RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000348564.10

PTPRC-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 4,626 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-201ENST00000348564 MPDZO75970 2070 aa4.19□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 ZCWPW2A0A1B0GU75 182 aa4.19□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 SH3PXD2BA1X283 911 aa4.19□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 TARM1B6A8C7 271 aa4.19□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 TK2O00142 265 aa4.19□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 NDUFAB1O14561 156 aa4.19□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 HAT1O14929 419 aa4.19□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 TOX3O15405 576 aaPredicted RBP4.19□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 ALDOAP04075 364 aaKnown RBP4.19□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 SERPINA7P05543 415 aa4.19□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 THRAP10827 490 aa4.19□□□□□ -1.74
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PTPRC-201ENST00000348564 KIR3DL1P43629 444 aa4.19□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 RPS7P62081 194 aaKnown RBP4.19□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 TLE3Q04726 772 aa4.19□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 MYBPC3Q14896 1274 aa4.19□□□□□ -1.74
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PTPRC-201ENST00000348564 IQCCQ4KMZ1 466 aa4.19□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 FLYWCH1Q4VC44 716 aa4.19□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 TEDDM1Q5T9Z0 273 aa4.19□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 VWA5B1Q5TIE3 1220 aa4.19□□□□□ -1.74
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PTPRC-201ENST00000348564 NOXRED1Q6NXP6 359 aa4.19□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 AAGABQ6PD74 315 aa4.19□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 VHLLQ6RSH7 139 aa4.19□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 OVCH1Q7RTY7 1134 aa4.19□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 PELI3Q8N2H9 469 aa4.19□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 PHTF2Q8N3S3 785 aa4.19□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 ACOT4Q8N9L9 421 aa4.19□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 OR1J4Q8NGS1 313 aa4.19□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 LPGAT1Q92604 370 aa4.19□□□□□ -1.74
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PTPRC-201ENST00000348564 TRIB1Q96RU8 372 aa4.19□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 SERINC2Q96SA4 455 aa4.19□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 SLC39A3Q9BRY0 314 aa4.19□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 DDA1Q9BW61 102 aa4.19□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 FOLH1BQ9HBA9 442 aa4.19□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 DYNLRB1Q9NP97 96 aa4.19□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 SACM1LQ9NTJ5 587 aa4.19□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 TEX10Q9NXF1 929 aaPredicted RBP4.19□□□□□ -1.74
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PTPRC-201ENST00000348564 RFXANKO14593 260 aa4.19□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 AIM2O14862 343 aa4.19□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 KLHL2O95198 593 aa4.19□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 EML2O95834 649 aa4.19□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 HOXC4P09017 264 aaPredicted RBP4.19□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 PNLIPP16233 465 aa4.19□□□□□ -1.74
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PTPRC-201ENST00000348564 SLC22A15Q8IZD6 547 aa4.19□□□□□ -1.74
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PTPRC-201ENST00000348564 OR2L5Q8NG80 312 aa4.19□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 DCAKDQ8WVC6 231 aa4.19□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 TSLPQ969D9 159 aa4.19□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 HS6ST2Q96MM7 605 aa4.19□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 LYSMD1Q96S90 227 aa4.19□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 SPATA9Q9BWV2 254 aa4.19□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 CD244Q9BZW8 370 aa4.19□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 RAD21L1Q9H4I0 556 aa4.19□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 C5AR2Q9P296 337 aa4.19□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 ICKQ9UPZ9 632 aa4.19□□□□□ -1.74
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PTPRC-201ENST00000348564 TRBC2A0A5B9 178 aa4.18□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 B8ZZF3 427 aa4.18□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 E9PBE3 544 aa4.18□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 ARHGEF9O43307 516 aa4.18□□□□□ -1.74
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PTPRC-201ENST00000348564 OR2B6P58173 313 aa4.18□□□□□ -1.74
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PTPRC-201ENST00000348564 IHHQ14623 411 aa4.18□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 NKG7Q16617 165 aa4.18□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 ZNF789Q5FWF6 425 aa4.18□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 TCHHL1Q5QJ38 904 aaPredicted RBP4.18□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 ANXA8L1Q5VT79 327 aa4.18□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 CES4AQ5XG92 561 aa4.18□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 ALG1LQ6GMV1 187 aa4.18□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 FIGNL1Q6PIW4 674 aa4.18□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 WASH2PQ6VEQ5 465 aa4.18□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 PNPLA5Q7Z6Z6 429 aaPredicted RBP4.18□□□□□ -1.74
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