RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469529.6

TRAF4-208, Transcript of TNF receptor associated factor 4, human

TSL 2

Gene TRAF4, Length 788 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TRAF4-208	ENST00000469529	BMP2	P12643	396 aa		11.99	□□□□□ -0.49
TRAF4-208	ENST00000469529	POR	P16435	677 aa	Predicted RBP	11.99	□□□□□ -0.49
TRAF4-208	ENST00000469529	HTR1E	P28566	365 aa		11.99	□□□□□ -0.49
TRAF4-208	ENST00000469529	NTS	P30990	170 aa		11.99	□□□□□ -0.49
TRAF4-208	ENST00000469529	CDKN2C	P42773	168 aa		11.99	□□□□□ -0.49
TRAF4-208	ENST00000469529	SLC7A2	P52569	658 aa		11.99	□□□□□ -0.49
TRAF4-208	ENST00000469529	RAB15	P59190	212 aa		11.99	□□□□□ -0.49
TRAF4-208	ENST00000469529	ABHD18	Q0P651	414 aa		11.99	□□□□□ -0.49
TRAF4-208	ENST00000469529	TRIM25	Q14258	630 aa	Known RBP	11.99	□□□□□ -0.49
TRAF4-208	ENST00000469529	PWWP2B	Q6NUJ5	590 aa		11.99	□□□□□ -0.49
TRAF4-208	ENST00000469529	ZNF621	Q6ZSS3	439 aa		11.99	□□□□□ -0.49
TRAF4-208	ENST00000469529	NET1	Q7Z628	596 aa	Predicted RBP	11.99	□□□□□ -0.49
TRAF4-208	ENST00000469529	ANKRD46	Q86W74	232 aa		11.99	□□□□□ -0.49
TRAF4-208	ENST00000469529	CALHM3	Q86XJ0	350 aa		11.99	□□□□□ -0.49
TRAF4-208	ENST00000469529	PTRH1	Q86Y79	214 aa	Known RBP	11.99	□□□□□ -0.49
TRAF4-208	ENST00000469529	CLECL1	Q8IZS7	167 aa		11.99	□□□□□ -0.49
TRAF4-208	ENST00000469529	OR51Q1	Q8NH59	317 aa		11.99	□□□□□ -0.49
TRAF4-208	ENST00000469529	CIDEC	Q96AQ7	238 aa	Predicted RBP	11.99	□□□□□ -0.49
TRAF4-208	ENST00000469529	EXOSC8	Q96B26	276 aa	Known RBP	11.99	□□□□□ -0.49
TRAF4-208	ENST00000469529	ZNF583	Q96ND8	569 aa		11.99	□□□□□ -0.49
TRAF4-208	ENST00000469529	CNTNAP3B	Q96NU0	1288 aa		11.99	□□□□□ -0.49
TRAF4-208	ENST00000469529	BBS4	Q96RK4	519 aa		11.99	□□□□□ -0.49
TRAF4-208	ENST00000469529	CPPED1	Q9BRF8	314 aa	Predicted RBP	11.99	□□□□□ -0.49
TRAF4-208	ENST00000469529	SPATA9	Q9BWV2	254 aa		11.99	□□□□□ -0.49
TRAF4-208	ENST00000469529	CNTNAP3	Q9BZ76	1288 aa		11.99	□□□□□ -0.49
TRAF4-208	ENST00000469529	FAM117A	Q9C073	453 aa		11.99	□□□□□ -0.49
TRAF4-208	ENST00000469529	SLC26A1	Q9H2B4	701 aa		11.99	□□□□□ -0.49
TRAF4-208	ENST00000469529	MUC13	Q9H3R2	512 aa		11.99	□□□□□ -0.49
TRAF4-208	ENST00000469529	GLIPR2	Q9H4G4	154 aa		11.99	□□□□□ -0.49
TRAF4-208	ENST00000469529	RAD21L1	Q9H4I0	556 aa		11.99	□□□□□ -0.49
TRAF4-208	ENST00000469529	TPT1P8	Q9HAU6	139 aa		11.99	□□□□□ -0.49
TRAF4-208	ENST00000469529	MKKS	Q9NPJ1	570 aa	Predicted RBP	11.99	□□□□□ -0.49
TRAF4-208	ENST00000469529	LANCL2	Q9NS86	450 aa		11.99	□□□□□ -0.49
TRAF4-208	ENST00000469529	SLC6A13	Q9NSD5	602 aa		11.99	□□□□□ -0.49
TRAF4-208	ENST00000469529	SIRT3	Q9NTG7	399 aa	Predicted RBP	11.99	□□□□□ -0.49
TRAF4-208	ENST00000469529	IRAK4	Q9NWZ3	460 aa		11.99	□□□□□ -0.49
TRAF4-208	ENST00000469529	ANGPTL2	Q9UKU9	493 aa		11.99	□□□□□ -0.49
TRAF4-208	ENST00000469529	PCDHGA3	Q9Y5H0	932 aa		11.99	□□□□□ -0.49
TRAF4-208	ENST00000469529	CLDN16	Q9Y5I7	305 aa		11.99	□□□□□ -0.49
TRAF4-208	ENST00000469529		A0A087WV62	115 aa		11.98	□□□□□ -0.49
TRAF4-208	ENST00000469529	ZNF860	A6NHJ4	632 aa		11.98	□□□□□ -0.49
TRAF4-208	ENST00000469529	WASHC1	A8K0Z3	465 aa		11.98	□□□□□ -0.49
TRAF4-208	ENST00000469529	EFCAB7	A8K855	629 aa		11.98	□□□□□ -0.49
TRAF4-208	ENST00000469529	ANKRD65	E5RJM6	399 aa		11.98	□□□□□ -0.49
TRAF4-208	ENST00000469529	ACOT8	O14734	319 aa		11.98	□□□□□ -0.49
TRAF4-208	ENST00000469529	SCRG1	O75711	98 aa		11.98	□□□□□ -0.49
TRAF4-208	ENST00000469529	SOX30	O94993	753 aa		11.98	□□□□□ -0.49
TRAF4-208	ENST00000469529	BMP10	O95393	424 aa		11.98	□□□□□ -0.49
TRAF4-208	ENST00000469529	ANP32D	O95626	131 aa		11.98	□□□□□ -0.49
TRAF4-208	ENST00000469529	CPSF4	O95639	269 aa	Known RBP	11.98	□□□□□ -0.49
TRAF4-208	ENST00000469529	KRT75	O95678	551 aa		11.98	□□□□□ -0.49
TRAF4-208	ENST00000469529	CPM	P14384	443 aa		11.98	□□□□□ -0.49
TRAF4-208	ENST00000469529	ALAS2	P22557	587 aa		11.98	□□□□□ -0.49
TRAF4-208	ENST00000469529	MVD	P53602	400 aa		11.98	□□□□□ -0.49
TRAF4-208	ENST00000469529	SIM1	P81133	766 aa	Predicted RBP	11.98	□□□□□ -0.49
TRAF4-208	ENST00000469529	DCD	P81605	110 aa	Known RBP	11.98	□□□□□ -0.49
TRAF4-208	ENST00000469529	BNIP2	Q12982	314 aa		11.98	□□□□□ -0.49
TRAF4-208	ENST00000469529	FADD	Q13158	208 aa		11.98	□□□□□ -0.49
TRAF4-208	ENST00000469529	SERTAD2	Q14140	314 aa		11.98	□□□□□ -0.49
TRAF4-208	ENST00000469529	CAPRIN1	Q14444	709 aa	Known RBP	11.98	□□□□□ -0.49
TRAF4-208	ENST00000469529	BHLHB9	Q6PI77	547 aa		11.98	□□□□□ -0.49
TRAF4-208	ENST00000469529	ZNF517	Q6ZMY9	492 aa	Predicted RBP	11.98	□□□□□ -0.49
TRAF4-208	ENST00000469529	QSOX2	Q6ZRP7	698 aa		11.98	□□□□□ -0.49
TRAF4-208	ENST00000469529	SERPINA11	Q86U17	422 aa		11.98	□□□□□ -0.49
TRAF4-208	ENST00000469529	C10orf67	Q8IYJ2	551 aa		11.98	□□□□□ -0.49
TRAF4-208	ENST00000469529	LRRC25	Q8N386	305 aa	Predicted RBP	11.98	□□□□□ -0.49
TRAF4-208	ENST00000469529	TMEM52	Q8NDY8	209 aa		11.98	□□□□□ -0.49
TRAF4-208	ENST00000469529	FAM13C	Q8NE31	585 aa		11.98	□□□□□ -0.49
TRAF4-208	ENST00000469529	PLPP5	Q8NEB5	264 aa		11.98	□□□□□ -0.49
TRAF4-208	ENST00000469529	TNIP2	Q8NFZ5	429 aa		11.98	□□□□□ -0.49
TRAF4-208	ENST00000469529	OR52E4	Q8NGH9	312 aa		11.98	□□□□□ -0.49
TRAF4-208	ENST00000469529	OR52N2	Q8NGI0	321 aa		11.98	□□□□□ -0.49
TRAF4-208	ENST00000469529	OR4A15	Q8NGL6	344 aa		11.98	□□□□□ -0.49
TRAF4-208	ENST00000469529	MIPOL1	Q8TD10	442 aa		11.98	□□□□□ -0.49
TRAF4-208	ENST00000469529	SFXN5	Q8TD22	340 aa		11.98	□□□□□ -0.49
TRAF4-208	ENST00000469529	ZNF675	Q8TD23	568 aa		11.98	□□□□□ -0.49
TRAF4-208	ENST00000469529	POP5	Q969H6	163 aa	Known RBP	11.98	□□□□□ -0.49
TRAF4-208	ENST00000469529	CTHRC1	Q96CG8	243 aa		11.98	□□□□□ -0.49
TRAF4-208	ENST00000469529	NEURL3	Q96EH8	262 aa		11.98	□□□□□ -0.49
TRAF4-208	ENST00000469529	CSF3R	Q99062	836 aa		11.98	□□□□□ -0.49
TRAF4-208	ENST00000469529	PELO	Q9BRX2	385 aa	Known RBP	11.98	□□□□□ -0.49
TRAF4-208	ENST00000469529	SLC39A3	Q9BRY0	314 aa		11.98	□□□□□ -0.49
TRAF4-208	ENST00000469529	DDA1	Q9BW61	102 aa		11.98	□□□□□ -0.49
TRAF4-208	ENST00000469529	ASPSCR1	Q9BZE9	553 aa		11.98	□□□□□ -0.49
TRAF4-208	ENST00000469529	SPRY4	Q9C004	299 aa		11.98	□□□□□ -0.49
TRAF4-208	ENST00000469529	SYNDIG1	Q9H7V2	258 aa		11.98	□□□□□ -0.49
TRAF4-208	ENST00000469529	IL1RL2	Q9HB29	575 aa		11.98	□□□□□ -0.49
TRAF4-208	ENST00000469529	SEMA3G	Q9NS98	782 aa		11.98	□□□□□ -0.49
TRAF4-208	ENST00000469529	ADA2	Q9NZK5	511 aa		11.98	□□□□□ -0.49
TRAF4-208	ENST00000469529	SUCO	Q9UBS9	1254 aa	Known RBP	11.98	□□□□□ -0.49
TRAF4-208	ENST00000469529	BCAP29	Q9UHQ4	241 aa		11.98	□□□□□ -0.49
TRAF4-208	ENST00000469529	ENTPD4	Q9Y227	616 aa		11.98	□□□□□ -0.49
TRAF4-208	ENST00000469529	POMP	Q9Y244	141 aa		11.98	□□□□□ -0.49
TRAF4-208	ENST00000469529	PCNX2	A6NKB5	2137 aa		11.98	□□□□□ -0.49
TRAF4-208	ENST00000469529	SPAAR	A0A1B0GVQ0	90 aa		11.97	□□□□□ -0.49
TRAF4-208	ENST00000469529	GLOD5	A6NK44	160 aa		11.97	□□□□□ -0.49
TRAF4-208	ENST00000469529	VSTM2B	A6NLU5	285 aa		11.97	□□□□□ -0.49
TRAF4-208	ENST00000469529	FAM227A	F5H4B4	570 aa		11.97	□□□□□ -0.49
TRAF4-208	ENST00000469529	PLOD3	O60568	738 aa		11.97	□□□□□ -0.49
TRAF4-208	ENST00000469529	ERAL1	O75616	437 aa	Known RBP	11.97	□□□□□ -0.49

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