RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534348.5

NEDD8-MDP1-202, Transcript of NEDD8-MDP1 readthrough, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene NEDD8-MDP1, Length 595 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PHACTR1Q9C0D0 580 aa9.25□□□□□ -0.93
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SPNS1Q9H2V7 528 aa9.25□□□□□ -0.93
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ACBD3Q9H3P7 528 aa9.25□□□□□ -0.93
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CHRAC1Q9NRG0 131 aa9.25□□□□□ -0.93
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 COPS7AQ9UBW8 275 aa9.25□□□□□ -0.93
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CNOT11Q9UKZ1 510 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 RYR3Q15413 4870 aa9.24□□□□□ -0.93
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 LRRC14BA6NHZ5 514 aa9.24□□□□□ -0.93
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 GNB5O14775 395 aa9.24□□□□□ -0.93
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CLOCKO15516 846 aa9.24□□□□□ -0.93
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PSTPIP1O43586 416 aa9.24□□□□□ -0.93
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ETHE1O95571 254 aa9.24□□□□□ -0.93
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 F7P08709 466 aaPredicted RBP9.24□□□□□ -0.93
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 RPL22P35268 128 aaKnown RBP9.24□□□□□ -0.93
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 STARP49675 285 aa9.24□□□□□ -0.93
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 STX4Q12846 297 aa9.24□□□□□ -0.93
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SQLEQ14534 574 aa9.24□□□□□ -0.93
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MPEG1Q2M385 716 aa9.24□□□□□ -0.93
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 LYPD8Q6UX82 237 aa9.24□□□□□ -0.93
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ZC3HAV1Q7Z2W4 902 aaKnown RBP9.24□□□□□ -0.93
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 P4HA3Q7Z4N8 544 aa9.24□□□□□ -0.93
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 LINC00523Q86TU6 105 aa9.24□□□□□ -0.93
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 OR8K3Q8NH51 312 aa9.24□□□□□ -0.93
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 RAB3IL1Q8TBN0 382 aa9.24□□□□□ -0.93
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 NT5CQ8TCD5 201 aa9.24□□□□□ -0.93
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SMAP2Q8WU79 429 aaPredicted RBP9.24□□□□□ -0.93
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ASB11Q8WXH4 323 aa9.24□□□□□ -0.93
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 HTRA1Q92743 480 aa9.24□□□□□ -0.93
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 NEUROG1Q92886 237 aa9.24□□□□□ -0.93
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 FAR2Q96K12 515 aa9.24□□□□□ -0.93
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 RILPQ96NA2 401 aa9.24□□□□□ -0.93
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 GAL3ST4Q96RP7 486 aa9.24□□□□□ -0.93
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CSF3RQ99062 836 aa9.24□□□□□ -0.93
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ANP32EQ9BTT0 268 aa9.24□□□□□ -0.93
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 NTMT1Q9BV86 223 aa9.24□□□□□ -0.93
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PCBD2Q9H0N5 130 aa9.24□□□□□ -0.93
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 UBQLN3Q9H347 655 aa9.24□□□□□ -0.93
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MANSC1Q9H8J5 431 aa9.24□□□□□ -0.93
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ZFP69BQ9UJL9 534 aa9.24□□□□□ -0.93
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 AMFRQ9UKV5 643 aa9.24□□□□□ -0.93
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 KCNS2Q9ULS6 477 aa9.24□□□□□ -0.93
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 DTX4Q9Y2E6 619 aa9.24□□□□□ -0.93
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 C15orf41Q9Y2V0 281 aa9.24□□□□□ -0.93
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TCAF1Q9Y4C2 921 aa9.24□□□□□ -0.93
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP9.24□□□□□ -0.933e-9■■□□□ 11.5
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ALPK2Q86TB3 2170 aa9.24□□□□□ -0.93
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 KMT2CQ8NEZ4 4911 aaKnown RBP9.23□□□□□ -0.93
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 A0A096LNT2 108 aa9.23□□□□□ -0.93
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TRBC2A0A5B9 178 aa9.23□□□□□ -0.93
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 GRID2IPA4D2P6 1211 aa9.23□□□□□ -0.93
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 URADA6NGE7 173 aa9.23□□□□□ -0.93
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PSMD3O43242 534 aa9.23□□□□□ -0.93
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 IGHV4-31P0DP07 118 aa9.23□□□□□ -0.93
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 NPPBP16860 134 aa9.23□□□□□ -0.93
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PTNP21246 168 aa9.23□□□□□ -0.93
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SKIV2L2P42285 1042 aaKnown RBP9.23□□□□□ -0.93
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 NUDT6P53370 316 aa9.23□□□□□ -0.93
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CRADDP78560 199 aa9.23□□□□□ -0.93
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TBL3Q12788 808 aaKnown RBP9.23□□□□□ -0.93
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 RBBP5Q15291 538 aaKnown RBP9.23□□□□□ -0.93
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SLC18A3Q16572 532 aa9.23□□□□□ -0.93
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 KBTBD12Q3ZCT8 623 aa9.23□□□□□ -0.93
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MIDNQ504T8 468 aa9.23□□□□□ -0.93
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ABHD17CQ6PCB6 329 aa9.23□□□□□ -0.93
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 AGTRAPQ6RW13 159 aa9.23□□□□□ -0.93
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SASS6Q6UVJ0 657 aa9.23□□□□□ -0.93
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PIWIL4Q7Z3Z4 852 aaKnown RBP9.23□□□□□ -0.93
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 C9orf40Q8IXQ3 194 aa9.23□□□□□ -0.93
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 KATNAL2Q8IYT4 538 aa9.23□□□□□ -0.93
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TBC1D19Q8N5T2 526 aa9.23□□□□□ -0.93
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ZNF610Q8N9Z0 462 aa9.23□□□□□ -0.93
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 FAM83FQ8NEG4 500 aaPredicted RBP9.23□□□□□ -0.93
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 LILRB1Q8NHL6 650 aaPredicted RBP9.23□□□□□ -0.93
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 RDH11Q8TC12 318 aa9.23□□□□□ -0.93
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 LPGAT1Q92604 370 aa9.23□□□□□ -0.93
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 KRT35Q92764 455 aa9.23□□□□□ -0.93
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 G6PC3Q9BUM1 346 aa9.23□□□□□ -0.93
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CLK4Q9HAZ1 481 aaKnown RBP9.23□□□□□ -0.93
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 EML4Q9HC35 981 aaKnown RBP9.23□□□□□ -0.93
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ANO10Q9NW15 660 aa9.23□□□□□ -0.93
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ELOVL5Q9NYP7 299 aa9.23□□□□□ -0.93
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CLCF1Q9UBD9 225 aa9.23□□□□□ -0.93
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 VTI1BQ9UEU0 232 aa9.23□□□□□ -0.93
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MED12LQ86YW9 2145 aa9.23□□□□□ -0.93
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 VWFP04275 2813 aa9.23□□□□□ -0.93
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 LOC100289279A0A1B0GTE1 492 aa9.22□□□□□ -0.93
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 A0A1W2PP18 115 aa9.22□□□□□ -0.93
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 FRG2CA6NGY1 282 aa9.22□□□□□ -0.93
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 HRKO00198 91 aa9.22□□□□□ -0.93
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 LDB3O75112 727 aa9.22□□□□□ -0.93
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ACTL6AO96019 429 aa9.22□□□□□ -0.93
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 FBXO45P0C2W1 286 aa9.22□□□□□ -0.93
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 DANCRP0C864 163 aa9.22□□□□□ -0.93
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SMIM10L1P0DMW3 83 aa9.22□□□□□ -0.93
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CPN1P15169 458 aa9.22□□□□□ -0.93
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 HNF1AP20823 631 aa9.22□□□□□ -0.93
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TBXA2RP21731 343 aa9.22□□□□□ -0.93
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TCEA1P23193 301 aaKnown RBP9.22□□□□□ -0.93
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SERPINB3P29508 390 aa9.22□□□□□ -0.93
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SCTRP47872 440 aa9.22□□□□□ -0.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.6 ms