RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000400772.6

ATG4B-203, Transcript of autophagy related 4B cysteine peptidase, humanhuman

TSL 4

Gene ATG4B, Length 625 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4B-203ENST00000400772 ART5Q96L15 291 aa14.66□□□□□ -0.06
ATG4B-203ENST00000400772 PHF12Q96QT6 1004 aa14.66□□□□□ -0.06
ATG4B-203ENST00000400772 ZNF382Q96SR6 550 aa14.66□□□□□ -0.06
ATG4B-203ENST00000400772 HBEGFQ99075 208 aa14.66□□□□□ -0.06
ATG4B-203ENST00000400772 PELOQ9BRX2 385 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
ATG4B-203ENST00000400772 CNPPD1Q9BV87 410 aa14.66□□□□□ -0.06
ATG4B-203ENST00000400772 CXorf21Q9HAI6 301 aa14.66□□□□□ -0.06
ATG4B-203ENST00000400772 PLSCR2Q9NRY7 297 aa14.66□□□□□ -0.06
ATG4B-203ENST00000400772 SUCOQ9UBS9 1254 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
ATG4B-203ENST00000400772 CES1P1Q9UKY3 287 aa14.66□□□□□ -0.06
ATG4B-203ENST00000400772 PCDHA9Q9Y5H5 950 aa14.66□□□□□ -0.06
ATG4B-203ENST00000400772 EML6Q6ZMW3 1958 aa14.65□□□□□ -0.06
ATG4B-203ENST00000400772 A0A1B0GTH9 108 aa14.65□□□□□ -0.06
ATG4B-203ENST00000400772 G3V2L1 256 aa14.65□□□□□ -0.06
ATG4B-203ENST00000400772 G3V3Y1 287 aa14.65□□□□□ -0.06
ATG4B-203ENST00000400772 TFECO14948 347 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
ATG4B-203ENST00000400772 DYRK3O43781 588 aa14.65□□□□□ -0.06
ATG4B-203ENST00000400772 GLSO94925 669 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
ATG4B-203ENST00000400772 CT62P0C5K7 136 aa14.65□□□□□ -0.06
ATG4B-203ENST00000400772 CCL3P10147 92 aa14.65□□□□□ -0.06
ATG4B-203ENST00000400772 CHN1P15882 459 aa14.65□□□□□ -0.06
ATG4B-203ENST00000400772 CNR1P21554 472 aa14.65□□□□□ -0.06
ATG4B-203ENST00000400772 TNFRSF8P28908 595 aa14.65□□□□□ -0.06
ATG4B-203ENST00000400772 XKP51811 444 aa14.65□□□□□ -0.06
ATG4B-203ENST00000400772 CASP6P55212 293 aa14.65□□□□□ -0.06
ATG4B-203ENST00000400772 RASA2Q15283 850 aa14.65□□□□□ -0.06
ATG4B-203ENST00000400772 ZNF791Q3KP31 576 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
ATG4B-203ENST00000400772 OPN5Q6U736 354 aa14.65□□□□□ -0.06
ATG4B-203ENST00000400772 PAGE2Q7Z2X7 111 aa14.65□□□□□ -0.06
ATG4B-203ENST00000400772 MRGPRGQ86SM5 289 aa14.65□□□□□ -0.06
ATG4B-203ENST00000400772 SLC22A9Q8IVM8 553 aa14.65□□□□□ -0.06
ATG4B-203ENST00000400772 MMP21Q8N119 569 aa14.65□□□□□ -0.06
ATG4B-203ENST00000400772 OR4K14Q8NGD5 310 aa14.65□□□□□ -0.06
ATG4B-203ENST00000400772 CHTF18Q8WVB6 975 aa14.65□□□□□ -0.06
ATG4B-203ENST00000400772 SGCZQ96LD1 299 aa14.65□□□□□ -0.06
ATG4B-203ENST00000400772 DCDC2Q9UHG0 476 aa14.65□□□□□ -0.06
ATG4B-203ENST00000400772 MEMO1Q9Y316 297 aa14.65□□□□□ -0.06
ATG4B-203ENST00000400772 HRH3Q9Y5N1 445 aa14.65□□□□□ -0.06
ATG4B-203ENST00000400772 MAST4O15021 2626 aa14.64□□□□□ -0.07
ATG4B-203ENST00000400772 ADAM10O14672 748 aa14.64□□□□□ -0.07
ATG4B-203ENST00000400772 ABOP16442 354 aa14.64□□□□□ -0.07
ATG4B-203ENST00000400772 PIK3R1P27986 724 aa14.64□□□□□ -0.07
ATG4B-203ENST00000400772 SSTR4P31391 388 aa14.64□□□□□ -0.07
ATG4B-203ENST00000400772 SLCO1A2P46721 670 aa14.64□□□□□ -0.07
ATG4B-203ENST00000400772 MAPK12P53778 367 aa14.64□□□□□ -0.07
ATG4B-203ENST00000400772 FUT7Q11130 342 aa14.64□□□□□ -0.07
ATG4B-203ENST00000400772 FOXO1Q12778 655 aa14.64□□□□□ -0.07
ATG4B-203ENST00000400772 EBPQ15125 230 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
ATG4B-203ENST00000400772 MTFR2Q6P444 385 aa14.64□□□□□ -0.07
ATG4B-203ENST00000400772 RNF111Q6ZNA4 994 aa14.64□□□□□ -0.07
ATG4B-203ENST00000400772 GPRIN3Q6ZVF9 776 aa14.64□□□□□ -0.07
ATG4B-203ENST00000400772 NCCRP1Q6ZVX7 275 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
ATG4B-203ENST00000400772 ZNF808Q8N4W9 903 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
ATG4B-203ENST00000400772 SLC15A4Q8N697 577 aa14.64□□□□□ -0.07
ATG4B-203ENST00000400772 ZNF441Q8N8Z8 693 aa14.64□□□□□ -0.07
ATG4B-203ENST00000400772 AGAP11Q8TF27 550 aa14.64□□□□□ -0.07
ATG4B-203ENST00000400772 UBLCP1Q8WVY7 318 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
ATG4B-203ENST00000400772 TTTY12Q9BZ98 90 aa14.64□□□□□ -0.07
ATG4B-203ENST00000400772 WWTR1Q9GZV5 400 aa14.64□□□□□ -0.07
ATG4B-203ENST00000400772 DEFB127Q9H1M4 99 aa14.64□□□□□ -0.07
ATG4B-203ENST00000400772 GSTO2Q9H4Y5 243 aa14.64□□□□□ -0.07
ATG4B-203ENST00000400772 ANKZF1Q9H8Y5 726 aa14.64□□□□□ -0.07
ATG4B-203ENST00000400772 SDAD1Q9NVU7 687 aaKnown RBP eCLIP14.64□□□□□ -0.079e-11■□□□□ 9.3
ATG4B-203ENST00000400772 VPS29Q9UBQ0 182 aa14.64□□□□□ -0.07
ATG4B-203ENST00000400772 CACNA1DQ01668 2161 aa14.64□□□□□ -0.07
ATG4B-203ENST00000400772 NCOA6Q14686 2063 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
ATG4B-203ENST00000400772 OR6C76A6NM76 312 aa14.63□□□□□ -0.07
ATG4B-203ENST00000400772 FAM166BA8MTA8 275 aa14.63□□□□□ -0.07
ATG4B-203ENST00000400772 UBFD1O14562 309 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
ATG4B-203ENST00000400772 CDC40O60508 579 aaKnown RBP eCLIP14.63□□□□□ -0.07
ATG4B-203ENST00000400772 PDE9AO76083 593 aa14.63□□□□□ -0.07
ATG4B-203ENST00000400772 ESRRAP11474 423 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
ATG4B-203ENST00000400772 CPMP14384 443 aa14.63□□□□□ -0.07
ATG4B-203ENST00000400772 S1PR1P21453 382 aa14.63□□□□□ -0.07
ATG4B-203ENST00000400772 GRNP28799 593 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
ATG4B-203ENST00000400772 SOX18P35713 384 aa14.63□□□□□ -0.07
ATG4B-203ENST00000400772 DNASE1L1P49184 302 aa14.63□□□□□ -0.07
ATG4B-203ENST00000400772 HTR6P50406 440 aa14.63□□□□□ -0.07
ATG4B-203ENST00000400772 PPIAP62937 165 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
ATG4B-203ENST00000400772 MGAT2Q10469 447 aa14.63□□□□□ -0.07
ATG4B-203ENST00000400772 ART3Q13508 389 aa14.63□□□□□ -0.07
ATG4B-203ENST00000400772 CDSNQ15517 529 aa14.63□□□□□ -0.07
ATG4B-203ENST00000400772 SP5Q6BEB4 398 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
ATG4B-203ENST00000400772 SLC48A1Q6P1K1 146 aa14.63□□□□□ -0.07
ATG4B-203ENST00000400772 RPTNQ6XPR3 784 aa14.63□□□□□ -0.07
ATG4B-203ENST00000400772 SLC29A4Q7RTT9 530 aa14.63□□□□□ -0.07
ATG4B-203ENST00000400772 TDRPQ86YL5 185 aa14.63□□□□□ -0.07
ATG4B-203ENST00000400772 CNPY4Q8N129 248 aa14.63□□□□□ -0.07
ATG4B-203ENST00000400772 C1orf52Q8N6N3 182 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
ATG4B-203ENST00000400772 ZNF615Q8N8J6 731 aa14.63□□□□□ -0.07
ATG4B-203ENST00000400772 METTL6Q8TCB7 284 aa14.63□□□□□ -0.07
ATG4B-203ENST00000400772 SLC22A8Q8TCC7 542 aa14.63□□□□□ -0.07
ATG4B-203ENST00000400772 PAQR8Q8TEZ7 354 aa14.63□□□□□ -0.07
ATG4B-203ENST00000400772 SPACA9Q96E40 222 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
ATG4B-203ENST00000400772 GAL3ST4Q96RP7 486 aa14.63□□□□□ -0.07
ATG4B-203ENST00000400772 KCNA7Q96RP8 456 aa14.63□□□□□ -0.07
ATG4B-203ENST00000400772 FAM173AQ9BQD7 235 aa14.63□□□□□ -0.07
ATG4B-203ENST00000400772 ACPTQ9BZG2 426 aa14.63□□□□□ -0.07
ATG4B-203ENST00000400772 C12orf65Q9H3J6 166 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
ATG4B-203ENST00000400772 ZDHHC11Q9H8X9 412 aa14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 81.8 ms