RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000246533.7

CAPNS1-201, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,918 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-201ENST00000246533 STARD8Q92502 1023 aa25.04■■□□□ 1.6
CAPNS1-201ENST00000246533 SLC6A13Q9NSD5 602 aa25.04■■□□□ 1.6
CAPNS1-201ENST00000246533 PLCXD1Q9NUJ7 323 aa25.04■■□□□ 1.6
CAPNS1-201ENST00000246533 ZDHHC3Q9NYG2 299 aa25.04■■□□□ 1.6
CAPNS1-201ENST00000246533 FAM8A1Q9UBU6 413 aa25.04■■□□□ 1.6
CAPNS1-201ENST00000246533 TBC1D29Q9UFV1 150 aa25.04■■□□□ 1.6
CAPNS1-201ENST00000246533 COL5A1P20908 1838 aaPredicted RBP25.03■■□□□ 1.6
CAPNS1-201ENST00000246533 IGLV3-16A0A075B6K0 115 aa25.03■■□□□ 1.6
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF682O95780 498 aa25.03■■□□□ 1.6
CAPNS1-201ENST00000246533 ANXA5P08758 320 aa25.03■■□□□ 1.6
CAPNS1-201ENST00000246533 GGT5P36269 586 aa25.03■■□□□ 1.6
CAPNS1-201ENST00000246533 TGFBR2P37173 567 aa25.03■■□□□ 1.6
CAPNS1-201ENST00000246533 NCS1P62166 190 aa25.03■■□□□ 1.6
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF404Q494X3 552 aa25.03■■□□□ 1.6
CAPNS1-201ENST00000246533 GSDMCQ9BYG8 508 aa25.03■■□□□ 1.6
CAPNS1-201ENST00000246533 ACPTQ9BZG2 426 aa25.03■■□□□ 1.6
CAPNS1-201ENST00000246533 RMI1Q9H9A7 625 aa25.03■■□□□ 1.6
CAPNS1-201ENST00000246533 FADS2O95864 444 aaKnown RBP25.02■■□□□ 1.6
CAPNS1-201ENST00000246533 PBLDP30039 288 aaPredicted RBP25.02■■□□□ 1.6
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CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF45Q02386 682 aa25.02■■□□□ 1.6
CAPNS1-201ENST00000246533 TEKQ02763 1124 aa25.02■■□□□ 1.6
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF33BQ06732 778 aa25.02■■□□□ 1.6
CAPNS1-201ENST00000246533 DNASE1L3Q13609 305 aa25.02■■□□□ 1.6
CAPNS1-201ENST00000246533 VMACQ2NL98 169 aa25.02■■□□□ 1.6
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CAPNS1-201ENST00000246533 LRRC70Q7Z2Q7 622 aa25.02■■□□□ 1.6
CAPNS1-201ENST00000246533 LILRA3Q8N6C8 439 aaPredicted RBP25.02■■□□□ 1.6
CAPNS1-201ENST00000246533 REEP1Q9H902 201 aa25.02■■□□□ 1.6
CAPNS1-201ENST00000246533 MOV10Q9HCE1 1003 aaKnown RBP25.02■■□□□ 1.6
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CAPNS1-201ENST00000246533 TSC22D4Q9Y3Q8 395 aa25.02■■□□□ 1.6
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CAPNS1-201ENST00000246533 ALPPL2P10696 532 aa25.02■■□□□ 1.6
CAPNS1-201ENST00000246533 VEZF1Q14119 521 aa25.02■■□□□ 1.6
CAPNS1-201ENST00000246533 TMEM236Q5W0B7 351 aa25.02■■□□□ 1.6
CAPNS1-201ENST00000246533 ZCCHC8Q6NZY4 707 aaKnown RBP25.02■■□□□ 1.6
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CAPNS1-201ENST00000246533 USP43Q70EL4 1123 aa25.02■■□□□ 1.6
CAPNS1-201ENST00000246533 NAGSQ8N159 534 aa25.02■■□□□ 1.6
CAPNS1-201ENST00000246533 AMER2Q8N7J2 671 aa25.02■■□□□ 1.6
CAPNS1-201ENST00000246533 CHAC2Q8WUX2 184 aa25.02■■□□□ 1.6
CAPNS1-201ENST00000246533 MYDGFQ969H8 173 aa25.02■■□□□ 1.6
CAPNS1-201ENST00000246533 EPYCQ99645 322 aa25.02■■□□□ 1.6
CAPNS1-201ENST00000246533 DUSP23Q9BVJ7 150 aa25.02■■□□□ 1.6
CAPNS1-201ENST00000246533 PRDM8Q9NQV8 689 aa25.02■■□□□ 1.6
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF229Q9UJW7 825 aa25.02■■□□□ 1.6
CAPNS1-201ENST00000246533 ABCG2Q9UNQ0 655 aa25.02■■□□□ 1.6
CAPNS1-201ENST00000246533 ERVK-11Q9UQG0 969 aa25.02■■□□□ 1.6
CAPNS1-201ENST00000246533 MYO1GB0I1T2 1018 aa25.01■■□□□ 1.59
CAPNS1-201ENST00000246533 POP7O75817 140 aaKnown RBP25.01■■□□□ 1.59
CAPNS1-201ENST00000246533 PTTG1O95997 202 aa25.01■■□□□ 1.59
CAPNS1-201ENST00000246533 ATP1B2P14415 290 aaPredicted RBP25.01■■□□□ 1.59
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CAPNS1-201ENST00000246533 S100A1P23297 94 aa25.01■■□□□ 1.59
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CAPNS1-201ENST00000246533 GUSBP11Q6P575 273 aa25.01■■□□□ 1.59
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CAPNS1-201ENST00000246533 DCSTAMPQ9H295 470 aa25.01■■□□□ 1.59
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CAPNS1-201ENST00000246533 TNFSF14O43557 240 aa25■■□□□ 1.59
CAPNS1-201ENST00000246533 PRPS1L1P21108 318 aa25■■□□□ 1.59
CAPNS1-201ENST00000246533 KDELR2P33947 212 aa25■■□□□ 1.59
CAPNS1-201ENST00000246533 MAZP56270 477 aaKnown RBP25■■□□□ 1.59
CAPNS1-201ENST00000246533 NPRL3Q12980 569 aa25■■□□□ 1.59
CAPNS1-201ENST00000246533 PGS1Q32NB8 556 aa25■■□□□ 1.59
CAPNS1-201ENST00000246533 FAM181AQ8N9Y4 354 aa25■■□□□ 1.59
CAPNS1-201ENST00000246533 HRASLS5Q96KN8 279 aa25■■□□□ 1.59
CAPNS1-201ENST00000246533 CDC6Q99741 560 aa25■■□□□ 1.59
CAPNS1-201ENST00000246533 CTRCQ99895 268 aa25■■□□□ 1.59
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CAPNS1-201ENST00000246533 MAN1A2O60476 641 aa25■■□□□ 1.59
CAPNS1-201ENST00000246533 C9P02748 559 aa25■■□□□ 1.59
CAPNS1-201ENST00000246533 GPR89BP0CG08 455 aa25■■□□□ 1.59
CAPNS1-201ENST00000246533 FUT4P22083 530 aa25■■□□□ 1.59
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CAPNS1-201ENST00000246533 GDF5P43026 501 aa25■■□□□ 1.59
CAPNS1-201ENST00000246533 KIR3DL1P43629 444 aa25■■□□□ 1.59
CAPNS1-201ENST00000246533 PCYT1AP49585 367 aa25■■□□□ 1.59
CAPNS1-201ENST00000246533 CD300CQ08708 224 aa25■■□□□ 1.59
CAPNS1-201ENST00000246533 NFE2L1Q14494 772 aa25■■□□□ 1.59
CAPNS1-201ENST00000246533 DGLUCYQ7Z3D6 616 aa25■■□□□ 1.59
CAPNS1-201ENST00000246533 GLRX5Q86SX6 157 aa25■■□□□ 1.59
CAPNS1-201ENST00000246533 LYSMD2Q8IV50 215 aa25■■□□□ 1.59
CAPNS1-201ENST00000246533 GPR156Q8NFN8 814 aa25■■□□□ 1.59
CAPNS1-201ENST00000246533 ZDHHC1Q8WTX9 485 aa25■■□□□ 1.59
CAPNS1-201ENST00000246533 SELENOMQ8WWX9 145 aa25■■□□□ 1.59
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