RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000445497.1

UBBP3-201, Transcript of ubiquitin B pseudogene 3, humanhuman

BASIC

Gene UBBP3, Length 241 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBBP3-201ENST00000445497 NPSR1Q6W5P4 371 aa2.65□□□□□ -1.99
UBBP3-201ENST00000445497 DEF8Q6ZN54 512 aa2.65□□□□□ -1.99
UBBP3-201ENST00000445497 C17orf107Q6ZR85 190 aa2.65□□□□□ -1.99
UBBP3-201ENST00000445497 USP43Q70EL4 1123 aa2.65□□□□□ -1.99
UBBP3-201ENST00000445497 YTHDF3Q7Z739 585 aaKnown RBP2.65□□□□□ -1.99
UBBP3-201ENST00000445497 TMED4Q7Z7H5 227 aa2.65□□□□□ -1.99
UBBP3-201ENST00000445497 LDB1Q86U70 411 aaPredicted RBP2.65□□□□□ -1.99
UBBP3-201ENST00000445497 ANKRD46Q86W74 232 aa2.65□□□□□ -1.99
UBBP3-201ENST00000445497 GPBP1Q86WP2 473 aa2.65□□□□□ -1.99
UBBP3-201ENST00000445497 SPPL2CQ8IUH8 684 aa2.65□□□□□ -1.99
UBBP3-201ENST00000445497 MMAAQ8IVH4 418 aaKnown RBP2.65□□□□□ -1.99
UBBP3-201ENST00000445497 AQP12AQ8IXF9 295 aa2.65□□□□□ -1.99
UBBP3-201ENST00000445497 ZBED8Q8IZ13 594 aa2.65□□□□□ -1.99
UBBP3-201ENST00000445497 TBC1D3Q8IZP1 549 aaPredicted RBP2.65□□□□□ -1.99
UBBP3-201ENST00000445497 RNF113BQ8IZP6 322 aaKnown RBP2.65□□□□□ -1.99
UBBP3-201ENST00000445497 OR4N4Q8N0Y3 316 aa2.65□□□□□ -1.99
UBBP3-201ENST00000445497 SYNE4Q8N205 404 aa2.65□□□□□ -1.99
UBBP3-201ENST00000445497 ELMOD1Q8N336 334 aa2.65□□□□□ -1.99
UBBP3-201ENST00000445497 ZNF561Q8N587 486 aa2.65□□□□□ -1.99
UBBP3-201ENST00000445497 AMER3Q8N944 861 aa2.65□□□□□ -1.99
UBBP3-201ENST00000445497 PDPRQ8NCN5 879 aa2.65□□□□□ -1.99
UBBP3-201ENST00000445497 CPEB3Q8NE35 698 aaKnown RBP2.65□□□□□ -1.99
UBBP3-201ENST00000445497 OR7D4Q8NG98 312 aa2.65□□□□□ -1.99
UBBP3-201ENST00000445497 OR7G2Q8NG99 324 aa2.65□□□□□ -1.99
UBBP3-201ENST00000445497 OR10J5Q8NHC4 309 aa2.65□□□□□ -1.99
UBBP3-201ENST00000445497 VANGL1Q8TAA9 524 aaPredicted RBP2.65□□□□□ -1.99
UBBP3-201ENST00000445497 MARCH1Q8TCQ1 289 aa2.65□□□□□ -1.99
UBBP3-201ENST00000445497 RAET1EQ8TD07 263 aa2.65□□□□□ -1.99
UBBP3-201ENST00000445497 NETO1Q8TDF5 533 aa2.65□□□□□ -1.99
UBBP3-201ENST00000445497 NEK7Q8TDX7 302 aa2.65□□□□□ -1.99
UBBP3-201ENST00000445497 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa2.65□□□□□ -1.99
UBBP3-201ENST00000445497 GDPD5Q8WTR4 605 aa2.65□□□□□ -1.99
UBBP3-201ENST00000445497 FAR1Q8WVX9 515 aa2.65□□□□□ -1.99
UBBP3-201ENST00000445497 CASKIN2Q8WXE0 1202 aa2.65□□□□□ -1.99
UBBP3-201ENST00000445497 ST8SIA2Q92186 375 aa2.65□□□□□ -1.99
UBBP3-201ENST00000445497 SMPDL3AQ92484 453 aa2.65□□□□□ -1.99
UBBP3-201ENST00000445497 PIGBQ92521 554 aa2.65□□□□□ -1.99
UBBP3-201ENST00000445497 GLG1Q92896 1179 aa2.65□□□□□ -1.99
UBBP3-201ENST00000445497 GLYATL1Q969I3 302 aa2.65□□□□□ -1.99
UBBP3-201ENST00000445497 RAB24Q969Q5 203 aa2.65□□□□□ -1.99
UBBP3-201ENST00000445497 TMBIM1Q969X1 311 aa2.65□□□□□ -1.99
UBBP3-201ENST00000445497 ARRDC3Q96B67 414 aa2.65□□□□□ -1.99
UBBP3-201ENST00000445497 KCTD12Q96CX2 325 aaKnown RBP2.65□□□□□ -1.99
UBBP3-201ENST00000445497 CMTM5Q96DZ9 223 aa2.65□□□□□ -1.99
UBBP3-201ENST00000445497 TOE1Q96GM8 510 aaKnown RBP2.65□□□□□ -1.99
UBBP3-201ENST00000445497 PPP1R16AQ96I34 528 aa2.65□□□□□ -1.99
UBBP3-201ENST00000445497 AKR1E2Q96JD6 320 aa2.65□□□□□ -1.99
UBBP3-201ENST00000445497 FAR2Q96K12 515 aa2.65□□□□□ -1.99
UBBP3-201ENST00000445497 HRASLS5Q96KN8 279 aa2.65□□□□□ -1.99
UBBP3-201ENST00000445497 PACRGQ96M98 296 aaPredicted RBP2.65□□□□□ -1.99
UBBP3-201ENST00000445497 ZFP42Q96MM3 310 aa2.65□□□□□ -1.99
UBBP3-201ENST00000445497 TECTBQ96PL2 329 aa2.65□□□□□ -1.99
UBBP3-201ENST00000445497 SEPHS2Q99611 448 aa2.65□□□□□ -1.99
UBBP3-201ENST00000445497 P2RY13Q9BPV8 354 aa2.65□□□□□ -1.99
UBBP3-201ENST00000445497 AIF1LQ9BQI0 150 aa2.65□□□□□ -1.99
UBBP3-201ENST00000445497 TCEAL7Q9BRU2 100 aa2.65□□□□□ -1.99
UBBP3-201ENST00000445497 ATG101Q9BSB4 218 aa2.65□□□□□ -1.99
UBBP3-201ENST00000445497 TIMM29Q9BSF4 260 aa2.65□□□□□ -1.99
UBBP3-201ENST00000445497 DUSP26Q9BV47 211 aa2.65□□□□□ -1.99
UBBP3-201ENST00000445497 SCNM1Q9BWG6 230 aa2.65□□□□□ -1.99
UBBP3-201ENST00000445497 GTPBP2Q9BX10 602 aaKnown RBP2.65□□□□□ -1.99
UBBP3-201ENST00000445497 TSSK1BQ9BXA7 367 aa2.65□□□□□ -1.99
UBBP3-201ENST00000445497 BCL2L14Q9BZR8 327 aa2.65□□□□□ -1.99
UBBP3-201ENST00000445497 SIRPDQ9H106 197 aa2.65□□□□□ -1.99
UBBP3-201ENST00000445497 SLCO5A1Q9H2Y9 848 aa2.65□□□□□ -1.99
UBBP3-201ENST00000445497 ASB7Q9H672 318 aa2.65□□□□□ -1.99
UBBP3-201ENST00000445497 EGLN3Q9H6Z9 239 aa2.65□□□□□ -1.99
UBBP3-201ENST00000445497 C10orf88Q9H8K7 445 aa2.65□□□□□ -1.99
UBBP3-201ENST00000445497 GPAMQ9HCL2 828 aa2.65□□□□□ -1.99
UBBP3-201ENST00000445497 HRASLSQ9HDD0 168 aa2.65□□□□□ -1.99
UBBP3-201ENST00000445497 CD209Q9NNX6 404 aa2.65□□□□□ -1.99
UBBP3-201ENST00000445497 MYNNQ9NPC7 610 aa2.65□□□□□ -1.99
UBBP3-201ENST00000445497 MKKSQ9NPJ1 570 aaPredicted RBP2.65□□□□□ -1.99
UBBP3-201ENST00000445497 SPANXA1Q9NS26 97 aa2.65□□□□□ -1.99
UBBP3-201ENST00000445497 LANCL2Q9NS86 450 aa2.65□□□□□ -1.99
UBBP3-201ENST00000445497 C20orf141Q9NUB4 165 aa2.65□□□□□ -1.99
UBBP3-201ENST00000445497 SMPD4Q9NXE4 827 aa2.65□□□□□ -1.99
UBBP3-201ENST00000445497 PLK2Q9NYY3 685 aa2.65□□□□□ -1.99
UBBP3-201ENST00000445497 KCMF1Q9P0J7 381 aa2.65□□□□□ -1.99
UBBP3-201ENST00000445497 ABI3Q9P2A4 366 aa2.65□□□□□ -1.99
UBBP3-201ENST00000445497 MYEF2Q9P2K5 600 aaKnown RBP2.65□□□□□ -1.99
UBBP3-201ENST00000445497 PEMTQ9UBM1 199 aa2.65□□□□□ -1.99
UBBP3-201ENST00000445497 PISDQ9UG56 409 aa2.65□□□□□ -1.99
UBBP3-201ENST00000445497 BTNL2Q9UIR0 455 aa2.65□□□□□ -1.99
UBBP3-201ENST00000445497 SIX4Q9UIU6 781 aa2.65□□□□□ -1.99
UBBP3-201ENST00000445497 NAGPAQ9UK23 515 aa2.65□□□□□ -1.99
UBBP3-201ENST00000445497 PITPNC1Q9UKF7 332 aa2.65□□□□□ -1.99
UBBP3-201ENST00000445497 A4GNTQ9UNA3 340 aa2.65□□□□□ -1.99
UBBP3-201ENST00000445497 DIMT1Q9UNQ2 313 aaKnown RBP2.65□□□□□ -1.99
UBBP3-201ENST00000445497 USP22Q9UPT9 525 aa2.65□□□□□ -1.99
UBBP3-201ENST00000445497 PSG11Q9UQ72 335 aa2.65□□□□□ -1.99
UBBP3-201ENST00000445497 STARD10Q9Y365 291 aa2.65□□□□□ -1.99
UBBP3-201ENST00000445497 DYRK1BQ9Y463 629 aa2.65□□□□□ -1.99
UBBP3-201ENST00000445497 TMEM184BQ9Y519 407 aaPredicted RBP2.65□□□□□ -1.99
UBBP3-201ENST00000445497 POLR3HQ9Y535 204 aaPredicted RBP2.65□□□□□ -1.99
UBBP3-201ENST00000445497 PPIAL4AQ9Y536 164 aa2.65□□□□□ -1.99
UBBP3-201ENST00000445497 CPQQ9Y646 472 aa2.65□□□□□ -1.99
UBBP3-201ENST00000445497 ARL5AQ9Y689 179 aa2.65□□□□□ -1.99
UBBP3-201ENST00000445497 NEURL4Q96JN8 1562 aa2.65□□□□□ -1.99
UBBP3-201ENST00000445497 GRIN2DO15399 1336 aa2.65□□□□□ -1.99
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.9 ms