RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000394202.8

CNN3-202, Transcript of calponin 3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CNN3, Length 1,974 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNN3-202ENST00000394202 CDK9P50750 372 aaKnown RBP21.88■■□□□ 1.09
CNN3-202ENST00000394202 NCBP2P52298 156 aaKnown RBP eCLIP21.88■■□□□ 1.09
CNN3-202ENST00000394202 BTG2P78543 158 aa21.88■■□□□ 1.09
CNN3-202ENST00000394202 DSG2Q14126 1118 aa21.88■■□□□ 1.09
CNN3-202ENST00000394202 CEBPEQ15744 281 aa21.88■■□□□ 1.09
CNN3-202ENST00000394202 PIGGQ5H8A4 983 aa21.88■■□□□ 1.09
CNN3-202ENST00000394202 OR4K14Q8NGD5 310 aa21.88■■□□□ 1.09
CNN3-202ENST00000394202 TBC1D20Q96BZ9 403 aa21.88■■□□□ 1.09
CNN3-202ENST00000394202 CLIP3Q96DZ5 547 aa21.88■■□□□ 1.09
CNN3-202ENST00000394202 ZBED6CLQ96FA7 236 aaPredicted RBP21.88■■□□□ 1.09
CNN3-202ENST00000394202 AKIRIN1Q9H9L7 192 aaPredicted RBP21.88■■□□□ 1.09
CNN3-202ENST00000394202 SIRT3Q9NTG7 399 aaPredicted RBP21.88■■□□□ 1.09
CNN3-202ENST00000394202 SLC39A1Q9NY26 324 aa21.88■■□□□ 1.09
CNN3-202ENST00000394202 ABCD2Q9UBJ2 740 aa21.88■■□□□ 1.09
CNN3-202ENST00000394202 PSME2Q9UL46 239 aa21.88■■□□□ 1.09
CNN3-202ENST00000394202 CDC14AQ9UNH5 594 aa21.88■■□□□ 1.09
CNN3-202ENST00000394202 MAP4K5Q9Y4K4 846 aa21.88■■□□□ 1.09
CNN3-202ENST00000394202 PCDHB3Q9Y5E6 796 aa21.88■■□□□ 1.09
CNN3-202ENST00000394202 FOXL2P58012 376 aa21.88■■□□□ 1.09
CNN3-202ENST00000394202 PRMT9Q6P2P2 845 aa21.88■■□□□ 1.09
CNN3-202ENST00000394202 RAB11FIP2Q7L804 512 aa21.88■■□□□ 1.09
CNN3-202ENST00000394202 TMEM151BQ8IW70 566 aa21.88■■□□□ 1.09
CNN3-202ENST00000394202 SCUBE1Q8IWY4 988 aa21.88■■□□□ 1.09
CNN3-202ENST00000394202 OR5AK3PQ8NH89 298 aa21.88■■□□□ 1.09
CNN3-202ENST00000394202 OR5P2Q8WZ92 322 aa21.88■■□□□ 1.09
CNN3-202ENST00000394202 PHF12Q96QT6 1004 aa21.88■■□□□ 1.09
CNN3-202ENST00000394202 CLK4Q9HAZ1 481 aaKnown RBP21.88■■□□□ 1.09
CNN3-202ENST00000394202 ACSS1Q9NUB1 689 aaPredicted RBP21.88■■□□□ 1.09
CNN3-202ENST00000394202 SLC7A8Q9UHI5 535 aa21.88■■□□□ 1.09
CNN3-202ENST00000394202 ACSL6Q9UKU0 697 aa21.88■■□□□ 1.09
CNN3-202ENST00000394202 PCDHGB4Q9UN71 923 aa21.88■■□□□ 1.09
CNN3-202ENST00000394202 CLDN16Q9Y5I7 305 aa21.88■■□□□ 1.09
CNN3-202ENST00000394202 ZNF780BQ9Y6R6 833 aa21.88■■□□□ 1.09
CNN3-202ENST00000394202 TCN1P20061 433 aaPredicted RBP21.87■■□□□ 1.09
CNN3-202ENST00000394202 FBLP22087 321 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
CNN3-202ENST00000394202 LTB4RQ15722 352 aa21.87■■□□□ 1.09
CNN3-202ENST00000394202 VWA2Q5GFL6 755 aa21.87■■□□□ 1.09
CNN3-202ENST00000394202 COX15Q7KZN9 410 aa21.87■■□□□ 1.09
CNN3-202ENST00000394202 DNAJB8Q8NHS0 232 aa21.87■■□□□ 1.09
CNN3-202ENST00000394202 PNPT1Q8TCS8 783 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
CNN3-202ENST00000394202 TANKQ92844 425 aa21.87■■□□□ 1.09
CNN3-202ENST00000394202 STRADBQ9C0K7 418 aa21.87■■□□□ 1.09
CNN3-202ENST00000394202 PIF1Q9H611 641 aa21.87■■□□□ 1.09
CNN3-202ENST00000394202 LANCL2Q9NS86 450 aa21.87■■□□□ 1.09
CNN3-202ENST00000394202 CD300AQ9UGN4 299 aa21.87■■□□□ 1.09
CNN3-202ENST00000394202 PRPF19Q9UMS4 504 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
CNN3-202ENST00000394202 USP22Q9UPT9 525 aa21.87■■□□□ 1.09
CNN3-202ENST00000394202 ENTPD4Q9Y227 616 aa21.87■■□□□ 1.09
CNN3-202ENST00000394202 CFAP73A6NFT4 308 aa21.87■■□□□ 1.09
CNN3-202ENST00000394202 B4E171 279 aa21.87■■□□□ 1.09
CNN3-202ENST00000394202 NVLO15381 856 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
CNN3-202ENST00000394202 GPR75O95800 540 aa21.87■■□□□ 1.09
CNN3-202ENST00000394202 FHP07954 510 aa21.87■■□□□ 1.09
CNN3-202ENST00000394202 CSNK2A2P19784 350 aaPredicted RBP21.87■■□□□ 1.09
CNN3-202ENST00000394202 NTSP30990 170 aa21.87■■□□□ 1.09
CNN3-202ENST00000394202 TSPAN7P41732 249 aa21.87■■□□□ 1.09
CNN3-202ENST00000394202 EFNA3P52797 238 aa21.87■■□□□ 1.09
CNN3-202ENST00000394202 LARP7Q4G0J3 582 aaKnown RBP eCLIP21.87■■□□□ 1.09
CNN3-202ENST00000394202 ARHGAP40Q5TG30 622 aa21.87■■□□□ 1.09
CNN3-202ENST00000394202 FBXW10Q5XX13 1052 aa21.87■■□□□ 1.09
CNN3-202ENST00000394202 ZNF385CQ66K41 422 aaPredicted RBP21.87■■□□□ 1.09
CNN3-202ENST00000394202 LCN10Q6JVE6 187 aa21.87■■□□□ 1.09
CNN3-202ENST00000394202 BPHLQ86WA6 291 aaPredicted RBP21.87■■□□□ 1.09
CNN3-202ENST00000394202 MARCH9Q86YJ5 346 aa21.87■■□□□ 1.09
CNN3-202ENST00000394202 FBXW8Q8N3Y1 598 aa21.87■■□□□ 1.09
CNN3-202ENST00000394202 NATD1Q8N6N6 113 aa21.87■■□□□ 1.09
CNN3-202ENST00000394202 ADCY4Q8NFM4 1077 aa21.87■■□□□ 1.09
CNN3-202ENST00000394202 DOK4Q8TEW6 326 aa21.87■■□□□ 1.09
CNN3-202ENST00000394202 CCDC124Q96CT7 223 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
CNN3-202ENST00000394202 CPPED1Q9BRF8 314 aaPredicted RBP21.87■■□□□ 1.09
CNN3-202ENST00000394202 PRDM9Q9NQV7 894 aa21.87■■□□□ 1.09
CNN3-202ENST00000394202 CTSFQ9UBX1 484 aa21.87■■□□□ 1.09
CNN3-202ENST00000394202 SNX8Q9Y5X2 465 aa21.87■■□□□ 1.09
CNN3-202ENST00000394202 B3GALT1Q9Y5Z6 326 aa21.87■■□□□ 1.09
CNN3-202ENST00000394202 DDX5P17844 614 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
CNN3-202ENST00000394202 MAOAP21397 527 aa21.86■■□□□ 1.09
CNN3-202ENST00000394202 CASP9P55211 416 aa21.86■■□□□ 1.09
CNN3-202ENST00000394202 LRRC74AQ0VAA2 488 aa21.86■■□□□ 1.09
CNN3-202ENST00000394202 OR9A2Q8NGT5 310 aa21.86■■□□□ 1.09
CNN3-202ENST00000394202 LIN37Q96GY3 246 aaPredicted RBP21.86■■□□□ 1.09
CNN3-202ENST00000394202 THUMPD3Q9BV44 507 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
CNN3-202ENST00000394202 VPS4AQ9UN37 437 aa21.86■■□□□ 1.09
CNN3-202ENST00000394202 CLIC1O00299 241 aa21.85■■□□□ 1.09
CNN3-202ENST00000394202 BMP10O95393 424 aa21.85■■□□□ 1.09
CNN3-202ENST00000394202 ZCCHC18P0CG32 403 aa21.85■■□□□ 1.09
CNN3-202ENST00000394202 CPMP14384 443 aa21.85■■□□□ 1.09
CNN3-202ENST00000394202 RORAP35398 523 aa21.85■■□□□ 1.09
CNN3-202ENST00000394202 MAPK10P53779 464 aa21.85■■□□□ 1.09
CNN3-202ENST00000394202 ABHD18Q0P651 414 aa21.85■■□□□ 1.09
CNN3-202ENST00000394202 SLC13A2Q13183 592 aa21.85■■□□□ 1.09
CNN3-202ENST00000394202 MLC1Q15049 377 aa21.85■■□□□ 1.09
CNN3-202ENST00000394202 NKAIN1Q4KMZ8 207 aa21.85■■□□□ 1.09
CNN3-202ENST00000394202 FAM13CQ8NE31 585 aa21.85■■□□□ 1.09
CNN3-202ENST00000394202 OR8J3Q8NGG0 315 aa21.85■■□□□ 1.09
CNN3-202ENST00000394202 ZFP90Q8TF47 636 aa21.85■■□□□ 1.09
CNN3-202ENST00000394202 MMADHCQ9H3L0 296 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
CNN3-202ENST00000394202 ANKRA2Q9H9E1 313 aa21.85■■□□□ 1.09
CNN3-202ENST00000394202 TPT1P8Q9HAU6 139 aa21.85■■□□□ 1.09
CNN3-202ENST00000394202 GPATCH2Q9NW75 528 aa21.85■■□□□ 1.09
CNN3-202ENST00000394202 AKAP7Q9P0M2 348 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 60.1 ms