RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000229265.10

CDCA3-201, Transcript of cell division cycle associated 3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CDCA3, Length 1,047 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA3-201ENST00000229265 THRBP10828 461 aa10.1□□□□□ -0.79
CDCA3-201ENST00000229265 HIST1H1TP22492 207 aaPredicted RBP10.1□□□□□ -0.79
CDCA3-201ENST00000229265 RYKP34925 604 aa10.1□□□□□ -0.79
CDCA3-201ENST00000229265 MPIP34949 423 aa10.1□□□□□ -0.79
CDCA3-201ENST00000229265 DCTP40126 519 aa10.1□□□□□ -0.79
CDCA3-201ENST00000229265 ACTR1BP42025 376 aa10.1□□□□□ -0.79
CDCA3-201ENST00000229265 ACTR1AP61163 376 aa10.1□□□□□ -0.79
CDCA3-201ENST00000229265 RACK1P63244 317 aaKnown RBP10.1□□□□□ -0.79
CDCA3-201ENST00000229265 PPP2R2BQ00005 443 aa10.1□□□□□ -0.79
CDCA3-201ENST00000229265 MEF2AQ02078 507 aaPredicted RBP10.1□□□□□ -0.79
CDCA3-201ENST00000229265 EEF1A2Q05639 463 aaKnown RBP10.1□□□□□ -0.79
CDCA3-201ENST00000229265 RGS1Q08116 209 aa10.1□□□□□ -0.79
CDCA3-201ENST00000229265 LIN52Q52LA3 116 aa10.1□□□□□ -0.79
CDCA3-201ENST00000229265 CYBRD1Q53TN4 286 aa10.1□□□□□ -0.79
CDCA3-201ENST00000229265 ZNF385BQ569K4 471 aa10.1□□□□□ -0.79
CDCA3-201ENST00000229265 CCDC157Q569K6 752 aa10.1□□□□□ -0.79
CDCA3-201ENST00000229265 RBM48Q5RL73 367 aaKnown RBP10.1□□□□□ -0.79
CDCA3-201ENST00000229265 GCNT6Q5T4J0 391 aa10.1□□□□□ -0.79
CDCA3-201ENST00000229265 SAXO2Q658L1 398 aa10.1□□□□□ -0.79
CDCA3-201ENST00000229265 REEP3Q6NUK4 255 aa10.1□□□□□ -0.79
CDCA3-201ENST00000229265 FBXO42Q6P3S6 717 aa10.1□□□□□ -0.79
CDCA3-201ENST00000229265 DHRS13Q6UX07 377 aa10.1□□□□□ -0.79
CDCA3-201ENST00000229265 ZNF551Q7Z340 670 aaPredicted RBP10.1□□□□□ -0.79
CDCA3-201ENST00000229265 UBE3DQ7Z6J8 389 aa10.1□□□□□ -0.79
CDCA3-201ENST00000229265 GLRX5Q86SX6 157 aa10.1□□□□□ -0.79
CDCA3-201ENST00000229265 EPHX4Q8IUS5 362 aa10.1□□□□□ -0.79
CDCA3-201ENST00000229265 CLEC4FQ8N1N0 589 aa10.1□□□□□ -0.79
CDCA3-201ENST00000229265 CAMKVQ8NCB2 501 aa10.1□□□□□ -0.79
CDCA3-201ENST00000229265 ZNF555Q8NEP9 628 aa10.1□□□□□ -0.79
CDCA3-201ENST00000229265 FBXO30Q8TB52 745 aa10.1□□□□□ -0.79
CDCA3-201ENST00000229265 SFXN5Q8TD22 340 aa10.1□□□□□ -0.79
CDCA3-201ENST00000229265 PMM1Q92871 262 aa10.1□□□□□ -0.79
CDCA3-201ENST00000229265 GAL3ST3Q96A11 431 aa10.1□□□□□ -0.79
CDCA3-201ENST00000229265 KLHDC7BQ96G42 594 aa10.1□□□□□ -0.79
CDCA3-201ENST00000229265 SMIM10Q96HG1 83 aa10.1□□□□□ -0.79
CDCA3-201ENST00000229265 VPS50Q96JG6 964 aa10.1□□□□□ -0.79
CDCA3-201ENST00000229265 CNDP2Q96KP4 475 aaKnown RBP10.1□□□□□ -0.79
CDCA3-201ENST00000229265 CNBD2Q96M20 576 aa10.1□□□□□ -0.79
CDCA3-201ENST00000229265 MYCBPQ99417 103 aaPredicted RBP10.1□□□□□ -0.79
CDCA3-201ENST00000229265 EPYCQ99645 322 aa10.1□□□□□ -0.79
CDCA3-201ENST00000229265 TRIM8Q9BZR9 551 aa10.1□□□□□ -0.79
CDCA3-201ENST00000229265 ABCG4Q9H172 646 aa10.1□□□□□ -0.79
CDCA3-201ENST00000229265 CXorf56Q9H5V9 222 aa10.1□□□□□ -0.79
CDCA3-201ENST00000229265 A4GALTQ9NPC4 353 aa10.1□□□□□ -0.79
CDCA3-201ENST00000229265 LHX9Q9NQ69 397 aa10.1□□□□□ -0.79
CDCA3-201ENST00000229265 SEMA3GQ9NS98 782 aa10.1□□□□□ -0.79
CDCA3-201ENST00000229265 TAAR2Q9P1P5 351 aa10.1□□□□□ -0.79
CDCA3-201ENST00000229265 CIDEBQ9UHD4 219 aa10.1□□□□□ -0.79
CDCA3-201ENST00000229265 PLAGL1Q9UM63 463 aa10.1□□□□□ -0.79
CDCA3-201ENST00000229265 USP22Q9UPT9 525 aa10.1□□□□□ -0.79
CDCA3-201ENST00000229265 SAC3D1A6NKF1 404 aa10.09□□□□□ -0.79
CDCA3-201ENST00000229265 OR52A4PA6NMU1 304 aa10.09□□□□□ -0.79
CDCA3-201ENST00000229265 MYO1GB0I1T2 1018 aa10.09□□□□□ -0.79
CDCA3-201ENST00000229265 TLR4O00206 839 aa10.09□□□□□ -0.79
CDCA3-201ENST00000229265 EI24O14681 340 aa10.09□□□□□ -0.79
CDCA3-201ENST00000229265 ADAMDEC1O15204 470 aa10.09□□□□□ -0.79
CDCA3-201ENST00000229265 TPST1O60507 370 aa10.09□□□□□ -0.79
CDCA3-201ENST00000229265 DNAJB5O75953 348 aa10.09□□□□□ -0.79
CDCA3-201ENST00000229265 C6orf47O95873 294 aa10.09□□□□□ -0.79
CDCA3-201ENST00000229265 AGR2O95994 175 aa10.09□□□□□ -0.79
CDCA3-201ENST00000229265 PROS1P07225 676 aa10.09□□□□□ -0.79
CDCA3-201ENST00000229265 SLC35G6P0C7Q6 338 aa10.09□□□□□ -0.79
CDCA3-201ENST00000229265 ARAFP10398 606 aa10.09□□□□□ -0.79
CDCA3-201ENST00000229265 GNSP15586 552 aa10.09□□□□□ -0.79
CDCA3-201ENST00000229265 FPR1P21462 350 aa10.09□□□□□ -0.79
CDCA3-201ENST00000229265 ATP5A1P25705 553 aaKnown RBP10.09□□□□□ -0.79
CDCA3-201ENST00000229265 CD38P28907 300 aa10.09□□□□□ -0.79
CDCA3-201ENST00000229265 EPHA8P29322 1005 aaPredicted RBP10.09□□□□□ -0.79
CDCA3-201ENST00000229265 CHI3L1P36222 383 aaPredicted RBP10.09□□□□□ -0.79
CDCA3-201ENST00000229265 CRATP43155 626 aa10.09□□□□□ -0.79
CDCA3-201ENST00000229265 CXCR4P61073 352 aa10.09□□□□□ -0.79
CDCA3-201ENST00000229265 CDK6Q00534 326 aa10.09□□□□□ -0.79
CDCA3-201ENST00000229265 MYBPC1Q00872 1141 aa10.09□□□□□ -0.79
CDCA3-201ENST00000229265 SLAMF1Q13291 335 aa10.09□□□□□ -0.79
CDCA3-201ENST00000229265 FZD2Q14332 565 aa10.09□□□□□ -0.79
CDCA3-201ENST00000229265 SUZ12Q15022 739 aaKnown RBP10.09□□□□□ -0.79
CDCA3-201ENST00000229265 TCEA2Q15560 299 aa10.09□□□□□ -0.79
CDCA3-201ENST00000229265 MPEG1Q2M385 716 aa10.09□□□□□ -0.79
CDCA3-201ENST00000229265 ALG11Q2TAA5 492 aa10.09□□□□□ -0.79
CDCA3-201ENST00000229265 ADNP2Q6IQ32 1131 aa10.09□□□□□ -0.79
CDCA3-201ENST00000229265 KLHL35Q6PF15 583 aa10.09□□□□□ -0.79
CDCA3-201ENST00000229265 ENPP6Q6UWR7 440 aa10.09□□□□□ -0.79
CDCA3-201ENST00000229265 FAM92BQ6ZTR7 304 aa10.09□□□□□ -0.79
CDCA3-201ENST00000229265 STK32CQ86UX6 486 aa10.09□□□□□ -0.79
CDCA3-201ENST00000229265 NRROSQ86YC3 692 aa10.09□□□□□ -0.79
CDCA3-201ENST00000229265 EID2Q8N6I1 236 aa10.09□□□□□ -0.79
CDCA3-201ENST00000229265 ARL10Q8N8L6 244 aa10.09□□□□□ -0.79
CDCA3-201ENST00000229265 OR4E2Q8NGC2 313 aa10.09□□□□□ -0.79
CDCA3-201ENST00000229265 MIPOL1Q8TD10 442 aa10.09□□□□□ -0.79
CDCA3-201ENST00000229265 RHBDD1Q8TEB9 315 aa10.09□□□□□ -0.79
CDCA3-201ENST00000229265 ADAMTS14Q8WXS8 1223 aa10.09□□□□□ -0.79
CDCA3-201ENST00000229265 NR4A3Q92570 626 aa10.09□□□□□ -0.79
CDCA3-201ENST00000229265 FKBP10Q96AY3 582 aa10.09□□□□□ -0.79
CDCA3-201ENST00000229265 RMND5BQ96G75 393 aaPredicted RBP10.09□□□□□ -0.79
CDCA3-201ENST00000229265 C7orf34Q96L11 122 aa10.09□□□□□ -0.79
CDCA3-201ENST00000229265 SERINC2Q96SA4 455 aa10.09□□□□□ -0.79
CDCA3-201ENST00000229265 ELF4Q99607 663 aaPredicted RBP10.09□□□□□ -0.79
CDCA3-201ENST00000229265 PSD2Q9BQI7 771 aa10.09□□□□□ -0.79
CDCA3-201ENST00000229265 NPLQ9BXD5 320 aaPredicted RBP10.09□□□□□ -0.79
CDCA3-201ENST00000229265 LDHAL6BQ9BYZ2 381 aaPredicted RBP10.09□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.2 ms