1Q9NRH1 226 aa3.94□□□□□ -1.78
RABGGTB-207ENST00000470201 PROCRQ9UNN8 238 aa3.94□□□□□ -1.78
RABGGTB-207ENST00000470201 MRPS28Q9Y2Q9 187 aaKnown RBP3.94□□□□□ -1.78
RABGGTB-207ENST00000470201 SLC6A5Q9Y345 797 aa3.94□□□□□ -1.78
RABGGTB-207ENST00000470201 PTPRUQ92729 1446 aa3.94□□□□□ -1.78
RABGGTB-207ENST00000470201 ABCC4O15439 1325 aa3.94□□□□□ -1.78
RABGGTB-207ENST00000470201 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa3.93□□□□□ -1.78
RABGGTB-207ENST00000470201 IGHV3-20A0A0C4DH32 117 aa3.93□□□□□ -1.78
RABGGTB-207ENST00000470201 ANKRD30BLA7E2S9 258 aa3.93□□□□□ -1.78
RABGGTB-207ENST00000470201 PRSS44E7EML9 344 aa3.93□□□□□ -1.78
RABGGTB-207ENST00000470201 G3V2L1 256 aa3.93□□□□□ -1.78
RABGGTB-207ENST00000470201 NXPH4O95158 308 aa3.93□□□□□ -1.78
RABGGTB-207ENST00000470201 NDUFA7O95182 113 aa3.93□□□□□ -1.78
RABGGTB-207ENST00000470201 AMBPP02760 352 aa3.93□□□□□ -1.78
RABGGTB-207ENST00000470201 KRT8P05787 483 aa3.93□□□□□ -1.78
RABGGTB-207ENST00000470201 TSPY4P0CV99 314 aa3.93□□□□□ -1.78
RABGGTB-207ENST00000470201 TSPY10P0CW01 314 aa3.93□□□□□ -1.78
RABGGTB-207ENST00000470201 CALCBP10092 127 aa3.93□□□□□ -1.78
RABGGTB-207ENST00000470201 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP3.93□□□□□ -1.78
RABGGTB-207ENST00000470201 PRKACGP22612 351 aa3.93□□□□□ -1.78
RABGGTB-207ENST00000470201 CYP2F1P24903 491 aa3.93□□□□□ -1.78
RABGGTB-207ENST00000470201 RPL9P32969 192 aaKnown RBP3.93□□□□□ -1.78
RABGGTB-207ENST00000470201 NDST2P52849 883 aa3.93□□□□□ -1.78
RABGGTB-207ENST00000470201 ERVK-16P61578 105 aa3.93□□□□□ -1.78
RABGGTB-207ENST00000470201 RPS4XP62701 263 aaKnown RBP3.93□□□□□ -1.78
RABGGTB-207ENST00000470201 TRA2BP62995 288 aaKnown RBP3.93□□□□□ -1.78
RABGGTB-207ENST00000470201 SLC17A1Q14916 467 aa3.93□□□□□ -1.78
RABGGTB-207ENST00000470201 MLF2Q15773 248 aaPredicted RBP3.93□□□□□ -1.78
RABGGTB-207ENST00000470201 FAM189A2Q15884 450 aa3.93□□□□□ -1.78
RABGGTB-207ENST00000470201 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP3.93□□□□□ -1.78
RABGGTB-207ENST00000470201 LRIT3Q3SXY7 679 aa3.93□□□□□ -1.78
RABGGTB-207ENST00000470201 ACSF3Q4G176 576 aaPredicted RBP3.93□□□□□ -1.78
RABGGTB-207ENST00000470201 TMEM41BQ5BJD5 291 aa3.93□□□□□ -1.78
RABGGTB-207ENST00000470201 BSPRYQ5W0U4 402 aa3.93□□□□□ -1.78
RABGGTB-207ENST00000470201 SLC25A24Q6NUK1 477 aa3.93□□□□□ -1.78
RABGGTB-207ENST00000470201 STEAP1BQ6NZ63 245 aa3.93□□□□□ -1.78
RABGGTB-207ENST00000470201 LCLAT1Q6UWP7 414 aa3.93□□□□□ -1.78
RABGGTB-207ENST00000470201 DPY19L2P2Q6ZN68 376 aa3.93□□□□□ -1.78
RABGGTB-207ENST00000470201 NOTCH2NLQ7Z3S9 236 aa3.93□□□□□ -1.78
RABGGTB-207ENST00000470201 TBC1D10CQ8IV04 446 aa3.93□□□□□ -1.78
RABGGTB-207ENST00000470201 LINC00518Q8N0U6 118 aa3.93□□□□□ -1.78
RABGGTB-207ENST00000470201 ZNF397Q8NF99 534 aaPredicted RBP3.93□□□□□ -1.78
RABGGTB-207ENST00000470201 IPMKQ8NFU5 416 aa3.93□□□□□ -1.78
RABGGTB-207ENST00000470201 PINX1Q96BK5 328 aaKnown RBP3.93□□□□□ -1.78
RABGGTB-207ENST00000470201 FBXO17Q96EF6 278 aa3.93□□□□□ -1.78
RABGGTB-207ENST00000470201 CCDC51Q96ER9 411 aa3.93□□□□□ -1.78
RABGGTB-207ENST00000470201 DTNBP1Q96EV8 351 aa3.93□□□□□ -1.78
RABGGTB-207ENST00000470201 CNRIP1Q96F85 164 aaPredicted RBP3.93□□□□□ -1.78
RABGGTB-207ENST00000470201 CAPNS2Q96L46 248 aa3.93□□□□□ -1.78
RABGGTB-207ENST00000470201 ZNF416Q9BWM5 594 aa3.93□□□□□ -1.78
RABGGTB-207ENST00000470201 CARD6Q9BX69 1037 aa3.93□□□□□ -1.78
RABGGTB-207ENST00000470201 RAB11FIP5Q9BXF6 653 aa3.93□□□□□ -1.78
RABGGTB-207ENST00000470201 RIBC2Q9H4K1 309 aa3.93□□□□□ -1.78
RABGGTB-207ENST00000470201 FGF22Q9HCT0 170 aa3.93□□□□□ -1.78
RABGGTB-207ENST00000470201 CENPMQ9NSP4 180 aa3.93□□□□□ -1.78
RABGGTB-207ENST00000470201 SDAD1Q9NVU7 687 aaKnown RBP eCLIP3.93□□□□□ -1.78
RABGGTB-207ENST00000470201 ZNF580Q9UK33 172 aa3.93□□□□□ -1.78
RABGGTB-207ENST00000470201 FOXJ3Q9UPW0 622 aa3.93□□□□□ -1.78
RABGGTB-207ENST00000470201 ZNF559-ZNF177A0A0A6YYI6 481 aaPredicted RBP3.92□□□□□ -1.78
RABGGTB-207ENST00000470201 A0A0U1RQV5 110 aa3.92□□□□□ -1.78
RABGGTB-207ENST00000470201 E9PMD0 336 aa3.92□□□□□ -1.78
RABGGTB-207ENST00000470201 SGK494L7N484 410 aa3.92□□□□□ -1.78
RABGGTB-207ENST00000470201 IDH1O75874 414 aaKnown RBP3.92□□□□□ -1.78
RABGGTB-207ENST00000470201 STK17BO94768 372 aa3.92□□□□□ -1.78
RABGGTB-207ENST00000470201 APBB3O95704 486 aa3.92□□□□□ -1.78
RABGGTB-207ENST00000470201 IGLV1-44P01699 117 aa3.92□□□□□ -1.78
RABGGTB-207ENST00000470201 PDHA2P29803 388 aa3.92□□□□□ -1.78
RABGGTB-207ENST00000470201 PPP2R1AP30153 589 aa3.92□□□□□ -1.78
RABGGTB-207ENST00000470201 MAT2AP31153 395 aaKnown RBP3.92□□□□□ -1.78
RABGGTB-207ENST00000470201 OVGP1Q12889 678 aa3.92□□□□□ -1.78
RABGGTB-207ENST00000470201 ZNF177Q13360 481 aaPredicted RBP3.92□□□□□ -1.78
RABGGTB-207ENST00000470201 RAPSNQ13702 412 aa3.92□□□□□ -1.78
RABGGTB-207ENST00000470201 KIAA0141Q14154 515 aaPredicted RBP3.92□□□□□ -1.78
RABGGTB-207ENST00000470201 UPP1Q16831 310 aa3.92□□□□□ -1.78
RABGGTB-207ENST00000470201 HKDC1Q2TB90 917 aa3.92□□□□□ -1.78
RABGGTB-207ENST00000470201 ADPRMQ3LIE5 342 aa3.92□□□□□ -1.78
RABGGTB-207ENST00000470201 ANKDD1AQ495B1 522 aa3.92□□□□□ -1.78
RABGGTB-207ENST00000470201 RHBDD2Q6NTF9 364 aa3.92□□□□□ -1.78
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.9 ms