RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442481.5

PRAME-210, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 3

Gene PRAME, Length 581 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-210ENST00000442481 ACOT7O00154 380 aa10.87□□□□□ -0.67
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PRAME-210ENST00000442481 B3GALT2O43825 422 aa10.87□□□□□ -0.67
PRAME-210ENST00000442481 CDC40O60508 579 aaKnown RBP eCLIP10.87□□□□□ -0.67
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PRAME-210ENST00000442481 RNF175Q8N4F7 328 aa10.87□□□□□ -0.67
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PRAME-210ENST00000442481 MS4A6EQ96DS6 147 aa10.87□□□□□ -0.67
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PRAME-210ENST00000442481 OR7G3Q8NG95 312 aa10.86□□□□□ -0.67
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PRAME-210ENST00000442481 OR51B5Q9H339 312 aa10.86□□□□□ -0.67
PRAME-210ENST00000442481 TIMMDC1Q9NPL8 285 aa10.86□□□□□ -0.67
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PRAME-210ENST00000442481 SBK3P0C264 359 aa10.85□□□□□ -0.67
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PRAME-210ENST00000442481 SMIM10L1P0DMW3 83 aa10.85□□□□□ -0.67
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PRAME-210ENST00000442481 HOXB4P17483 251 aaPredicted RBP10.85□□□□□ -0.67
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PRAME-210ENST00000442481 MAOAP21397 527 aa10.85□□□□□ -0.67
PRAME-210ENST00000442481 ALDH3A1P30838 453 aa10.85□□□□□ -0.67
PRAME-210ENST00000442481 DNAJA1P31689 397 aaKnown RBP10.85□□□□□ -0.67
PRAME-210ENST00000442481 CASP2P42575 452 aa10.85□□□□□ -0.67
PRAME-210ENST00000442481 ST13P50502 369 aaKnown RBP10.85□□□□□ -0.67
PRAME-210ENST00000442481 CLCN2P51788 898 aa10.85□□□□□ -0.67
PRAME-210ENST00000442481 MTTPP55157 894 aa10.85□□□□□ -0.67
PRAME-210ENST00000442481 BTG2P78543 158 aa10.85□□□□□ -0.67
PRAME-210ENST00000442481 GUCY1A3Q02108 690 aa10.85□□□□□ -0.67
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