RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487876.1

RPSA-208, Transcript of ribosomal protein SA, human

TSL 4

Gene RPSA, Length 572 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RPSA-208	ENST00000487876	MYL2	P10916	166 aa		11.98	□□□□□ -0.49
RPSA-208	ENST00000487876	COX7A2	P14406	83 aa		11.98	□□□□□ -0.49
RPSA-208	ENST00000487876	ALOX15	P16050	662 aa	Predicted RBP	11.98	□□□□□ -0.49
RPSA-208	ENST00000487876	KRT4	P19013	534 aa		11.98	□□□□□ -0.49
RPSA-208	ENST00000487876	RNF4	P78317	190 aa		11.98	□□□□□ -0.49
RPSA-208	ENST00000487876	PLIN5	Q00G26	463 aa		11.98	□□□□□ -0.49
RPSA-208	ENST00000487876	LCP2	Q13094	533 aa		11.98	□□□□□ -0.49
RPSA-208	ENST00000487876	RNFT1	Q5M7Z0	435 aa		11.98	□□□□□ -0.49
RPSA-208	ENST00000487876	C10orf62	Q5T681	223 aa	Predicted RBP	11.98	□□□□□ -0.49
RPSA-208	ENST00000487876	SLC25A25	Q6KCM7	469 aa		11.98	□□□□□ -0.49
RPSA-208	ENST00000487876	MDGA2	Q7Z553	956 aa		11.98	□□□□□ -0.49
RPSA-208	ENST00000487876	PNPLA5	Q7Z6Z6	429 aa	Predicted RBP	11.98	□□□□□ -0.49
RPSA-208	ENST00000487876	CYP4Z2P	Q8N1L4	340 aa		11.98	□□□□□ -0.49
RPSA-208	ENST00000487876	TMEM156	Q8N614	296 aa		11.98	□□□□□ -0.49
RPSA-208	ENST00000487876	HORMAD2	Q8N7B1	307 aa		11.98	□□□□□ -0.49
RPSA-208	ENST00000487876	CCNYL1	Q8N7R7	359 aa		11.98	□□□□□ -0.49
RPSA-208	ENST00000487876	TMEM178A	Q8NBL3	297 aa		11.98	□□□□□ -0.49
RPSA-208	ENST00000487876	MYRIP	Q8NFW9	859 aa		11.98	□□□□□ -0.49
RPSA-208	ENST00000487876	AEN	Q8WTP8	325 aa	Known RBP	11.98	□□□□□ -0.49
RPSA-208	ENST00000487876	PPCS	Q9HAB8	311 aa		11.98	□□□□□ -0.49
RPSA-208	ENST00000487876	MYOT	Q9UBF9	498 aa		11.98	□□□□□ -0.49
RPSA-208	ENST00000487876	TIMM22	Q9Y584	194 aa		11.98	□□□□□ -0.49
RPSA-208	ENST00000487876	NAV2	Q8IVL1	2488 aa		11.98	□□□□□ -0.49
RPSA-208	ENST00000487876	MYO7B	Q6PIF6	2116 aa		11.98	□□□□□ -0.49
RPSA-208	ENST00000487876	CRYBG3	Q68DQ2	2970 aa		11.97	□□□□□ -0.49
RPSA-208	ENST00000487876	TLDC2	A0PJX2	215 aa		11.97	□□□□□ -0.49
RPSA-208	ENST00000487876	ASPDH	A6ND91	283 aa		11.97	□□□□□ -0.49
RPSA-208	ENST00000487876	COPE	O14579	308 aa		11.97	□□□□□ -0.49
RPSA-208	ENST00000487876	OR10H2	O60403	315 aa		11.97	□□□□□ -0.49
RPSA-208	ENST00000487876	CDH16	O75309	829 aa		11.97	□□□□□ -0.49
RPSA-208	ENST00000487876	IGKV3-11	P04433	115 aa		11.97	□□□□□ -0.49
RPSA-208	ENST00000487876	NUDT17	P0C025	328 aa		11.97	□□□□□ -0.49
RPSA-208	ENST00000487876	CRHR1	P34998	444 aa		11.97	□□□□□ -0.49
RPSA-208	ENST00000487876	RFC3	P40938	356 aa		11.97	□□□□□ -0.49
RPSA-208	ENST00000487876	SOX3	P41225	446 aa		11.97	□□□□□ -0.49
RPSA-208	ENST00000487876	SSR4	P51571	173 aa		11.97	□□□□□ -0.49
RPSA-208	ENST00000487876	MAPK12	P53778	367 aa		11.97	□□□□□ -0.49
RPSA-208	ENST00000487876	FOXA1	P55317	472 aa		11.97	□□□□□ -0.49
RPSA-208	ENST00000487876	ERVK-8	P63133	956 aa		11.97	□□□□□ -0.49
RPSA-208	ENST00000487876	GTF3C1	Q12789	2109 aa		11.97	□□□□□ -0.49
RPSA-208	ENST00000487876	ZNF750	Q32MQ0	723 aa		11.97	□□□□□ -0.49
RPSA-208	ENST00000487876	CCNYL2	Q5T2Q4	361 aa		11.97	□□□□□ -0.49
RPSA-208	ENST00000487876	NDUFAF5	Q5TEU4	345 aa		11.97	□□□□□ -0.49
RPSA-208	ENST00000487876	C1QL3	Q5VWW1	255 aa		11.97	□□□□□ -0.49
RPSA-208	ENST00000487876	OR52E8	Q6IFG1	317 aa		11.97	□□□□□ -0.49
RPSA-208	ENST00000487876	GFRAL	Q6UXV0	394 aa		11.97	□□□□□ -0.49
RPSA-208	ENST00000487876	C9orf40	Q8IXQ3	194 aa		11.97	□□□□□ -0.49
RPSA-208	ENST00000487876	ST13P4	Q8IZP2	240 aa	Predicted RBP	11.97	□□□□□ -0.49
RPSA-208	ENST00000487876	C1orf52	Q8N6N3	182 aa	Known RBP	11.97	□□□□□ -0.49
RPSA-208	ENST00000487876	DNAJB8	Q8NHS0	232 aa		11.97	□□□□□ -0.49
RPSA-208	ENST00000487876	METTL6	Q8TCB7	284 aa		11.97	□□□□□ -0.49
RPSA-208	ENST00000487876	AGAP11	Q8TF27	550 aa		11.97	□□□□□ -0.49
RPSA-208	ENST00000487876	SENP5	Q96HI0	755 aa	Predicted RBP	11.97	□□□□□ -0.49
RPSA-208	ENST00000487876	RASL10B	Q96S79	203 aa		11.97	□□□□□ -0.49
RPSA-208	ENST00000487876	CNPPD1	Q9BV87	410 aa		11.97	□□□□□ -0.49
RPSA-208	ENST00000487876	ACPT	Q9BZG2	426 aa		11.97	□□□□□ -0.49
RPSA-208	ENST00000487876	BRF2	Q9HAW0	419 aa		11.97	□□□□□ -0.49
RPSA-208	ENST00000487876	MID1IP1	Q9NPA3	183 aa		11.97	□□□□□ -0.49
RPSA-208	ENST00000487876	COPS7A	Q9UBW8	275 aa		11.97	□□□□□ -0.49
RPSA-208	ENST00000487876	SEC14L3	Q9UDX4	400 aa		11.97	□□□□□ -0.49
RPSA-208	ENST00000487876	ADAM29	Q9UKF5	820 aa		11.97	□□□□□ -0.49
RPSA-208	ENST00000487876	ERVK-19	Q9WJR5	959 aa		11.97	□□□□□ -0.49
RPSA-208	ENST00000487876	SLC5A6	Q9Y289	635 aa		11.97	□□□□□ -0.49
RPSA-208	ENST00000487876	YARS2	Q9Y2Z4	477 aa	Known RBP	11.97	□□□□□ -0.49
RPSA-208	ENST00000487876		A0A0G2JMM0	328 aa		11.96	□□□□□ -0.49
RPSA-208	ENST00000487876		A0A1W2PPB8	328 aa		11.96	□□□□□ -0.49
RPSA-208	ENST00000487876		A0A1W2PRS3	328 aa		11.96	□□□□□ -0.49
RPSA-208	ENST00000487876		A1L4Q6	167 aa		11.96	□□□□□ -0.49
RPSA-208	ENST00000487876	KIR3DP1	A8MWS1	328 aa		11.96	□□□□□ -0.49
RPSA-208	ENST00000487876	ZNHIT1	O43257	154 aa		11.96	□□□□□ -0.49
RPSA-208	ENST00000487876	LRRTM2	O43300	516 aa		11.96	□□□□□ -0.49
RPSA-208	ENST00000487876	MLYCD	O95822	493 aa		11.96	□□□□□ -0.49
RPSA-208	ENST00000487876	LDLR	P01130	860 aa		11.96	□□□□□ -0.49
RPSA-208	ENST00000487876	KRT6A	P02538	564 aa		11.96	□□□□□ -0.49
RPSA-208	ENST00000487876	CLPS	P04118	112 aa		11.96	□□□□□ -0.49
RPSA-208	ENST00000487876	KRT6B	P04259	564 aa		11.96	□□□□□ -0.49
RPSA-208	ENST00000487876	HMOX2	P30519	316 aa		11.96	□□□□□ -0.49
RPSA-208	ENST00000487876	PTGER1	P34995	402 aa		11.96	□□□□□ -0.49
RPSA-208	ENST00000487876	KRT6C	P48668	564 aa		11.96	□□□□□ -0.49
RPSA-208	ENST00000487876	MEOX1	P50221	254 aa		11.96	□□□□□ -0.49
RPSA-208	ENST00000487876	NAGLU	P54802	743 aa		11.96	□□□□□ -0.49
RPSA-208	ENST00000487876	GPR85	P60893	370 aa		11.96	□□□□□ -0.49
RPSA-208	ENST00000487876	HMGCS1	Q01581	520 aa		11.96	□□□□□ -0.49
RPSA-208	ENST00000487876	ALDH6A1	Q02252	535 aa	Known RBP	11.96	□□□□□ -0.49
RPSA-208	ENST00000487876	SLC18A2	Q05940	514 aa		11.96	□□□□□ -0.49
RPSA-208	ENST00000487876	ZNF267	Q14586	743 aa	Predicted RBP	11.96	□□□□□ -0.49
RPSA-208	ENST00000487876	SPRED3	Q2MJR0	410 aa		11.96	□□□□□ -0.49
RPSA-208	ENST00000487876	ERCC6L	Q2NKX8	1250 aa		11.96	□□□□□ -0.49
RPSA-208	ENST00000487876	CCDC153	Q494R4	210 aa		11.96	□□□□□ -0.49
RPSA-208	ENST00000487876	HIST2H2BC	Q6DN03	193 aa		11.96	□□□□□ -0.49
RPSA-208	ENST00000487876	WDR93	Q6P2C0	686 aa		11.96	□□□□□ -0.49
RPSA-208	ENST00000487876	SCIMP	Q6UWF3	145 aa		11.96	□□□□□ -0.49
RPSA-208	ENST00000487876	IL20RB	Q6UXL0	311 aa		11.96	□□□□□ -0.49
RPSA-208	ENST00000487876	FRMD7	Q6ZUT3	714 aa		11.96	□□□□□ -0.49
RPSA-208	ENST00000487876	PAGE2	Q7Z2X7	111 aa		11.96	□□□□□ -0.49
RPSA-208	ENST00000487876	SIAH3	Q8IW03	269 aa		11.96	□□□□□ -0.49
RPSA-208	ENST00000487876	ASB15	Q8WXK1	588 aa		11.96	□□□□□ -0.49
RPSA-208	ENST00000487876	TMEM125	Q96AQ2	219 aa		11.96	□□□□□ -0.49
RPSA-208	ENST00000487876	RBM18	Q96H35	190 aa	Known RBP	11.96	□□□□□ -0.49
RPSA-208	ENST00000487876	FBXL20	Q96IG2	436 aa		11.96	□□□□□ -0.49

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