RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495350.5

CBX1-205, Transcript of chromobox 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CBX1, Length 550 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1-205ENST00000495350 CDK9P50750 372 aaKnown RBP5.63□□□□□ -1.51
CBX1-205ENST00000495350 REEP5Q00765 189 aa5.63□□□□□ -1.51
CBX1-205ENST00000495350 OCRLQ01968 901 aa5.63□□□□□ -1.51
CBX1-205ENST00000495350 RUNX1T1Q06455 604 aa5.63□□□□□ -1.51
CBX1-205ENST00000495350 KRTAP1-1Q07627 177 aa5.63□□□□□ -1.51
CBX1-205ENST00000495350 TGM3Q08188 693 aa5.63□□□□□ -1.51
CBX1-205ENST00000495350 GAB1Q13480 694 aa5.63□□□□□ -1.51
CBX1-205ENST00000495350 ZNF791Q3KP31 576 aaPredicted RBP5.63□□□□□ -1.51
CBX1-205ENST00000495350 PIGGQ5H8A4 983 aa5.63□□□□□ -1.51
CBX1-205ENST00000495350 VASNQ6EMK4 673 aa5.63□□□□□ -1.51
CBX1-205ENST00000495350 TRIM40Q6P9F5 258 aa5.63□□□□□ -1.51
CBX1-205ENST00000495350 ENPP6Q6UWR7 440 aa5.63□□□□□ -1.51
CBX1-205ENST00000495350 CES3Q6UWW8 571 aa5.63□□□□□ -1.51
CBX1-205ENST00000495350 CENPUQ71F23 418 aa5.63□□□□□ -1.51
CBX1-205ENST00000495350 SLC29A4Q7RTT9 530 aa5.63□□□□□ -1.51
CBX1-205ENST00000495350 TMPRSS11BQ86T26 416 aa5.63□□□□□ -1.51
CBX1-205ENST00000495350 PACS2Q86VP3 889 aa5.63□□□□□ -1.51
CBX1-205ENST00000495350 GRAMD2AQ8IUY3 354 aa5.63□□□□□ -1.51
CBX1-205ENST00000495350 GCNT2Q8N0V5 402 aa5.63□□□□□ -1.51
CBX1-205ENST00000495350 C7orf57Q8NEG2 295 aa5.63□□□□□ -1.51
CBX1-205ENST00000495350 TTLQ8NG68 377 aa5.63□□□□□ -1.51
CBX1-205ENST00000495350 OR10G3Q8NGC4 313 aa5.63□□□□□ -1.51
CBX1-205ENST00000495350 OR4K1Q8NGD4 311 aa5.63□□□□□ -1.51
CBX1-205ENST00000495350 NUBPLQ8TB37 319 aa5.63□□□□□ -1.51
CBX1-205ENST00000495350 SLC35B2Q8TB61 432 aa5.63□□□□□ -1.51
CBX1-205ENST00000495350 CD200R1Q8TD46 325 aa5.63□□□□□ -1.51
CBX1-205ENST00000495350 SLC5A11Q8WWX8 675 aa5.63□□□□□ -1.51
CBX1-205ENST00000495350 ATG4AQ8WYN0 398 aa5.63□□□□□ -1.51
CBX1-205ENST00000495350 ALG3Q92685 438 aa5.63□□□□□ -1.51
CBX1-205ENST00000495350 NEIL2Q969S2 332 aa5.63□□□□□ -1.51
CBX1-205ENST00000495350 ZBED6CLQ96FA7 236 aaPredicted RBP5.63□□□□□ -1.51
CBX1-205ENST00000495350 TRMT61AQ96FX7 289 aaKnown RBP5.63□□□□□ -1.51
CBX1-205ENST00000495350 ZC3HAV1LQ96H79 300 aaKnown RBP5.63□□□□□ -1.51
CBX1-205ENST00000495350 TSNARE1Q96NA8 513 aa5.63□□□□□ -1.51
CBX1-205ENST00000495350 GAL3ST4Q96RP7 486 aa5.63□□□□□ -1.51
CBX1-205ENST00000495350 KRT12Q99456 494 aa5.63□□□□□ -1.51
CBX1-205ENST00000495350 SLC39A3Q9BRY0 314 aa5.63□□□□□ -1.51
CBX1-205ENST00000495350 C19orf24Q9BVV8 132 aa5.63□□□□□ -1.51
CBX1-205ENST00000495350 KIFC1Q9BW19 673 aa5.63□□□□□ -1.51
CBX1-205ENST00000495350 UGT2B28Q9BY64 529 aa5.63□□□□□ -1.51
CBX1-205ENST00000495350 REG4Q9BYZ8 158 aa5.63□□□□□ -1.51
CBX1-205ENST00000495350 TSGA10Q9BZW7 698 aa5.63□□□□□ -1.51
CBX1-205ENST00000495350 PELI2Q9HAT8 420 aa5.63□□□□□ -1.51
CBX1-205ENST00000495350 EIF2B3Q9NR50 452 aaKnown RBP5.63□□□□□ -1.51
CBX1-205ENST00000495350 RYDENQ9NUL5 291 aaKnown RBP5.63□□□□□ -1.51
CBX1-205ENST00000495350 SDAD1Q9NVU7 687 aaKnown RBP eCLIP5.63□□□□□ -1.51
CBX1-205ENST00000495350 SYBUQ9NX95 663 aa5.63□□□□□ -1.51
CBX1-205ENST00000495350 VTI1BQ9UEU0 232 aa5.63□□□□□ -1.51
CBX1-205ENST00000495350 AMFRQ9UKV5 643 aa5.63□□□□□ -1.51
CBX1-205ENST00000495350 SOX13Q9UN79 622 aa5.63□□□□□ -1.51
CBX1-205ENST00000495350 PCDHA13Q9Y5I0 950 aa5.63□□□□□ -1.51
CBX1-205ENST00000495350 COMMD10Q9Y6G5 202 aa5.63□□□□□ -1.51
CBX1-205ENST00000495350 SPACA6W5XKT8 324 aa5.63□□□□□ -1.51
CBX1-205ENST00000495350 KIAA1549Q9HCM3 1950 aa5.63□□□□□ -1.51
CBX1-205ENST00000495350 NINQ8N4C6 2090 aa5.63□□□□□ -1.51
CBX1-205ENST00000495350 DOCK7Q96N67 2140 aa5.63□□□□□ -1.51
CBX1-205ENST00000495350 A0A087X1B8 175 aa5.62□□□□□ -1.51
CBX1-205ENST00000495350 MYOCOSA0A1B0GUC4 107 aa5.62□□□□□ -1.51
CBX1-205ENST00000495350 A8MXE2 369 aa5.62□□□□□ -1.51
CBX1-205ENST00000495350 AKR1B15C9JRZ8 316 aaPredicted RBP5.62□□□□□ -1.51
CBX1-205ENST00000495350 TGFBR3LH3BV60 316 aa5.62□□□□□ -1.51
CBX1-205ENST00000495350 MSTNO14793 375 aa5.62□□□□□ -1.51
CBX1-205ENST00000495350 ZNF354AO60765 605 aaPredicted RBP5.62□□□□□ -1.51
CBX1-205ENST00000495350 CTNSO60931 367 aa5.62□□□□□ -1.51
CBX1-205ENST00000495350 RCBTB2O95199 551 aa5.62□□□□□ -1.51
CBX1-205ENST00000495350 SNX4O95219 450 aa5.62□□□□□ -1.51
CBX1-205ENST00000495350 GUCA1CO95843 209 aa5.62□□□□□ -1.51
CBX1-205ENST00000495350 ACTL6AO96019 429 aa5.62□□□□□ -1.51
CBX1-205ENST00000495350 C1QAP02745 245 aa5.62□□□□□ -1.51
CBX1-205ENST00000495350 HPNP05981 417 aa5.62□□□□□ -1.51
CBX1-205ENST00000495350 FBXO45P0C2W1 286 aa5.62□□□□□ -1.51
CBX1-205ENST00000495350 SMIM10L1P0DMW3 83 aa5.62□□□□□ -1.51
CBX1-205ENST00000495350 POU2F1P14859 743 aa5.62□□□□□ -1.51
CBX1-205ENST00000495350 PAX1P15863 534 aa5.62□□□□□ -1.51
CBX1-205ENST00000495350 CHMP24386 653 aa5.62□□□□□ -1.51
CBX1-205ENST00000495350 CD79BP40259 229 aa5.62□□□□□ -1.51
CBX1-205ENST00000495350 TMED10P49755 219 aaKnown RBP5.62□□□□□ -1.51
CBX1-205ENST00000495350 HNRNPFP52597 415 aaKnown RBP5.62□□□□□ -1.51
CBX1-205ENST00000495350 PLA2G16P53816 162 aa5.62□□□□□ -1.51
CBX1-205ENST00000495350 AP1S2P56377 157 aa5.62□□□□□ -1.51
CBX1-205ENST00000495350 RPS4XP62701 263 aaKnown RBP5.62□□□□□ -1.51
CBX1-205ENST00000495350 RPP38P78345 283 aaKnown RBP5.62□□□□□ -1.51
CBX1-205ENST00000495350 SARNPP82979 210 aaKnown RBP5.62□□□□□ -1.51
CBX1-205ENST00000495350 SRYQ05066 204 aa5.62□□□□□ -1.51
CBX1-205ENST00000495350 DHX9Q08211 1270 aaKnown RBP5.62□□□□□ -1.51
CBX1-205ENST00000495350 FOXF2Q12947 444 aa5.62□□□□□ -1.51
CBX1-205ENST00000495350 TBX2Q13207 712 aaPredicted RBP5.62□□□□□ -1.51
CBX1-205ENST00000495350 KLF1Q13351 362 aaPredicted RBP5.62□□□□□ -1.51
CBX1-205ENST00000495350 RUNX2Q13950 521 aa5.62□□□□□ -1.51
CBX1-205ENST00000495350 RPS6KA2Q15349 733 aa5.62□□□□□ -1.51
CBX1-205ENST00000495350 KRTAP24-1Q3LI83 254 aa5.62□□□□□ -1.51
CBX1-205ENST00000495350 KBTBD12Q3ZCT8 623 aa5.62□□□□□ -1.51
CBX1-205ENST00000495350 NHSL2Q5HYW2 709 aa5.62□□□□□ -1.51
CBX1-205ENST00000495350 SEL1L2Q5TEA6 688 aa5.62□□□□□ -1.51
CBX1-205ENST00000495350 ADGRD1Q6QNK2 874 aa5.62□□□□□ -1.51
CBX1-205ENST00000495350 CYHR1Q6ZMK1 362 aa5.62□□□□□ -1.51
CBX1-205ENST00000495350 PEX26Q7Z412 305 aa5.62□□□□□ -1.51
CBX1-205ENST00000495350 P4HA3Q7Z4N8 544 aa5.62□□□□□ -1.51
CBX1-205ENST00000495350 KLHDC8AQ8IYD2 350 aa5.62□□□□□ -1.51
CBX1-205ENST00000495350 TAGAPQ8N103 731 aa5.62□□□□□ -1.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.1 ms