RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000396308.3

VAMP1-202, Transcript of vesicle associated membrane protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene VAMP1, Length 1,113 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP1-202ENST00000396308 TXNL4AP83876 142 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
VAMP1-202ENST00000396308 VAC14Q08AM6 782 aa14.48□□□□□ -0.09
VAMP1-202ENST00000396308 FADDQ13158 208 aa14.48□□□□□ -0.09
VAMP1-202ENST00000396308 GAB1Q13480 694 aa14.48□□□□□ -0.09
VAMP1-202ENST00000396308 TP53BP2Q13625 1128 aa14.48□□□□□ -0.09
VAMP1-202ENST00000396308 PRAMEF17Q5VTA0 474 aa14.48□□□□□ -0.09
VAMP1-202ENST00000396308 FAM180BQ6P0A1 224 aa14.48□□□□□ -0.09
VAMP1-202ENST00000396308 ERICH5Q6P6B1 374 aa14.48□□□□□ -0.09
VAMP1-202ENST00000396308 QSOX2Q6ZRP7 698 aa14.48□□□□□ -0.09
VAMP1-202ENST00000396308 IFNEQ86WN2 208 aa14.48□□□□□ -0.09
VAMP1-202ENST00000396308 HPS6Q86YV9 775 aa14.48□□□□□ -0.09
VAMP1-202ENST00000396308 RNF148Q8N7C7 305 aa14.48□□□□□ -0.09
VAMP1-202ENST00000396308 OR2T12Q8NG77 320 aa14.48□□□□□ -0.09
VAMP1-202ENST00000396308 PSMA8Q8TAA3 256 aa14.48□□□□□ -0.09
VAMP1-202ENST00000396308 UCN3Q969E3 161 aa14.48□□□□□ -0.09
VAMP1-202ENST00000396308 FKBP10Q96AY3 582 aa14.48□□□□□ -0.09
VAMP1-202ENST00000396308 SLC35G5Q96KT7 338 aa14.48□□□□□ -0.09
VAMP1-202ENST00000396308 LRGUKQ96M69 825 aa14.48□□□□□ -0.09
VAMP1-202ENST00000396308 LRFN5Q96NI6 719 aa14.48□□□□□ -0.09
VAMP1-202ENST00000396308 CXorf36Q9H7Y0 433 aa14.48□□□□□ -0.09
VAMP1-202ENST00000396308 APMAPQ9HDC9 416 aa14.48□□□□□ -0.09
VAMP1-202ENST00000396308 SLAMF7Q9NQ25 335 aa14.48□□□□□ -0.09
VAMP1-202ENST00000396308 ZCCHC3Q9NUD5 404 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
VAMP1-202ENST00000396308 DDX18Q9NVP1 670 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
VAMP1-202ENST00000396308 CMTM6Q9NX76 183 aa14.48□□□□□ -0.09
VAMP1-202ENST00000396308 TOR4AQ9NXH8 423 aa14.48□□□□□ -0.09
VAMP1-202ENST00000396308 SLC7A8Q9UHI5 535 aa14.48□□□□□ -0.09
VAMP1-202ENST00000396308 NXT1Q9UKK6 140 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
VAMP1-202ENST00000396308 SPTBP11277 2137 aa14.48□□□□□ -0.09
VAMP1-202ENST00000396308 SPAARA0A1B0GVQ0 90 aa14.47□□□□□ -0.09
VAMP1-202ENST00000396308 TMEM247A6NEH6 219 aa14.47□□□□□ -0.09
VAMP1-202ENST00000396308 FAM220BPB1ANY3 271 aa14.47□□□□□ -0.09
VAMP1-202ENST00000396308 EMC8O43402 210 aa14.47□□□□□ -0.09
VAMP1-202ENST00000396308 TIAF1O95411 115 aa14.47□□□□□ -0.09
VAMP1-202ENST00000396308 CD63P08962 238 aa14.47□□□□□ -0.09
VAMP1-202ENST00000396308 IFI6P09912 130 aa14.47□□□□□ -0.09
VAMP1-202ENST00000396308 SLC35E2P0CK97 266 aa14.47□□□□□ -0.09
VAMP1-202ENST00000396308 HOXB9P17482 250 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
VAMP1-202ENST00000396308 PTPN6P29350 595 aa14.47□□□□□ -0.09
VAMP1-202ENST00000396308 GSK3BP49841 420 aa14.47□□□□□ -0.09
VAMP1-202ENST00000396308 KHKP50053 298 aa14.47□□□□□ -0.09
VAMP1-202ENST00000396308 CDK9P50750 372 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
VAMP1-202ENST00000396308 NOVA1P51513 510 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
VAMP1-202ENST00000396308 ID2Q02363 134 aa14.47□□□□□ -0.09
VAMP1-202ENST00000396308 CEACAM7Q14002 265 aa14.47□□□□□ -0.09
VAMP1-202ENST00000396308 COL9A2Q14055 689 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
VAMP1-202ENST00000396308 FLOT2Q14254 428 aa14.47□□□□□ -0.09
VAMP1-202ENST00000396308 PRSS53Q2L4Q9 553 aa14.47□□□□□ -0.09
VAMP1-202ENST00000396308 TMEM107Q6UX40 140 aa14.47□□□□□ -0.09
VAMP1-202ENST00000396308 MED25Q71SY5 747 aa14.47□□□□□ -0.09
VAMP1-202ENST00000396308 OR4N5Q8IXE1 308 aa14.47□□□□□ -0.09
VAMP1-202ENST00000396308 MSRB3Q8IXL7 192 aa14.47□□□□□ -0.09
VAMP1-202ENST00000396308 ST13P4Q8IZP2 240 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
VAMP1-202ENST00000396308 OR52N2Q8NGI0 321 aa14.47□□□□□ -0.09
VAMP1-202ENST00000396308 OR9A2Q8NGT5 310 aa14.47□□□□□ -0.09
VAMP1-202ENST00000396308 OR5AK3PQ8NH89 298 aa14.47□□□□□ -0.09
VAMP1-202ENST00000396308 PNPT1Q8TCS8 783 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
VAMP1-202ENST00000396308 ZFP90Q8TF47 636 aa14.47□□□□□ -0.09
VAMP1-202ENST00000396308 ZDHHC19Q8WVZ1 309 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
VAMP1-202ENST00000396308 JADE3Q92613 823 aa14.47□□□□□ -0.09
VAMP1-202ENST00000396308 STMN2Q93045 179 aa14.47□□□□□ -0.09
VAMP1-202ENST00000396308 UTP4Q969X6 686 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
VAMP1-202ENST00000396308 ASB9Q96DX5 294 aa14.47□□□□□ -0.09
VAMP1-202ENST00000396308 AURKBQ96GD4 344 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
VAMP1-202ENST00000396308 RBM18Q96H35 190 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
VAMP1-202ENST00000396308 ZNF681Q96N22 645 aa14.47□□□□□ -0.09
VAMP1-202ENST00000396308 PTCHD1Q96NR3 888 aa14.47□□□□□ -0.09
VAMP1-202ENST00000396308 THUMPD1Q9NXG2 353 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
VAMP1-202ENST00000396308 PTGFRNQ9P2B2 879 aa14.47□□□□□ -0.09
VAMP1-202ENST00000396308 MAGEL2Q9UJ55 1249 aa14.47□□□□□ -0.09
VAMP1-202ENST00000396308 SPTBN4Q9H254 2564 aa14.47□□□□□ -0.09
VAMP1-202ENST00000396308 ZFHX2Q9C0A1 2572 aaPredicted RBP14.46□□□□□ -0.09
VAMP1-202ENST00000396308 MEN1O00255 615 aa14.46□□□□□ -0.09
VAMP1-202ENST00000396308 COQ9O75208 318 aa14.46□□□□□ -0.09
VAMP1-202ENST00000396308 IFNA16P05015 189 aa14.46□□□□□ -0.09
VAMP1-202ENST00000396308 CRATP43155 626 aa14.46□□□□□ -0.09
VAMP1-202ENST00000396308 TRAP1Q12931 704 aaKnown RBP14.46□□□□□ -0.09
VAMP1-202ENST00000396308 ZNF750Q32MQ0 723 aa14.46□□□□□ -0.09
VAMP1-202ENST00000396308 C3orf38Q5JPI3 329 aa14.46□□□□□ -0.09
VAMP1-202ENST00000396308 PGM2L1Q6PCE3 622 aa14.46□□□□□ -0.09
VAMP1-202ENST00000396308 SERPINA11Q86U17 422 aa14.46□□□□□ -0.09
VAMP1-202ENST00000396308 ZC3H7AQ8IWR0 971 aaKnown RBP14.46□□□□□ -0.09
VAMP1-202ENST00000396308 GALNT12Q8IXK2 581 aa14.46□□□□□ -0.09
VAMP1-202ENST00000396308 CACTIN-AS1Q8N1I8 211 aa14.46□□□□□ -0.09
VAMP1-202ENST00000396308 TMEM52Q8NDY8 209 aa14.46□□□□□ -0.09
VAMP1-202ENST00000396308 FAM13CQ8NE31 585 aa14.46□□□□□ -0.09
VAMP1-202ENST00000396308 OR10A6Q8NH74 314 aa14.46□□□□□ -0.09
VAMP1-202ENST00000396308 SUN3Q8TAQ9 357 aa14.46□□□□□ -0.09
VAMP1-202ENST00000396308 MR1Q95460 341 aa14.46□□□□□ -0.09
VAMP1-202ENST00000396308 ANKRD9Q96BM1 317 aaPredicted RBP14.46□□□□□ -0.09
VAMP1-202ENST00000396308 NEURL3Q96EH8 262 aa14.46□□□□□ -0.09
VAMP1-202ENST00000396308 REXO5Q96IC2 774 aaKnown RBP14.46□□□□□ -0.09
VAMP1-202ENST00000396308 MAGED4Q96JG8 741 aa14.46□□□□□ -0.09
VAMP1-202ENST00000396308 ZNF578Q96N58 590 aaPredicted RBP14.46□□□□□ -0.09
VAMP1-202ENST00000396308 MS4A4EQ96PG1 132 aa14.46□□□□□ -0.09
VAMP1-202ENST00000396308 TRIM8Q9BZR9 551 aa14.46□□□□□ -0.09
VAMP1-202ENST00000396308 TGIF2Q9GZN2 237 aa14.46□□□□□ -0.09
VAMP1-202ENST00000396308 KAT8Q9H7Z6 458 aaKnown RBP14.46□□□□□ -0.09
VAMP1-202ENST00000396308 SLC6A13Q9NSD5 602 aa14.46□□□□□ -0.09
VAMP1-202ENST00000396308 PACSIN3Q9UKS6 424 aa14.46□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.1 ms