RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409189.7

CCL20-202, Transcript of C-C motif chemokine ligand 20, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCL20, Length 839 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL20-202ENST00000409189 ULK1O75385 1050 aa6.24□□□□□ -1.41
CCL20-202ENST00000409189 EEDO75530 441 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
CCL20-202ENST00000409189 ATP6AP2O75787 350 aa6.24□□□□□ -1.41
CCL20-202ENST00000409189 PCDH8O95206 1070 aa6.24□□□□□ -1.41
CCL20-202ENST00000409189 C1orf105O95561 183 aa6.24□□□□□ -1.41
CCL20-202ENST00000409189 WNT1P04628 370 aa6.24□□□□□ -1.41
CCL20-202ENST00000409189 HOXC4P09017 264 aaPredicted RBP6.24□□□□□ -1.41
CCL20-202ENST00000409189 LINC00032P0C843 101 aa6.24□□□□□ -1.41
CCL20-202ENST00000409189 ERGP11308 486 aa6.24□□□□□ -1.41
CCL20-202ENST00000409189 ZNF8P17098 575 aaPredicted RBP6.24□□□□□ -1.41
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CCL20-202ENST00000409189 PBLDP30039 288 aaPredicted RBP6.24□□□□□ -1.41
CCL20-202ENST00000409189 HNRNPH1P31943 449 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
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CCL20-202ENST00000409189 MBNL2Q5VZF2 373 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
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CCL20-202ENST00000409189 C11orf96Q7Z7L8 435 aa6.24□□□□□ -1.41
CCL20-202ENST00000409189 TRIM74Q86UV6 250 aa6.24□□□□□ -1.41
CCL20-202ENST00000409189 AMZ2Q86W34 360 aa6.24□□□□□ -1.41
CCL20-202ENST00000409189 ZFAND4Q86XD8 727 aa6.24□□□□□ -1.41
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CCL20-202ENST00000409189 DEFB107AQ8IZN7 70 aa6.24□□□□□ -1.41
CCL20-202ENST00000409189 DSELQ8IZU8 1212 aa6.24□□□□□ -1.41
CCL20-202ENST00000409189 RAB42Q8N4Z0 105 aa6.24□□□□□ -1.41
CCL20-202ENST00000409189 FNDC5Q8NAU1 212 aa6.24□□□□□ -1.41
CCL20-202ENST00000409189 GLB1L3Q8NCI6 653 aaPredicted RBP6.24□□□□□ -1.41
CCL20-202ENST00000409189 OR2T11Q8NH01 316 aa6.24□□□□□ -1.41
CCL20-202ENST00000409189 ST8SIA2Q92186 375 aa6.24□□□□□ -1.41
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CCL20-202ENST00000409189 TIMM22Q9Y584 194 aa6.24□□□□□ -1.41
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CCL20-202ENST00000409189 PTGDR2Q9Y5Y4 395 aa6.24□□□□□ -1.41
CCL20-202ENST00000409189 ANKHD1Q8IWZ3 2542 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
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CCL20-202ENST00000409189 H0YIV9 168 aa6.23□□□□□ -1.41
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CCL20-202ENST00000409189 IGLV3-19P01714 112 aa6.23□□□□□ -1.41
CCL20-202ENST00000409189 SLC35G4P0C7Q5 338 aa6.23□□□□□ -1.41
CCL20-202ENST00000409189 GNAZP19086 355 aa6.23□□□□□ -1.41
CCL20-202ENST00000409189 CAPN3P20807 821 aa6.23□□□□□ -1.41
CCL20-202ENST00000409189 KELP23276 732 aa6.23□□□□□ -1.41
CCL20-202ENST00000409189 SERPINB1P30740 379 aa6.23□□□□□ -1.41
CCL20-202ENST00000409189 ACSL1P33121 698 aa6.23□□□□□ -1.41
CCL20-202ENST00000409189 NUDT1P36639 197 aa6.23□□□□□ -1.41
CCL20-202ENST00000409189 GNPDA1P46926 289 aa6.23□□□□□ -1.41
CCL20-202ENST00000409189 CLNS1AP54105 237 aaKnown RBP6.23□□□□□ -1.41
CCL20-202ENST00000409189 PFN3P60673 137 aa6.23□□□□□ -1.41
CCL20-202ENST00000409189 RPL38P63173 70 aaKnown RBP6.23□□□□□ -1.41
CCL20-202ENST00000409189 PRKG2Q13237 762 aa6.23□□□□□ -1.41
CCL20-202ENST00000409189 SGCGQ13326 291 aa6.23□□□□□ -1.41
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