RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462494.5

ACTB-207, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 5

Gene ACTB, Length 2,245 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-207ENST00000462494 CARTPTQ16568 116 aa16.04■□□□□ 0.16
ACTB-207ENST00000462494 FAM46CQ5VWP2 391 aa16.04■□□□□ 0.16
ACTB-207ENST00000462494 WDR53Q7Z5U6 358 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
ACTB-207ENST00000462494 UBE3DQ7Z6J8 389 aa16.04■□□□□ 0.16
ACTB-207ENST00000462494 FAM20CQ8IXL6 584 aa16.04■□□□□ 0.16
ACTB-207ENST00000462494 LINC01555Q8NAE3 123 aa16.04■□□□□ 0.16
ACTB-207ENST00000462494 MENTQ9BUN1 341 aa16.04■□□□□ 0.16
ACTB-207ENST00000462494 PCBD2Q9H0N5 130 aa16.04■□□□□ 0.16
ACTB-207ENST00000462494 KCNK12Q9HB15 430 aa16.04■□□□□ 0.16
ACTB-207ENST00000462494 CLEC2DQ9UHP7 191 aa16.04■□□□□ 0.16
ACTB-207ENST00000462494 WBP11Q9Y2W2 641 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
ACTB-207ENST00000462494 A3GALT2U3KPV4 340 aa16.04■□□□□ 0.16
ACTB-207ENST00000462494 GOLGA4Q13439 2230 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
ACTB-207ENST00000462494 M0R3H8 397 aa16.04■□□□□ 0.16
ACTB-207ENST00000462494 UGT2B17O75795 530 aa16.04■□□□□ 0.16
ACTB-207ENST00000462494 MED26O95402 600 aa16.04■□□□□ 0.16
ACTB-207ENST00000462494 HSD17B2P37059 387 aa16.04■□□□□ 0.16
ACTB-207ENST00000462494 SOX3P41225 446 aa16.04■□□□□ 0.16
ACTB-207ENST00000462494 SSR2P43308 183 aa16.04■□□□□ 0.16
ACTB-207ENST00000462494 TMED10P49755 219 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
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ACTB-207ENST00000462494 WSCD2Q2TBF2 565 aa16.04■□□□□ 0.16
ACTB-207ENST00000462494 TIMM50Q3ZCQ8 353 aa16.04■□□□□ 0.16
ACTB-207ENST00000462494 PGBD2Q6P3X8 592 aa16.04■□□□□ 0.16
ACTB-207ENST00000462494 ATCAYQ86WG3 371 aa16.04■□□□□ 0.16
ACTB-207ENST00000462494 SLC7A13Q8TCU3 470 aa16.04■□□□□ 0.16
ACTB-207ENST00000462494 SLC35G5Q96KT7 338 aa16.04■□□□□ 0.16
ACTB-207ENST00000462494 TEFMQ96QE5 360 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
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ACTB-207ENST00000462494 YIPF4Q9BSR8 244 aa16.04■□□□□ 0.16
ACTB-207ENST00000462494 DPH7Q9BTV6 452 aa16.04■□□□□ 0.16
ACTB-207ENST00000462494 CNPPD1Q9BV87 410 aa16.04■□□□□ 0.16
ACTB-207ENST00000462494 NUAK2Q9H093 628 aa16.04■□□□□ 0.16
ACTB-207ENST00000462494 MVB12BQ9H7P6 319 aa16.04■□□□□ 0.16
ACTB-207ENST00000462494 SP140LQ9H930 580 aa16.04■□□□□ 0.16
ACTB-207ENST00000462494 SLC25A19Q9HC21 320 aa16.04■□□□□ 0.16
ACTB-207ENST00000462494 PRSS16Q9NQE7 514 aa16.04■□□□□ 0.16
ACTB-207ENST00000462494 P2RX2Q9UBL9 471 aa16.04■□□□□ 0.16
ACTB-207ENST00000462494 WDR37Q9Y2I8 494 aa16.04■□□□□ 0.16
ACTB-207ENST00000462494 PEX16Q9Y5Y5 336 aa16.04■□□□□ 0.16
ACTB-207ENST00000462494 PRAMEF27A3QJZ7 478 aa16.03■□□□□ 0.16
ACTB-207ENST00000462494 TBX19O60806 448 aa16.03■□□□□ 0.16
ACTB-207ENST00000462494 ACP5P13686 325 aa16.03■□□□□ 0.16
ACTB-207ENST00000462494 WASP42768 502 aa16.03■□□□□ 0.16
ACTB-207ENST00000462494 SLC15A1P46059 708 aa16.03■□□□□ 0.16
ACTB-207ENST00000462494 LIMK1P53667 647 aa16.03■□□□□ 0.16
ACTB-207ENST00000462494 PRKCDQ05655 676 aa16.03■□□□□ 0.16
ACTB-207ENST00000462494 UAP1L1Q3KQV9 507 aa16.03■□□□□ 0.16
ACTB-207ENST00000462494 PIP5KL1Q5T9C9 394 aa16.03■□□□□ 0.16
ACTB-207ENST00000462494 NDUFAF5Q5TEU4 345 aa16.03■□□□□ 0.16
ACTB-207ENST00000462494 OR4C11Q6IEV9 310 aa16.03■□□□□ 0.16
ACTB-207ENST00000462494 IQCF1Q8N6M8 205 aa16.03■□□□□ 0.16
ACTB-207ENST00000462494 TCEANCQ8N8B7 351 aa16.03■□□□□ 0.16
ACTB-207ENST00000462494 KLHL6Q8WZ60 621 aa16.03■□□□□ 0.16
ACTB-207ENST00000462494 C12orf66Q96MD2 445 aa16.03■□□□□ 0.16
ACTB-207ENST00000462494 GLIPR2Q9H4G4 154 aa16.03■□□□□ 0.16
ACTB-207ENST00000462494 NME6O75414 186 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
ACTB-207ENST00000462494 GPX5O75715 221 aa16.03■□□□□ 0.16
ACTB-207ENST00000462494 OXSR1O95747 527 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
ACTB-207ENST00000462494 ALPPL2P10696 532 aa16.03■□□□□ 0.16
ACTB-207ENST00000462494 CD72P21854 359 aa16.03■□□□□ 0.16
ACTB-207ENST00000462494 FRKP42685 505 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
ACTB-207ENST00000462494 NCBP2P52298 156 aaKnown RBP eCLIP16.03■□□□□ 0.165e-18■■□□□ 11.9
ACTB-207ENST00000462494 SNRPGP62308 76 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
ACTB-207ENST00000462494 CSNK1G2P78368 415 aa16.03■□□□□ 0.16
ACTB-207ENST00000462494 SLX4IPQ5VYV7 408 aa16.03■□□□□ 0.16
ACTB-207ENST00000462494 RAB11FIP1Q6WKZ4 1283 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
ACTB-207ENST00000462494 FAM92BQ6ZTR7 304 aa16.03■□□□□ 0.16
ACTB-207ENST00000462494 COMTD1Q86VU5 262 aa16.03■□□□□ 0.16
ACTB-207ENST00000462494 RASSF5Q8WWW0 418 aa16.03■□□□□ 0.16
ACTB-207ENST00000462494 OPALINQ96PE5 141 aa16.03■□□□□ 0.16
ACTB-207ENST00000462494 HDAC8Q9BY41 377 aa16.03■□□□□ 0.16
ACTB-207ENST00000462494 MBNL1Q9NR56 388 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
ACTB-207ENST00000462494 CTPS2Q9NRF8 586 aa16.03■□□□□ 0.16
ACTB-207ENST00000462494 ZCCHC3Q9NUD5 404 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
ACTB-207ENST00000462494 IMP3Q9NV31 184 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
ACTB-207ENST00000462494 TVP23BQ9NYZ1 205 aa16.03■□□□□ 0.16
ACTB-207ENST00000462494 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
ACTB-207ENST00000462494 TRPM6Q9BX84 2022 aa16.02■□□□□ 0.16
ACTB-207ENST00000462494 KMOO15229 486 aa16.02■□□□□ 0.16
ACTB-207ENST00000462494 ERAL1O75616 437 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.16
ACTB-207ENST00000462494 PIPP12273 146 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.16
ACTB-207ENST00000462494 CSTF2P33240 577 aaKnown RBP eCLIP16.02■□□□□ 0.16
ACTB-207ENST00000462494 SPANXN2Q5MJ10 180 aa16.02■□□□□ 0.16
ACTB-207ENST00000462494 KLK6Q92876 244 aa16.02■□□□□ 0.16
ACTB-207ENST00000462494 TMEM80Q96HE8 168 aa16.02■□□□□ 0.16
ACTB-207ENST00000462494 CEP19Q96LK0 163 aa16.02■□□□□ 0.16
ACTB-207ENST00000462494 KLHL31Q9H511 634 aa16.02■□□□□ 0.16
ACTB-207ENST00000462494 CPNE5Q9HCH3 593 aa16.02■□□□□ 0.16
ACTB-207ENST00000462494 CFL2Q9Y281 166 aa16.02■□□□□ 0.16
ACTB-207ENST00000462494 CTDSP2O14595 271 aa16.02■□□□□ 0.15
ACTB-207ENST00000462494 MID1O15344 667 aa16.02■□□□□ 0.15
ACTB-207ENST00000462494 CSO75390 466 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.15
ACTB-207ENST00000462494 SPNP16150 400 aa16.02■□□□□ 0.15
ACTB-207ENST00000462494 PPP2R1BP30154 601 aa16.02■□□□□ 0.15
ACTB-207ENST00000462494 CDC20Q12834 499 aa16.02■□□□□ 0.15
ACTB-207ENST00000462494 PODNL1Q6PEZ8 512 aa16.02■□□□□ 0.15
ACTB-207ENST00000462494 KRT73Q86Y46 540 aa16.02■□□□□ 0.15
ACTB-207ENST00000462494 RAB42Q8N4Z0 105 aa16.02■□□□□ 0.15
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