RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436759.6

PLEC-208, Transcript of plectin, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PLEC, Length 14,787 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLEC-208ENST00000436759 ACTR10Q9NZ32 417 aa11.5□□□□□ -0.57
PLEC-208ENST00000436759 DTLQ9NZJ0 730 aa11.5□□□□□ -0.57
PLEC-208ENST00000436759 MMP20O60882 483 aa11.5□□□□□ -0.57
PLEC-208ENST00000436759 AMY2AP04746 511 aa11.5□□□□□ -0.57
PLEC-208ENST00000436759 CSF1P09603 554 aa11.5□□□□□ -0.57
PLEC-208ENST00000436759 ARSJQ5FYB0 599 aaPredicted RBP11.5□□□□□ -0.57
PLEC-208ENST00000436759 AWAT2Q6E213 333 aa11.5□□□□□ -0.57
PLEC-208ENST00000436759 ZNF695Q8IW36 515 aa11.5□□□□□ -0.57
PLEC-208ENST00000436759 KCNH6Q9H252 994 aa11.5□□□□□ -0.57
PLEC-208ENST00000436759 GPR137BO60478 399 aa11.5□□□□□ -0.57
PLEC-208ENST00000436759 SPDEFO95238 335 aa11.5□□□□□ -0.57
PLEC-208ENST00000436759 KCNC1P48547 511 aa11.5□□□□□ -0.57
PLEC-208ENST00000436759 MEF2DQ14814 521 aa11.5□□□□□ -0.57
PLEC-208ENST00000436759 MPP7Q5T2T1 576 aa11.5□□□□□ -0.57
PLEC-208ENST00000436759 SFRP4Q6FHJ7 346 aaPredicted RBP11.5□□□□□ -0.57
PLEC-208ENST00000436759 CREB3L2Q70SY1 520 aa11.5□□□□□ -0.57
PLEC-208ENST00000436759 ADAMTS19Q8TE59 1207 aa11.5□□□□□ -0.57
PLEC-208ENST00000436759 SETD7Q8WTS6 366 aaKnown RBP11.5□□□□□ -0.57
PLEC-208ENST00000436759 PRRT1Q99946 306 aa11.5□□□□□ -0.57
PLEC-208ENST00000436759 WDR26Q9H7D7 661 aa11.5□□□□□ -0.57
PLEC-208ENST00000436759 HAS3O00219 553 aa11.5□□□□□ -0.57
PLEC-208ENST00000436759 CCL22O00626 93 aa11.5□□□□□ -0.57
PLEC-208ENST00000436759 GPR143P51810 404 aa11.5□□□□□ -0.57
PLEC-208ENST00000436759 BTN1A1Q13410 526 aa11.5□□□□□ -0.57
PLEC-208ENST00000436759 GK3PQ14409 553 aa11.5□□□□□ -0.57
PLEC-208ENST00000436759 ZDHHC12Q96GR4 267 aa11.5□□□□□ -0.57
PLEC-208ENST00000436759 TSGA13Q96PP4 275 aa11.5□□□□□ -0.57
PLEC-208ENST00000436759 A0A0G2JN53 185 aa11.49□□□□□ -0.57
PLEC-208ENST00000436759 TNFP01375 233 aa11.49□□□□□ -0.57
PLEC-208ENST00000436759 PROS1P07225 676 aa11.49□□□□□ -0.57
PLEC-208ENST00000436759 HLA-EP13747 358 aa11.49□□□□□ -0.57
PLEC-208ENST00000436759 AGAP7PQ5VUJ5 663 aa11.49□□□□□ -0.57
PLEC-208ENST00000436759 AGAP6Q5VW22 663 aa11.49□□□□□ -0.57
PLEC-208ENST00000436759 DESI1Q6ICB0 168 aa11.49□□□□□ -0.57
PLEC-208ENST00000436759 CNIH2Q6PI25 160 aa11.49□□□□□ -0.57
PLEC-208ENST00000436759 RASGRP3Q8IV61 690 aa11.49□□□□□ -0.57
PLEC-208ENST00000436759 ZNF611Q8N823 705 aa11.49□□□□□ -0.57
PLEC-208ENST00000436759 OR10Q1Q8NGQ4 319 aa11.49□□□□□ -0.57
PLEC-208ENST00000436759 TMEM234Q8WY98 164 aa11.49□□□□□ -0.57
PLEC-208ENST00000436759 FKBP10Q96AY3 582 aa11.49□□□□□ -0.57
PLEC-208ENST00000436759 MSI2Q96DH6 328 aaKnown RBP11.49□□□□□ -0.57
PLEC-208ENST00000436759 AGAP4Q96P64 663 aa11.49□□□□□ -0.57
PLEC-208ENST00000436759 POLDIP3Q9BY77 421 aaKnown RBP11.49□□□□□ -0.57
PLEC-208ENST00000436759 JCADQ9P266 1359 aa11.49□□□□□ -0.57
PLEC-208ENST00000436759 A0A0D9SG52 128 aa11.49□□□□□ -0.57
PLEC-208ENST00000436759 CXorf49A8MYA2 514 aaPredicted RBP11.49□□□□□ -0.57
PLEC-208ENST00000436759 OR1D2P34982 312 aa11.49□□□□□ -0.57
PLEC-208ENST00000436759 MMP12P39900 470 aa11.49□□□□□ -0.57
PLEC-208ENST00000436759 AMZ1Q400G9 498 aa11.49□□□□□ -0.57
PLEC-208ENST00000436759 RFPL4BQ6ZWI9 263 aa11.49□□□□□ -0.57
PLEC-208ENST00000436759 SLC24A5Q71RS6 500 aa11.49□□□□□ -0.57
PLEC-208ENST00000436759 TRAM1L1Q8N609 369 aa11.49□□□□□ -0.57
PLEC-208ENST00000436759 OR6N2Q8NGY6 317 aa11.49□□□□□ -0.57
PLEC-208ENST00000436759 CNTNAP3Q9BZ76 1288 aa11.49□□□□□ -0.57
PLEC-208ENST00000436759 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP11.49□□□□□ -0.57
PLEC-208ENST00000436759 TRBV23OR9-2A0A075B6M9 112 aa11.49□□□□□ -0.57
PLEC-208ENST00000436759 LYRM1O43325 122 aa11.49□□□□□ -0.57
PLEC-208ENST00000436759 UNGP13051 313 aaPredicted RBP11.49□□□□□ -0.57
PLEC-208ENST00000436759 TRIM23P36406 574 aa11.49□□□□□ -0.57
PLEC-208ENST00000436759 ENPP5Q9UJA9 477 aa11.49□□□□□ -0.57
PLEC-208ENST00000436759 OPN1SWP03999 348 aa11.49□□□□□ -0.57
PLEC-208ENST00000436759 RAB6AP20340 208 aa11.49□□□□□ -0.57
PLEC-208ENST00000436759 SCNN1AP37088 669 aa11.49□□□□□ -0.57
PLEC-208ENST00000436759 CRTC1Q6UUV9 634 aa11.49□□□□□ -0.57
PLEC-208ENST00000436759 SMAP2Q8WU79 429 aaPredicted RBP11.49□□□□□ -0.57
PLEC-208ENST00000436759 TMEM233B4DJY2 109 aa11.49□□□□□ -0.57
PLEC-208ENST00000436759 POU6F2P78424 691 aaPredicted RBP11.49□□□□□ -0.57
PLEC-208ENST00000436759 GALPQ9UBC7 116 aa11.49□□□□□ -0.57
PLEC-208ENST00000436759 A0A1W2PPL8 197 aa11.49□□□□□ -0.57
PLEC-208ENST00000436759 SCAMP1O15126 338 aa11.49□□□□□ -0.57
PLEC-208ENST00000436759 LIPJQ5W064 366 aa11.49□□□□□ -0.57
PLEC-208ENST00000436759 CEP290O15078 2479 aa11.49□□□□□ -0.57
PLEC-208ENST00000436759 SLC22A5O76082 557 aa11.49□□□□□ -0.57
PLEC-208ENST00000436759 CHRNA4P43681 627 aa11.49□□□□□ -0.57
PLEC-208ENST00000436759 PROX2Q3B8N5 592 aa11.49□□□□□ -0.57
PLEC-208ENST00000436759 DPY19L4Q7Z388 723 aa11.49□□□□□ -0.57
PLEC-208ENST00000436759 DNTTIP1Q9H147 329 aa11.49□□□□□ -0.57
PLEC-208ENST00000436759 SALL4Q9UJQ4 1053 aa11.49□□□□□ -0.57
PLEC-208ENST00000436759 UBFD1O14562 309 aaKnown RBP11.49□□□□□ -0.57
PLEC-208ENST00000436759 SERPINE2P07093 398 aa11.49□□□□□ -0.57
PLEC-208ENST00000436759 GDF10P55107 478 aa11.49□□□□□ -0.57
PLEC-208ENST00000436759 ZNF705AQ6ZN79 300 aaPredicted RBP11.49□□□□□ -0.57
PLEC-208ENST00000436759 MMAAQ8IVH4 418 aaKnown RBP11.49□□□□□ -0.57
PLEC-208ENST00000436759 ABHD11Q8NFV4 315 aa11.49□□□□□ -0.57
PLEC-208ENST00000436759 DCUN1D4Q92564 292 aa11.49□□□□□ -0.57
PLEC-208ENST00000436759 TEX10Q9NXF1 929 aaPredicted RBP11.49□□□□□ -0.57
PLEC-208ENST00000436759 RHOP08100 348 aa11.49□□□□□ -0.57
PLEC-208ENST00000436759 BMP2P12643 396 aa11.49□□□□□ -0.57
PLEC-208ENST00000436759 ZNF442Q9H7R0 627 aa11.49□□□□□ -0.57
PLEC-208ENST00000436759 KHNYNO15037 678 aaKnown RBP11.49□□□□□ -0.57
PLEC-208ENST00000436759 RSU1Q15404 277 aa11.49□□□□□ -0.57
PLEC-208ENST00000436759 LRCH3Q96II8 777 aa11.49□□□□□ -0.57
PLEC-208ENST00000436759 UNC13CQ8NB66 2214 aa11.49□□□□□ -0.57
PLEC-208ENST00000436759 EIF2DP41214 584 aaKnown RBP11.49□□□□□ -0.57
PLEC-208ENST00000436759 ZNF763Q0D2J5 394 aa11.49□□□□□ -0.57
PLEC-208ENST00000436759 FAM205BPQ63HN1 556 aa11.49□□□□□ -0.57
PLEC-208ENST00000436759 ZNF425Q6IV72 752 aa11.49□□□□□ -0.57
PLEC-208ENST00000436759 ZNF585AQ6P3V2 769 aa11.49□□□□□ -0.57
PLEC-208ENST00000436759 ABHD5Q8WTS1 349 aa11.49□□□□□ -0.57
PLEC-208ENST00000436759 SMIM28A0A1B0GU29 152 aa11.48□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 64.2 ms