RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000379565.7

RPS6KA3-201, Transcript of ribosomal protein S6 kinase A3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RPS6KA3, Length 7,918 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KA3-201ENST00000379565 LRIG1Q96JA1 1093 aa16.74■□□□□ 0.27
RPS6KA3-201ENST00000379565 ANKRD34BA5PLL1 514 aa16.74■□□□□ 0.27
RPS6KA3-201ENST00000379565 POLR1CO15160 346 aaPredicted RBP16.74■□□□□ 0.27
RPS6KA3-201ENST00000379565 PROS1P07225 676 aa16.74■□□□□ 0.27
RPS6KA3-201ENST00000379565 FIGLAQ6QHK4 219 aa16.74■□□□□ 0.27
RPS6KA3-201ENST00000379565 LARP4Q71RC2 724 aaKnown RBP eCLIP16.74■□□□□ 0.274e-6■■■□□ 17.7
RPS6KA3-201ENST00000379565 ANKK1Q8NFD2 765 aa16.74■□□□□ 0.27
RPS6KA3-201ENST00000379565 TRBV21OR9-2A0A075B6F4 123 aaPredicted RBP16.74■□□□□ 0.27
RPS6KA3-201ENST00000379565 PIGRP01833 764 aa16.74■□□□□ 0.27
RPS6KA3-201ENST00000379565 APLNRP35414 380 aa16.74■□□□□ 0.27
RPS6KA3-201ENST00000379565 ASTE1Q2TB18 679 aaPredicted RBP16.74■□□□□ 0.27
RPS6KA3-201ENST00000379565 KRTCAP2Q8N6L1 136 aa16.74■□□□□ 0.27
RPS6KA3-201ENST00000379565 TAMM41Q96BW9 452 aa16.74■□□□□ 0.27
RPS6KA3-201ENST00000379565 C1orf226A1L170 272 aa16.74■□□□□ 0.27
RPS6KA3-201ENST00000379565 B8ZZF3 427 aa16.74■□□□□ 0.27
RPS6KA3-201ENST00000379565 SHOXO15266 292 aa16.74■□□□□ 0.27
RPS6KA3-201ENST00000379565 RIDAP52758 137 aaKnown RBP16.74■□□□□ 0.27
RPS6KA3-201ENST00000379565 RABL3Q5HYI8 236 aa16.74■□□□□ 0.27
RPS6KA3-201ENST00000379565 GID4Q8IVV7 300 aa16.74■□□□□ 0.27
RPS6KA3-201ENST00000379565 SLC37A3Q8NCC5 494 aa16.74■□□□□ 0.27
RPS6KA3-201ENST00000379565 URM1Q9BTM9 101 aaKnown RBP16.74■□□□□ 0.27
RPS6KA3-201ENST00000379565 TRIM64CA6NLI5 447 aa16.73■□□□□ 0.27
RPS6KA3-201ENST00000379565 FAM163BP0C2L3 166 aa16.73■□□□□ 0.27
RPS6KA3-201ENST00000379565 APCDD1Q8J025 514 aa16.73■□□□□ 0.27
RPS6KA3-201ENST00000379565 OR5T1Q8NG75 326 aa16.73■□□□□ 0.27
RPS6KA3-201ENST00000379565 ASB9Q96DX5 294 aa16.73■□□□□ 0.27
RPS6KA3-201ENST00000379565 SIX2Q9NPC8 291 aa16.73■□□□□ 0.27
RPS6KA3-201ENST00000379565 ENAMQ9NRM1 1142 aa16.73■□□□□ 0.27
RPS6KA3-201ENST00000379565 MGAT4BQ9UQ53 548 aa16.73■□□□□ 0.27
RPS6KA3-201ENST00000379565 DFNA5O60443 496 aa16.73■□□□□ 0.27
RPS6KA3-201ENST00000379565 IFNA5P01569 189 aa16.73■□□□□ 0.27
RPS6KA3-201ENST00000379565 ZNF43P17038 809 aa16.73■□□□□ 0.27
RPS6KA3-201ENST00000379565 SIM1P81133 766 aaPredicted RBP16.73■□□□□ 0.27
RPS6KA3-201ENST00000379565 RBPJQ06330 500 aa16.73■□□□□ 0.27
RPS6KA3-201ENST00000379565 TMEM201Q5SNT2 666 aa16.73■□□□□ 0.27
RPS6KA3-201ENST00000379565 TMEM69Q5SWH9 247 aa16.73■□□□□ 0.27
RPS6KA3-201ENST00000379565 OR4C11Q6IEV9 310 aa16.73■□□□□ 0.27
RPS6KA3-201ENST00000379565 OR2T33Q8NG76 320 aa16.73■□□□□ 0.27
RPS6KA3-201ENST00000379565 IGSF8Q969P0 613 aa16.73■□□□□ 0.27
RPS6KA3-201ENST00000379565 K7ERQ8 282 aa16.73■□□□□ 0.27
RPS6KA3-201ENST00000379565 RTCAO00442 366 aaKnown RBP16.73■□□□□ 0.27
RPS6KA3-201ENST00000379565 MAFKO60675 156 aa16.73■□□□□ 0.27
RPS6KA3-201ENST00000379565 EMX2Q04743 252 aa16.73■□□□□ 0.27
RPS6KA3-201ENST00000379565 ABHD18Q0P651 414 aa16.73■□□□□ 0.27
RPS6KA3-201ENST00000379565 TRIM73Q86UV7 250 aa16.73■□□□□ 0.27
RPS6KA3-201ENST00000379565 ZNF610Q8N9Z0 462 aa16.73■□□□□ 0.27
RPS6KA3-201ENST00000379565 ACTR6Q9GZN1 396 aa16.73■□□□□ 0.27
RPS6KA3-201ENST00000379565 CWH43Q9H720 699 aa16.73■□□□□ 0.27
RPS6KA3-201ENST00000379565 NANSQ9NR45 359 aa16.73■□□□□ 0.27
RPS6KA3-201ENST00000379565 RXFP3Q9NSD7 469 aa16.73■□□□□ 0.27
RPS6KA3-201ENST00000379565 GPRC5BQ9NZH0 403 aa16.73■□□□□ 0.27
RPS6KA3-201ENST00000379565 DNAJB11Q9UBS4 358 aa16.73■□□□□ 0.27
RPS6KA3-201ENST00000379565 TPTEP56180 551 aa16.73■□□□□ 0.27
RPS6KA3-201ENST00000379565 ZSWIM9Q86XI8 627 aa16.73■□□□□ 0.27
RPS6KA3-201ENST00000379565 OR5B2Q96R09 309 aa16.73■□□□□ 0.27
RPS6KA3-201ENST00000379565 HERPUD2Q9BSE4 406 aa16.73■□□□□ 0.27
RPS6KA3-201ENST00000379565 CMAHPQ9Y471 501 aa16.73■□□□□ 0.27
RPS6KA3-201ENST00000379565 PCDHGB6Q9Y5F9 930 aa16.73■□□□□ 0.27
RPS6KA3-201ENST00000379565 NFE2L1Q14494 772 aa16.73■□□□□ 0.27
RPS6KA3-201ENST00000379565 HSD17B12Q53GQ0 312 aa16.73■□□□□ 0.27
RPS6KA3-201ENST00000379565 DCDC5Q6ZRR9 648 aa16.73■□□□□ 0.27
RPS6KA3-201ENST00000379565 C2orf42Q9NWW7 574 aa16.73■□□□□ 0.27
RPS6KA3-201ENST00000379565 DMWDQ09019 674 aa16.73■□□□□ 0.27
RPS6KA3-201ENST00000379565 KCNJ11Q14654 390 aa16.73■□□□□ 0.27
RPS6KA3-201ENST00000379565 RHEBQ15382 184 aa16.73■□□□□ 0.27
RPS6KA3-201ENST00000379565 MTFR2Q6P444 385 aa16.73■□□□□ 0.27
RPS6KA3-201ENST00000379565 UEVLDQ8IX04 471 aa16.73■□□□□ 0.27
RPS6KA3-201ENST00000379565 KCND1Q9NSA2 647 aa16.73■□□□□ 0.27
RPS6KA3-201ENST00000379565 COPZ2Q9P299 210 aa16.73■□□□□ 0.27
RPS6KA3-201ENST00000379565 UBE2J1Q9Y385 318 aaPredicted RBP16.73■□□□□ 0.27
RPS6KA3-201ENST00000379565 SLC22A1O15245 554 aa16.72■□□□□ 0.27
RPS6KA3-201ENST00000379565 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP16.72■□□□□ 0.27
RPS6KA3-201ENST00000379565 PRR22Q8IZ63 422 aa16.72■□□□□ 0.27
RPS6KA3-201ENST00000379565 S100PBPQ96BU1 408 aa16.72■□□□□ 0.27
RPS6KA3-201ENST00000379565 BIRC7Q96CA5 298 aa16.72■□□□□ 0.27
RPS6KA3-201ENST00000379565 KCMF1Q9P0J7 381 aa16.72■□□□□ 0.27
RPS6KA3-201ENST00000379565 FPR1P21462 350 aa16.72■□□□□ 0.27
RPS6KA3-201ENST00000379565 FNTBP49356 437 aa16.72■□□□□ 0.27
RPS6KA3-201ENST00000379565 CES4AQ5XG92 561 aa16.72■□□□□ 0.27
RPS6KA3-201ENST00000379565 KCNK12Q9HB15 430 aa16.72■□□□□ 0.27
RPS6KA3-201ENST00000379565 PPM1BO75688 479 aa16.72■□□□□ 0.27
RPS6KA3-201ENST00000379565 AKR1C2P52895 323 aa16.72■□□□□ 0.27
RPS6KA3-201ENST00000379565 RHDQ02161 417 aa16.72■□□□□ 0.27
RPS6KA3-201ENST00000379565 MFSD13AQ14CX5 517 aa16.72■□□□□ 0.27
RPS6KA3-201ENST00000379565 BCL2L15Q5TBC7 163 aa16.72■□□□□ 0.27
RPS6KA3-201ENST00000379565 TMPRSS12Q86WS5 348 aa16.72■□□□□ 0.27
RPS6KA3-201ENST00000379565 OR10T2Q8NGX3 314 aa16.72■□□□□ 0.27
RPS6KA3-201ENST00000379565 SGTBQ96EQ0 304 aa16.72■□□□□ 0.27
RPS6KA3-201ENST00000379565 UNCXA6NJT0 531 aa16.72■□□□□ 0.27
RPS6KA3-201ENST00000379565 ZNF783Q6ZMS7 281 aa16.72■□□□□ 0.27
RPS6KA3-201ENST00000379565 FAM159BA6NKW6 160 aa16.72■□□□□ 0.27
RPS6KA3-201ENST00000379565 MAGEA8P43361 318 aa16.72■□□□□ 0.27
RPS6KA3-201ENST00000379565 TUBB3Q13509 450 aa16.72■□□□□ 0.27
RPS6KA3-201ENST00000379565 SF3B4Q15427 424 aaKnown RBP eCLIP16.72■□□□□ 0.272e-18■■■■■ 53.7
RPS6KA3-201ENST00000379565 C2CD4AQ8NCU7 369 aaPredicted RBP16.72■□□□□ 0.27
RPS6KA3-201ENST00000379565 MAN2C1Q9NTJ4 1040 aa16.72■□□□□ 0.27
RPS6KA3-201ENST00000379565 FRKP42685 505 aaPredicted RBP16.72■□□□□ 0.27
RPS6KA3-201ENST00000379565 SLC25A11Q02978 314 aaKnown RBP16.72■□□□□ 0.27
RPS6KA3-201ENST00000379565 ZNF678Q5SXM1 525 aa16.72■□□□□ 0.27
RPS6KA3-201ENST00000379565 AADACL4Q5VUY2 407 aa16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45 ms