RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000414700.7

SHMT2-202, Transcript of serine hydroxymethyltransferase 2, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SHMT2, Length 2,006 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHMT2-202ENST00000414700 MIEF1Q9NQG6 463 aa14.64□□□□□ -0.07
SHMT2-202ENST00000414700 CUTCQ9NTM9 273 aa14.64□□□□□ -0.07
SHMT2-202ENST00000414700 TMEM45AQ9NWC5 275 aa14.64□□□□□ -0.07
SHMT2-202ENST00000414700 SERTAD3Q9UJW9 196 aa14.64□□□□□ -0.07
SHMT2-202ENST00000414700 FAM32AQ9Y421 112 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
SHMT2-202ENST00000414700 MAU2Q9Y6X3 613 aa14.64□□□□□ -0.07
SHMT2-202ENST00000414700 A0A1W2PS29 197 aa14.63□□□□□ -0.07
SHMT2-202ENST00000414700 EFCAB7A8K855 629 aa14.63□□□□□ -0.07
SHMT2-202ENST00000414700 SCN2BO60939 215 aa14.63□□□□□ -0.07
SHMT2-202ENST00000414700 IL6P05231 212 aa14.63□□□□□ -0.07
SHMT2-202ENST00000414700 ALAS2P22557 587 aa14.63□□□□□ -0.07
SHMT2-202ENST00000414700 CSTF2P33240 577 aaKnown RBP eCLIP14.63□□□□□ -0.07
SHMT2-202ENST00000414700 S100A3P33764 101 aa14.63□□□□□ -0.07
SHMT2-202ENST00000414700 HPCAL1P37235 193 aa14.63□□□□□ -0.07
SHMT2-202ENST00000414700 KIR3DL1P43629 444 aa14.63□□□□□ -0.07
SHMT2-202ENST00000414700 MS4A2Q01362 244 aa14.63□□□□□ -0.07
SHMT2-202ENST00000414700 KCNC4Q03721 635 aa14.63□□□□□ -0.07
SHMT2-202ENST00000414700 FAM53BQ14153 422 aa14.63□□□□□ -0.07
SHMT2-202ENST00000414700 HEPACAMQ14CZ8 416 aa14.63□□□□□ -0.07
SHMT2-202ENST00000414700 KCTD21Q4G0X4 260 aa14.63□□□□□ -0.07
SHMT2-202ENST00000414700 CPTPQ5TA50 214 aa14.63□□□□□ -0.07
SHMT2-202ENST00000414700 KIAA2013Q8IYS2 634 aa14.63□□□□□ -0.07
SHMT2-202ENST00000414700 CENPSQ8N2Z9 138 aa14.63□□□□□ -0.07
SHMT2-202ENST00000414700 BMPERQ8N8U9 685 aa14.63□□□□□ -0.07
SHMT2-202ENST00000414700 SCAIQ8N9R8 606 aa14.63□□□□□ -0.07
SHMT2-202ENST00000414700 FAM47BQ8NA70 645 aa14.63□□□□□ -0.07
SHMT2-202ENST00000414700 SLC38A9Q8NBW4 561 aa14.63□□□□□ -0.07
SHMT2-202ENST00000414700 OR8J2Q8NGG1 315 aa14.63□□□□□ -0.07
SHMT2-202ENST00000414700 CHPT1Q8WUD6 406 aa14.63□□□□□ -0.07
SHMT2-202ENST00000414700 ZDHHC19Q8WVZ1 309 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
SHMT2-202ENST00000414700 PMEPA1Q969W9 287 aa14.63□□□□□ -0.07
SHMT2-202ENST00000414700 TRIM8Q9BZR9 551 aa14.63□□□□□ -0.07
SHMT2-202ENST00000414700 ENAMQ9NRM1 1142 aa14.63□□□□□ -0.07
SHMT2-202ENST00000414700 SLC6A13Q9NSD5 602 aa14.63□□□□□ -0.07
SHMT2-202ENST00000414700 OLAHQ9NV23 265 aa14.63□□□□□ -0.07
SHMT2-202ENST00000414700 HCN3Q9P1Z3 774 aa14.63□□□□□ -0.07
SHMT2-202ENST00000414700 ATP6V1HQ9UI12 483 aa14.63□□□□□ -0.07
SHMT2-202ENST00000414700 CCDC88CQ9P219 2028 aa14.63□□□□□ -0.07
SHMT2-202ENST00000414700 A0A087WXM4 84 aa14.63□□□□□ -0.07
SHMT2-202ENST00000414700 PMS2P1A4D2B8 440 aa14.63□□□□□ -0.07
SHMT2-202ENST00000414700 FAM227AF5H4B4 570 aa14.63□□□□□ -0.07
SHMT2-202ENST00000414700 FOXD2O60548 495 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
SHMT2-202ENST00000414700 TMED10P49755 219 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
SHMT2-202ENST00000414700 HNRNPFP52597 415 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
SHMT2-202ENST00000414700 TRA2BP62995 288 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
SHMT2-202ENST00000414700 SHC2P98077 582 aa14.63□□□□□ -0.07
SHMT2-202ENST00000414700 ACY1Q03154 408 aa14.63□□□□□ -0.07
SHMT2-202ENST00000414700 GARNL3Q5VVW2 1013 aa14.63□□□□□ -0.07
SHMT2-202ENST00000414700 PWWP2BQ6NUJ5 590 aa14.63□□□□□ -0.07
SHMT2-202ENST00000414700 DNAJC14Q6Y2X3 702 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
SHMT2-202ENST00000414700 CLECL1Q8IZS7 167 aa14.63□□□□□ -0.07
SHMT2-202ENST00000414700 CA13Q8N1Q1 262 aa14.63□□□□□ -0.07
SHMT2-202ENST00000414700 TMEM52Q8NDY8 209 aa14.63□□□□□ -0.07
SHMT2-202ENST00000414700 TSPEARQ8WU66 669 aa14.63□□□□□ -0.07
SHMT2-202ENST00000414700 GTF2H4Q92759 462 aa14.63□□□□□ -0.07
SHMT2-202ENST00000414700 PPCDCQ96CD2 204 aa14.63□□□□□ -0.07
SHMT2-202ENST00000414700 COQ8BQ96D53 544 aa14.63□□□□□ -0.07
SHMT2-202ENST00000414700 MMABQ96EY8 250 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
SHMT2-202ENST00000414700 GPATCH1Q9BRR8 931 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
SHMT2-202ENST00000414700 INPP5KQ9BT40 448 aa14.63□□□□□ -0.07
SHMT2-202ENST00000414700 DUSP26Q9BV47 211 aa14.63□□□□□ -0.07
SHMT2-202ENST00000414700 RBCK1Q9BYM8 510 aa14.63□□□□□ -0.07
SHMT2-202ENST00000414700 ROGDIQ9GZN7 287 aa14.63□□□□□ -0.07
SHMT2-202ENST00000414700 COQ10BQ9H8M1 238 aa14.63□□□□□ -0.07
SHMT2-202ENST00000414700 EFCAB1Q9HAE3 211 aa14.63□□□□□ -0.07
SHMT2-202ENST00000414700 FANCEQ9HB96 536 aa14.63□□□□□ -0.07
SHMT2-202ENST00000414700 SERHLQ9NQF3 203 aa14.63□□□□□ -0.07
SHMT2-202ENST00000414700 NDOR1Q9UHB4 597 aa14.63□□□□□ -0.07
SHMT2-202ENST00000414700 SPAARA0A1B0GVQ0 90 aa14.62□□□□□ -0.07
SHMT2-202ENST00000414700 FXYD1O00168 92 aa14.62□□□□□ -0.07
SHMT2-202ENST00000414700 ACOT8O14734 319 aa14.62□□□□□ -0.07
SHMT2-202ENST00000414700 CFLARO15519 480 aa14.62□□□□□ -0.07
SHMT2-202ENST00000414700 NSA2O95478 260 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
SHMT2-202ENST00000414700 ITIH1P19827 911 aa14.62□□□□□ -0.07
SHMT2-202ENST00000414700 ZNF10P21506 573 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
SHMT2-202ENST00000414700 CDKN2CP42773 168 aa14.62□□□□□ -0.07
SHMT2-202ENST00000414700 OR1D4P47884 311 aa14.62□□□□□ -0.07
SHMT2-202ENST00000414700 SRSF11Q05519 484 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
SHMT2-202ENST00000414700 ILKQ13418 452 aa14.62□□□□□ -0.07
SHMT2-202ENST00000414700 TRA2AQ13595 282 aaKnown RBP eCLIP14.62□□□□□ -0.07
SHMT2-202ENST00000414700 MAPKAPK3Q16644 382 aa14.62□□□□□ -0.07
SHMT2-202ENST00000414700 NRF1Q16656 503 aa14.62□□□□□ -0.07
SHMT2-202ENST00000414700 NDUFA9Q16795 377 aa14.62□□□□□ -0.07
SHMT2-202ENST00000414700 ZNF750Q32MQ0 723 aa14.62□□□□□ -0.07
SHMT2-202ENST00000414700 CAMKMTQ7Z624 323 aa14.62□□□□□ -0.07
SHMT2-202ENST00000414700 TTC29Q8NA56 475 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
SHMT2-202ENST00000414700 AGBL5Q8NDL9 886 aa14.62□□□□□ -0.07
SHMT2-202ENST00000414700 TBC1D15Q8TC07 691 aa14.62□□□□□ -0.07
SHMT2-202ENST00000414700 EXOSC8Q96B26 276 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
SHMT2-202ENST00000414700 DCUN1D5Q9BTE7 237 aa14.62□□□□□ -0.07
SHMT2-202ENST00000414700 ANKRD60Q9BZ19 345 aa14.62□□□□□ -0.07
SHMT2-202ENST00000414700 SLAMF7Q9NQ25 335 aa14.62□□□□□ -0.07
SHMT2-202ENST00000414700 LEF1Q9UJU2 399 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
SHMT2-202ENST00000414700 BBIP1A8MTZ0 92 aa14.61□□□□□ -0.07
SHMT2-202ENST00000414700 CHST10O43529 356 aa14.61□□□□□ -0.07
SHMT2-202ENST00000414700 C1QCP02747 245 aa14.61□□□□□ -0.07
SHMT2-202ENST00000414700 INHBBP09529 407 aa14.61□□□□□ -0.07
SHMT2-202ENST00000414700 CPN2P22792 545 aa14.61□□□□□ -0.07
SHMT2-202ENST00000414700 CCKBRP32239 447 aa14.61□□□□□ -0.07
SHMT2-202ENST00000414700 SIM1P81133 766 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.2 ms