RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497511.5

SKAP2-209, Transcript of src kinase associated phosphoprotein 2, human

TSL 4

Gene SKAP2, Length 585 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SKAP2-209	ENST00000497511	AQP7	O14520	342 aa		10.02	□□□□□ -0.81
SKAP2-209	ENST00000497511	DVL2	O14641	736 aa		10.02	□□□□□ -0.81
SKAP2-209	ENST00000497511	OR6B1	O95007	311 aa		10.02	□□□□□ -0.81
SKAP2-209	ENST00000497511		P04436	131 aa		10.02	□□□□□ -0.81
SKAP2-209	ENST00000497511	TACR1	P25103	407 aa		10.02	□□□□□ -0.81
SKAP2-209	ENST00000497511	RPL22	P35268	128 aa	Known RBP	10.02	□□□□□ -0.81
SKAP2-209	ENST00000497511	RGS4	P49798	205 aa		10.02	□□□□□ -0.81
SKAP2-209	ENST00000497511	ASCL1	P50553	236 aa		10.02	□□□□□ -0.81
SKAP2-209	ENST00000497511	TERF1	P54274	439 aa		10.02	□□□□□ -0.81
SKAP2-209	ENST00000497511	SLC13A2	Q13183	592 aa		10.02	□□□□□ -0.81
SKAP2-209	ENST00000497511	SLC10A1	Q14973	349 aa		10.02	□□□□□ -0.81
SKAP2-209	ENST00000497511	HSPB2	Q16082	182 aa		10.02	□□□□□ -0.81
SKAP2-209	ENST00000497511	RIPPLY2	Q5TAB7	128 aa		10.02	□□□□□ -0.81
SKAP2-209	ENST00000497511	RTL6	Q6ICC9	239 aa		10.02	□□□□□ -0.81
SKAP2-209	ENST00000497511	KIAA0930	Q6ICG6	404 aa	Predicted RBP	10.02	□□□□□ -0.81
SKAP2-209	ENST00000497511	LCTL	Q6UWM7	567 aa		10.02	□□□□□ -0.81
SKAP2-209	ENST00000497511	MBOAT1	Q6ZNC8	495 aa		10.02	□□□□□ -0.81
SKAP2-209	ENST00000497511	RTL4	Q6ZR62	310 aa		10.02	□□□□□ -0.81
SKAP2-209	ENST00000497511	CENPU	Q71F23	418 aa		10.02	□□□□□ -0.81
SKAP2-209	ENST00000497511	TRIL	Q7L0X0	811 aa		10.02	□□□□□ -0.81
SKAP2-209	ENST00000497511	TMEM251	Q8N6I4	163 aa		10.02	□□□□□ -0.81
SKAP2-209	ENST00000497511	TC2N	Q8N9U0	490 aa		10.02	□□□□□ -0.81
SKAP2-209	ENST00000497511	FAM168A	Q92567	244 aa		10.02	□□□□□ -0.81
SKAP2-209	ENST00000497511	RNASE6	Q93091	150 aa	Known RBP	10.02	□□□□□ -0.81
SKAP2-209	ENST00000497511	GPR21	Q99679	349 aa		10.02	□□□□□ -0.81
SKAP2-209	ENST00000497511	TM9SF2	Q99805	663 aa		10.02	□□□□□ -0.81
SKAP2-209	ENST00000497511	YIPF4	Q9BSR8	244 aa		10.02	□□□□□ -0.81
SKAP2-209	ENST00000497511	CNPPD1	Q9BV87	410 aa		10.02	□□□□□ -0.81
SKAP2-209	ENST00000497511	IL1RL2	Q9HB29	575 aa		10.02	□□□□□ -0.81
SKAP2-209	ENST00000497511	SLAMF8	Q9P0V8	285 aa		10.02	□□□□□ -0.81
SKAP2-209	ENST00000497511	KLHL42	Q9P2K6	505 aa		10.02	□□□□□ -0.81
SKAP2-209	ENST00000497511	MTRF1L	Q9UGC7	380 aa	Known RBP	10.02	□□□□□ -0.81
SKAP2-209	ENST00000497511	TRMT6	Q9UJA5	497 aa	Known RBP	10.02	□□□□□ -0.81
SKAP2-209	ENST00000497511	DHRS7	Q9Y394	339 aa		10.02	□□□□□ -0.81
SKAP2-209	ENST00000497511	IGKV3D-11	A0A0A0MRZ8	115 aa		10.01	□□□□□ -0.81
SKAP2-209	ENST00000497511	TRGV5	A0A0B4J1U4	118 aa		10.01	□□□□□ -0.81
SKAP2-209	ENST00000497511	TRBC2	A0A5B9	178 aa		10.01	□□□□□ -0.81
SKAP2-209	ENST00000497511	TUBAL3	A6NHL2	446 aa		10.01	□□□□□ -0.81
SKAP2-209	ENST00000497511	BTNL10	A8MVZ5	291 aa		10.01	□□□□□ -0.81
SKAP2-209	ENST00000497511	CLDN4	O14493	209 aa		10.01	□□□□□ -0.81
SKAP2-209	ENST00000497511	ARHGEF9	O43307	516 aa		10.01	□□□□□ -0.81
SKAP2-209	ENST00000497511	IGHG3	P01860	377 aa		10.01	□□□□□ -0.81
SKAP2-209	ENST00000497511	IFNA16	P05015	189 aa		10.01	□□□□□ -0.81
SKAP2-209	ENST00000497511	C8G	P07360	202 aa		10.01	□□□□□ -0.81
SKAP2-209	ENST00000497511	F7	P08709	466 aa	Predicted RBP	10.01	□□□□□ -0.81
SKAP2-209	ENST00000497511	RAC2	P15153	192 aa		10.01	□□□□□ -0.81
SKAP2-209	ENST00000497511	CNR1	P21554	472 aa		10.01	□□□□□ -0.81
SKAP2-209	ENST00000497511	SAT1	P21673	171 aa		10.01	□□□□□ -0.81
SKAP2-209	ENST00000497511	SOX3	P41225	446 aa		10.01	□□□□□ -0.81
SKAP2-209	ENST00000497511	DCAF7	P61962	342 aa		10.01	□□□□□ -0.81
SKAP2-209	ENST00000497511	NKX6-1	P78426	367 aa	Predicted RBP	10.01	□□□□□ -0.81
SKAP2-209	ENST00000497511	PPP2R2B	Q00005	443 aa		10.01	□□□□□ -0.81
SKAP2-209	ENST00000497511	EGR3	Q06889	387 aa		10.01	□□□□□ -0.81
SKAP2-209	ENST00000497511	TBX2	Q13207	712 aa	Predicted RBP	10.01	□□□□□ -0.81
SKAP2-209	ENST00000497511	DHX34	Q14147	1143 aa	Known RBP	10.01	□□□□□ -0.81
SKAP2-209	ENST00000497511	CSHL1	Q14406	222 aa		10.01	□□□□□ -0.81
SKAP2-209	ENST00000497511	RBBP5	Q15291	538 aa	Known RBP	10.01	□□□□□ -0.81
SKAP2-209	ENST00000497511	TERF2	Q15554	542 aa		10.01	□□□□□ -0.81
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF750	Q32MQ0	723 aa		10.01	□□□□□ -0.81
SKAP2-209	ENST00000497511	SHE	Q5VZ18	495 aa		10.01	□□□□□ -0.81
SKAP2-209	ENST00000497511	LRRC8E	Q6NSJ5	796 aa		10.01	□□□□□ -0.81
SKAP2-209	ENST00000497511	CYHR1	Q6ZMK1	362 aa		10.01	□□□□□ -0.81
SKAP2-209	ENST00000497511	SLC13A5	Q86YT5	568 aa	Predicted RBP	10.01	□□□□□ -0.81
SKAP2-209	ENST00000497511	P3H2	Q8IVL5	708 aa		10.01	□□□□□ -0.81
SKAP2-209	ENST00000497511	MYO1H	Q8N1T3	1032 aa		10.01	□□□□□ -0.81
SKAP2-209	ENST00000497511	LIX1	Q8N485	282 aa		10.01	□□□□□ -0.81
SKAP2-209	ENST00000497511	NT5C	Q8TCD5	201 aa		10.01	□□□□□ -0.81
SKAP2-209	ENST00000497511	UTP15	Q8TED0	518 aa	Known RBP	10.01	□□□□□ -0.81
SKAP2-209	ENST00000497511	SNF8	Q96H20	258 aa		10.01	□□□□□ -0.81
SKAP2-209	ENST00000497511	FAR2	Q96K12	515 aa		10.01	□□□□□ -0.81
SKAP2-209	ENST00000497511	CLK4	Q9HAZ1	481 aa	Known RBP	10.01	□□□□□ -0.81
SKAP2-209	ENST00000497511	PARVB	Q9HBI1	364 aa		10.01	□□□□□ -0.81
SKAP2-209	ENST00000497511	PRTFDC1	Q9NRG1	225 aa		10.01	□□□□□ -0.81
SKAP2-209	ENST00000497511	SACM1L	Q9NTJ5	587 aa		10.01	□□□□□ -0.81
SKAP2-209	ENST00000497511	ZFP69B	Q9UJL9	534 aa		10.01	□□□□□ -0.81
SKAP2-209	ENST00000497511	PDE10A	Q9Y233	779 aa		10.01	□□□□□ -0.81
SKAP2-209	ENST00000497511	MMACHC	Q9Y4U1	282 aa		10.01	□□□□□ -0.81
SKAP2-209	ENST00000497511	CLCA3P	Q9Y6N3	262 aa		10.01	□□□□□ -0.81
SKAP2-209	ENST00000497511		A0A1B0GVC2	190 aa		10	□□□□□ -0.81
SKAP2-209	ENST00000497511	NRDC	O43847	1150 aa		10	□□□□□ -0.81
SKAP2-209	ENST00000497511	SUSD5	O60279	629 aa		10	□□□□□ -0.81
SKAP2-209	ENST00000497511	GLS	O94925	669 aa	Predicted RBP	10	□□□□□ -0.81
SKAP2-209	ENST00000497511	LY6G6D	O95868	133 aa		10	□□□□□ -0.81
SKAP2-209	ENST00000497511	NPPB	P16860	134 aa		10	□□□□□ -0.81
SKAP2-209	ENST00000497511	PPP2R1B	P30154	601 aa		10	□□□□□ -0.81
SKAP2-209	ENST00000497511	HOXC12	P31275	282 aa		10	□□□□□ -0.81
SKAP2-209	ENST00000497511	DNASE1L1	P49184	302 aa		10	□□□□□ -0.81
SKAP2-209	ENST00000497511	SARNP	P82979	210 aa	Known RBP	10	□□□□□ -0.81
SKAP2-209	ENST00000497511	CTBP1	Q13363	440 aa		10	□□□□□ -0.81
SKAP2-209	ENST00000497511	XKR6	Q5GH73	641 aa		10	□□□□□ -0.81
SKAP2-209	ENST00000497511	CATSPERE	Q5SY80	951 aa		10	□□□□□ -0.81
SKAP2-209	ENST00000497511	UGT3A1	Q6NUS8	523 aa		10	□□□□□ -0.81
SKAP2-209	ENST00000497511	C4orf22	Q6V702	233 aa		10	□□□□□ -0.81
SKAP2-209	ENST00000497511	HSDL2	Q6YN16	418 aa		10	□□□□□ -0.81
SKAP2-209	ENST00000497511	PRIMA1	Q86XR5	153 aa		10	□□□□□ -0.81
SKAP2-209	ENST00000497511	KIF18B	Q86Y91	864 aa		10	□□□□□ -0.81
SKAP2-209	ENST00000497511	DENND6A	Q8IWF6	608 aa		10	□□□□□ -0.81
SKAP2-209	ENST00000497511	CA13	Q8N1Q1	262 aa		10	□□□□□ -0.81
SKAP2-209	ENST00000497511	TMEM132C	Q8N3T6	1108 aa		10	□□□□□ -0.81
SKAP2-209	ENST00000497511	FBXW8	Q8N3Y1	598 aa		10	□□□□□ -0.81

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