RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511185.5

SH3BP2-218, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP2, Length 1,071 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-218ENST00000511185 SLC2A12Q8TD20 617 aa17.41■□□□□ 0.38
SH3BP2-218ENST00000511185 SELENOMQ8WWX9 145 aa17.41■□□□□ 0.38
SH3BP2-218ENST00000511185 DGCR8Q8WYQ5 773 aaKnown RBP eCLIP17.41■□□□□ 0.382e-8■■■■■ 72.2
SH3BP2-218ENST00000511185 PPWD1Q96BP3 646 aaKnown RBP17.41■□□□□ 0.38
SH3BP2-218ENST00000511185 AGPAT4Q9NRZ5 378 aa17.41■□□□□ 0.38
SH3BP2-218ENST00000511185 LYARQ9NX58 379 aaKnown RBP17.41■□□□□ 0.38
SH3BP2-218ENST00000511185 ABI3Q9P2A4 366 aa17.41■□□□□ 0.38
SH3BP2-218ENST00000511185 SLC12A4Q9UP95 1085 aa17.41■□□□□ 0.38
SH3BP2-218ENST00000511185 USP9YO00507 2555 aaPredicted RBP17.4■□□□□ 0.38
SH3BP2-218ENST00000511185 UBFD1O14562 309 aaKnown RBP17.4■□□□□ 0.38
SH3BP2-218ENST00000511185 PLIN3O60664 434 aa17.4■□□□□ 0.38
SH3BP2-218ENST00000511185 CDH16O75309 829 aa17.4■□□□□ 0.38
SH3BP2-218ENST00000511185 CHN1P15882 459 aa17.4■□□□□ 0.38
SH3BP2-218ENST00000511185 IMPDH1P20839 514 aa17.4■□□□□ 0.38
SH3BP2-218ENST00000511185 ARFIP1P53367 373 aa17.4■□□□□ 0.38
SH3BP2-218ENST00000511185 FOXA1P55317 472 aa17.4■□□□□ 0.38
SH3BP2-218ENST00000511185 GPRIN3Q6ZVF9 776 aa17.4■□□□□ 0.38
SH3BP2-218ENST00000511185 COMMD6Q7Z4G1 85 aa17.4■□□□□ 0.38
SH3BP2-218ENST00000511185 AGAP11Q8TF27 550 aa17.4■□□□□ 0.38
SH3BP2-218ENST00000511185 PSD3Q9NYI0 1048 aa17.4■□□□□ 0.38
SH3BP2-218ENST00000511185 LRFN1Q9P244 771 aa17.4■□□□□ 0.38
SH3BP2-218ENST00000511185 DCDC2Q9UHG0 476 aa17.4■□□□□ 0.38
SH3BP2-218ENST00000511185 CLCA3PQ9Y6N3 262 aa17.4■□□□□ 0.38
SH3BP2-218ENST00000511185 DIDO1Q9BTC0 2240 aaKnown RBP17.4■□□□□ 0.38
SH3BP2-218ENST00000511185 BLACEA4D250 179 aa17.39■□□□□ 0.37
SH3BP2-218ENST00000511185 ESPNB1AK53 854 aa17.39■□□□□ 0.37
SH3BP2-218ENST00000511185 MANBAO00462 879 aa17.39■□□□□ 0.37
SH3BP2-218ENST00000511185 ZNF354AO60765 605 aaPredicted RBP17.39■□□□□ 0.37
SH3BP2-218ENST00000511185 ITGA10O75578 1167 aa17.39■□□□□ 0.37
SH3BP2-218ENST00000511185 SLC25A12O75746 678 aa17.39■□□□□ 0.37
SH3BP2-218ENST00000511185 RASAL1O95294 804 aa17.39■□□□□ 0.37
SH3BP2-218ENST00000511185 KLK1P06870 262 aa17.39■□□□□ 0.37
SH3BP2-218ENST00000511185 NUDT17P0C025 328 aa17.39■□□□□ 0.37
SH3BP2-218ENST00000511185 MYL2P10916 166 aa17.39■□□□□ 0.37
SH3BP2-218ENST00000511185 KRT4P19013 534 aa17.39■□□□□ 0.37
SH3BP2-218ENST00000511185 BUD31P41223 144 aaPredicted RBP17.39■□□□□ 0.37
SH3BP2-218ENST00000511185 STT3AP46977 705 aa17.39■□□□□ 0.37
SH3BP2-218ENST00000511185 KCNK10P57789 538 aa17.39■□□□□ 0.37
SH3BP2-218ENST00000511185 TBL3Q12788 808 aaKnown RBP17.39■□□□□ 0.37
SH3BP2-218ENST00000511185 LCP2Q13094 533 aa17.39■□□□□ 0.37
SH3BP2-218ENST00000511185 SERTAD2Q14140 314 aa17.39■□□□□ 0.37
SH3BP2-218ENST00000511185 RASA2Q15283 850 aa17.39■□□□□ 0.37
SH3BP2-218ENST00000511185 ERCC6LQ2NKX8 1250 aa17.39■□□□□ 0.37
SH3BP2-218ENST00000511185 FHL5Q5TD97 284 aa17.39■□□□□ 0.37
SH3BP2-218ENST00000511185 GALNTL5Q7Z4T8 443 aa17.39■□□□□ 0.37
SH3BP2-218ENST00000511185 SLC22A9Q8IVM8 553 aa17.39■□□□□ 0.37
SH3BP2-218ENST00000511185 METTL4Q8N3J2 472 aa17.39■□□□□ 0.37
SH3BP2-218ENST00000511185 TMEM132CQ8N3T6 1108 aa17.39■□□□□ 0.37
SH3BP2-218ENST00000511185 SUN3Q8TAQ9 357 aa17.39■□□□□ 0.37
SH3BP2-218ENST00000511185 ZNF721Q8TF20 911 aa17.39■□□□□ 0.37
SH3BP2-218ENST00000511185 NR4A3Q92570 626 aa17.39■□□□□ 0.37
SH3BP2-218ENST00000511185 TSPAN10Q9H1Z9 355 aaPredicted RBP17.39■□□□□ 0.37
SH3BP2-218ENST00000511185 PPCSQ9HAB8 311 aa17.39■□□□□ 0.37
SH3BP2-218ENST00000511185 TNFRSF12AQ9NP84 129 aa17.39■□□□□ 0.37
SH3BP2-218ENST00000511185 MS4A12Q9NXJ0 267 aa17.39■□□□□ 0.37
SH3BP2-218ENST00000511185 ERRFI1Q9UJM3 462 aaPredicted RBP17.39■□□□□ 0.37
SH3BP2-218ENST00000511185 TIMM22Q9Y584 194 aa17.39■□□□□ 0.37
SH3BP2-218ENST00000511185 TLDC2A0PJX2 215 aa17.38■□□□□ 0.37
SH3BP2-218ENST00000511185 PGRMC2O15173 223 aa17.38■□□□□ 0.37
SH3BP2-218ENST00000511185 OR2J2O76002 312 aa17.38■□□□□ 0.37
SH3BP2-218ENST00000511185 AGFG2O95081 481 aa17.38■□□□□ 0.37
SH3BP2-218ENST00000511185 EDN3P14138 238 aa17.38■□□□□ 0.37
SH3BP2-218ENST00000511185 TRHRP34981 398 aaPredicted RBP17.38■□□□□ 0.37
SH3BP2-218ENST00000511185 HK2P52789 917 aa17.38■□□□□ 0.37
SH3BP2-218ENST00000511185 PLIN5Q00G26 463 aa17.38■□□□□ 0.37
SH3BP2-218ENST00000511185 WDR93Q6P2C0 686 aa17.38■□□□□ 0.37
SH3BP2-218ENST00000511185 C9orf40Q8IXQ3 194 aa17.38■□□□□ 0.37
SH3BP2-218ENST00000511185 C1orf52Q8N6N3 182 aaKnown RBP17.38■□□□□ 0.37
SH3BP2-218ENST00000511185 CCNYL1Q8N7R7 359 aa17.38■□□□□ 0.37
SH3BP2-218ENST00000511185 MORN4Q8NDC4 146 aa17.38■□□□□ 0.37
SH3BP2-218ENST00000511185 DAZLQ92904 295 aaKnown RBP17.38■□□□□ 0.37
SH3BP2-218ENST00000511185 C5orf34Q96MH7 638 aa17.38■□□□□ 0.37
SH3BP2-218ENST00000511185 FRMD6Q96NE9 622 aa17.38■□□□□ 0.37
SH3BP2-218ENST00000511185 DGAT2Q96PD7 388 aa17.38■□□□□ 0.37
SH3BP2-218ENST00000511185 ACPTQ9BZG2 426 aa17.38■□□□□ 0.37
SH3BP2-218ENST00000511185 SNX6Q9UNH7 406 aa17.38■□□□□ 0.37
SH3BP2-218ENST00000511185 SPTBN1Q01082 2364 aaKnown RBP17.38■□□□□ 0.37
SH3BP2-218ENST00000511185 WWP2O00308 870 aa17.37■□□□□ 0.37
SH3BP2-218ENST00000511185 FCHO1O14526 889 aa17.37■□□□□ 0.37
SH3BP2-218ENST00000511185 COPEO14579 308 aa17.37■□□□□ 0.37
SH3BP2-218ENST00000511185 NME2P1O60361 137 aa17.37■□□□□ 0.37
SH3BP2-218ENST00000511185 CLPSP04118 112 aa17.37■□□□□ 0.37
SH3BP2-218ENST00000511185 ALOX15P16050 662 aaPredicted RBP17.37■□□□□ 0.37
SH3BP2-218ENST00000511185 TNNI3P19429 210 aa17.37■□□□□ 0.37
SH3BP2-218ENST00000511185 NME2P22392 152 aa17.37■□□□□ 0.37
SH3BP2-218ENST00000511185 PTGER1P34995 402 aa17.37■□□□□ 0.37
SH3BP2-218ENST00000511185 CRHR1P34998 444 aa17.37■□□□□ 0.37
SH3BP2-218ENST00000511185 CYB561P49447 251 aa17.37■□□□□ 0.37
SH3BP2-218ENST00000511185 HLCSP50747 726 aa17.37■□□□□ 0.37
SH3BP2-218ENST00000511185 SLC18A2Q05940 514 aa17.37■□□□□ 0.37
SH3BP2-218ENST00000511185 GTF3C1Q12789 2109 aa17.37■□□□□ 0.37
SH3BP2-218ENST00000511185 PCLAFQ15004 111 aa17.37■□□□□ 0.37
SH3BP2-218ENST00000511185 ZNF750Q32MQ0 723 aa17.37■□□□□ 0.37
SH3BP2-218ENST00000511185 C10orf62Q5T681 223 aaPredicted RBP17.37■□□□□ 0.37
SH3BP2-218ENST00000511185 OR52E8Q6IFG1 317 aa17.37■□□□□ 0.37
SH3BP2-218ENST00000511185 SCIMPQ6UWF3 145 aa17.37■□□□□ 0.37
SH3BP2-218ENST00000511185 FRMD7Q6ZUT3 714 aa17.37■□□□□ 0.37
SH3BP2-218ENST00000511185 CPSF7Q8N684 471 aaKnown RBP17.37■□□□□ 0.37
SH3BP2-218ENST00000511185 MYRIPQ8NFW9 859 aa17.37■□□□□ 0.37
SH3BP2-218ENST00000511185 TANKQ92844 425 aa17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.1 ms