RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000379445.7

CTXN3-201, Transcript of cortexin 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTXN3, Length 1,660 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3-201ENST00000379445 TMEM178AQ8NBL3 297 aa6.51□□□□□ -1.37
CTXN3-201ENST00000379445 NFAM1Q8NET5 270 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
CTXN3-201ENST00000379445 CEP70Q8NHQ1 597 aa6.51□□□□□ -1.37
CTXN3-201ENST00000379445 ADAMTS15Q8TE58 950 aa6.51□□□□□ -1.37
CTXN3-201ENST00000379445 CREB3L4Q8TEY5 395 aa6.51□□□□□ -1.37
CTXN3-201ENST00000379445 ATL1Q8WXF7 558 aa6.51□□□□□ -1.37
CTXN3-201ENST00000379445 RAX2Q96IS3 184 aa6.51□□□□□ -1.37
CTXN3-201ENST00000379445 TSNARE1Q96NA8 513 aa6.51□□□□□ -1.37
CTXN3-201ENST00000379445 TRIM51Q9BSJ1 452 aa6.51□□□□□ -1.37
CTXN3-201ENST00000379445 TRIM45Q9H8W5 580 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
CTXN3-201ENST00000379445 PELI2Q9HAT8 420 aa6.51□□□□□ -1.37
CTXN3-201ENST00000379445 CLK4Q9HAZ1 481 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
CTXN3-201ENST00000379445 SMURF1Q9HCE7 757 aa6.51□□□□□ -1.37
CTXN3-201ENST00000379445 FRRS1LQ9P0K9 344 aa6.51□□□□□ -1.37
CTXN3-201ENST00000379445 CHMP2BQ9UQN3 213 aa6.51□□□□□ -1.37
CTXN3-201ENST00000379445 VWA7Q9Y334 891 aa6.51□□□□□ -1.37
CTXN3-201ENST00000379445 PSAT1Q9Y617 370 aa6.51□□□□□ -1.37
CTXN3-201ENST00000379445 ATP23Q9Y6H3 246 aa6.51□□□□□ -1.37
CTXN3-201ENST00000379445 TEX264Q9Y6I9 313 aa6.51□□□□□ -1.37
CTXN3-201ENST00000379445 NPIPA5E9PKD4 350 aa6.5□□□□□ -1.37
CTXN3-201ENST00000379445 LINC01387J3KSC0 135 aa6.5□□□□□ -1.37
CTXN3-201ENST00000379445 CDC7O00311 574 aa6.5□□□□□ -1.37
CTXN3-201ENST00000379445 NDC80O14777 642 aa6.5□□□□□ -1.37
CTXN3-201ENST00000379445 NME2P1O60361 137 aa6.5□□□□□ -1.37
CTXN3-201ENST00000379445 B4GALT2O60909 372 aa6.5□□□□□ -1.37
CTXN3-201ENST00000379445 SLC25A12O75746 678 aa6.5□□□□□ -1.37
CTXN3-201ENST00000379445 SERPIND1P05546 499 aa6.5□□□□□ -1.37
CTXN3-201ENST00000379445 SP1P08047 785 aa6.5□□□□□ -1.37
CTXN3-201ENST00000379445 PORP16435 677 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
CTXN3-201ENST00000379445 AGAP20933 346 aa6.5□□□□□ -1.37
CTXN3-201ENST00000379445 MAOAP21397 527 aa6.5□□□□□ -1.37
CTXN3-201ENST00000379445 HTR1EP28566 365 aa6.5□□□□□ -1.37
CTXN3-201ENST00000379445 TPP2P29144 1249 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
CTXN3-201ENST00000379445 TRHRP34981 398 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
CTXN3-201ENST00000379445 PTGER4P35408 488 aa6.5□□□□□ -1.37
CTXN3-201ENST00000379445 RAB8AP61006 207 aa6.5□□□□□ -1.37
CTXN3-201ENST00000379445 BTG2P78543 158 aa6.5□□□□□ -1.37
CTXN3-201ENST00000379445 OC90Q02509 493 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
CTXN3-201ENST00000379445 ACTN3Q08043 901 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
CTXN3-201ENST00000379445 CSHL1Q14406 222 aa6.5□□□□□ -1.37
CTXN3-201ENST00000379445 SLBPQ14493 270 aaKnown RBP eCLIP6.5□□□□□ -1.37
CTXN3-201ENST00000379445 KRTCAP3Q53RY4 240 aa6.5□□□□□ -1.37
CTXN3-201ENST00000379445 HP1BP3Q5SSJ5 553 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
CTXN3-201ENST00000379445 SLC25A25Q6KCM7 469 aa6.5□□□□□ -1.37
CTXN3-201ENST00000379445 XKRXQ6PP77 449 aa6.5□□□□□ -1.37
CTXN3-201ENST00000379445 ABHD13Q7L211 337 aa6.5□□□□□ -1.37
CTXN3-201ENST00000379445 THOC6Q86W42 341 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
CTXN3-201ENST00000379445 ZC3HC1Q86WB0 502 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
CTXN3-201ENST00000379445 RPS19BP1Q86WX3 136 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
CTXN3-201ENST00000379445 SPPL2CQ8IUH8 684 aa6.5□□□□□ -1.37
CTXN3-201ENST00000379445 KLHDC8AQ8IYD2 350 aa6.5□□□□□ -1.37
CTXN3-201ENST00000379445 PDIK1LQ8N165 341 aa6.5□□□□□ -1.37
CTXN3-201ENST00000379445 TBC1D19Q8N5T2 526 aa6.5□□□□□ -1.37
CTXN3-201ENST00000379445 APCDD1LQ8NCL9 501 aa6.5□□□□□ -1.37
CTXN3-201ENST00000379445 TOR1AIP2Q8NFQ8 470 aa6.5□□□□□ -1.37
CTXN3-201ENST00000379445 GOT1L1Q8NHS2 421 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
CTXN3-201ENST00000379445 ANKRD7Q92527 254 aa6.5□□□□□ -1.37
CTXN3-201ENST00000379445 LRRC39Q96DD0 335 aa6.5□□□□□ -1.37
CTXN3-201ENST00000379445 CFAP36Q96G28 342 aa6.5□□□□□ -1.37
CTXN3-201ENST00000379445 SLC35A4Q96G79 324 aa6.5□□□□□ -1.37
CTXN3-201ENST00000379445 MAGED4Q96JG8 741 aa6.5□□□□□ -1.37
CTXN3-201ENST00000379445 COG8Q96MW5 612 aa6.5□□□□□ -1.37
CTXN3-201ENST00000379445 PTCHD1Q96NR3 888 aa6.5□□□□□ -1.37
CTXN3-201ENST00000379445 TRIM54Q9BYV2 358 aa6.5□□□□□ -1.37
CTXN3-201ENST00000379445 KLHL31Q9H511 634 aa6.5□□□□□ -1.37
CTXN3-201ENST00000379445 CDCP1Q9H5V8 836 aa6.5□□□□□ -1.37
CTXN3-201ENST00000379445 SAYSD1Q9NPB0 183 aa6.5□□□□□ -1.37
CTXN3-201ENST00000379445 CHST11Q9NPF2 352 aa6.5□□□□□ -1.37
CTXN3-201ENST00000379445 NECTIN3Q9NQS3 549 aa6.5□□□□□ -1.37
CTXN3-201ENST00000379445 NPIPA1Q9UND3 350 aa6.5□□□□□ -1.37
CTXN3-201ENST00000379445 SLC22A14Q9Y267 594 aa6.5□□□□□ -1.37
CTXN3-201ENST00000379445 CLDN16Q9Y5I7 305 aa6.5□□□□□ -1.37
CTXN3-201ENST00000379445 NPEPPSL1A6NEC2 478 aa6.49□□□□□ -1.37
CTXN3-201ENST00000379445 H0Y3Z8 333 aa6.49□□□□□ -1.37
CTXN3-201ENST00000379445 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa6.49□□□□□ -1.37
CTXN3-201ENST00000379445 ASNA1O43681 348 aa6.49□□□□□ -1.37
CTXN3-201ENST00000379445 SEC31AO94979 1220 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
CTXN3-201ENST00000379445 WISP3O95389 354 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
CTXN3-201ENST00000379445 MLYCDO95822 493 aa6.49□□□□□ -1.37
CTXN3-201ENST00000379445 TBX6O95947 436 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
CTXN3-201ENST00000379445 SERPINA6P08185 405 aa6.49□□□□□ -1.37
CTXN3-201ENST00000379445 BMP4P12644 408 aa6.49□□□□□ -1.37
CTXN3-201ENST00000379445 RNH1P13489 461 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
CTXN3-201ENST00000379445 ZNF24P17028 368 aa6.49□□□□□ -1.37
CTXN3-201ENST00000379445 TCP1P17987 556 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
CTXN3-201ENST00000379445 HNF4AP41235 474 aa6.49□□□□□ -1.37
CTXN3-201ENST00000379445 SLC6A12P48065 614 aa6.49□□□□□ -1.37
CTXN3-201ENST00000379445 MANFP55145 182 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
CTXN3-201ENST00000379445 TPD52P55327 224 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
CTXN3-201ENST00000379445 MLF1P58340 268 aa6.49□□□□□ -1.37
CTXN3-201ENST00000379445 TAS2R39P59534 338 aa6.49□□□□□ -1.37
CTXN3-201ENST00000379445 CDKL1Q00532 357 aa6.49□□□□□ -1.37
CTXN3-201ENST00000379445 HSF1Q00613 529 aa6.49□□□□□ -1.37
CTXN3-201ENST00000379445 FASTKD3Q14CZ7 662 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
CTXN3-201ENST00000379445 SLCO4C1Q6ZQN7 724 aa6.49□□□□□ -1.37
CTXN3-201ENST00000379445 NCCRP1Q6ZVX7 275 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
CTXN3-201ENST00000379445 GDF7Q7Z4P5 450 aa6.49□□□□□ -1.37
CTXN3-201ENST00000379445 UBE3DQ7Z6J8 389 aa6.49□□□□□ -1.37
CTXN3-201ENST00000379445 PNPLA5Q7Z6Z6 429 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
CTXN3-201ENST00000379445 EPHX4Q8IUS5 362 aa6.49□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.4 ms