RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551137.5

CS-223, Transcript of citrate synthase, human

TSL 3

Gene CS, Length 903 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CS-223	ENST00000551137	AIFM1	O95831	613 aa		10.64	□□□□□ -0.71
CS-223	ENST00000551137	RHOXF2B	P0C7M4	288 aa		10.64	□□□□□ -0.71
CS-223	ENST00000551137	NR2F6	P10588	404 aa		10.64	□□□□□ -0.71
CS-223	ENST00000551137	HSD3B1	P14060	373 aa		10.64	□□□□□ -0.71
CS-223	ENST00000551137	TAC1	P20366	129 aa		10.64	□□□□□ -0.71
CS-223	ENST00000551137	IMPDH1	P20839	514 aa		10.64	□□□□□ -0.71
CS-223	ENST00000551137	ATP5F1	P24539	256 aa	Predicted RBP	10.64	□□□□□ -0.71
CS-223	ENST00000551137	HSD3B2	P26439	372 aa		10.64	□□□□□ -0.71
CS-223	ENST00000551137	TNFRSF8	P28908	595 aa		10.64	□□□□□ -0.71
CS-223	ENST00000551137	SOX3	P41225	446 aa		10.64	□□□□□ -0.71
CS-223	ENST00000551137	MEOX1	P50221	254 aa		10.64	□□□□□ -0.71
CS-223	ENST00000551137	CASP6	P55212	293 aa		10.64	□□□□□ -0.71
CS-223	ENST00000551137	NAA20	P61599	178 aa		10.64	□□□□□ -0.71
CS-223	ENST00000551137	ID2	Q02363	134 aa		10.64	□□□□□ -0.71
CS-223	ENST00000551137	CLC	Q05315	142 aa		10.64	□□□□□ -0.71
CS-223	ENST00000551137	SRSF11	Q05519	484 aa	Known RBP	10.64	□□□□□ -0.71
CS-223	ENST00000551137	PIGG	Q5H8A4	983 aa		10.64	□□□□□ -0.71
CS-223	ENST00000551137	OR52E8	Q6IFG1	317 aa		10.64	□□□□□ -0.71
CS-223	ENST00000551137	LETMD1	Q6P1Q0	360 aa		10.64	□□□□□ -0.71
CS-223	ENST00000551137	OPN5	Q6U736	354 aa		10.64	□□□□□ -0.71
CS-223	ENST00000551137	RPTN	Q6XPR3	784 aa		10.64	□□□□□ -0.71
CS-223	ENST00000551137	C16orf47	Q6ZP98	133 aa	Predicted RBP	10.64	□□□□□ -0.71
CS-223	ENST00000551137	DGAT2L6	Q6ZPD8	337 aa		10.64	□□□□□ -0.71
CS-223	ENST00000551137	RGS9BP	Q6ZS82	235 aa		10.64	□□□□□ -0.71
CS-223	ENST00000551137	SH2D5	Q6ZV89	423 aa		10.64	□□□□□ -0.71
CS-223	ENST00000551137	DND1	Q8IYX4	353 aa	Known RBP	10.64	□□□□□ -0.71
CS-223	ENST00000551137	ZNF382	Q96SR6	550 aa		10.64	□□□□□ -0.71
CS-223	ENST00000551137	RHOXF2	Q9BQY4	288 aa		10.64	□□□□□ -0.71
CS-223	ENST00000551137	ELOVL6	Q9H5J4	265 aa		10.64	□□□□□ -0.71
CS-223	ENST00000551137	SEMA4B	Q9NPR2	832 aa	Predicted RBP	10.64	□□□□□ -0.71
CS-223	ENST00000551137	HPF1	Q9NWY4	346 aa		10.64	□□□□□ -0.71
CS-223	ENST00000551137	SUCO	Q9UBS9	1254 aa	Known RBP	10.64	□□□□□ -0.71
CS-223	ENST00000551137	TRPS1	Q9UHF7	1281 aa		10.64	□□□□□ -0.71
CS-223	ENST00000551137	DCDC2	Q9UHG0	476 aa		10.64	□□□□□ -0.71
CS-223	ENST00000551137	NPIPA1	Q9UND3	350 aa		10.64	□□□□□ -0.71
CS-223	ENST00000551137	SNX6	Q9UNH7	406 aa		10.64	□□□□□ -0.71
CS-223	ENST00000551137	ERVK-11	Q9UQG0	969 aa		10.64	□□□□□ -0.71
CS-223	ENST00000551137	KLF2	Q9Y5W3	355 aa	Predicted RBP	10.64	□□□□□ -0.71
CS-223	ENST00000551137	ADGRG4	Q8IZF6	3080 aa		10.63	□□□□□ -0.71
CS-223	ENST00000551137	MYOCOS	A0A1B0GUC4	107 aa		10.63	□□□□□ -0.71
CS-223	ENST00000551137	OR6C76	A6NM76	312 aa		10.63	□□□□□ -0.71
CS-223	ENST00000551137	WWP2	O00308	870 aa		10.63	□□□□□ -0.71
CS-223	ENST00000551137	CCL21	O00585	134 aa		10.63	□□□□□ -0.71
CS-223	ENST00000551137	ZNF354A	O60765	605 aa	Predicted RBP	10.63	□□□□□ -0.71
CS-223	ENST00000551137	GUCY1B2	O75343	617 aa		10.63	□□□□□ -0.71
CS-223	ENST00000551137	OR6B1	O95007	311 aa		10.63	□□□□□ -0.71
CS-223	ENST00000551137	CNR1	P21554	472 aa		10.63	□□□□□ -0.71
CS-223	ENST00000551137	PRKAA2	P54646	552 aa		10.63	□□□□□ -0.71
CS-223	ENST00000551137	CDH13	P55290	713 aa		10.63	□□□□□ -0.71
CS-223	ENST00000551137	SLC37A1	P57057	533 aa		10.63	□□□□□ -0.71
CS-223	ENST00000551137	GALNT1	Q10472	559 aa	Predicted RBP	10.63	□□□□□ -0.71
CS-223	ENST00000551137	FUT7	Q11130	342 aa		10.63	□□□□□ -0.71
CS-223	ENST00000551137	TBL3	Q12788	808 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
CS-223	ENST00000551137	C3AR1	Q16581	482 aa		10.63	□□□□□ -0.71
CS-223	ENST00000551137	HYAL4	Q2M3T9	481 aa		10.63	□□□□□ -0.71
CS-223	ENST00000551137	ZNF791	Q3KP31	576 aa	Predicted RBP	10.63	□□□□□ -0.71
CS-223	ENST00000551137	UNC50	Q53HI1	259 aa		10.63	□□□□□ -0.71
CS-223	ENST00000551137	ZNF678	Q5SXM1	525 aa		10.63	□□□□□ -0.71
CS-223	ENST00000551137	TTC19	Q6DKK2	380 aa	Predicted RBP	10.63	□□□□□ -0.71
CS-223	ENST00000551137	HIST2H2BC	Q6DN03	193 aa		10.63	□□□□□ -0.71
CS-223	ENST00000551137	XKRX	Q6PP77	449 aa		10.63	□□□□□ -0.71
CS-223	ENST00000551137	IL20RB	Q6UXL0	311 aa		10.63	□□□□□ -0.71
CS-223	ENST00000551137	RTL4	Q6ZR62	310 aa		10.63	□□□□□ -0.71
CS-223	ENST00000551137	TDRP	Q86YL5	185 aa		10.63	□□□□□ -0.71
CS-223	ENST00000551137	SLC22A9	Q8IVM8	553 aa		10.63	□□□□□ -0.71
CS-223	ENST00000551137	C9orf40	Q8IXQ3	194 aa		10.63	□□□□□ -0.71
CS-223	ENST00000551137	ZNF808	Q8N4W9	903 aa	Predicted RBP	10.63	□□□□□ -0.71
CS-223	ENST00000551137	ITLN2	Q8WWU7	325 aa	Predicted RBP	10.63	□□□□□ -0.71
CS-223	ENST00000551137	RIT1	Q92963	219 aa		10.63	□□□□□ -0.71
CS-223	ENST00000551137	PPWD1	Q96BP3	646 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
CS-223	ENST00000551137	MTFMT	Q96DP5	389 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
CS-223	ENST00000551137	L3HYPDH	Q96EM0	354 aa		10.63	□□□□□ -0.71
CS-223	ENST00000551137	CCDC120	Q96HB5	630 aa		10.63	□□□□□ -0.71
CS-223	ENST00000551137	MAGED4	Q96JG8	741 aa		10.63	□□□□□ -0.71
CS-223	ENST00000551137	ZDHHC11	Q9H8X9	412 aa		10.63	□□□□□ -0.71
CS-223	ENST00000551137	LIN28A	Q9H9Z2	209 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
CS-223	ENST00000551137	CXorf21	Q9HAI6	301 aa		10.63	□□□□□ -0.71
CS-223	ENST00000551137	PRM3	Q9NNZ6	103 aa		10.63	□□□□□ -0.71
CS-223	ENST00000551137	SH2D2A	Q9NP31	389 aa		10.63	□□□□□ -0.71
CS-223	ENST00000551137	FARSB	Q9NSD9	589 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
CS-223	ENST00000551137	DEPP	Q9NTK1	212 aa		10.63	□□□□□ -0.71
CS-223	ENST00000551137	NMRK1	Q9NWW6	199 aa		10.63	□□□□□ -0.71
CS-223	ENST00000551137	ENTPD4	Q9Y227	616 aa		10.63	□□□□□ -0.71
CS-223	ENST00000551137	STK38L	Q9Y2H1	464 aa		10.63	□□□□□ -0.71
CS-223	ENST00000551137	ABCA12	Q86UK0	2595 aa		10.63	□□□□□ -0.71
CS-223	ENST00000551137	APC	P25054	2843 aa		10.62	□□□□□ -0.71
CS-223	ENST00000551137	CREBBP	Q92793	2442 aa		10.62	□□□□□ -0.71
CS-223	ENST00000551137	PKDREJ	Q9NTG1	2253 aa		10.62	□□□□□ -0.71
CS-223	ENST00000551137	SERTM1	A2A2V5	107 aa		10.62	□□□□□ -0.71
CS-223	ENST00000551137	WASHC1	A8K0Z3	465 aa		10.62	□□□□□ -0.71
CS-223	ENST00000551137	HRK	O00198	91 aa		10.62	□□□□□ -0.71
CS-223	ENST00000551137	PGRMC2	O15173	223 aa		10.62	□□□□□ -0.71
CS-223	ENST00000551137	PRKRA	O75569	313 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
CS-223	ENST00000551137	SUPT7L	O94864	414 aa		10.62	□□□□□ -0.71
CS-223	ENST00000551137	GLS	O94925	669 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
CS-223	ENST00000551137	NADK	O95544	446 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
CS-223	ENST00000551137	PDYN	P01213	254 aa		10.62	□□□□□ -0.71
CS-223	ENST00000551137	KRT6A	P02538	564 aa		10.62	□□□□□ -0.71
CS-223	ENST00000551137	CLPS	P04118	112 aa		10.62	□□□□□ -0.71
CS-223	ENST00000551137	KRT6B	P04259	564 aa		10.62	□□□□□ -0.71

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