RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000348564.10

PTPRC-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 4,626 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-201ENST00000348564 YRDCQ86U90 279 aaKnown RBP4.18□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 ANKRD46Q86W74 232 aa4.18□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 TDRPQ86YL5 185 aa4.18□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 CREB3L4Q8TEY5 395 aa4.18□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 TMEM234Q8WY98 164 aa4.18□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 OR52E6Q96RD3 313 aa4.18□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 SPATA5L1Q9BVQ7 753 aa4.18□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 GID8Q9NWU2 228 aa4.18□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 BAIAP2L1Q9UHR4 511 aa4.18□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 TRAF6Q9Y4K3 522 aa4.18□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 TMEM184BQ9Y519 407 aaPredicted RBP4.18□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 ORC6Q9Y5N6 252 aa4.18□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 CHD7Q9P2D1 2997 aa4.18□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 DOCK4Q8N1I0 1966 aa4.18□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 C2orf72A6NCS6 295 aa4.18□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 EIF1AYO14602 144 aaKnown RBP4.18□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 SERPINA6P08185 405 aa4.18□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 IL10P22301 178 aa4.18□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 POU1F1P28069 291 aa4.18□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 AQP1P29972 269 aa4.18□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 ADSLP30566 484 aaPredicted RBP4.18□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 PKNOX1P55347 436 aa4.18□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 PCDH1Q08174 1060 aa4.18□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 MERTKQ12866 999 aa4.18□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 ZNF169Q14929 603 aaPredicted RBP4.18□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 CLEC6AQ6EIG7 209 aa4.18□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 LCTLQ6UWM7 567 aa4.18□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 CYP4Z1Q86W10 505 aa4.18□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 GHDCQ8N2G8 530 aa4.18□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 LNX2Q8N448 690 aa4.18□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 HUS1BQ8NHY5 278 aa4.18□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 TCP10LQ8TDR4 215 aa4.18□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 FAR1Q8WVX9 515 aa4.18□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 CRELD1Q96HD1 420 aa4.18□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 SENP5Q96HI0 755 aaPredicted RBP4.18□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 TPD52L3Q96J77 140 aa4.18□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 SLC35G5Q96KT7 338 aa4.18□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 RANBP9Q96S59 729 aa4.18□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 HES7Q9BYE0 225 aa4.18□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 SERHLQ9NQF3 203 aa4.18□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 ZNF358Q9NW07 568 aa4.18□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 FETUBQ9UGM5 382 aa4.18□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 LGALS13Q9UHV8 139 aa4.18□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 ZNF180Q9UJW8 692 aa4.18□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 AURKCQ9UQB9 309 aa4.18□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 A0A1B0GUH1 482 aa4.18□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 C1orf226A1L170 272 aa4.18□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 MAGEB17A8MXT2 336 aa4.18□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 SERPINB7O75635 380 aa4.18□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 AHSA1O95433 338 aa4.18□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 TCN1P20061 433 aaPredicted RBP4.18□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 BGNP21810 368 aa4.18□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 TEAD1P28347 426 aa4.18□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 MDH1P40925 334 aaKnown RBP4.18□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 EEFSECP57772 596 aaKnown RBP4.18□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 TGFBR3Q03167 851 aa4.18□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 PLP2Q04941 152 aa4.18□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 SLC14A2Q15849 920 aa4.18□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 TBR1Q16650 682 aa4.18□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 ZXDCQ2QGD7 858 aaPredicted RBP4.18□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 FGD3Q5JSP0 725 aa4.18□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 ARHGAP11AQ6P4F7 1023 aa4.18□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 MEX3BQ6ZN04 569 aaKnown RBP4.18□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 RIPOR1Q6ZS17 1223 aa4.18□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 CDHR3Q6ZTQ4 885 aa4.18□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 ZNF595Q8IYB9 648 aa4.18□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 LRRC25Q8N386 305 aaPredicted RBP4.18□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 VWA5B2Q8N398 1253 aa4.18□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 FDCSPQ8NFU4 85 aa4.18□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 OR4F6Q8NGB9 312 aa4.18□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 OR14A16Q8NHC5 309 aa4.18□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 CAPSLQ8WWF8 208 aa4.18□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 STMN2Q93045 179 aa4.18□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 ARL5BQ96KC2 179 aa4.18□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 NSMCE3Q96MG7 304 aa4.18□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 TRIB3Q96RU7 358 aa4.18□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 SLC30A3Q99726 388 aa4.18□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 PRDM9Q9NQV7 894 aa4.18□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 C1orf109Q9NX04 203 aa4.18□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 GALNT8Q9NY28 637 aa4.18□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 CCDC167Q9P0B6 97 aa4.18□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 BLACEA4D250 179 aa4.18□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 OR5H15A6NDH6 313 aa4.18□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 ELOA3DA6NLF2 546 aaPredicted RBP4.18□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 ERVH48-1M5A8F1 160 aa4.18□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 GNLYP22749 145 aa4.18□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 RPS3P23396 243 aaKnown RBP eCLIP4.18□□□□□ -1.742e-7■■■□□ 15.8
PTPRC-201ENST00000348564 DNASE1L1P49184 302 aa4.18□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 NUDT2P50583 147 aa4.18□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 FOXL2P58012 376 aa4.18□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 MRPS35P82673 323 aaKnown RBP4.18□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 ELOA3BQ3SY89 546 aa4.18□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 C9orf135Q5VTT2 229 aa4.18□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 C1QL3Q5VWW1 255 aa4.18□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 CYS1Q717R9 158 aa4.18□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 BTLAQ7Z6A9 289 aa4.18□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 PATL1Q86TB9 770 aaKnown RBP4.18□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 ULK2Q8IYT8 1036 aa4.18□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 ARHGAP24Q8N264 748 aa4.18□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 ZNF619Q8N2I2 560 aa4.18□□□□□ -1.74
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