RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493107.5

SEC22C-216, Transcript of SEC22 homolog C, vesicle trafficking protein, humanhuman

TSL 5

Gene SEC22C, Length 827 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC22C-216ENST00000493107 GFM1Q96RP9 751 aaKnown RBP8.85□□□□□ -0.99
SEC22C-216ENST00000493107 DPH2Q9BQC3 489 aaPredicted RBP8.85□□□□□ -0.99
SEC22C-216ENST00000493107 SLC35A5Q9BS91 424 aa8.85□□□□□ -0.99
SEC22C-216ENST00000493107 NLNQ9BYT8 704 aa8.85□□□□□ -0.99
SEC22C-216ENST00000493107 CLK4Q9HAZ1 481 aaKnown RBP8.85□□□□□ -0.99
SEC22C-216ENST00000493107 APMAPQ9HDC9 416 aa8.85□□□□□ -0.99
SEC22C-216ENST00000493107 TMEM9BQ9NQ34 198 aa8.85□□□□□ -0.99
SEC22C-216ENST00000493107 LANCL2Q9NS86 450 aa8.85□□□□□ -0.99
SEC22C-216ENST00000493107 FGF21Q9NSA1 209 aa8.85□□□□□ -0.99
SEC22C-216ENST00000493107 NTMQ9P121 344 aa8.85□□□□□ -0.99
SEC22C-216ENST00000493107 HCN3Q9P1Z3 774 aa8.85□□□□□ -0.99
SEC22C-216ENST00000493107 FTSJ1Q9UET6 329 aa8.85□□□□□ -0.99
SEC22C-216ENST00000493107 VPS4AQ9UN37 437 aa8.85□□□□□ -0.99
SEC22C-216ENST00000493107 ADAMTS9Q9P2N4 1935 aa8.85□□□□□ -0.99
SEC22C-216ENST00000493107 CABIN1Q9Y6J0 2220 aa8.85□□□□□ -0.99
SEC22C-216ENST00000493107 PRAMEF27A3QJZ7 478 aa8.84□□□□□ -0.99
SEC22C-216ENST00000493107 H0YHG0 523 aa8.84□□□□□ -0.99
SEC22C-216ENST00000493107 AGRPO00253 132 aa8.84□□□□□ -0.99
SEC22C-216ENST00000493107 DSCR3O14972 297 aa8.84□□□□□ -0.99
SEC22C-216ENST00000493107 LRP3O75074 770 aa8.84□□□□□ -0.99
SEC22C-216ENST00000493107 LDB3O75112 727 aa8.84□□□□□ -0.99
SEC22C-216ENST00000493107 JRKO75564 520 aa8.84□□□□□ -0.99
SEC22C-216ENST00000493107 ERAL1O75616 437 aaKnown RBP8.84□□□□□ -0.99
SEC22C-216ENST00000493107 CIB2O75838 187 aa8.84□□□□□ -0.99
SEC22C-216ENST00000493107 DKK1O94907 266 aa8.84□□□□□ -0.99
SEC22C-216ENST00000493107 GPR75O95800 540 aa8.84□□□□□ -0.99
SEC22C-216ENST00000493107 LMNAP02545 664 aaKnown RBP8.84□□□□□ -0.99
SEC22C-216ENST00000493107 C8BP07358 591 aa8.84□□□□□ -0.99
SEC22C-216ENST00000493107 FGF5P12034 268 aa8.84□□□□□ -0.99
SEC22C-216ENST00000493107 BMP2P12643 396 aa8.84□□□□□ -0.99
SEC22C-216ENST00000493107 NCK1P16333 377 aa8.84□□□□□ -0.99
SEC22C-216ENST00000493107 CSNK2A2P19784 350 aaPredicted RBP8.84□□□□□ -0.99
SEC22C-216ENST00000493107 S1PR1P21453 382 aa8.84□□□□□ -0.99
SEC22C-216ENST00000493107 ZNF10P21506 573 aaPredicted RBP8.84□□□□□ -0.99
SEC22C-216ENST00000493107 UQCRC2P22695 453 aa8.84□□□□□ -0.99
SEC22C-216ENST00000493107 NCBP2P52298 156 aaKnown RBP eCLIP8.84□□□□□ -0.99
SEC22C-216ENST00000493107 CRYBA2P53672 197 aa8.84□□□□□ -0.99
SEC22C-216ENST00000493107 CASP9P55211 416 aa8.84□□□□□ -0.99
SEC22C-216ENST00000493107 CLDN6P56747 220 aa8.84□□□□□ -0.99
SEC22C-216ENST00000493107 BTG2P78543 158 aa8.84□□□□□ -0.99
SEC22C-216ENST00000493107 INSM1Q01101 510 aaPredicted RBP8.84□□□□□ -0.99
SEC22C-216ENST00000493107 ACY1Q03154 408 aa8.84□□□□□ -0.99
SEC22C-216ENST00000493107 FOLH1Q04609 750 aa8.84□□□□□ -0.99
SEC22C-216ENST00000493107 HSPB3Q12988 150 aa8.84□□□□□ -0.99
SEC22C-216ENST00000493107 DUSP8Q13202 625 aa8.84□□□□□ -0.99
SEC22C-216ENST00000493107 TRA2AQ13595 282 aaKnown RBP eCLIP8.84□□□□□ -0.99
SEC22C-216ENST00000493107 LTB4RQ15722 352 aa8.84□□□□□ -0.99
SEC22C-216ENST00000493107 FAM214AQ32MH5 1076 aa8.84□□□□□ -0.99
SEC22C-216ENST00000493107 ZNF628Q5EBL2 1059 aa8.84□□□□□ -0.99
SEC22C-216ENST00000493107 EXOSC6Q5RKV6 272 aaKnown RBP8.84□□□□□ -0.99
SEC22C-216ENST00000493107 DDX59Q5T1V6 619 aaKnown RBP eCLIP8.84□□□□□ -0.99
SEC22C-216ENST00000493107 FHL5Q5TD97 284 aa8.84□□□□□ -0.99
SEC22C-216ENST00000493107 YOD1Q5VVQ6 348 aaPredicted RBP8.84□□□□□ -0.99
SEC22C-216ENST00000493107 OR52E8Q6IFG1 317 aa8.84□□□□□ -0.99
SEC22C-216ENST00000493107 RHBDD2Q6NTF9 364 aa8.84□□□□□ -0.99
SEC22C-216ENST00000493107 PWWP2BQ6NUJ5 590 aa8.84□□□□□ -0.99
SEC22C-216ENST00000493107 TTLL10Q6ZVT0 673 aa8.84□□□□□ -0.99
SEC22C-216ENST00000493107 SERPINA11Q86U17 422 aa8.84□□□□□ -0.99
SEC22C-216ENST00000493107 IFNEQ86WN2 208 aa8.84□□□□□ -0.99
SEC22C-216ENST00000493107 OR4K14Q8NGD5 310 aa8.84□□□□□ -0.99
SEC22C-216ENST00000493107 OR51Q1Q8NH59 317 aa8.84□□□□□ -0.99
SEC22C-216ENST00000493107 OR5AK3PQ8NH89 298 aa8.84□□□□□ -0.99
SEC22C-216ENST00000493107 TANKQ92844 425 aa8.84□□□□□ -0.99
SEC22C-216ENST00000493107 PMEPA1Q969W9 287 aa8.84□□□□□ -0.99
SEC22C-216ENST00000493107 NEURL3Q96EH8 262 aa8.84□□□□□ -0.99
SEC22C-216ENST00000493107 RNF31Q96EP0 1072 aa8.84□□□□□ -0.99
SEC22C-216ENST00000493107 MVB12AQ96EY5 273 aa8.84□□□□□ -0.99
SEC22C-216ENST00000493107 MMABQ96EY8 250 aaPredicted RBP8.84□□□□□ -0.99
SEC22C-216ENST00000493107 DUS3LQ96G46 650 aaKnown RBP8.84□□□□□ -0.99
SEC22C-216ENST00000493107 PEX11GQ96HA9 241 aa8.84□□□□□ -0.99
SEC22C-216ENST00000493107 REXO5Q96IC2 774 aaKnown RBP8.84□□□□□ -0.99
SEC22C-216ENST00000493107 OR6C1Q96RD1 312 aa8.84□□□□□ -0.99
SEC22C-216ENST00000493107 PRRX2Q99811 253 aa8.84□□□□□ -0.99
SEC22C-216ENST00000493107 SH3GL1Q99961 368 aa8.84□□□□□ -0.99
SEC22C-216ENST00000493107 KCTD14Q9BQ13 255 aaPredicted RBP8.84□□□□□ -0.99
SEC22C-216ENST00000493107 THUMPD3Q9BV44 507 aaKnown RBP8.84□□□□□ -0.99
SEC22C-216ENST00000493107 RSPO3Q9BXY4 272 aaPredicted RBP8.84□□□□□ -0.99
SEC22C-216ENST00000493107 ANKRA2Q9H9E1 313 aa8.84□□□□□ -0.99
SEC22C-216ENST00000493107 ACTR3BQ9P1U1 418 aa8.84□□□□□ -0.99
SEC22C-216ENST00000493107 SERTAD3Q9UJW9 196 aa8.84□□□□□ -0.99
SEC22C-216ENST00000493107 AP3M1Q9Y2T2 418 aa8.84□□□□□ -0.99
SEC22C-216ENST00000493107 MAU2Q9Y6X3 613 aa8.84□□□□□ -0.99
SEC22C-216ENST00000493107 ASXL3Q9C0F0 2248 aa8.83□□□□□ -1
SEC22C-216ENST00000493107 RNF103-CHMP3A0A140T963 221 aa8.83□□□□□ -1
SEC22C-216ENST00000493107 A0A1W2PNU3 283 aaPredicted RBP8.83□□□□□ -1
SEC22C-216ENST00000493107 ELOVL7A1L3X0 281 aa8.83□□□□□ -1
SEC22C-216ENST00000493107 PLOD2O00469 737 aa8.83□□□□□ -1
SEC22C-216ENST00000493107 ARPC2O15144 300 aa8.83□□□□□ -1
SEC22C-216ENST00000493107 CTNSO60931 367 aa8.83□□□□□ -1
SEC22C-216ENST00000493107 NME6O75414 186 aaPredicted RBP8.83□□□□□ -1
SEC22C-216ENST00000493107 PSMG1O95456 288 aa8.83□□□□□ -1
SEC22C-216ENST00000493107 ANP32DO95626 131 aa8.83□□□□□ -1
SEC22C-216ENST00000493107 RECKO95980 971 aa8.83□□□□□ -1
SEC22C-216ENST00000493107 NTRK1P04629 796 aa8.83□□□□□ -1
SEC22C-216ENST00000493107 ATP1B1P05026 303 aa8.83□□□□□ -1
SEC22C-216ENST00000493107 CT62P0C5K7 136 aa8.83□□□□□ -1
SEC22C-216ENST00000493107 CCL4P13236 92 aa8.83□□□□□ -1
SEC22C-216ENST00000493107 ETFAP13804 333 aa8.83□□□□□ -1
SEC22C-216ENST00000493107 CCKBRP32239 447 aa8.83□□□□□ -1
SEC22C-216ENST00000493107 RORAP35398 523 aa8.83□□□□□ -1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23 ms