RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000075430.11

CTDP1-201, Transcript of CTD phosphatase subunit 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDP1, Length 3,538 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDP1-201ENST00000075430 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP15.93■□□□□ 0.14
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CTDP1-201ENST00000075430 DNAJB8Q8NHS0 232 aa15.93■□□□□ 0.14
CTDP1-201ENST00000075430 UCN3Q969E3 161 aa15.93■□□□□ 0.14
CTDP1-201ENST00000075430 TMEM19Q96HH6 336 aa15.93■□□□□ 0.14
CTDP1-201ENST00000075430 CHIAQ9BZP6 476 aa15.93■□□□□ 0.14
CTDP1-201ENST00000075430 SLC6A16Q9GZN6 736 aa15.93■□□□□ 0.14
CTDP1-201ENST00000075430 PADI2Q9Y2J8 665 aa15.93■□□□□ 0.14
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CTDP1-201ENST00000075430 FAM20CQ8IXL6 584 aa15.92■□□□□ 0.14
CTDP1-201ENST00000075430 ASZ1Q8WWH4 475 aa15.92■□□□□ 0.14
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CTDP1-201ENST00000075430 SAP130Q9H0E3 1048 aa15.92■□□□□ 0.14
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CTDP1-201ENST00000075430 C16orf62Q7Z3J2 963 aa15.92■□□□□ 0.14
CTDP1-201ENST00000075430 HORMAD2Q8N7B1 307 aa15.92■□□□□ 0.14
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CTDP1-201ENST00000075430 UGT2B17O75795 530 aa15.91■□□□□ 0.14
CTDP1-201ENST00000075430 C8orf89P0DMQ9 161 aa15.91■□□□□ 0.14
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CTDP1-201ENST00000075430 SYPL1Q16563 259 aa15.91■□□□□ 0.14
CTDP1-201ENST00000075430 C9orf43Q8TAL5 461 aaPredicted RBP15.91■□□□□ 0.14
CTDP1-201ENST00000075430 FATE1Q969F0 183 aa15.91■□□□□ 0.14
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CTDP1-201ENST00000075430 PLCXD1Q9NUJ7 323 aa15.91■□□□□ 0.14
CTDP1-201ENST00000075430 PTGFRNQ9P2B2 879 aa15.91■□□□□ 0.14
CTDP1-201ENST00000075430 STOX2Q9P2F5 926 aaPredicted RBP15.91■□□□□ 0.14
CTDP1-201ENST00000075430 LSM7Q9UK45 103 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
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CTDP1-201ENST00000075430 SRRDQ9UH36 339 aa15.91■□□□□ 0.14
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CTDP1-201ENST00000075430 HEPACAM2A8MVW5 462 aa15.91■□□□□ 0.14
CTDP1-201ENST00000075430 ZNF670-ZNF695F2Z2N8 137 aa15.91■□□□□ 0.14
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CTDP1-201ENST00000075430 EPHX1P07099 455 aa15.91■□□□□ 0.14
CTDP1-201ENST00000075430 H1F0P07305 194 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
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CTDP1-201ENST00000075430 AP1S1P61966 158 aa15.91■□□□□ 0.14
CTDP1-201ENST00000075430 ZNF800Q2TB10 664 aaPredicted RBP eCLIP15.91■□□□□ 0.14
CTDP1-201ENST00000075430 YIF1BQ5BJH7 314 aa15.91■□□□□ 0.14
CTDP1-201ENST00000075430 FAM27D1Q5T7N8 215 aa15.91■□□□□ 0.14
CTDP1-201ENST00000075430 MED27Q6P2C8 311 aa15.91■□□□□ 0.14
CTDP1-201ENST00000075430 TM9SF4Q92544 642 aa15.91■□□□□ 0.14
CTDP1-201ENST00000075430 SUV39H2Q9H5I1 410 aa15.91■□□□□ 0.14
CTDP1-201ENST00000075430 ZFR2Q9UPR6 939 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
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CTDP1-201ENST00000075430 ZNF250P15622 560 aa15.9■□□□□ 0.14
CTDP1-201ENST00000075430 DRD5P21918 477 aa15.9■□□□□ 0.14
CTDP1-201ENST00000075430 ALAS2P22557 587 aa15.9■□□□□ 0.14
CTDP1-201ENST00000075430 CPN2P22792 545 aa15.9■□□□□ 0.14
CTDP1-201ENST00000075430 RECQLP46063 649 aaPredicted RBP15.9■□□□□ 0.14
CTDP1-201ENST00000075430 EIF4HQ15056 248 aaKnown RBP15.9■□□□□ 0.14
CTDP1-201ENST00000075430 SLC35F1Q5T1Q4 408 aa15.9■□□□□ 0.14
CTDP1-201ENST00000075430 SLX4IPQ5VYV7 408 aa15.9■□□□□ 0.14
CTDP1-201ENST00000075430 OR2AP1Q8NGE2 309 aa15.9■□□□□ 0.14
CTDP1-201ENST00000075430 CREB3L4Q8TEY5 395 aa15.9■□□□□ 0.14
CTDP1-201ENST00000075430 UPRTQ96BW1 309 aa15.9■□□□□ 0.14
CTDP1-201ENST00000075430 MAPKAP1Q9BPZ7 522 aa15.9■□□□□ 0.14
CTDP1-201ENST00000075430 KATNB1Q9BVA0 655 aa15.9■□□□□ 0.14
CTDP1-201ENST00000075430 NXF2Q9GZY0 626 aaKnown RBP15.9■□□□□ 0.14
CTDP1-201ENST00000075430 CXorf36Q9H7Y0 433 aa15.9■□□□□ 0.14
CTDP1-201ENST00000075430 RPL36Q9Y3U8 105 aaKnown RBP15.9■□□□□ 0.14
CTDP1-201ENST00000075430 A0A1W2PRU2 124 aa15.9■□□□□ 0.14
CTDP1-201ENST00000075430 FEZF1A0PJY2 475 aa15.9■□□□□ 0.14
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