RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000447046.1

AC004980.3-201, humanhuman

BASIC

Gene AC004980.3, Length 365 nt, Biotype unprocessed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AC004980.3-201ENST00000447046 WDR20Q8TBZ3 569 aa4.88□□□□□ -1.63
AC004980.3-201ENST00000447046 LMX1AQ8TE12 382 aa4.88□□□□□ -1.63
AC004980.3-201ENST00000447046 NAT14Q8WUY8 206 aa4.88□□□□□ -1.63
AC004980.3-201ENST00000447046 TESCQ96BS2 214 aa4.88□□□□□ -1.63
AC004980.3-201ENST00000447046 SLC7A6OSQ96CW6 309 aaPredicted RBP4.88□□□□□ -1.63
AC004980.3-201ENST00000447046 CLIP3Q96DZ5 547 aa4.88□□□□□ -1.63
AC004980.3-201ENST00000447046 C3orf30Q96M34 536 aa4.88□□□□□ -1.63
AC004980.3-201ENST00000447046 PRAP1Q96NZ9 151 aa4.88□□□□□ -1.63
AC004980.3-201ENST00000447046 KCNC2Q96PR1 638 aa4.88□□□□□ -1.63
AC004980.3-201ENST00000447046 OR4K3Q96R72 315 aa4.88□□□□□ -1.63
AC004980.3-201ENST00000447046 KCNA7Q96RP8 456 aa4.88□□□□□ -1.63
AC004980.3-201ENST00000447046 CDRT15Q96T59 188 aa4.88□□□□□ -1.63
AC004980.3-201ENST00000447046 CD180Q99467 661 aa4.88□□□□□ -1.63
AC004980.3-201ENST00000447046 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa4.88□□□□□ -1.63
AC004980.3-201ENST00000447046 DPH7Q9BTV6 452 aa4.88□□□□□ -1.63
AC004980.3-201ENST00000447046 TBCDQ9BTW9 1192 aa4.88□□□□□ -1.63
AC004980.3-201ENST00000447046 THUMPD3Q9BV44 507 aaKnown RBP4.88□□□□□ -1.63
AC004980.3-201ENST00000447046 SARGQ9BW04 601 aa4.88□□□□□ -1.63
AC004980.3-201ENST00000447046 ACAT2Q9BWD1 397 aa4.88□□□□□ -1.63
AC004980.3-201ENST00000447046 TUBB1Q9H4B7 451 aa4.88□□□□□ -1.63
AC004980.3-201ENST00000447046 YY1AP1Q9H869 796 aa4.88□□□□□ -1.63
AC004980.3-201ENST00000447046 COPS7BQ9H9Q2 264 aaPredicted RBP4.88□□□□□ -1.63
AC004980.3-201ENST00000447046 MIEF1Q9NQG6 463 aa4.88□□□□□ -1.63
AC004980.3-201ENST00000447046 TM7SF3Q9NS93 570 aa4.88□□□□□ -1.63
AC004980.3-201ENST00000447046 GIMAP4Q9NUV9 329 aa4.88□□□□□ -1.63
AC004980.3-201ENST00000447046 HRASLS2Q9NWW9 162 aa4.88□□□□□ -1.63
AC004980.3-201ENST00000447046 GEMIN8Q9NWZ8 242 aaKnown RBP4.88□□□□□ -1.63
AC004980.3-201ENST00000447046 FAM120CQ9NX05 1096 aaKnown RBP4.88□□□□□ -1.63
AC004980.3-201ENST00000447046 THUMPD1Q9NXG2 353 aaKnown RBP4.88□□□□□ -1.63
AC004980.3-201ENST00000447046 Q9UFV3 132 aa4.88□□□□□ -1.63
AC004980.3-201ENST00000447046 ZNF225Q9UK10 706 aa4.88□□□□□ -1.63
AC004980.3-201ENST00000447046 WDR37Q9Y2I8 494 aa4.88□□□□□ -1.63
AC004980.3-201ENST00000447046 CFAP20Q9Y6A4 193 aaKnown RBP4.88□□□□□ -1.63
AC004980.3-201ENST00000447046 AP1M2Q9Y6Q5 423 aa4.88□□□□□ -1.63
AC004980.3-201ENST00000447046 KIAA1549LQ6ZVL6 1849 aa4.88□□□□□ -1.63
AC004980.3-201ENST00000447046 DENND4AQ7Z401 1863 aa4.88□□□□□ -1.63
AC004980.3-201ENST00000447046 KIF26AQ9ULI4 1882 aaPredicted RBP4.88□□□□□ -1.63
AC004980.3-201ENST00000447046 A0A1W2PR77 199 aa4.87□□□□□ -1.63
AC004980.3-201ENST00000447046 OR6C74A6NCV1 312 aa4.87□□□□□ -1.63
AC004980.3-201ENST00000447046 SYNDIG1LA6NDD5 238 aa4.87□□□□□ -1.63
AC004980.3-201ENST00000447046 ANTXRLA6NF34 631 aa4.87□□□□□ -1.63
AC004980.3-201ENST00000447046 TMEM221A6NGB7 291 aa4.87□□□□□ -1.63
AC004980.3-201ENST00000447046 MAGEB17A8MXT2 336 aa4.87□□□□□ -1.63
AC004980.3-201ENST00000447046 C10orf142B7Z368 130 aa4.87□□□□□ -1.63
AC004980.3-201ENST00000447046 M0R296 226 aa4.87□□□□□ -1.63
AC004980.3-201ENST00000447046 TRIM38O00635 465 aa4.87□□□□□ -1.63
AC004980.3-201ENST00000447046 RFXANKO14593 260 aa4.87□□□□□ -1.63
AC004980.3-201ENST00000447046 SCAMP1O15126 338 aa4.87□□□□□ -1.63
AC004980.3-201ENST00000447046 YY2O15391 372 aa4.87□□□□□ -1.63
AC004980.3-201ENST00000447046 NUDT21O43809 227 aaKnown RBP4.87□□□□□ -1.63
AC004980.3-201ENST00000447046 SH3BP5O60239 455 aa4.87□□□□□ -1.63
AC004980.3-201ENST00000447046 PCDH7O60245 1069 aa4.87□□□□□ -1.63
AC004980.3-201ENST00000447046 MGRN1O60291 552 aa4.87□□□□□ -1.63
AC004980.3-201ENST00000447046 EEDO75530 441 aaKnown RBP4.87□□□□□ -1.63
AC004980.3-201ENST00000447046 SEC24DO94855 1032 aaPredicted RBP4.87□□□□□ -1.63
AC004980.3-201ENST00000447046 UBXN7O94888 489 aa4.87□□□□□ -1.63
AC004980.3-201ENST00000447046 IFNA14P01570 189 aa4.87□□□□□ -1.63
AC004980.3-201ENST00000447046 SERPIND1P05546 499 aa4.87□□□□□ -1.63
AC004980.3-201ENST00000447046 MED14OSP0DP75 135 aa4.87□□□□□ -1.63
AC004980.3-201ENST00000447046 UMPSP11172 480 aa4.87□□□□□ -1.63
AC004980.3-201ENST00000447046 COX7A2P14406 83 aa4.87□□□□□ -1.63
AC004980.3-201ENST00000447046 IL10P22301 178 aa4.87□□□□□ -1.63
AC004980.3-201ENST00000447046 AK4P27144 223 aaPredicted RBP4.87□□□□□ -1.63
AC004980.3-201ENST00000447046 MPIP34949 423 aa4.87□□□□□ -1.63
AC004980.3-201ENST00000447046 FASLGP48023 281 aa4.87□□□□□ -1.63
AC004980.3-201ENST00000447046 RXRGP48443 463 aa4.87□□□□□ -1.63
AC004980.3-201ENST00000447046 PXNP49023 591 aaPredicted RBP4.87□□□□□ -1.63
AC004980.3-201ENST00000447046 CSNK1EP49674 416 aaKnown RBP4.87□□□□□ -1.63
AC004980.3-201ENST00000447046 MAPK12P53778 367 aa4.87□□□□□ -1.63
AC004980.3-201ENST00000447046 ATXN3P54252 364 aaPredicted RBP4.87□□□□□ -1.63
AC004980.3-201ENST00000447046 DIO3P55073 304 aa4.87□□□□□ -1.63
AC004980.3-201ENST00000447046 C21orf58P58505 322 aa4.87□□□□□ -1.63
AC004980.3-201ENST00000447046 PSME3P61289 254 aa4.87□□□□□ -1.63
AC004980.3-201ENST00000447046 UFM1P61960 85 aa4.87□□□□□ -1.63
AC004980.3-201ENST00000447046 RPS13P62277 151 aaKnown RBP4.87□□□□□ -1.63
AC004980.3-201ENST00000447046 ELF3P78545 371 aaPredicted RBP4.87□□□□□ -1.63
AC004980.3-201ENST00000447046 TXNL4AP83876 142 aaKnown RBP4.87□□□□□ -1.63
AC004980.3-201ENST00000447046 SLC25A3Q00325 362 aa4.87□□□□□ -1.63
AC004980.3-201ENST00000447046 HMGCS1Q01581 520 aa4.87□□□□□ -1.63
AC004980.3-201ENST00000447046 C2orf80Q0P641 193 aa4.87□□□□□ -1.63
AC004980.3-201ENST00000447046 BNIP2Q12982 314 aa4.87□□□□□ -1.63
AC004980.3-201ENST00000447046 EIF2B5Q13144 721 aaKnown RBP4.87□□□□□ -1.63
AC004980.3-201ENST00000447046 TOP3AQ13472 1001 aaPredicted RBP4.87□□□□□ -1.63
AC004980.3-201ENST00000447046 RCAN2Q14206 197 aa4.87□□□□□ -1.63
AC004980.3-201ENST00000447046 KIAA0040Q15053 153 aa4.87□□□□□ -1.63
AC004980.3-201ENST00000447046 CLPPQ16740 277 aaPredicted RBP4.87□□□□□ -1.63
AC004980.3-201ENST00000447046 FAM214AQ32MH5 1076 aa4.87□□□□□ -1.63
AC004980.3-201ENST00000447046 PGS1Q32NB8 556 aa4.87□□□□□ -1.63
AC004980.3-201ENST00000447046 CCSMST1Q4G0I0 132 aa4.87□□□□□ -1.63
AC004980.3-201ENST00000447046 MTX3Q5HYI7 312 aa4.87□□□□□ -1.63
AC004980.3-201ENST00000447046 TCTE1Q5JU00 501 aa4.87□□□□□ -1.63
AC004980.3-201ENST00000447046 C6orf10Q5SRN2 563 aa4.87□□□□□ -1.63
AC004980.3-201ENST00000447046 TMEM198Q66K66 360 aa4.87□□□□□ -1.63
AC004980.3-201ENST00000447046 OR4C11Q6IEV9 310 aa4.87□□□□□ -1.63
AC004980.3-201ENST00000447046 FIGLAQ6QHK4 219 aa4.87□□□□□ -1.63
AC004980.3-201ENST00000447046 BMP8AQ7Z5Y6 402 aa4.87□□□□□ -1.63
AC004980.3-201ENST00000447046 NUDT13Q86X67 352 aa4.87□□□□□ -1.63
AC004980.3-201ENST00000447046 LRRC56Q8IYG6 542 aaPredicted RBP4.87□□□□□ -1.63
AC004980.3-201ENST00000447046 ULK2Q8IYT8 1036 aa4.87□□□□□ -1.63
AC004980.3-201ENST00000447046 METTL4Q8N3J2 472 aa4.87□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.5 ms