RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489053.1

HDAC6-232, Transcript of histone deacetylase 6, humanhuman

TSL 4

Gene HDAC6, Length 539 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC6-232ENST00000489053 HERVK_113P63132 956 aa8.5□□□□□ -1.05
HDAC6-232ENST00000489053 FOLH1Q04609 750 aa8.5□□□□□ -1.05
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HDAC6-232ENST00000489053 E2F2Q14209 437 aa8.5□□□□□ -1.05
HDAC6-232ENST00000489053 RASA2Q15283 850 aa8.5□□□□□ -1.05
HDAC6-232ENST00000489053 CFAP157Q5JU67 520 aa8.5□□□□□ -1.05
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HDAC6-232ENST00000489053 OR52E8Q6IFG1 317 aa8.5□□□□□ -1.05
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HDAC6-232ENST00000489053 IL20RBQ6UXL0 311 aa8.5□□□□□ -1.05
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HDAC6-232ENST00000489053 RNF175Q8N4F7 328 aa8.5□□□□□ -1.05
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HDAC6-232ENST00000489053 CCNYL1Q8N7R7 359 aa8.5□□□□□ -1.05
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HDAC6-232ENST00000489053 NFAM1Q8NET5 270 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
HDAC6-232ENST00000489053 OR52B6Q8NGF0 335 aa8.5□□□□□ -1.05
HDAC6-232ENST00000489053 METTL6Q8TCB7 284 aa8.5□□□□□ -1.05
HDAC6-232ENST00000489053 SLC22A8Q8TCC7 542 aa8.5□□□□□ -1.05
HDAC6-232ENST00000489053 SLC2A12Q8TD20 617 aa8.5□□□□□ -1.05
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HDAC6-232ENST00000489053 NTMT1Q9BV86 223 aa8.5□□□□□ -1.05
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HDAC6-232ENST00000489053 CCL21O00585 134 aa8.49□□□□□ -1.05
HDAC6-232ENST00000489053 COPEO14579 308 aa8.49□□□□□ -1.05
HDAC6-232ENST00000489053 PRRG2O14669 202 aa8.49□□□□□ -1.05
HDAC6-232ENST00000489053 PEX1O43933 1283 aa8.49□□□□□ -1.05
HDAC6-232ENST00000489053 FGF17O60258 216 aa8.49□□□□□ -1.05
HDAC6-232ENST00000489053 CDC40O60508 579 aaKnown RBP eCLIP8.49□□□□□ -1.05
HDAC6-232ENST00000489053 SLC19A2O60779 497 aa8.49□□□□□ -1.05
HDAC6-232ENST00000489053 GLRA3O75311 464 aa8.49□□□□□ -1.05
HDAC6-232ENST00000489053 ULK1O75385 1050 aa8.49□□□□□ -1.05
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HDAC6-232ENST00000489053 TBX6O95947 436 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
HDAC6-232ENST00000489053 GBAP04062 536 aa8.49□□□□□ -1.05
HDAC6-232ENST00000489053 P04436 131 aa8.49□□□□□ -1.05
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HDAC6-232ENST00000489053 ALDH9A1P49189 494 aa8.49□□□□□ -1.05
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HDAC6-232ENST00000489053 ZNF267Q14586 743 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
HDAC6-232ENST00000489053 IMPG1Q17R60 797 aa8.49□□□□□ -1.05
HDAC6-232ENST00000489053 FAM153CQ494X1 144 aa8.49□□□□□ -1.05
HDAC6-232ENST00000489053 GGTA1PQ4G0N0 100 aa8.49□□□□□ -1.05
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HDAC6-232ENST00000489053 PAOXQ6QHF9 649 aa8.49□□□□□ -1.05
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HDAC6-232ENST00000489053 RNF111Q6ZNA4 994 aa8.49□□□□□ -1.05
HDAC6-232ENST00000489053 RTL4Q6ZR62 310 aa8.49□□□□□ -1.05
HDAC6-232ENST00000489053 GPRIN3Q6ZVF9 776 aa8.49□□□□□ -1.05
HDAC6-232ENST00000489053 MAMDC2Q7Z304 686 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
HDAC6-232ENST00000489053 GALNT12Q8IXK2 581 aa8.49□□□□□ -1.05
HDAC6-232ENST00000489053 ST13P4Q8IZP2 240 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
HDAC6-232ENST00000489053 TAGAPQ8N103 731 aa8.49□□□□□ -1.05
HDAC6-232ENST00000489053 GHDCQ8N2G8 530 aa8.49□□□□□ -1.05
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HDAC6-232ENST00000489053 OR4F6Q8NGB9 312 aa8.49□□□□□ -1.05
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HDAC6-232ENST00000489053 PTPMT1Q8WUK0 201 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
HDAC6-232ENST00000489053 DGCR8Q8WYQ5 773 aaKnown RBP eCLIP8.49□□□□□ -1.05
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HDAC6-232ENST00000489053 NPAS2Q99743 824 aa8.49□□□□□ -1.05
HDAC6-232ENST00000489053 DDX31Q9H8H2 851 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
HDAC6-232ENST00000489053 GIMAP4Q9NUV9 329 aa8.49□□□□□ -1.05
HDAC6-232ENST00000489053 PSD3Q9NYI0 1048 aa8.49□□□□□ -1.05
HDAC6-232ENST00000489053 MYOTQ9UBF9 498 aa8.49□□□□□ -1.05
HDAC6-232ENST00000489053 MID2Q9UJV3 735 aa8.49□□□□□ -1.05
HDAC6-232ENST00000489053 PPIEQ9UNP9 301 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
HDAC6-232ENST00000489053 ATG4BQ9Y4P1 393 aa8.49□□□□□ -1.05
HDAC6-232ENST00000489053 TEX15Q9BXT5 2789 aa8.48□□□□□ -1.05
HDAC6-232ENST00000489053 SVILO95425 2214 aa8.48□□□□□ -1.05
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