RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487288.1

TAF6-215, Transcript of TATA-box binding protein associated factor 6, human

TSL 5

Gene TAF6, Length 1,195 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TAF6-215	ENST00000487288	WDR1	O75083	606 aa		13.69	□□□□□ -0.22
TAF6-215	ENST00000487288	SUPT3H	O75486	399 aa		13.69	□□□□□ -0.22
TAF6-215	ENST00000487288	KRT38	O76015	456 aa		13.69	□□□□□ -0.22
TAF6-215	ENST00000487288	LRAT	O95237	230 aa		13.69	□□□□□ -0.22
TAF6-215	ENST00000487288	CLPS	P04118	112 aa		13.69	□□□□□ -0.22
TAF6-215	ENST00000487288	S100B	P04271	92 aa	Predicted RBP	13.69	□□□□□ -0.22
TAF6-215	ENST00000487288	COX7A2	P14406	83 aa		13.69	□□□□□ -0.22
TAF6-215	ENST00000487288	PAFAH1B1	P43034	410 aa		13.69	□□□□□ -0.22
TAF6-215	ENST00000487288	TNFRSF17	Q02223	184 aa		13.69	□□□□□ -0.22
TAF6-215	ENST00000487288	MYBPH	Q13203	477 aa		13.69	□□□□□ -0.22
TAF6-215	ENST00000487288	DDX39B	Q13838	428 aa	Known RBP	13.69	□□□□□ -0.22
TAF6-215	ENST00000487288	KBTBD12	Q3ZCT8	623 aa		13.69	□□□□□ -0.22
TAF6-215	ENST00000487288	CES4A	Q5XG92	561 aa		13.69	□□□□□ -0.22
TAF6-215	ENST00000487288	SLC22A10	Q63ZE4	541 aa		13.69	□□□□□ -0.22
TAF6-215	ENST00000487288	GRHL2	Q6ISB3	625 aa		13.69	□□□□□ -0.22
TAF6-215	ENST00000487288	SEM1	Q6ZVN7	128 aa		13.69	□□□□□ -0.22
TAF6-215	ENST00000487288	GPR180	Q86V85	440 aa		13.69	□□□□□ -0.22
TAF6-215	ENST00000487288	CTAGE3P	Q8IX95	158 aa		13.69	□□□□□ -0.22
TAF6-215	ENST00000487288	CLYBL	Q8N0X4	340 aa		13.69	□□□□□ -0.22
TAF6-215	ENST00000487288	OR10G3	Q8NGC4	313 aa		13.69	□□□□□ -0.22
TAF6-215	ENST00000487288	HUS1B	Q8NHY5	278 aa		13.69	□□□□□ -0.22
TAF6-215	ENST00000487288	SARAF	Q96BY9	339 aa		13.69	□□□□□ -0.22
TAF6-215	ENST00000487288	SPACA9	Q96E40	222 aa	Predicted RBP	13.69	□□□□□ -0.22
TAF6-215	ENST00000487288	RBM18	Q96H35	190 aa	Known RBP	13.69	□□□□□ -0.22
TAF6-215	ENST00000487288	FBXL20	Q96IG2	436 aa		13.69	□□□□□ -0.22
TAF6-215	ENST00000487288	SLC6A15	Q9H2J7	730 aa		13.69	□□□□□ -0.22
TAF6-215	ENST00000487288	DMRT3	Q9NQL9	472 aa		13.69	□□□□□ -0.22
TAF6-215	ENST00000487288	ALKBH4	Q9NXW9	302 aa		13.69	□□□□□ -0.22
TAF6-215	ENST00000487288	WHRN	Q9P202	907 aa		13.69	□□□□□ -0.22
TAF6-215	ENST00000487288	OPTC	Q9UBM4	332 aa		13.69	□□□□□ -0.22
TAF6-215	ENST00000487288	CHCHD2	Q9Y6H1	151 aa	Predicted RBP	13.69	□□□□□ -0.22
TAF6-215	ENST00000487288	LRRC14B	A6NHZ5	514 aa		13.68	□□□□□ -0.22
TAF6-215	ENST00000487288	KDM4E	B2RXH2	506 aa	Predicted RBP	13.68	□□□□□ -0.22
TAF6-215	ENST00000487288	PROM1	O43490	865 aa		13.68	□□□□□ -0.22
TAF6-215	ENST00000487288	RAD51C	O43502	376 aa		13.68	□□□□□ -0.22
TAF6-215	ENST00000487288	TMPRSS11D	O60235	418 aa		13.68	□□□□□ -0.22
TAF6-215	ENST00000487288	HCN1	O60741	890 aa		13.68	□□□□□ -0.22
TAF6-215	ENST00000487288	EED	O75530	441 aa	Known RBP	13.68	□□□□□ -0.22
TAF6-215	ENST00000487288	FBXO45	P0C2W1	286 aa		13.68	□□□□□ -0.22
TAF6-215	ENST00000487288	ALOX15	P16050	662 aa	Predicted RBP	13.68	□□□□□ -0.22
TAF6-215	ENST00000487288	SPR	P35270	261 aa	Predicted RBP	13.68	□□□□□ -0.22
TAF6-215	ENST00000487288	IST1	P53990	364 aa		13.68	□□□□□ -0.22
TAF6-215	ENST00000487288	RPS13	P62277	151 aa	Known RBP	13.68	□□□□□ -0.22
TAF6-215	ENST00000487288	HERVK_113	P63132	956 aa		13.68	□□□□□ -0.22
TAF6-215	ENST00000487288	ERVK-8	P63133	956 aa		13.68	□□□□□ -0.22
TAF6-215	ENST00000487288	PLIN5	Q00G26	463 aa		13.68	□□□□□ -0.22
TAF6-215	ENST00000487288	WLS	Q5T9L3	541 aa		13.68	□□□□□ -0.22
TAF6-215	ENST00000487288	GRTP1	Q5TC63	336 aa		13.68	□□□□□ -0.22
TAF6-215	ENST00000487288	MRM1	Q6IN84	353 aa	Known RBP	13.68	□□□□□ -0.22
TAF6-215	ENST00000487288	RAPH1	Q70E73	1250 aa		13.68	□□□□□ -0.22
TAF6-215	ENST00000487288	LRRC25	Q8N386	305 aa	Predicted RBP	13.68	□□□□□ -0.22
TAF6-215	ENST00000487288	FBXW8	Q8N3Y1	598 aa		13.68	□□□□□ -0.22
TAF6-215	ENST00000487288	ZCCHC7	Q8N3Z6	543 aa	Known RBP	13.68	□□□□□ -0.22
TAF6-215	ENST00000487288	SLC15A4	Q8N697	577 aa		13.68	□□□□□ -0.22
TAF6-215	ENST00000487288	PPM1N	Q8N819	430 aa		13.68	□□□□□ -0.22
TAF6-215	ENST00000487288	SLC22A8	Q8TCC7	542 aa		13.68	□□□□□ -0.22
TAF6-215	ENST00000487288	TANK	Q92844	425 aa		13.68	□□□□□ -0.22
TAF6-215	ENST00000487288	RGMA	Q96B86	450 aa		13.68	□□□□□ -0.22
TAF6-215	ENST00000487288	NXNL1	Q96CM4	212 aa		13.68	□□□□□ -0.22
TAF6-215	ENST00000487288	MTERF1	Q99551	399 aa	Known RBP	13.68	□□□□□ -0.22
TAF6-215	ENST00000487288	ERVK-6	Q9BXR3	956 aa		13.68	□□□□□ -0.22
TAF6-215	ENST00000487288	NMRAL1	Q9HBL8	299 aa		13.68	□□□□□ -0.22
TAF6-215	ENST00000487288	PRM3	Q9NNZ6	103 aa		13.68	□□□□□ -0.22
TAF6-215	ENST00000487288	ZFP64	Q9NPA5	681 aa		13.68	□□□□□ -0.22
TAF6-215	ENST00000487288	MS4A12	Q9NXJ0	267 aa		13.68	□□□□□ -0.22
TAF6-215	ENST00000487288	CNOT11	Q9UKZ1	510 aa	Known RBP	13.68	□□□□□ -0.22
TAF6-215	ENST00000487288	ERVK-19	Q9WJR5	959 aa		13.68	□□□□□ -0.22
TAF6-215	ENST00000487288	ASB4	Q9Y574	426 aa		13.68	□□□□□ -0.22
TAF6-215	ENST00000487288	ITPR3	Q14573	2671 aa		13.67	□□□□□ -0.22
TAF6-215	ENST00000487288		A0A1W2PR48	441 aa		13.67	□□□□□ -0.22
TAF6-215	ENST00000487288		A0A1W2PS29	197 aa		13.67	□□□□□ -0.22
TAF6-215	ENST00000487288	FAM187A	A6NFU0	413 aa		13.67	□□□□□ -0.22
TAF6-215	ENST00000487288	GLOD5	A6NK44	160 aa		13.67	□□□□□ -0.22
TAF6-215	ENST00000487288	ZWINT	O95229	277 aa		13.67	□□□□□ -0.22
TAF6-215	ENST00000487288	LTA4H	P09960	611 aa	Known RBP	13.67	□□□□□ -0.22
TAF6-215	ENST00000487288	CD1E	P15812	388 aa		13.67	□□□□□ -0.22
TAF6-215	ENST00000487288	EPB42	P16452	691 aa		13.67	□□□□□ -0.22
TAF6-215	ENST00000487288	SERPINB1	P30740	379 aa		13.67	□□□□□ -0.22
TAF6-215	ENST00000487288	BSG	P35613	385 aa		13.67	□□□□□ -0.22
TAF6-215	ENST00000487288	PIK3CB	P42338	1070 aa		13.67	□□□□□ -0.22
TAF6-215	ENST00000487288	SLC37A1	P57057	533 aa		13.67	□□□□□ -0.22
TAF6-215	ENST00000487288	KCNJ2	P63252	427 aa		13.67	□□□□□ -0.22
TAF6-215	ENST00000487288	IRF9	Q00978	393 aa		13.67	□□□□□ -0.22
TAF6-215	ENST00000487288	CALCOCO2	Q13137	446 aa		13.67	□□□□□ -0.22
TAF6-215	ENST00000487288	ZNF267	Q14586	743 aa	Predicted RBP	13.67	□□□□□ -0.22
TAF6-215	ENST00000487288	SLMAP	Q14BN4	828 aa		13.67	□□□□□ -0.22
TAF6-215	ENST00000487288	EBP	Q15125	230 aa	Known RBP	13.67	□□□□□ -0.22
TAF6-215	ENST00000487288	TRADD	Q15628	312 aa		13.67	□□□□□ -0.22
TAF6-215	ENST00000487288	SPRED3	Q2MJR0	410 aa		13.67	□□□□□ -0.22
TAF6-215	ENST00000487288	RIPPLY2	Q5TAB7	128 aa		13.67	□□□□□ -0.22
TAF6-215	ENST00000487288	ARSK	Q6UWY0	536 aa		13.67	□□□□□ -0.22
TAF6-215	ENST00000487288	ST13P4	Q8IZP2	240 aa	Predicted RBP	13.67	□□□□□ -0.22
TAF6-215	ENST00000487288	CENPL	Q8N0S6	344 aa	Predicted RBP	13.67	□□□□□ -0.22
TAF6-215	ENST00000487288	TEX9	Q8N6V9	391 aa		13.67	□□□□□ -0.22
TAF6-215	ENST00000487288	NAXE	Q8NCW5	288 aa		13.67	□□□□□ -0.22
TAF6-215	ENST00000487288	FAM13C	Q8NE31	585 aa		13.67	□□□□□ -0.22
TAF6-215	ENST00000487288	KCTD4	Q8WVF5	259 aa		13.67	□□□□□ -0.22
TAF6-215	ENST00000487288	GAL3ST4	Q96RP7	486 aa		13.67	□□□□□ -0.22
TAF6-215	ENST00000487288	WWTR1	Q9GZV5	400 aa		13.67	□□□□□ -0.22
TAF6-215	ENST00000487288	LIME1	Q9H400	295 aa		13.67	□□□□□ -0.22

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.7 ms