RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000265339.6

UBE2B-201, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UBE2B, Length 2,515 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2B-201ENST00000265339 TRIM48Q8IWZ4 208 aa19.31■□□□□ 0.68
UBE2B-201ENST00000265339 MICU2Q8IYU8 434 aa19.31■□□□□ 0.68
UBE2B-201ENST00000265339 DTWD1Q8N5C7 304 aa19.31■□□□□ 0.68
UBE2B-201ENST00000265339 OR2L8Q8NGY9 312 aa19.31■□□□□ 0.68
UBE2B-201ENST00000265339 ZDHHC1Q8WTX9 485 aa19.31■□□□□ 0.68
UBE2B-201ENST00000265339 SMPDL3AQ92484 453 aa19.31■□□□□ 0.68
UBE2B-201ENST00000265339 C11orf16Q9NQ32 467 aa19.31■□□□□ 0.68
UBE2B-201ENST00000265339 CPNE7Q9UBL6 633 aa19.31■□□□□ 0.68
UBE2B-201ENST00000265339 SUSD2Q9UGT4 822 aa19.31■□□□□ 0.68
UBE2B-201ENST00000265339 WBP11Q9Y2W2 641 aaKnown RBP19.31■□□□□ 0.68
UBE2B-201ENST00000265339 KCNE2Q9Y6J6 123 aa19.31■□□□□ 0.68
UBE2B-201ENST00000265339 KIR2DS5A0A0G2JLQ3 304 aa19.31■□□□□ 0.68
UBE2B-201ENST00000265339 A0A0G2JNG1 304 aa19.31■□□□□ 0.68
UBE2B-201ENST00000265339 KIR2DS3K7RE56 304 aa19.31■□□□□ 0.68
UBE2B-201ENST00000265339 PSMB5P28074 263 aa19.31■□□□□ 0.68
UBE2B-201ENST00000265339 DEFA1P59665 94 aa19.31■□□□□ 0.68
UBE2B-201ENST00000265339 DEFA3P59666 94 aa19.31■□□□□ 0.68
UBE2B-201ENST00000265339 GRIK2Q13002 908 aa19.31■□□□□ 0.68
UBE2B-201ENST00000265339 KIR2DS5Q14953 304 aa19.31■□□□□ 0.68
UBE2B-201ENST00000265339 GGTA1PQ4G0N0 100 aa19.31■□□□□ 0.68
UBE2B-201ENST00000265339 NXNL2Q5VZ03 156 aa19.31■□□□□ 0.68
UBE2B-201ENST00000265339 GKN2Q86XP6 184 aa19.31■□□□□ 0.68
UBE2B-201ENST00000265339 GRAMD2AQ8IUY3 354 aa19.31■□□□□ 0.68
UBE2B-201ENST00000265339 L3MBTL4Q8NA19 623 aa19.31■□□□□ 0.68
UBE2B-201ENST00000265339 DHRS9Q9BPW9 319 aa19.31■□□□□ 0.68
UBE2B-201ENST00000265339 RBM4BQ9BQ04 359 aaKnown RBP19.31■□□□□ 0.68
UBE2B-201ENST00000265339 ACAT2Q9BWD1 397 aa19.31■□□□□ 0.68
UBE2B-201ENST00000265339 RBM4Q9BWF3 364 aaKnown RBP19.31■□□□□ 0.68
UBE2B-201ENST00000265339 ERVMER34-1Q9H9K5 563 aa19.31■□□□□ 0.68
UBE2B-201ENST00000265339 RPRD1BQ9NQG5 326 aaKnown RBP19.31■□□□□ 0.68
UBE2B-201ENST00000265339 UCKL1Q9NWZ5 548 aa19.31■□□□□ 0.68
UBE2B-201ENST00000265339 STMN3Q9NZ72 180 aa19.31■□□□□ 0.68
UBE2B-201ENST00000265339 GPRC5BQ9NZH0 403 aa19.31■□□□□ 0.68
UBE2B-201ENST00000265339 TAC3Q9UHF0 121 aa19.31■□□□□ 0.68
UBE2B-201ENST00000265339 SPEF1Q9Y4P9 236 aa19.31■□□□□ 0.68
UBE2B-201ENST00000265339 CACNA1EQ15878 2313 aa19.31■□□□□ 0.68
UBE2B-201ENST00000265339 OR5K4A6NMS3 321 aa19.3■□□□□ 0.68
UBE2B-201ENST00000265339 YY2O15391 372 aa19.3■□□□□ 0.68
UBE2B-201ENST00000265339 PIAS2O75928 621 aa19.3■□□□□ 0.68
UBE2B-201ENST00000265339 MT-ND2P03891 347 aa19.3■□□□□ 0.68
UBE2B-201ENST00000265339 DBTP11182 482 aaKnown RBP19.3■□□□□ 0.68
UBE2B-201ENST00000265339 ERVK-8P63133 956 aa19.3■□□□□ 0.68
UBE2B-201ENST00000265339 TUBA1BP68363 451 aa19.3■□□□□ 0.68
UBE2B-201ENST00000265339 IRF8Q02556 426 aa19.3■□□□□ 0.68
UBE2B-201ENST00000265339 CPSF6Q16630 551 aaKnown RBP eCLIP19.3■□□□□ 0.68
UBE2B-201ENST00000265339 XKR6Q5GH73 641 aa19.3■□□□□ 0.68
UBE2B-201ENST00000265339 C6orf136Q5SQH8 315 aa19.3■□□□□ 0.68
UBE2B-201ENST00000265339 PEAR1Q5VY43 1037 aaPredicted RBP19.3■□□□□ 0.68
UBE2B-201ENST00000265339 LCTLQ6UWM7 567 aa19.3■□□□□ 0.68
UBE2B-201ENST00000265339 TUBA1AQ71U36 451 aa19.3■□□□□ 0.68
UBE2B-201ENST00000265339 TMPRSS11BQ86T26 416 aa19.3■□□□□ 0.68
UBE2B-201ENST00000265339 SYT12Q8IV01 421 aa19.3■□□□□ 0.68
UBE2B-201ENST00000265339 HBEGFQ99075 208 aa19.3■□□□□ 0.68
UBE2B-201ENST00000265339 POT1Q9NUX5 634 aa19.3■□□□□ 0.68
UBE2B-201ENST00000265339 NPAP1Q9NZP6 1156 aa19.3■□□□□ 0.68
UBE2B-201ENST00000265339 MAGEL2Q9UJ55 1249 aa19.3■□□□□ 0.68
UBE2B-201ENST00000265339 DYRK1BQ9Y463 629 aa19.3■□□□□ 0.68
UBE2B-201ENST00000265339 FAM234BA2RU67 622 aa19.3■□□□□ 0.68
UBE2B-201ENST00000265339 METTL15A6NJ78 407 aa19.3■□□□□ 0.68
UBE2B-201ENST00000265339 PCDH1Q08174 1060 aa19.3■□□□□ 0.68
UBE2B-201ENST00000265339 C19orf57Q0VDD7 668 aa19.3■□□□□ 0.68
UBE2B-201ENST00000265339 DOC2AQ14183 400 aa19.3■□□□□ 0.68
UBE2B-201ENST00000265339 SIM2Q14190 667 aaPredicted RBP19.3■□□□□ 0.68
UBE2B-201ENST00000265339 GPR18Q14330 331 aa19.3■□□□□ 0.68
UBE2B-201ENST00000265339 UBQLNLQ8IYU4 475 aa19.3■□□□□ 0.68
UBE2B-201ENST00000265339 FAM86B1Q8N7N1 296 aa19.3■□□□□ 0.68
UBE2B-201ENST00000265339 GRPEL2Q8TAA5 225 aa19.3■□□□□ 0.68
UBE2B-201ENST00000265339 FBXO30Q8TB52 745 aa19.3■□□□□ 0.68
UBE2B-201ENST00000265339 LCN9Q8WX39 176 aa19.3■□□□□ 0.68
UBE2B-201ENST00000265339 RHNO1Q9BSD3 238 aa19.3■□□□□ 0.68
UBE2B-201ENST00000265339 C3orf18Q9UK00 162 aa19.3■□□□□ 0.68
UBE2B-201ENST00000265339 PCM1Q15154 2024 aa19.3■□□□□ 0.68
UBE2B-201ENST00000265339 BCKDKO14874 412 aa19.29■□□□□ 0.68
UBE2B-201ENST00000265339 VIPP01282 170 aa19.29■□□□□ 0.68
UBE2B-201ENST00000265339 SLC2A4P14672 509 aa19.29■□□□□ 0.68
UBE2B-201ENST00000265339 GPLD1P80108 840 aa19.29■□□□□ 0.68
UBE2B-201ENST00000265339 RAPSNQ13702 412 aa19.29■□□□□ 0.68
UBE2B-201ENST00000265339 SLCO4C1Q6ZQN7 724 aa19.29■□□□□ 0.68
UBE2B-201ENST00000265339 EFL1Q7Z2Z2 1120 aaKnown RBP19.29■□□□□ 0.68
UBE2B-201ENST00000265339 SETD7Q8WTS6 366 aaKnown RBP19.29■□□□□ 0.68
UBE2B-201ENST00000265339 SH3KBP1Q96B97 665 aa19.29■□□□□ 0.68
UBE2B-201ENST00000265339 ST6GAL2Q96JF0 529 aa19.29■□□□□ 0.68
UBE2B-201ENST00000265339 SLC29A3Q9BZD2 475 aa19.29■□□□□ 0.68
UBE2B-201ENST00000265339 SLA2Q9H6Q3 261 aa19.29■□□□□ 0.68
UBE2B-201ENST00000265339 FARSBQ9NSD9 589 aaKnown RBP19.29■□□□□ 0.68
UBE2B-201ENST00000265339 PI4KAP42356 2102 aa19.29■□□□□ 0.68
UBE2B-201ENST00000265339 UGDHO60701 494 aa19.29■□□□□ 0.68
UBE2B-201ENST00000265339 S100A5P33763 92 aa19.29■□□□□ 0.68
UBE2B-201ENST00000265339 FAM214AQ32MH5 1076 aa19.29■□□□□ 0.68
UBE2B-201ENST00000265339 LIPJQ5W064 366 aa19.29■□□□□ 0.68
UBE2B-201ENST00000265339 DLEU7Q6UYE1 221 aa19.29■□□□□ 0.68
UBE2B-201ENST00000265339 B3GNT8Q7Z7M8 397 aa19.29■□□□□ 0.68
UBE2B-201ENST00000265339 AMIGO1Q86WK6 493 aa19.29■□□□□ 0.68
UBE2B-201ENST00000265339 CCDC28AQ8IWP9 274 aa19.29■□□□□ 0.68
UBE2B-201ENST00000265339 OR4E2Q8NGC2 313 aa19.29■□□□□ 0.68
UBE2B-201ENST00000265339 SLC5A11Q8WWX8 675 aa19.29■□□□□ 0.68
UBE2B-201ENST00000265339 FSCN3Q9NQT6 498 aa19.29■□□□□ 0.68
UBE2B-201ENST00000265339 ZIM2Q9NZV7 527 aa19.29■□□□□ 0.68
UBE2B-201ENST00000265339 SNX6Q9UNH7 406 aa19.29■□□□□ 0.68
UBE2B-201ENST00000265339 LMO7DNF2Z398 122 aa19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.5 ms