RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000319942.7

RABGGTB-201, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RABGGTB, Length 1,496 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-201ENST00000319942 LYRM4Q9HD34 91 aa9.56□□□□□ -0.88
RABGGTB-201ENST00000319942 PDE7BQ9NP56 450 aa9.56□□□□□ -0.88
RABGGTB-201ENST00000319942 SEMA3GQ9NS98 782 aa9.56□□□□□ -0.88
RABGGTB-201ENST00000319942 TMEM74BQ9NUR3 256 aa9.56□□□□□ -0.88
RABGGTB-201ENST00000319942 THUMPD1Q9NXG2 353 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
RABGGTB-201ENST00000319942 RPS6KA6Q9UK32 745 aa9.56□□□□□ -0.88
RABGGTB-201ENST00000319942 USP22Q9UPT9 525 aa9.56□□□□□ -0.88
RABGGTB-201ENST00000319942 ENTPD4Q9Y227 616 aa9.56□□□□□ -0.88
RABGGTB-201ENST00000319942 TMEM247A6NEH6 219 aa9.55□□□□□ -0.88
RABGGTB-201ENST00000319942 ADARB2-AS1A8MUL3 147 aa9.55□□□□□ -0.88
RABGGTB-201ENST00000319942 M0R082 166 aa9.55□□□□□ -0.88
RABGGTB-201ENST00000319942 PGRMC2O15173 223 aa9.55□□□□□ -0.88
RABGGTB-201ENST00000319942 PAX4O43316 350 aa9.55□□□□□ -0.88
RABGGTB-201ENST00000319942 PRAMEF10O60809 474 aa9.55□□□□□ -0.88
RABGGTB-201ENST00000319942 TIPRLO75663 272 aa9.55□□□□□ -0.88
RABGGTB-201ENST00000319942 AIFM1O95831 613 aa9.55□□□□□ -0.88
RABGGTB-201ENST00000319942 NR2F6P10588 404 aa9.55□□□□□ -0.88
RABGGTB-201ENST00000319942 KDELR2P33947 212 aa9.55□□□□□ -0.88
RABGGTB-201ENST00000319942 SOAT1P35610 550 aa9.55□□□□□ -0.88
RABGGTB-201ENST00000319942 MAGEA8P43361 318 aa9.55□□□□□ -0.88
RABGGTB-201ENST00000319942 CCT3P49368 545 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
RABGGTB-201ENST00000319942 ANXA11P50995 505 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
RABGGTB-201ENST00000319942 NCBP2P52298 156 aaKnown RBP eCLIP9.55□□□□□ -0.885e-12■■□□□ 13.8
RABGGTB-201ENST00000319942 TCTE1Q5JU00 501 aa9.55□□□□□ -0.88
RABGGTB-201ENST00000319942 DDX59Q5T1V6 619 aaKnown RBP eCLIP9.55□□□□□ -0.88
RABGGTB-201ENST00000319942 OGFRL1Q5TC84 451 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
RABGGTB-201ENST00000319942 FAM92BQ6ZTR7 304 aa9.55□□□□□ -0.88
RABGGTB-201ENST00000319942 ERMP1Q7Z2K6 904 aa9.55□□□□□ -0.88
RABGGTB-201ENST00000319942 MMP21Q8N119 569 aa9.55□□□□□ -0.88
RABGGTB-201ENST00000319942 LILRA2Q8N149 483 aa9.55□□□□□ -0.88
RABGGTB-201ENST00000319942 DNAJC22Q8N4W6 341 aa9.55□□□□□ -0.88
RABGGTB-201ENST00000319942 TMEM102Q8N9M5 508 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
RABGGTB-201ENST00000319942 ICA1LQ8NDH6 482 aa9.55□□□□□ -0.88
RABGGTB-201ENST00000319942 PSMA8Q8TAA3 256 aa9.55□□□□□ -0.88
RABGGTB-201ENST00000319942 ZNF417Q8TAU3 575 aa9.55□□□□□ -0.88
RABGGTB-201ENST00000319942 ZCCHC10Q8TBK6 192 aa9.55□□□□□ -0.88
RABGGTB-201ENST00000319942 PNPT1Q8TCS8 783 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
RABGGTB-201ENST00000319942 NETO1Q8TDF5 533 aa9.55□□□□□ -0.88
RABGGTB-201ENST00000319942 AMDHD1Q96NU7 426 aa9.55□□□□□ -0.88
RABGGTB-201ENST00000319942 NECAB3Q96P71 396 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
RABGGTB-201ENST00000319942 TGM7Q96PF1 710 aa9.55□□□□□ -0.88
RABGGTB-201ENST00000319942 ZNF587Q96SQ5 575 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
RABGGTB-201ENST00000319942 MAPKAP1Q9BPZ7 522 aa9.55□□□□□ -0.88
RABGGTB-201ENST00000319942 DPH2Q9BQC3 489 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
RABGGTB-201ENST00000319942 NPLQ9BXD5 320 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
RABGGTB-201ENST00000319942 CLK4Q9HAZ1 481 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
RABGGTB-201ENST00000319942 ANKHQ9HCJ1 492 aa9.55□□□□□ -0.88
RABGGTB-201ENST00000319942 OLAHQ9NV23 265 aa9.55□□□□□ -0.88
RABGGTB-201ENST00000319942 NLGN3Q9NZ94 848 aa9.55□□□□□ -0.88
RABGGTB-201ENST00000319942 RIMS3Q9UJD0 308 aa9.55□□□□□ -0.88
RABGGTB-201ENST00000319942 CNOT11Q9UKZ1 510 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
RABGGTB-201ENST00000319942 DAPP1Q9UN19 280 aa9.55□□□□□ -0.88
RABGGTB-201ENST00000319942 PLCL2Q9UPR0 1127 aa9.55□□□□□ -0.88
RABGGTB-201ENST00000319942 SAMD4AQ9UPU9 718 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
RABGGTB-201ENST00000319942 CLCA2Q9UQC9 943 aa9.55□□□□□ -0.88
RABGGTB-201ENST00000319942 DTNAQ9Y4J8 743 aa9.55□□□□□ -0.88
RABGGTB-201ENST00000319942 RNF215Q9Y6U7 377 aa9.55□□□□□ -0.88
RABGGTB-201ENST00000319942 ARHGEF17Q96PE2 2063 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
RABGGTB-201ENST00000319942 A0A1B0GTQ1 180 aa9.54□□□□□ -0.88
RABGGTB-201ENST00000319942 GLOD5A6NK44 160 aa9.54□□□□□ -0.88
RABGGTB-201ENST00000319942 MYO1GB0I1T2 1018 aa9.54□□□□□ -0.88
RABGGTB-201ENST00000319942 H0YJX3 145 aa9.54□□□□□ -0.88
RABGGTB-201ENST00000319942 DUX1O43812 170 aa9.54□□□□□ -0.88
RABGGTB-201ENST00000319942 ZBTB11O95625 1053 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
RABGGTB-201ENST00000319942 SERPINA1P01009 418 aa9.54□□□□□ -0.88
RABGGTB-201ENST00000319942 LDLRP01130 860 aa9.54□□□□□ -0.88
RABGGTB-201ENST00000319942 CAPNS1P04632 268 aa9.54□□□□□ -0.88
RABGGTB-201ENST00000319942 CFIP05156 583 aa9.54□□□□□ -0.88
RABGGTB-201ENST00000319942 LIM2P55344 173 aa9.54□□□□□ -0.88
RABGGTB-201ENST00000319942 SRSF5Q13243 272 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
RABGGTB-201ENST00000319942 ADRM1Q16186 407 aa9.54□□□□□ -0.88
RABGGTB-201ENST00000319942 PRSS53Q2L4Q9 553 aa9.54□□□□□ -0.88
RABGGTB-201ENST00000319942 ZNF630Q2M218 657 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
RABGGTB-201ENST00000319942 HLA-BQ31612 363 aa9.54□□□□□ -0.88
RABGGTB-201ENST00000319942 ZNF528Q3MIS6 628 aa9.54□□□□□ -0.88
RABGGTB-201ENST00000319942 GCNT6Q5T4J0 391 aa9.54□□□□□ -0.88
RABGGTB-201ENST00000319942 GARNL3Q5VVW2 1013 aa9.54□□□□□ -0.88
RABGGTB-201ENST00000319942 LPCAT4Q643R3 524 aa9.54□□□□□ -0.88
RABGGTB-201ENST00000319942 IZUMO2Q6UXV1 221 aa9.54□□□□□ -0.88
RABGGTB-201ENST00000319942 ZBTB49Q6ZSB9 765 aa9.54□□□□□ -0.88
RABGGTB-201ENST00000319942 ZNF551Q7Z340 670 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
RABGGTB-201ENST00000319942 C6orf120Q7Z4R8 191 aa9.54□□□□□ -0.88
RABGGTB-201ENST00000319942 AMIGO2Q86SJ2 522 aa9.54□□□□□ -0.88
RABGGTB-201ENST00000319942 RNF130Q86XS8 419 aa9.54□□□□□ -0.88
RABGGTB-201ENST00000319942 ZZZ3Q8IYH5 903 aa9.54□□□□□ -0.88
RABGGTB-201ENST00000319942 MAML2Q8IZL2 1156 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
RABGGTB-201ENST00000319942 OR4K14Q8NGD5 310 aa9.54□□□□□ -0.88
RABGGTB-201ENST00000319942 TANKQ92844 425 aa9.54□□□□□ -0.88
RABGGTB-201ENST00000319942 MOAP1Q96BY2 351 aa9.54□□□□□ -0.88
RABGGTB-201ENST00000319942 NEURL3Q96EH8 262 aa9.54□□□□□ -0.88
RABGGTB-201ENST00000319942 PYURFQ96I23 114 aa9.54□□□□□ -0.88
RABGGTB-201ENST00000319942 ASPSCR1Q9BZE9 553 aa9.54□□□□□ -0.88
RABGGTB-201ENST00000319942 GLIPR2Q9H4G4 154 aa9.54□□□□□ -0.88
RABGGTB-201ENST00000319942 TMEM38AQ9H6F2 299 aa9.54□□□□□ -0.88
RABGGTB-201ENST00000319942 MAGIXQ9H6Y5 334 aa9.54□□□□□ -0.88
RABGGTB-201ENST00000319942 CXorf36Q9H7Y0 433 aa9.54□□□□□ -0.88
RABGGTB-201ENST00000319942 SYNPO2LQ9H987 977 aa9.54□□□□□ -0.88
RABGGTB-201ENST00000319942 C3orf14Q9HBI5 128 aa9.54□□□□□ -0.88
RABGGTB-201ENST00000319942 FAM60AQ9NP50 221 aa9.54□□□□□ -0.88
RABGGTB-201ENST00000319942 C8orf4Q9NR00 106 aa9.54□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.3 ms