RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516252.1

RNU6-415P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 415, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-415P, Length 97 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-415P-201ENST00000516252 EXOC4Q96A65 974 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-415P-201ENST00000516252 C16orf58Q96GQ5 468 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-415P-201ENST00000516252 ERGIC2Q96RQ1 377 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-415P-201ENST00000516252 IDI2Q9BXS1 227 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-415P-201ENST00000516252 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
RNU6-415P-201ENST00000516252 ZNF665Q9H7R5 613 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-415P-201ENST00000516252 CCT8L1PA6NM43 557 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-415P-201ENST00000516252 KIAA0513O60268 411 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-415P-201ENST00000516252 PLOD3O60568 738 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-415P-201ENST00000516252 PRAMEF12O95522 483 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-415P-201ENST00000516252 RLN1P04808 185 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-415P-201ENST00000516252 GSTA2P09210 222 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-415P-201ENST00000516252 ELK1P19419 428 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-415P-201ENST00000516252 OVGP1Q12889 678 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-415P-201ENST00000516252 PSMD6Q15008 389 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-415P-201ENST00000516252 C1orf189Q5VU69 101 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-415P-201ENST00000516252 C2orf66Q6UXQ4 117 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-415P-201ENST00000516252 SLFN11Q7Z7L1 901 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-415P-201ENST00000516252 LINC01006Q8NI28 216 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-415P-201ENST00000516252 CCT8L2Q96SF2 557 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-415P-201ENST00000516252 SLCO1C1Q9NYB5 712 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-415P-201ENST00000516252 PLEK2Q9NYT0 353 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-415P-201ENST00000516252 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP3.58□□□□□ -1.84
RNU6-415P-201ENST00000516252 WI2-2373I1.2A0A1W2PRP0 233 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-415P-201ENST00000516252 YDJCA8MPS7 323 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-415P-201ENST00000516252 SELENOFO60613 162 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-415P-201ENST00000516252 CALCAP01258 141 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-415P-201ENST00000516252 LDHCP07864 332 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-415P-201ENST00000516252 SNRPCP09234 159 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
RNU6-415P-201ENST00000516252 MMP10P09238 476 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-415P-201ENST00000516252 HMGCLP35914 325 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-415P-201ENST00000516252 CCR4P51679 360 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-415P-201ENST00000516252 NUCB1Q02818 461 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-415P-201ENST00000516252 ODF2Q5BJF6 829 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-415P-201ENST00000516252 CYP4V2Q6ZWL3 525 aaPredicted RBP3.57□□□□□ -1.84
RNU6-415P-201ENST00000516252 C17orf64Q86WR6 236 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-415P-201ENST00000516252 ZNF491Q8N8L2 437 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-415P-201ENST00000516252 KIAA0895Q8NCT3 520 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-415P-201ENST00000516252 GOLGA5Q8TBA6 731 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-415P-201ENST00000516252 UBLCP1Q8WVY7 318 aaPredicted RBP3.57□□□□□ -1.84
RNU6-415P-201ENST00000516252 FAF2Q96CS3 445 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-415P-201ENST00000516252 GBP5Q96PP8 586 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-415P-201ENST00000516252 LRRC2Q9BYS8 371 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-415P-201ENST00000516252 CUEDC2Q9H467 287 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-415P-201ENST00000516252 IMPAD1Q9NX62 359 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-415P-201ENST00000516252 CHCHD3Q9NX63 227 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
RNU6-415P-201ENST00000516252 EIF3KQ9UBQ5 218 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
RNU6-415P-201ENST00000516252 CIDEBQ9UHD4 219 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-415P-201ENST00000516252 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP3.56□□□□□ -1.84
RNU6-415P-201ENST00000516252 GPAA1O43292 621 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-415P-201ENST00000516252 FIBPO43427 364 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-415P-201ENST00000516252 CSO75390 466 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
RNU6-415P-201ENST00000516252 RAD51DO75771 328 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-415P-201ENST00000516252 CCDC159P0C7I6 412 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-415P-201ENST00000516252 P0C879 139 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-415P-201ENST00000516252 PRKCIP41743 596 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-415P-201ENST00000516252 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
RNU6-415P-201ENST00000516252 PAX2Q02962 417 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-415P-201ENST00000516252 MFGE8Q08431 387 aaPredicted RBP3.56□□□□□ -1.84
RNU6-415P-201ENST00000516252 MICAQ29983 383 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-415P-201ENST00000516252 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
RNU6-415P-201ENST00000516252 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
RNU6-415P-201ENST00000516252 ADGRD2Q7Z7M1 963 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-415P-201ENST00000516252 CCDC197Q8NCU1 140 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-415P-201ENST00000516252 RAB40CQ96S21 281 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-415P-201ENST00000516252 INTS14Q96SY0 518 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-415P-201ENST00000516252 WWP1Q9H0M0 922 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-415P-201ENST00000516252 IGHV3OR16-12A0A075B7B8 117 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-415P-201ENST00000516252 GTPBP10A4D1E9 387 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
RNU6-415P-201ENST00000516252 SAP18O00422 153 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
RNU6-415P-201ENST00000516252 CTDSPLO15194 276 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-415P-201ENST00000516252 SYT7O43581 403 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-415P-201ENST00000516252 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
RNU6-415P-201ENST00000516252 RPL27P61353 136 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
RNU6-415P-201ENST00000516252 CXCL6P80162 114 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-415P-201ENST00000516252 CAPN13Q6MZZ7 669 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
RNU6-415P-201ENST00000516252 IGFL3Q6UXB1 125 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-415P-201ENST00000516252 OR2L5Q8NG80 312 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-415P-201ENST00000516252 TRAF3IP1Q8TDR0 691 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
RNU6-415P-201ENST00000516252 TTYH2Q9BSA4 534 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-415P-201ENST00000516252 MRPL17Q9NRX2 175 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
RNU6-415P-201ENST00000516252 MIS18AQ9NYP9 233 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-415P-201ENST00000516252 RCOR3Q9P2K3 495 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
RNU6-415P-201ENST00000516252 GPR132Q9UNW8 380 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-415P-201ENST00000516252 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
RNU6-415P-201ENST00000516252 NDST1P52848 882 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-415P-201ENST00000516252 WNT4P56705 351 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-415P-201ENST00000516252 KRTAP10-1P60331 282 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-415P-201ENST00000516252 GCNT7Q6ZNI0 430 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-415P-201ENST00000516252 KRTAP5-2Q701N4 177 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-415P-201ENST00000516252 SAP25Q8TEE9 199 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-415P-201ENST00000516252 MRPL24Q96A35 216 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
RNU6-415P-201ENST00000516252 OR5M11Q96RB7 305 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-415P-201ENST00000516252 RASL10BQ96S79 203 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-415P-201ENST00000516252 BAG1Q99933 345 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
RNU6-415P-201ENST00000516252 CENPOQ9BU64 300 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-415P-201ENST00000516252 ZNF446Q9NWS9 450 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-415P-201ENST00000516252 SEC14L4Q9UDX3 406 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-415P-201ENST00000516252 MLXQ9UH92 298 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-415P-201ENST00000516252 MOKQ9UQ07 419 aa3.54□□□□□ -1.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 100 ms