RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000607882.5

RABGEF1-209, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 2

Gene RABGEF1, Length 2,654 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-209ENST00000607882 H3BMH7 237 aa11.86□□□□□ -0.51
RABGEF1-209ENST00000607882 JRKO75564 520 aa11.86□□□□□ -0.51
RABGEF1-209ENST00000607882 MPC1LP0DKB6 136 aa11.86□□□□□ -0.51
RABGEF1-209ENST00000607882 VARSP26640 1264 aaKnown RBP11.86□□□□□ -0.51
RABGEF1-209ENST00000607882 CMPK1P30085 196 aa11.86□□□□□ -0.51
RABGEF1-209ENST00000607882 SOX11P35716 441 aa11.86□□□□□ -0.51
RABGEF1-209ENST00000607882 STT3AP46977 705 aa11.86□□□□□ -0.51
RABGEF1-209ENST00000607882 AGTR2P50052 363 aa11.86□□□□□ -0.51
RABGEF1-209ENST00000607882 PRDX1Q06830 199 aaKnown RBP11.86□□□□□ -0.51
RABGEF1-209ENST00000607882 GALNT1Q10472 559 aaPredicted RBP11.86□□□□□ -0.51
RABGEF1-209ENST00000607882 NHSL2Q5HYW2 709 aa11.86□□□□□ -0.51
RABGEF1-209ENST00000607882 TBCELQ5QJ74 424 aa11.86□□□□□ -0.51
RABGEF1-209ENST00000607882 C6orf183Q5T699 404 aa11.86□□□□□ -0.51
RABGEF1-209ENST00000607882 SPPL2CQ8IUH8 684 aa11.86□□□□□ -0.51
RABGEF1-209ENST00000607882 CBR4Q8N4T8 237 aa11.86□□□□□ -0.51
RABGEF1-209ENST00000607882 PTGR2Q8N8N7 351 aaPredicted RBP11.86□□□□□ -0.51
RABGEF1-209ENST00000607882 EXD3Q8N9H8 876 aa11.86□□□□□ -0.51
RABGEF1-209ENST00000607882 PCYOX1LQ8NBM8 494 aa11.86□□□□□ -0.51
RABGEF1-209ENST00000607882 NEIL2Q969S2 332 aa11.86□□□□□ -0.51
RABGEF1-209ENST00000607882 SLC22A18Q96BI1 424 aa11.86□□□□□ -0.51
RABGEF1-209ENST00000607882 KCNA7Q96RP8 456 aa11.86□□□□□ -0.51
RABGEF1-209ENST00000607882 NDC1Q9BTX1 674 aa11.86□□□□□ -0.51
RABGEF1-209ENST00000607882 ANKRD60Q9BZ19 345 aa11.86□□□□□ -0.51
RABGEF1-209ENST00000607882 MID1IP1Q9NPA3 183 aa11.86□□□□□ -0.51
RABGEF1-209ENST00000607882 PLCL2Q9UPR0 1127 aa11.86□□□□□ -0.51
RABGEF1-209ENST00000607882 PIP5K1BO14986 540 aa11.85□□□□□ -0.51
RABGEF1-209ENST00000607882 CAPN3P20807 821 aa11.85□□□□□ -0.51
RABGEF1-209ENST00000607882 GPX3P22352 226 aa11.85□□□□□ -0.51
RABGEF1-209ENST00000607882 EVI2BP34910 448 aa11.85□□□□□ -0.51
RABGEF1-209ENST00000607882 HSD17B2P37059 387 aa11.85□□□□□ -0.51
RABGEF1-209ENST00000607882 VWA2Q5GFL6 755 aa11.85□□□□□ -0.51
RABGEF1-209ENST00000607882 ZC3H12BQ5HYM0 836 aaKnown RBP11.85□□□□□ -0.51
RABGEF1-209ENST00000607882 DDIASQ8IXT1 998 aa11.85□□□□□ -0.51
RABGEF1-209ENST00000607882 CDC26Q8NHZ8 85 aa11.85□□□□□ -0.51
RABGEF1-209ENST00000607882 SLC39A7Q92504 469 aa11.85□□□□□ -0.51
RABGEF1-209ENST00000607882 NSUN5Q96P11 429 aaKnown RBP11.85□□□□□ -0.51
RABGEF1-209ENST00000607882 ZPBPQ9BS86 351 aa11.85□□□□□ -0.51
RABGEF1-209ENST00000607882 TRMOQ9BU70 441 aa11.85□□□□□ -0.51
RABGEF1-209ENST00000607882 TIMMDC1Q9NPL8 285 aa11.85□□□□□ -0.51
RABGEF1-209ENST00000607882 MAP10Q9P2G4 905 aa11.85□□□□□ -0.51
RABGEF1-209ENST00000607882 SNX7Q9UNH6 387 aa11.85□□□□□ -0.51
RABGEF1-209ENST00000607882 RUVBL1Q9Y265 456 aaKnown RBP11.85□□□□□ -0.51
RABGEF1-209ENST00000607882 A0A0A6YYC8 382 aaPredicted RBP11.85□□□□□ -0.51
RABGEF1-209ENST00000607882 DHRS12A0PJE2 317 aa11.85□□□□□ -0.51
RABGEF1-209ENST00000607882 ARGFXA6NJG6 315 aa11.85□□□□□ -0.51
RABGEF1-209ENST00000607882 I3L1I5 382 aaPredicted RBP11.85□□□□□ -0.51
RABGEF1-209ENST00000607882 UBXN8O00124 270 aa11.85□□□□□ -0.51
RABGEF1-209ENST00000607882 DNAJB6O75190 326 aa11.85□□□□□ -0.51
RABGEF1-209ENST00000607882 NPPBP16860 134 aa11.85□□□□□ -0.51
RABGEF1-209ENST00000607882 IL1RNP18510 177 aa11.85□□□□□ -0.51
RABGEF1-209ENST00000607882 RORAP35398 523 aa11.85□□□□□ -0.51
RABGEF1-209ENST00000607882 ALDH3B2P48448 385 aa11.85□□□□□ -0.51
RABGEF1-209ENST00000607882 HSPA7P48741 367 aa11.85□□□□□ -0.51
RABGEF1-209ENST00000607882 HERVK_113P63132 956 aa11.85□□□□□ -0.51
RABGEF1-209ENST00000607882 ABHD18Q0P651 414 aa11.85□□□□□ -0.51
RABGEF1-209ENST00000607882 TBR1Q16650 682 aa11.85□□□□□ -0.51
RABGEF1-209ENST00000607882 UGT3A2Q3SY77 523 aa11.85□□□□□ -0.51
RABGEF1-209ENST00000607882 HACD2Q6Y1H2 254 aa11.85□□□□□ -0.51
RABGEF1-209ENST00000607882 ZNF600Q6ZNG1 722 aa11.85□□□□□ -0.51
RABGEF1-209ENST00000607882 EPHX4Q8IUS5 362 aa11.85□□□□□ -0.51
RABGEF1-209ENST00000607882 LURAP1LQ8IV03 231 aa11.85□□□□□ -0.51
RABGEF1-209ENST00000607882 ZNF786Q8N393 782 aa11.85□□□□□ -0.51
RABGEF1-209ENST00000607882 DUS3LQ96G46 650 aaKnown RBP11.85□□□□□ -0.51
RABGEF1-209ENST00000607882 ERVK-6Q9BXR3 956 aa11.85□□□□□ -0.51
RABGEF1-209ENST00000607882 IFT80Q9P2H3 777 aaPredicted RBP11.85□□□□□ -0.51
RABGEF1-209ENST00000607882 PTRH2Q9Y3E5 179 aaKnown RBP11.85□□□□□ -0.51
RABGEF1-209ENST00000607882 ANGPT2O15123 496 aa11.84□□□□□ -0.51
RABGEF1-209ENST00000607882 TMCC2O75069 709 aa11.84□□□□□ -0.51
RABGEF1-209ENST00000607882 CDC123O75794 336 aaPredicted RBP11.84□□□□□ -0.51
RABGEF1-209ENST00000607882 CD82P27701 267 aa11.84□□□□□ -0.51
RABGEF1-209ENST00000607882 OLR1P78380 273 aa11.84□□□□□ -0.51
RABGEF1-209ENST00000607882 NFATC3Q12968 1075 aa11.84□□□□□ -0.51
RABGEF1-209ENST00000607882 PFKFB4Q16877 469 aa11.84□□□□□ -0.51
RABGEF1-209ENST00000607882 LINC00303Q3SY05 128 aa11.84□□□□□ -0.51
RABGEF1-209ENST00000607882 PPP4R4Q6NUP7 873 aa11.84□□□□□ -0.51
RABGEF1-209ENST00000607882 FAM198BQ6UWH4 519 aa11.84□□□□□ -0.51
RABGEF1-209ENST00000607882 TMPRSS11BQ86T26 416 aa11.84□□□□□ -0.51
RABGEF1-209ENST00000607882 LAPTM4BQ86VI4 370 aa11.84□□□□□ -0.51
RABGEF1-209ENST00000607882 CLYBLQ8N0X4 340 aa11.84□□□□□ -0.51
RABGEF1-209ENST00000607882 ANKFN1Q8N957 763 aa11.84□□□□□ -0.51
RABGEF1-209ENST00000607882 ZSCAN1Q8NBB4 408 aa11.84□□□□□ -0.51
RABGEF1-209ENST00000607882 TWIST2Q8WVJ9 160 aa11.84□□□□□ -0.51
RABGEF1-209ENST00000607882 TFAP2CQ92754 450 aa11.84□□□□□ -0.51
RABGEF1-209ENST00000607882 ROPN1LQ96C74 230 aa11.84□□□□□ -0.51
RABGEF1-209ENST00000607882 L3HYPDHQ96EM0 354 aa11.84□□□□□ -0.51
RABGEF1-209ENST00000607882 ZFYVE21Q9BQ24 234 aa11.84□□□□□ -0.51
RABGEF1-209ENST00000607882 RAB11FIP5Q9BXF6 653 aa11.84□□□□□ -0.51
RABGEF1-209ENST00000607882 CLK4Q9HAZ1 481 aaKnown RBP11.84□□□□□ -0.51
RABGEF1-209ENST00000607882 CUTCQ9NTM9 273 aa11.84□□□□□ -0.51
RABGEF1-209ENST00000607882 LUZP4Q9P127 313 aa11.84□□□□□ -0.51
RABGEF1-209ENST00000607882 SSUH2Q9Y2M2 353 aa11.84□□□□□ -0.51
RABGEF1-209ENST00000607882 HECTD1Q9ULT8 2610 aa11.84□□□□□ -0.51
RABGEF1-209ENST00000607882 TNRC6AQ8NDV7 1962 aaKnown RBP11.84□□□□□ -0.51
RABGEF1-209ENST00000607882 TRAV6A0A075B6T7 132 aa11.84□□□□□ -0.51
RABGEF1-209ENST00000607882 GIMAP1-GIMAP5A0A087WTJ2 511 aa11.84□□□□□ -0.51
RABGEF1-209ENST00000607882 FXYD1O00168 92 aa11.84□□□□□ -0.51
RABGEF1-209ENST00000607882 CREG1O75629 220 aa11.84□□□□□ -0.51
RABGEF1-209ENST00000607882 WISP3O95389 354 aaPredicted RBP11.84□□□□□ -0.51
RABGEF1-209ENST00000607882 CLIC3O95833 236 aa11.84□□□□□ -0.51
RABGEF1-209ENST00000607882 AGR2O95994 175 aa11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.7 ms