RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504294.5

SH3BP2-208, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP2, Length 557 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-208ENST00000504294 FDCSPQ8NFU4 85 aa13.63□□□□□ -0.23
SH3BP2-208ENST00000504294 MGARPQ8TDB4 240 aa13.63□□□□□ -0.23
SH3BP2-208ENST00000504294 TSLPQ969D9 159 aa13.63□□□□□ -0.23
SH3BP2-208ENST00000504294 ARL8AQ96BM9 186 aa13.63□□□□□ -0.23
SH3BP2-208ENST00000504294 VMP1Q96GC9 406 aa13.63□□□□□ -0.23
SH3BP2-208ENST00000504294 HBEGFQ99075 208 aa13.63□□□□□ -0.23
SH3BP2-208ENST00000504294 SORBS1Q9BX66 1292 aaKnown RBP13.63□□□□□ -0.23
SH3BP2-208ENST00000504294 PNO1Q9NRX1 252 aaKnown RBP13.63□□□□□ -0.23
SH3BP2-208ENST00000504294 COPS7AQ9UBW8 275 aa13.63□□□□□ -0.23
SH3BP2-208ENST00000504294 HAO1Q9UJM8 370 aa13.63□□□□□ -0.23
SH3BP2-208ENST00000504294 PPIEQ9UNP9 301 aaKnown RBP13.63□□□□□ -0.23
SH3BP2-208ENST00000504294 FIS1Q9Y3D6 152 aa13.63□□□□□ -0.23
SH3BP2-208ENST00000504294 DSPP15924 2871 aaKnown RBP13.63□□□□□ -0.23
SH3BP2-208ENST00000504294 CFAP47Q6ZTR5 3102 aa13.63□□□□□ -0.23
SH3BP2-208ENST00000504294 SCN3AQ9NY46 2000 aa13.63□□□□□ -0.23
SH3BP2-208ENST00000504294 CELSR3Q9NYQ7 3312 aa13.62□□□□□ -0.23
SH3BP2-208ENST00000504294 A0A1W2PR48 441 aa13.62□□□□□ -0.23
SH3BP2-208ENST00000504294 DYTNA2CJ06 578 aa13.62□□□□□ -0.23
SH3BP2-208ENST00000504294 TRPC5OSA6NMA1 111 aa13.62□□□□□ -0.23
SH3BP2-208ENST00000504294 SLC35E2P0CK97 266 aa13.62□□□□□ -0.23
SH3BP2-208ENST00000504294 BGNP21810 368 aa13.62□□□□□ -0.23
SH3BP2-208ENST00000504294 WDR4P57081 412 aaKnown RBP13.62□□□□□ -0.23
SH3BP2-208ENST00000504294 FOXL2P58012 376 aa13.62□□□□□ -0.23
SH3BP2-208ENST00000504294 SLC26A5P58743 744 aa13.62□□□□□ -0.23
SH3BP2-208ENST00000504294 PPP2R2AP63151 447 aa13.62□□□□□ -0.23
SH3BP2-208ENST00000504294 IGLV3-21P80748 117 aaPredicted RBP13.62□□□□□ -0.23
SH3BP2-208ENST00000504294 FOLH1Q04609 750 aa13.62□□□□□ -0.23
SH3BP2-208ENST00000504294 CHAF1BQ13112 559 aa13.62□□□□□ -0.23
SH3BP2-208ENST00000504294 ABHD17BQ5VST6 288 aa13.62□□□□□ -0.23
SH3BP2-208ENST00000504294 CPZQ66K79 652 aa13.62□□□□□ -0.23
SH3BP2-208ENST00000504294 C18orf63Q68DL7 685 aa13.62□□□□□ -0.23
SH3BP2-208ENST00000504294 IGFL3Q6UXB1 125 aa13.62□□□□□ -0.23
SH3BP2-208ENST00000504294 NATD1Q8N6N6 113 aa13.62□□□□□ -0.23
SH3BP2-208ENST00000504294 TEX19Q8NA77 164 aa13.62□□□□□ -0.23
SH3BP2-208ENST00000504294 B3GNT7Q8NFL0 401 aa13.62□□□□□ -0.23
SH3BP2-208ENST00000504294 OR5L2Q8NGL0 311 aa13.62□□□□□ -0.23
SH3BP2-208ENST00000504294 DNAJB14Q8TBM8 379 aa13.62□□□□□ -0.23
SH3BP2-208ENST00000504294 TM4SF18Q96CE8 201 aa13.62□□□□□ -0.23
SH3BP2-208ENST00000504294 APIPQ96GX9 242 aa13.62□□□□□ -0.23
SH3BP2-208ENST00000504294 CSF3RQ99062 836 aa13.62□□□□□ -0.23
SH3BP2-208ENST00000504294 TRIM55Q9BYV6 548 aa13.62□□□□□ -0.23
SH3BP2-208ENST00000504294 KCNK13Q9HB14 408 aa13.62□□□□□ -0.23
SH3BP2-208ENST00000504294 MED4Q9NPJ6 270 aa13.62□□□□□ -0.23
SH3BP2-208ENST00000504294 MIEF1Q9NQG6 463 aa13.62□□□□□ -0.23
SH3BP2-208ENST00000504294 INTS9Q9NV88 658 aaKnown RBP13.62□□□□□ -0.23
SH3BP2-208ENST00000504294 ZDHHC2Q9UIJ5 367 aa13.62□□□□□ -0.23
SH3BP2-208ENST00000504294 ANAPC2Q9UJX6 822 aa13.62□□□□□ -0.23
SH3BP2-208ENST00000504294 CACNA1GO43497 2377 aa13.61□□□□□ -0.23
SH3BP2-208ENST00000504294 LDB3O75112 727 aa13.61□□□□□ -0.23
SH3BP2-208ENST00000504294 SLITRK5O94991 958 aa13.61□□□□□ -0.23
SH3BP2-208ENST00000504294 AIFM1O95831 613 aa13.61□□□□□ -0.23
SH3BP2-208ENST00000504294 GBAP04062 536 aa13.61□□□□□ -0.23
SH3BP2-208ENST00000504294 LINC00032P0C843 101 aa13.61□□□□□ -0.23
SH3BP2-208ENST00000504294 CSNK2A2P19784 350 aaPredicted RBP13.61□□□□□ -0.23
SH3BP2-208ENST00000504294 KLRB1Q12918 225 aa13.61□□□□□ -0.23
SH3BP2-208ENST00000504294 MEP1AQ16819 746 aa13.61□□□□□ -0.23
SH3BP2-208ENST00000504294 UGT3A2Q3SY77 523 aa13.61□□□□□ -0.23
SH3BP2-208ENST00000504294 NOXRED1Q6NXP6 359 aa13.61□□□□□ -0.23
SH3BP2-208ENST00000504294 SLC48A1Q6P1K1 146 aa13.61□□□□□ -0.23
SH3BP2-208ENST00000504294 SCIMPQ6UWF3 145 aa13.61□□□□□ -0.23
SH3BP2-208ENST00000504294 R3HCC1LQ7Z5L2 792 aaKnown RBP13.61□□□□□ -0.23
SH3BP2-208ENST00000504294 HORMAD2Q8N7B1 307 aa13.61□□□□□ -0.23
SH3BP2-208ENST00000504294 EXD3Q8N9H8 876 aa13.61□□□□□ -0.23
SH3BP2-208ENST00000504294 OR8K3Q8NH51 312 aa13.61□□□□□ -0.23
SH3BP2-208ENST00000504294 SUN3Q8TAQ9 357 aa13.61□□□□□ -0.23
SH3BP2-208ENST00000504294 LRRC8CQ8TDW0 803 aa13.61□□□□□ -0.23
SH3BP2-208ENST00000504294 ANKRD9Q96BM1 317 aaPredicted RBP13.61□□□□□ -0.23
SH3BP2-208ENST00000504294 C11orf24Q96F05 449 aaPredicted RBP13.61□□□□□ -0.23
SH3BP2-208ENST00000504294 DEFB126Q9BYW3 111 aa13.61□□□□□ -0.23
SH3BP2-208ENST00000504294 RNF32Q9H0A6 362 aa13.61□□□□□ -0.23
SH3BP2-208ENST00000504294 ZNF552Q9H707 407 aaPredicted RBP13.61□□□□□ -0.23
SH3BP2-208ENST00000504294 MYNNQ9NPC7 610 aa13.61□□□□□ -0.23
SH3BP2-208ENST00000504294 EIF3LQ9Y262 564 aaKnown RBP13.61□□□□□ -0.23
SH3BP2-208ENST00000504294 DLGAP4Q9Y2H0 992 aa13.61□□□□□ -0.23
SH3BP2-208ENST00000504294 HEMK1Q9Y5R4 338 aaPredicted RBP13.61□□□□□ -0.23
SH3BP2-208ENST00000504294 ZZEF1O43149 2961 aa13.61□□□□□ -0.23
SH3BP2-208ENST00000504294 C17orf105B2RV13 164 aa13.6□□□□□ -0.23
SH3BP2-208ENST00000504294 FCHO1O14526 889 aa13.6□□□□□ -0.23
SH3BP2-208ENST00000504294 PIP5K1BO14986 540 aa13.6□□□□□ -0.23
SH3BP2-208ENST00000504294 LAMA5O15230 3695 aa13.6□□□□□ -0.23
SH3BP2-208ENST00000504294 FGF17O60258 216 aa13.6□□□□□ -0.23
SH3BP2-208ENST00000504294 LYPLA1O75608 230 aaPredicted RBP13.6□□□□□ -0.23
SH3BP2-208ENST00000504294 BCAS2O75934 225 aaPredicted RBP13.6□□□□□ -0.23
SH3BP2-208ENST00000504294 DNAJB5O75953 348 aa13.6□□□□□ -0.23
SH3BP2-208ENST00000504294 ZFAND5O76080 213 aa13.6□□□□□ -0.23
SH3BP2-208ENST00000504294 PRPS2P11908 318 aa13.6□□□□□ -0.23
SH3BP2-208ENST00000504294 CHN1P15882 459 aa13.6□□□□□ -0.23
SH3BP2-208ENST00000504294 PORP16435 677 aaPredicted RBP13.6□□□□□ -0.23
SH3BP2-208ENST00000504294 MPIP34949 423 aa13.6□□□□□ -0.23
SH3BP2-208ENST00000504294 CASRP41180 1078 aa13.6□□□□□ -0.23
SH3BP2-208ENST00000504294 XKP51811 444 aa13.6□□□□□ -0.23
SH3BP2-208ENST00000504294 BST1Q10588 318 aa13.6□□□□□ -0.23
SH3BP2-208ENST00000504294 MFAP5Q13361 173 aa13.6□□□□□ -0.23
SH3BP2-208ENST00000504294 TTMPQ5BVD1 217 aa13.6□□□□□ -0.23
SH3BP2-208ENST00000504294 H3F3CQ6NXT2 135 aa13.6□□□□□ -0.23
SH3BP2-208ENST00000504294 IGFL2Q6UWQ7 119 aa13.6□□□□□ -0.23
SH3BP2-208ENST00000504294 HSDL2Q6YN16 418 aa13.6□□□□□ -0.23
SH3BP2-208ENST00000504294 CLNKQ7Z7G1 428 aa13.6□□□□□ -0.23
SH3BP2-208ENST00000504294 CRLF3Q8IUI8 442 aa13.6□□□□□ -0.23
SH3BP2-208ENST00000504294 TMEM52Q8NDY8 209 aa13.6□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.3 ms