RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000258243.6

URB2-201, Transcript of URB2 ribosome biogenesis 2 homolog (S. cerevisiae), humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene URB2, Length 5,613 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
URB2-201ENST00000258243 M0R233 179 aa10.44□□□□□ -0.74
URB2-201ENST00000258243 FAM189A1O60320 539 aa10.44□□□□□ -0.74
URB2-201ENST00000258243 PLATP00750 562 aa10.44□□□□□ -0.74
URB2-201ENST00000258243 GNALP38405 381 aa10.44□□□□□ -0.74
URB2-201ENST00000258243 ALDH3B1P43353 468 aa10.44□□□□□ -0.74
URB2-201ENST00000258243 RAB7AP51149 207 aa10.44□□□□□ -0.74
URB2-201ENST00000258243 SYT16Q17RD7 645 aa10.44□□□□□ -0.74
URB2-201ENST00000258243 WSCD2Q2TBF2 565 aa10.44□□□□□ -0.74
URB2-201ENST00000258243 DNM1P34Q6PK57 102 aa10.44□□□□□ -0.74
URB2-201ENST00000258243 SMARCD3Q6STE5 483 aa10.44□□□□□ -0.74
URB2-201ENST00000258243 ZC3HAV1Q7Z2W4 902 aaKnown RBP10.44□□□□□ -0.74
URB2-201ENST00000258243 FCGR1BQ92637 280 aa10.44□□□□□ -0.74
URB2-201ENST00000258243 APOOQ9BUR5 198 aa10.44□□□□□ -0.74
URB2-201ENST00000258243 ICKQ9UPZ9 632 aa10.44□□□□□ -0.74
URB2-201ENST00000258243 PCDHGB5Q9Y5G0 923 aa10.44□□□□□ -0.74
URB2-201ENST00000258243 FXYD6-FXYD2A0A087WZ82 144 aa10.44□□□□□ -0.74
URB2-201ENST00000258243 SNAP29O95721 258 aa10.44□□□□□ -0.74
URB2-201ENST00000258243 CLIC3O95833 236 aa10.44□□□□□ -0.74
URB2-201ENST00000258243 PROS1P07225 676 aa10.44□□□□□ -0.74
URB2-201ENST00000258243 C1GALT1C1LP0DN25 315 aa10.44□□□□□ -0.74
URB2-201ENST00000258243 DLSTP36957 453 aa10.44□□□□□ -0.74
URB2-201ENST00000258243 STT3AP46977 705 aa10.44□□□□□ -0.74
URB2-201ENST00000258243 EEFSECP57772 596 aaKnown RBP10.44□□□□□ -0.74
URB2-201ENST00000258243 ID2Q02363 134 aa10.44□□□□□ -0.74
URB2-201ENST00000258243 PCBP2Q15366 365 aaKnown RBP eCLIP10.44□□□□□ -0.74
URB2-201ENST00000258243 HNRNPA1L2Q32P51 320 aaKnown RBP10.44□□□□□ -0.74
URB2-201ENST00000258243 LIPJQ5W064 366 aa10.44□□□□□ -0.74
URB2-201ENST00000258243 OR4F3Q6IEY1 312 aa10.44□□□□□ -0.74
URB2-201ENST00000258243 ADGRD2Q7Z7M1 963 aa10.44□□□□□ -0.74
URB2-201ENST00000258243 TMBIM1Q969X1 311 aa10.44□□□□□ -0.74
URB2-201ENST00000258243 MOAP1Q96BY2 351 aa10.44□□□□□ -0.74
URB2-201ENST00000258243 COG8Q96MW5 612 aa10.44□□□□□ -0.74
URB2-201ENST00000258243 OR14A2Q96R54 314 aa10.44□□□□□ -0.74
URB2-201ENST00000258243 COMMD4Q9H0A8 199 aa10.44□□□□□ -0.74
URB2-201ENST00000258243 FXYD6Q9H0Q3 95 aa10.44□□□□□ -0.74
URB2-201ENST00000258243 C12orf71A8MTZ7 269 aa10.43□□□□□ -0.74
URB2-201ENST00000258243 HOXC13P31276 330 aa10.43□□□□□ -0.74
URB2-201ENST00000258243 SLC6A4P31645 630 aa10.43□□□□□ -0.74
URB2-201ENST00000258243 CTBP2P56545 445 aa10.43□□□□□ -0.74
URB2-201ENST00000258243 GRM7Q14831 915 aa10.43□□□□□ -0.74
URB2-201ENST00000258243 TCEAL1Q15170 157 aa10.43□□□□□ -0.74
URB2-201ENST00000258243 MLF2Q15773 248 aaPredicted RBP10.43□□□□□ -0.74
URB2-201ENST00000258243 TCTE1Q5JU00 501 aa10.43□□□□□ -0.74
URB2-201ENST00000258243 KRBOX4Q5JUW0 171 aa10.43□□□□□ -0.74
URB2-201ENST00000258243 GALNTL5Q7Z4T8 443 aa10.43□□□□□ -0.74
URB2-201ENST00000258243 IQCHQ86VS3 1027 aa10.43□□□□□ -0.74
URB2-201ENST00000258243 DCSTAMPQ9H295 470 aa10.43□□□□□ -0.74
URB2-201ENST00000258243 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa10.43□□□□□ -0.74
URB2-201ENST00000258243 TRPV4Q9HBA0 871 aa10.43□□□□□ -0.74
URB2-201ENST00000258243 PCDHB16Q9NRJ7 776 aa10.43□□□□□ -0.74
URB2-201ENST00000258243 ZFR2Q9UPR6 939 aaKnown RBP10.43□□□□□ -0.74
URB2-201ENST00000258243 ZNF860A6NHJ4 632 aa10.43□□□□□ -0.74
URB2-201ENST00000258243 KCNC1P48547 511 aa10.43□□□□□ -0.74
URB2-201ENST00000258243 MEF2AQ02078 507 aaPredicted RBP10.43□□□□□ -0.74
URB2-201ENST00000258243 SPOCK1Q08629 439 aa10.43□□□□□ -0.74
URB2-201ENST00000258243 GBX1Q14549 363 aa10.43□□□□□ -0.74
URB2-201ENST00000258243 SCD5Q86SK9 330 aa10.43□□□□□ -0.74
URB2-201ENST00000258243 OR52E4Q8NGH9 312 aa10.43□□□□□ -0.74
URB2-201ENST00000258243 ZNF420Q8TAQ5 688 aaPredicted RBP10.43□□□□□ -0.74
URB2-201ENST00000258243 STON2Q8WXE9 905 aa10.43□□□□□ -0.74
URB2-201ENST00000258243 MALSU1Q96EH3 234 aa10.43□□□□□ -0.74
URB2-201ENST00000258243 KCNC2Q96PR1 638 aa10.43□□□□□ -0.74
URB2-201ENST00000258243 TXN2Q99757 166 aa10.43□□□□□ -0.74
URB2-201ENST00000258243 TAS2R9Q9NYW1 312 aa10.43□□□□□ -0.74
URB2-201ENST00000258243 DLX3O60479 287 aa10.43□□□□□ -0.74
URB2-201ENST00000258243 CRYZL1O95825 349 aa10.43□□□□□ -0.74
URB2-201ENST00000258243 CYP17A1P05093 508 aa10.43□□□□□ -0.74
URB2-201ENST00000258243 C8BP07358 591 aa10.43□□□□□ -0.74
URB2-201ENST00000258243 HCKP08631 526 aa10.43□□□□□ -0.74
URB2-201ENST00000258243 PSKH1P11801 424 aa10.43□□□□□ -0.74
URB2-201ENST00000258243 RNH1P13489 461 aaKnown RBP10.43□□□□□ -0.74
URB2-201ENST00000258243 MATN1P21941 496 aa10.43□□□□□ -0.74
URB2-201ENST00000258243 ARSFP54793 590 aa10.43□□□□□ -0.74
URB2-201ENST00000258243 TSPAN5P62079 268 aa10.43□□□□□ -0.74
URB2-201ENST00000258243 COL28A1Q2UY09 1125 aa10.43□□□□□ -0.74
URB2-201ENST00000258243 ALG10BQ5I7T1 473 aa10.43□□□□□ -0.74
URB2-201ENST00000258243 UBAP2Q5T6F2 1119 aaKnown RBP10.43□□□□□ -0.74
URB2-201ENST00000258243 UNC5DQ6UXZ4 953 aa10.43□□□□□ -0.74
URB2-201ENST00000258243 TIFABQ6ZNK6 161 aa10.43□□□□□ -0.74
URB2-201ENST00000258243 MFSD6LQ8IWD5 586 aa10.43□□□□□ -0.74
URB2-201ENST00000258243 GTPBP3Q969Y2 492 aaKnown RBP10.43□□□□□ -0.74
URB2-201ENST00000258243 ST6GALNAC1Q9NSC7 600 aaPredicted RBP10.43□□□□□ -0.74
URB2-201ENST00000258243 ZIM2Q9NZV7 527 aa10.43□□□□□ -0.74
URB2-201ENST00000258243 MALT1Q9UDY8 824 aa10.43□□□□□ -0.74
URB2-201ENST00000258243 OARD1Q9Y530 152 aa10.43□□□□□ -0.74
URB2-201ENST00000258243 ST14Q9Y5Y6 855 aa10.43□□□□□ -0.74
URB2-201ENST00000258243 SLC30A4O14863 429 aa10.43□□□□□ -0.74
URB2-201ENST00000258243 CDC123O75794 336 aaPredicted RBP10.43□□□□□ -0.74
URB2-201ENST00000258243 GSTT2P0CG29 244 aa10.43□□□□□ -0.74
URB2-201ENST00000258243 FGF3P11487 239 aaPredicted RBP10.43□□□□□ -0.74
URB2-201ENST00000258243 ENGP17813 658 aa10.43□□□□□ -0.74
URB2-201ENST00000258243 SERPINF1P36955 418 aa10.43□□□□□ -0.74
URB2-201ENST00000258243 SOX9P48436 509 aa10.43□□□□□ -0.74
URB2-201ENST00000258243 PON3Q15166 354 aa10.43□□□□□ -0.74
URB2-201ENST00000258243 TIGD6Q17RP2 521 aa10.43□□□□□ -0.74
URB2-201ENST00000258243 DEFB133Q30KQ1 61 aa10.43□□□□□ -0.74
URB2-201ENST00000258243 ANKRD33Q7Z3H0 272 aa10.43□□□□□ -0.74
URB2-201ENST00000258243 METTL25Q8N6Q8 603 aa10.43□□□□□ -0.74
URB2-201ENST00000258243 OR5L2Q8NGL0 311 aa10.43□□□□□ -0.74
URB2-201ENST00000258243 OR9I1Q8NGQ6 314 aa10.43□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 72.1 ms