RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000246533.7

CAPNS1-201, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,918 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-201ENST00000246533 ELOVL6Q9H5J4 265 aa25■■□□□ 1.59
CAPNS1-201ENST00000246533 CCDC59Q9P031 241 aaKnown RBP25■■□□□ 1.59
CAPNS1-201ENST00000246533 CPED1A4D0V7 1026 aa24.99■■□□□ 1.59
CAPNS1-201ENST00000246533 AGAP5A6NIR3 686 aa24.99■■□□□ 1.59
CAPNS1-201ENST00000246533 METTL15A6NJ78 407 aa24.99■■□□□ 1.59
CAPNS1-201ENST00000246533 PRR19A6NJB7 356 aa24.99■■□□□ 1.59
CAPNS1-201ENST00000246533 PDYNP01213 254 aa24.99■■□□□ 1.59
CAPNS1-201ENST00000246533 FTH1P19P0C7X4 201 aa24.99■■□□□ 1.59
CAPNS1-201ENST00000246533 CYP4B1P13584 511 aa24.99■■□□□ 1.59
CAPNS1-201ENST00000246533 GSSP48637 474 aa24.99■■□□□ 1.59
CAPNS1-201ENST00000246533 DAB2P98082 770 aa24.99■■□□□ 1.59
CAPNS1-201ENST00000246533 IL1RL1Q01638 556 aa24.99■■□□□ 1.59
CAPNS1-201ENST00000246533 OGFOD3Q6PK18 319 aa24.99■■□□□ 1.59
CAPNS1-201ENST00000246533 ATG16L2Q8NAA4 619 aa24.99■■□□□ 1.59
CAPNS1-201ENST00000246533 KBTBD8Q8NFY9 601 aa24.99■■□□□ 1.59
CAPNS1-201ENST00000246533 ZCCHC2Q9C0B9 1178 aaKnown RBP24.99■■□□□ 1.59
CAPNS1-201ENST00000246533 DLGAP4Q9Y2H0 992 aa24.99■■□□□ 1.59
CAPNS1-201ENST00000246533 UNC13CQ8NB66 2214 aa24.99■■□□□ 1.59
CAPNS1-201ENST00000246533 PABPN1LA6NDY0 278 aaKnown RBP24.98■■□□□ 1.59
CAPNS1-201ENST00000246533 GSTT2P0CG29 244 aa24.98■■□□□ 1.59
CAPNS1-201ENST00000246533 GSTT2BP0CG30 244 aa24.98■■□□□ 1.59
CAPNS1-201ENST00000246533 CKMT1AP12532 417 aa24.98■■□□□ 1.59
CAPNS1-201ENST00000246533 ALDH4A1P30038 563 aa24.98■■□□□ 1.59
CAPNS1-201ENST00000246533 RPP38P78345 283 aaKnown RBP24.98■■□□□ 1.59
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CAPNS1-201ENST00000246533 KCNJ8Q15842 424 aa24.98■■□□□ 1.59
CAPNS1-201ENST00000246533 P3H2Q8IVL5 708 aa24.98■■□□□ 1.59
CAPNS1-201ENST00000246533 ZZZ3Q8IYH5 903 aa24.98■■□□□ 1.59
CAPNS1-201ENST00000246533 C10orf111Q8N326 155 aa24.98■■□□□ 1.59
CAPNS1-201ENST00000246533 SDR16C5Q8N3Y7 309 aa24.98■■□□□ 1.59
CAPNS1-201ENST00000246533 CLHC1Q8NHS4 586 aa24.98■■□□□ 1.59
CAPNS1-201ENST00000246533 PSMA8Q8TAA3 256 aa24.98■■□□□ 1.59
CAPNS1-201ENST00000246533 FCRL1Q96LA6 429 aa24.98■■□□□ 1.59
CAPNS1-201ENST00000246533 CORO2BQ9UQ03 480 aa24.98■■□□□ 1.59
CAPNS1-201ENST00000246533 AKAP13Q12802 2813 aa24.98■■□□□ 1.59
CAPNS1-201ENST00000246533 A6NCN8 305 aa24.98■■□□□ 1.59
CAPNS1-201ENST00000246533 CLIC1O00299 241 aa24.98■■□□□ 1.59
CAPNS1-201ENST00000246533 AIREO43918 545 aa24.98■■□□□ 1.59
CAPNS1-201ENST00000246533 PTX3P26022 381 aaPredicted RBP24.98■■□□□ 1.59
CAPNS1-201ENST00000246533 AKAP14Q86UN6 197 aa24.98■■□□□ 1.59
CAPNS1-201ENST00000246533 L3MBTL4Q8NA19 623 aa24.98■■□□□ 1.59
CAPNS1-201ENST00000246533 FAM120CQ9NX05 1096 aaKnown RBP24.98■■□□□ 1.59
CAPNS1-201ENST00000246533 MAPRE3Q9UPY8 281 aa24.98■■□□□ 1.59
CAPNS1-201ENST00000246533 CELSR3Q9NYQ7 3312 aa24.97■■□□□ 1.59
CAPNS1-201ENST00000246533 PRAMEF33A0A0G2JMD5 474 aa24.97■■□□□ 1.59
CAPNS1-201ENST00000246533 WBP4O75554 376 aaKnown RBP24.97■■□□□ 1.59
CAPNS1-201ENST00000246533 SDC1P18827 310 aa24.97■■□□□ 1.59
CAPNS1-201ENST00000246533 PPIBP23284 216 aaKnown RBP24.97■■□□□ 1.59
CAPNS1-201ENST00000246533 HNMTP50135 292 aa24.97■■□□□ 1.59
CAPNS1-201ENST00000246533 C21orf58P58505 322 aa24.97■■□□□ 1.59
CAPNS1-201ENST00000246533 SELENBP1Q13228 472 aa24.97■■□□□ 1.59
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CAPNS1-201ENST00000246533 TOR1AIP1Q5JTV8 583 aa24.96■■□□□ 1.59
CAPNS1-201ENST00000246533 LKAAEAR1Q8TD35 194 aa24.96■■□□□ 1.59
CAPNS1-201ENST00000246533 TIMM29Q9BSF4 260 aa24.96■■□□□ 1.59
CAPNS1-201ENST00000246533 COPS4Q9BT78 406 aa24.96■■□□□ 1.59
CAPNS1-201ENST00000246533 THUMPD1Q9NXG2 353 aaKnown RBP24.96■■□□□ 1.59
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CAPNS1-201ENST00000246533 RNF6Q9Y252 685 aa24.96■■□□□ 1.59
CAPNS1-201ENST00000246533 CEP295Q9C0D2 2601 aa24.96■■□□□ 1.59
CAPNS1-201ENST00000246533 KCNE1BA0A087WTH5 132 aa24.96■■□□□ 1.59
CAPNS1-201ENST00000246533 ITGB6P18564 788 aa24.96■■□□□ 1.59
CAPNS1-201ENST00000246533 S100A5P33763 92 aa24.96■■□□□ 1.59
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CAPNS1-201ENST00000246533 NSG1P42857 185 aa24.96■■□□□ 1.59
CAPNS1-201ENST00000246533 OLR1P78380 273 aa24.96■■□□□ 1.59
CAPNS1-201ENST00000246533 CPSF6Q16630 551 aaKnown RBP eCLIP24.96■■□□□ 1.59
CAPNS1-201ENST00000246533 BCL7AQ4VC05 210 aa24.96■■□□□ 1.59
CAPNS1-201ENST00000246533 AHSA2Q719I0 299 aa24.96■■□□□ 1.59
CAPNS1-201ENST00000246533 MARCH9Q86YJ5 346 aa24.96■■□□□ 1.59
CAPNS1-201ENST00000246533 METTL2AQ96IZ6 378 aaKnown RBP24.96■■□□□ 1.59
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CAPNS1-201ENST00000246533 IFT52Q9Y366 437 aa24.96■■□□□ 1.59
CAPNS1-201ENST00000246533 FREM2Q5SZK8 3169 aa24.95■■□□□ 1.58
CAPNS1-201ENST00000246533 PNMA8CA0A1B0GUJ8 204 aa24.95■■□□□ 1.58
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CAPNS1-201ENST00000246533 VLDLRP98155 873 aa24.95■■□□□ 1.58
CAPNS1-201ENST00000246533 NR0B2Q15466 257 aa24.95■■□□□ 1.58
CAPNS1-201ENST00000246533 CATSPEREQ5SY80 951 aa24.95■■□□□ 1.58
CAPNS1-201ENST00000246533 C1QTNF12Q5T7M4 302 aa24.95■■□□□ 1.58
CAPNS1-201ENST00000246533 DHRS13Q6UX07 377 aa24.95■■□□□ 1.58
CAPNS1-201ENST00000246533 GPR155Q7Z3F1 870 aa24.95■■□□□ 1.58
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF761Q86XN6 746 aaPredicted RBP24.95■■□□□ 1.58
CAPNS1-201ENST00000246533 ENTHD1Q8IYW4 607 aa24.95■■□□□ 1.58
CAPNS1-201ENST00000246533 ARL14Q8N4G2 192 aa24.95■■□□□ 1.58
CAPNS1-201ENST00000246533 IFI44Q8TCB0 444 aa24.95■■□□□ 1.58
CAPNS1-201ENST00000246533 SLC37A2Q8TED4 501 aa24.95■■□□□ 1.58
CAPNS1-201ENST00000246533 HSH2DQ96JZ2 352 aa24.95■■□□□ 1.58
CAPNS1-201ENST00000246533 TSSK3Q96PN8 268 aa24.95■■□□□ 1.58
CAPNS1-201ENST00000246533 FKBP14Q9NWM8 211 aa24.95■■□□□ 1.58
CAPNS1-201ENST00000246533 RNF215Q9Y6U7 377 aa24.95■■□□□ 1.58
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