RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000320857.7

SSR4-201, Transcript of signal sequence receptor subunit 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene SSR4, Length 1,671 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSR4-201ENST00000320857 OR12D1P0DN82 309 aa16.04■□□□□ 0.16
SSR4-201ENST00000320857 CPN2P22792 545 aa16.04■□□□□ 0.16
SSR4-201ENST00000320857 CD27P26842 260 aa16.04■□□□□ 0.16
SSR4-201ENST00000320857 GSTT1P30711 240 aa16.04■□□□□ 0.16
SSR4-201ENST00000320857 PRR5P85299 388 aa16.04■□□□□ 0.16
SSR4-201ENST00000320857 TNFRSF17Q02223 184 aa16.04■□□□□ 0.16
SSR4-201ENST00000320857 HHEXQ03014 270 aa16.04■□□□□ 0.16
SSR4-201ENST00000320857 C1orf61Q13536 156 aa16.04■□□□□ 0.16
SSR4-201ENST00000320857 RPS26P11Q5JNZ5 115 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
SSR4-201ENST00000320857 MANEAQ5SRI9 462 aa16.04■□□□□ 0.16
SSR4-201ENST00000320857 C6orf141Q5SZD1 244 aa16.04■□□□□ 0.16
SSR4-201ENST00000320857 SIX5Q8N196 739 aa16.04■□□□□ 0.16
SSR4-201ENST00000320857 AVL9Q8NBF6 648 aa16.04■□□□□ 0.16
SSR4-201ENST00000320857 CHDHQ8NE62 594 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
SSR4-201ENST00000320857 FAM46DQ8NEK8 389 aa16.04■□□□□ 0.16
SSR4-201ENST00000320857 ZCCHC10Q8TBK6 192 aa16.04■□□□□ 0.16
SSR4-201ENST00000320857 NCSTNQ92542 709 aa16.04■□□□□ 0.16
SSR4-201ENST00000320857 PIP5K1AQ99755 562 aa16.04■□□□□ 0.16
SSR4-201ENST00000320857 ADNPQ9H2P0 1102 aa16.04■□□□□ 0.16
SSR4-201ENST00000320857 SERHL2Q9H4I8 314 aa16.04■□□□□ 0.16
SSR4-201ENST00000320857 C3orf14Q9HBI5 128 aa16.04■□□□□ 0.16
SSR4-201ENST00000320857 PRDM9Q9NQV7 894 aa16.04■□□□□ 0.16
SSR4-201ENST00000320857 SH3GLB1Q9Y371 365 aa16.04■□□□□ 0.16
SSR4-201ENST00000320857 A0A0C4DFX4 3053 aa16.03■□□□□ 0.16
SSR4-201ENST00000320857 STK25O00506 426 aa16.03■□□□□ 0.16
SSR4-201ENST00000320857 ZSCAN9O15535 394 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
SSR4-201ENST00000320857 P2RX6O15547 441 aa16.03■□□□□ 0.16
SSR4-201ENST00000320857 EMC8O43402 210 aa16.03■□□□□ 0.16
SSR4-201ENST00000320857 SERPINB7O75635 380 aa16.03■□□□□ 0.16
SSR4-201ENST00000320857 MFN2O95140 757 aa16.03■□□□□ 0.16
SSR4-201ENST00000320857 NR2F1P10589 423 aa16.03■□□□□ 0.16
SSR4-201ENST00000320857 RHCEP18577 417 aa16.03■□□□□ 0.16
SSR4-201ENST00000320857 CD247P20963 164 aa16.03■□□□□ 0.16
SSR4-201ENST00000320857 TLX1P31314 330 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
SSR4-201ENST00000320857 FEN1P39748 380 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
SSR4-201ENST00000320857 XCR1P46094 333 aa16.03■□□□□ 0.16
SSR4-201ENST00000320857 SH3BGRP55822 239 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
SSR4-201ENST00000320857 ISL1P61371 349 aa16.03■□□□□ 0.16
SSR4-201ENST00000320857 ZXDAP98168 799 aa16.03■□□□□ 0.16
SSR4-201ENST00000320857 CD47Q08722 323 aa16.03■□□□□ 0.16
SSR4-201ENST00000320857 ZNF773Q6PK81 442 aa16.03■□□□□ 0.16
SSR4-201ENST00000320857 RNF44Q7L0R7 432 aa16.03■□□□□ 0.16
SSR4-201ENST00000320857 GPR141Q7Z602 305 aa16.03■□□□□ 0.16
SSR4-201ENST00000320857 KRT73Q86Y46 540 aa16.03■□□□□ 0.16
SSR4-201ENST00000320857 UBALD2Q8IYN6 164 aa16.03■□□□□ 0.16
SSR4-201ENST00000320857 SPEM1Q8N4L4 309 aa16.03■□□□□ 0.16
SSR4-201ENST00000320857 TTC29Q8NA56 475 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
SSR4-201ENST00000320857 OR4C15Q8NGM1 316 aa16.03■□□□□ 0.16
SSR4-201ENST00000320857 PROX1Q92786 737 aa16.03■□□□□ 0.16
SSR4-201ENST00000320857 MAGED4Q96JG8 741 aa16.03■□□□□ 0.16
SSR4-201ENST00000320857 APOL4Q9BPW4 351 aa16.03■□□□□ 0.16
SSR4-201ENST00000320857 LRRC61Q9BV99 259 aa16.03■□□□□ 0.16
SSR4-201ENST00000320857 MS4A12Q9NXJ0 267 aa16.03■□□□□ 0.16
SSR4-201ENST00000320857 OR5K3A6NET4 321 aa16.02■□□□□ 0.16
SSR4-201ENST00000320857 METTL12A8MUP2 240 aa16.02■□□□□ 0.16
SSR4-201ENST00000320857 H0YGG7 62 aa16.02■□□□□ 0.16
SSR4-201ENST00000320857 C8orf89P0DMQ9 161 aa16.02■□□□□ 0.16
SSR4-201ENST00000320857 ANXA8P13928 327 aa16.02■□□□□ 0.16
SSR4-201ENST00000320857 EEF1B2P24534 225 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.16
SSR4-201ENST00000320857 POLR2IP36954 125 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.16
SSR4-201ENST00000320857 PRKAG1P54619 331 aa16.02■□□□□ 0.16
SSR4-201ENST00000320857 CDH12P55289 794 aa16.02■□□□□ 0.16
SSR4-201ENST00000320857 GABARAPL2P60520 117 aa16.02■□□□□ 0.16
SSR4-201ENST00000320857 ARF3P61204 181 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.16
SSR4-201ENST00000320857 ELOCQ15369 112 aa16.02■□□□□ 0.16
SSR4-201ENST00000320857 MAPK11Q15759 364 aa16.02■□□□□ 0.16
SSR4-201ENST00000320857 MEP1AQ16819 746 aa16.02■□□□□ 0.16
SSR4-201ENST00000320857 ZNF750Q32MQ0 723 aa16.02■□□□□ 0.16
SSR4-201ENST00000320857 BROXQ5VW32 411 aa16.02■□□□□ 0.16
SSR4-201ENST00000320857 CADM4Q8NFZ8 388 aa16.02■□□□□ 0.16
SSR4-201ENST00000320857 OR10G2Q8NGC3 310 aa16.02■□□□□ 0.16
SSR4-201ENST00000320857 BBS10Q8TAM1 723 aa16.02■□□□□ 0.16
SSR4-201ENST00000320857 MIPOL1Q8TD10 442 aa16.02■□□□□ 0.16
SSR4-201ENST00000320857 XAGE5Q8WWM1 108 aa16.02■□□□□ 0.16
SSR4-201ENST00000320857 CLDN23Q96B33 292 aa16.02■□□□□ 0.16
SSR4-201ENST00000320857 ZNF681Q96N22 645 aa16.02■□□□□ 0.16
SSR4-201ENST00000320857 KLHL25Q9H0H3 589 aa16.02■□□□□ 0.16
SSR4-201ENST00000320857 VCX3AQ9NNX9 186 aa16.02■□□□□ 0.16
SSR4-201ENST00000320857 EVA1BQ9NVM1 165 aa16.02■□□□□ 0.16
SSR4-201ENST00000320857 DNAAF2Q9NVR5 837 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.16
SSR4-201ENST00000320857 GMPPBQ9Y5P6 360 aa16.02■□□□□ 0.16
SSR4-201ENST00000320857 CEPT1Q9Y6K0 416 aa16.02■□□□□ 0.16
SSR4-201ENST00000320857 SLCO1B1Q9Y6L6 691 aa16.02■□□□□ 0.16
SSR4-201ENST00000320857 LOC105369274A0A096LPK9 316 aa16.02■□□□□ 0.15
SSR4-201ENST00000320857 LOC102723532A0A0G2JNH3 316 aa16.02■□□□□ 0.15
SSR4-201ENST00000320857 PRAMEF25A6NGN4 478 aa16.02■□□□□ 0.15
SSR4-201ENST00000320857 A8MVJ9 347 aa16.02■□□□□ 0.15
SSR4-201ENST00000320857 FESP07332 822 aa16.02■□□□□ 0.15
SSR4-201ENST00000320857 IL7RP16871 459 aa16.02■□□□□ 0.15
SSR4-201ENST00000320857 ALOX12P18054 663 aa16.02■□□□□ 0.15
SSR4-201ENST00000320857 CRHBPP24387 322 aa16.02■□□□□ 0.15
SSR4-201ENST00000320857 TTKP33981 857 aa16.02■□□□□ 0.15
SSR4-201ENST00000320857 YAP1P46937 504 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.15
SSR4-201ENST00000320857 LSSP48449 732 aa16.02■□□□□ 0.15
SSR4-201ENST00000320857 CRISP3P54108 245 aa16.02■□□□□ 0.15
SSR4-201ENST00000320857 IL5RAQ01344 420 aa16.02■□□□□ 0.15
SSR4-201ENST00000320857 DUSP2Q05923 314 aa16.02■□□□□ 0.15
SSR4-201ENST00000320857 SIM2Q14190 667 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.15
SSR4-201ENST00000320857 GPR19Q15760 415 aa16.02■□□□□ 0.15
SSR4-201ENST00000320857 DUSP7Q16829 419 aa16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25 ms