RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000365488.1

RNU6-652P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 652, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-652P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-652P-201ENST00000365488 ZNF273Q14593 569 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-652P-201ENST00000365488 MEF2DQ14814 521 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-652P-201ENST00000365488 PSMD6Q15008 389 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-652P-201ENST00000365488 BRD3Q15059 726 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-652P-201ENST00000365488 SNAPC1Q16533 368 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-652P-201ENST00000365488 MICAQ29983 383 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-652P-201ENST00000365488 C15orf59Q2T9L4 293 aaPredicted RBP-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-652P-201ENST00000365488 FAM174BQ3ZCQ3 159 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-652P-201ENST00000365488 GLYR1Q49A26 553 aaPredicted RBP-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-652P-201ENST00000365488 IQCCQ4KMZ1 466 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-652P-201ENST00000365488 UNC50Q53HI1 259 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-652P-201ENST00000365488 C5orf47Q569G3 176 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-652P-201ENST00000365488 OR2B11Q5JQS5 317 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-652P-201ENST00000365488 CASC10Q5T4H9 136 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-652P-201ENST00000365488 PRR9Q5T870 116 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-652P-201ENST00000365488 SEL1L2Q5TEA6 688 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-652P-201ENST00000365488 TSPO2Q5TGU0 170 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-652P-201ENST00000365488 LIPJQ5W064 366 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-652P-201ENST00000365488 ZNF57Q68EA5 555 aaPredicted RBP-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-652P-201ENST00000365488 CYB5R2Q6BCY4 276 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-652P-201ENST00000365488 MOXD1Q6UVY6 613 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-652P-201ENST00000365488 TMCO3Q6UWJ1 677 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-652P-201ENST00000365488 C2orf66Q6UXQ4 117 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-652P-201ENST00000365488 ZBTB49Q6ZSB9 765 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-652P-201ENST00000365488 RFLNAQ6ZTI6 216 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-652P-201ENST00000365488 RFPL4BQ6ZWI9 263 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-652P-201ENST00000365488 CYP4V2Q6ZWL3 525 aaPredicted RBP-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-652P-201ENST00000365488 Q71RC1 249 aaPredicted RBP-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-652P-201ENST00000365488 DET1Q7L5Y6 550 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-652P-201ENST00000365488 SZRD1Q7Z422 152 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-652P-201ENST00000365488 GPR142Q7Z601 462 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-652P-201ENST00000365488 GLRX5Q86SX6 157 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-652P-201ENST00000365488 OAFQ86UD1 273 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-652P-201ENST00000365488 NLRP14Q86W24 1093 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-652P-201ENST00000365488 UNC5CLQ8IV45 518 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-652P-201ENST00000365488 MFN1Q8IWA4 741 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-652P-201ENST00000365488 SLC43A2Q8N370 569 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-652P-201ENST00000365488 RNF182Q8N6D2 247 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-652P-201ENST00000365488 GVQW1Q8N7I0 195 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-652P-201ENST00000365488 PDILTQ8N807 584 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-652P-201ENST00000365488 TMEM99Q8N816 258 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-652P-201ENST00000365488 Q8N976 141 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-652P-201ENST00000365488 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-652P-201ENST00000365488 LINC00304Q8N9R0 145 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-652P-201ENST00000365488 C20orf203Q8NBC4 194 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-652P-201ENST00000365488 XXYLT1Q8NBI6 393 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-652P-201ENST00000365488 RNF149Q8NC42 400 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-652P-201ENST00000365488 CAMKVQ8NCB2 501 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-652P-201ENST00000365488 NAXEQ8NCW5 288 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-652P-201ENST00000365488 Q8NFD4 153 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-652P-201ENST00000365488 TSPAN14Q8NG11 270 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-652P-201ENST00000365488 OR2L5Q8NG80 312 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-652P-201ENST00000365488 OR4C15Q8NGM1 316 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-652P-201ENST00000365488 OR1K1Q8NGR3 316 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-652P-201ENST00000365488 CCDC26Q8TAB7 109 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-652P-201ENST00000365488 NEIL3Q8TAT5 605 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-652P-201ENST00000365488 UBALD1Q8TB05 177 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-652P-201ENST00000365488 TFB1MQ8WVM0 346 aaKnown RBP-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-652P-201ENST00000365488 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-652P-201ENST00000365488 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-652P-201ENST00000365488 RAD54LQ92698 747 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-652P-201ENST00000365488 ESR2Q92731 530 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-652P-201ENST00000365488 SMARCD2Q92925 531 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-652P-201ENST00000365488 DLX4Q92988 240 aaPredicted RBP-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-652P-201ENST00000365488 EXT2Q93063 718 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-652P-201ENST00000365488 TSACCQ96A04 125 aaPredicted RBP-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-652P-201ENST00000365488 BPIFA2Q96DR5 249 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-652P-201ENST00000365488 RAB3CQ96E17 227 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-652P-201ENST00000365488 FAM120BQ96EK7 910 aaKnown RBP-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-652P-201ENST00000365488 SAT2Q96F10 170 aaPredicted RBP-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-652P-201ENST00000365488 SIPA1Q96FS4 1042 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-652P-201ENST00000365488 TIMD4Q96H15 378 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-652P-201ENST00000365488 PCED1BQ96HM7 432 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-652P-201ENST00000365488 RSRC1Q96IZ7 334 aaKnown RBP-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-652P-201ENST00000365488 EPSTI1Q96J88 318 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-652P-201ENST00000365488 RPGRIP1Q96KN7 1286 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-652P-201ENST00000365488 MAGEB18Q96M61 343 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-652P-201ENST00000365488 C9orf85Q96MD7 179 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-652P-201ENST00000365488 IL4I1Q96RQ9 567 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-652P-201ENST00000365488 SPIN2AQ99865 258 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-652P-201ENST00000365488 SSX3Q99909 188 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-652P-201ENST00000365488 SPIN2BQ9BPZ2 258 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-652P-201ENST00000365488 TREX2Q9BQ50 279 aaPredicted RBP-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-652P-201ENST00000365488 ZNF559Q9BR84 538 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-652P-201ENST00000365488 CHCHD6Q9BRQ6 235 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-652P-201ENST00000365488 ZNF2Q9BSG1 426 aaPredicted RBP-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-652P-201ENST00000365488 RNF126Q9BV68 326 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-652P-201ENST00000365488 KATNB1Q9BVA0 655 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-652P-201ENST00000365488 OSBPL11Q9BXB4 747 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-652P-201ENST00000365488 TRIM9Q9C026 710 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-652P-201ENST00000365488 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-652P-201ENST00000365488 ANKRD2Q9GZV1 360 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-652P-201ENST00000365488 VCXQ9H320 206 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-652P-201ENST00000365488 TPK1Q9H3S4 243 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-652P-201ENST00000365488 EHD1Q9H4M9 534 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-652P-201ENST00000365488 ZDHHC6Q9H6R6 413 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-652P-201ENST00000365488 SH2D4AQ9H788 454 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-652P-201ENST00000365488 Q9HAA7 133 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-652P-201ENST00000365488 LMAN1LQ9HAT1 526 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-652P-201ENST00000365488 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP-0.07□□□□□ -2.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.1 ms