RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000444658.7

CCNDBP1-202, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene CCNDBP1, Length 1,479 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-202ENST00000444658 CBLL1Q75N03 491 aa8.7□□□□□ -1.02
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CCNDBP1-202ENST00000444658 IGLV3-21P80748 117 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
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CCNDBP1-202ENST00000444658 TIPRLO75663 272 aa8.69□□□□□ -1.02
CCNDBP1-202ENST00000444658 OR2B3O76000 313 aa8.69□□□□□ -1.02
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CCNDBP1-202ENST00000444658 CSF2RBP32927 897 aa8.69□□□□□ -1.02
CCNDBP1-202ENST00000444658 GPC1P35052 558 aa8.69□□□□□ -1.02
CCNDBP1-202ENST00000444658 ITGA1P56199 1179 aa8.69□□□□□ -1.02
CCNDBP1-202ENST00000444658 PCBP3P57721 371 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
CCNDBP1-202ENST00000444658 DSTNP60981 165 aa8.69□□□□□ -1.02
CCNDBP1-202ENST00000444658 SNRPNP63162 240 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
CCNDBP1-202ENST00000444658 CDK6Q00534 326 aa8.69□□□□□ -1.02
CCNDBP1-202ENST00000444658 AMZ1Q400G9 498 aa8.69□□□□□ -1.02
CCNDBP1-202ENST00000444658 LARP7Q4G0J3 582 aaKnown RBP eCLIP8.69□□□□□ -1.02
CCNDBP1-202ENST00000444658 COX20Q5RI15 118 aa8.69□□□□□ -1.02
CCNDBP1-202ENST00000444658 REEP3Q6NUK4 255 aa8.69□□□□□ -1.02
CCNDBP1-202ENST00000444658 GUSBP11Q6P575 273 aa8.69□□□□□ -1.02
CCNDBP1-202ENST00000444658 CEACAM20Q6UY09 585 aa8.69□□□□□ -1.02
CCNDBP1-202ENST00000444658 ZBTB49Q6ZSB9 765 aa8.69□□□□□ -1.02
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