RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429738.1

MRPL28-203, Transcript of mitochondrial ribosomal protein L28, human

TSL 2 BASIC

Gene MRPL28, Length 310 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MRPL28-203	ENST00000429738	GTF2H2	Q13888	395 aa		16.45	■□□□□ 0.22
MRPL28-203	ENST00000429738	GTF2H2C	Q6P1K8	395 aa		16.45	■□□□□ 0.22
MRPL28-203	ENST00000429738	HSDL2	Q6YN16	418 aa		16.45	■□□□□ 0.22
MRPL28-203	ENST00000429738	GOLGA7	Q7Z5G4	137 aa		16.45	■□□□□ 0.22
MRPL28-203	ENST00000429738	L3MBTL4	Q8NA19	623 aa		16.45	■□□□□ 0.22
MRPL28-203	ENST00000429738	ACBD4	Q8NC06	268 aa		16.45	■□□□□ 0.22
MRPL28-203	ENST00000429738	SLC2A12	Q8TD20	617 aa		16.45	■□□□□ 0.22
MRPL28-203	ENST00000429738	ZNF721	Q8TF20	911 aa		16.45	■□□□□ 0.22
MRPL28-203	ENST00000429738	RGMA	Q96B86	450 aa		16.45	■□□□□ 0.22
MRPL28-203	ENST00000429738	RASL10B	Q96S79	203 aa		16.45	■□□□□ 0.22
MRPL28-203	ENST00000429738	FMO2	Q99518	471 aa		16.45	■□□□□ 0.22
MRPL28-203	ENST00000429738	MTERF1	Q99551	399 aa	Known RBP	16.45	■□□□□ 0.22
MRPL28-203	ENST00000429738	ENKD1	Q9H0I2	346 aa		16.45	■□□□□ 0.22
MRPL28-203	ENST00000429738	ACTR8	Q9H981	624 aa		16.45	■□□□□ 0.22
MRPL28-203	ENST00000429738	ZNF358	Q9NW07	568 aa		16.45	■□□□□ 0.22
MRPL28-203	ENST00000429738	PSD3	Q9NYI0	1048 aa		16.45	■□□□□ 0.22
MRPL28-203	ENST00000429738	PPT2	Q9UMR5	302 aa		16.45	■□□□□ 0.22
MRPL28-203	ENST00000429738	TNPO3	Q9Y5L0	923 aa	Known RBP	16.45	■□□□□ 0.22
MRPL28-203	ENST00000429738	ZNF407	Q9C0G0	2248 aa		16.44	■□□□□ 0.22
MRPL28-203	ENST00000429738		A8MVJ9	347 aa		16.44	■□□□□ 0.22
MRPL28-203	ENST00000429738	C17orf105	B2RV13	164 aa		16.44	■□□□□ 0.22
MRPL28-203	ENST00000429738	PEX1	O43933	1283 aa		16.44	■□□□□ 0.22
MRPL28-203	ENST00000429738	SIX3	O95343	332 aa	Predicted RBP	16.44	■□□□□ 0.22
MRPL28-203	ENST00000429738	ETHE1	O95571	254 aa		16.44	■□□□□ 0.22
MRPL28-203	ENST00000429738	ACSL3	O95573	720 aa		16.44	■□□□□ 0.22
MRPL28-203	ENST00000429738	PIK3CG	P48736	1102 aa		16.44	■□□□□ 0.22
MRPL28-203	ENST00000429738	HNRNPH2	P55795	449 aa	Known RBP	16.44	■□□□□ 0.22
MRPL28-203	ENST00000429738	RPS13	P62277	151 aa	Known RBP	16.44	■□□□□ 0.22
MRPL28-203	ENST00000429738	ID2	Q02363	134 aa		16.44	■□□□□ 0.22
MRPL28-203	ENST00000429738	DDX39B	Q13838	428 aa	Known RBP	16.44	■□□□□ 0.22
MRPL28-203	ENST00000429738	MRM1	Q6IN84	353 aa	Known RBP	16.44	■□□□□ 0.22
MRPL28-203	ENST00000429738	PSD4	Q8NDX1	1056 aa		16.44	■□□□□ 0.22
MRPL28-203	ENST00000429738	PAFAH2	Q99487	392 aa		16.44	■□□□□ 0.22
MRPL28-203	ENST00000429738	CENPK	Q9BS16	269 aa		16.44	■□□□□ 0.22
MRPL28-203	ENST00000429738	OR8D2	Q9GZM6	311 aa		16.44	■□□□□ 0.22
MRPL28-203	ENST00000429738	VPS11	Q9H270	941 aa		16.44	■□□□□ 0.22
MRPL28-203	ENST00000429738	IPPK	Q9H8X2	491 aa		16.44	■□□□□ 0.22
MRPL28-203	ENST00000429738	TIMMDC1	Q9NPL8	285 aa		16.44	■□□□□ 0.22
MRPL28-203	ENST00000429738	PLSCR2	Q9NRY7	297 aa		16.44	■□□□□ 0.22
MRPL28-203	ENST00000429738	DEPP	Q9NTK1	212 aa		16.44	■□□□□ 0.22
MRPL28-203	ENST00000429738	HPF1	Q9NWY4	346 aa		16.44	■□□□□ 0.22
MRPL28-203	ENST00000429738	CPSF2	Q9P2I0	782 aa	Known RBP	16.44	■□□□□ 0.22
MRPL28-203	ENST00000429738	DNAJC13	O75165	2243 aa		16.43	■□□□□ 0.22
MRPL28-203	ENST00000429738		A0A0A6YYD5	115 aa		16.43	■□□□□ 0.22
MRPL28-203	ENST00000429738	ZNHIT1	O43257	154 aa		16.43	■□□□□ 0.22
MRPL28-203	ENST00000429738	ZNF354A	O60765	605 aa	Predicted RBP	16.43	■□□□□ 0.22
MRPL28-203	ENST00000429738	OR6B1	O95007	311 aa		16.43	■□□□□ 0.22
MRPL28-203	ENST00000429738	TUBB4A	P04350	444 aa		16.43	■□□□□ 0.22
MRPL28-203	ENST00000429738	IGKV3-11	P04433	115 aa		16.43	■□□□□ 0.22
MRPL28-203	ENST00000429738	INHBA	P08476	426 aa		16.43	■□□□□ 0.22
MRPL28-203	ENST00000429738	RBP1	P09455	135 aa		16.43	■□□□□ 0.22
MRPL28-203	ENST00000429738	PTX3	P26022	381 aa	Predicted RBP	16.43	■□□□□ 0.22
MRPL28-203	ENST00000429738	PTGER1	P34995	402 aa		16.43	■□□□□ 0.22
MRPL28-203	ENST00000429738	BSG	P35613	385 aa		16.43	■□□□□ 0.22
MRPL28-203	ENST00000429738	SOX3	P41225	446 aa		16.43	■□□□□ 0.22
MRPL28-203	ENST00000429738	STT3A	P46977	705 aa		16.43	■□□□□ 0.22
MRPL28-203	ENST00000429738	RAP1GDS1	P52306	607 aa		16.43	■□□□□ 0.22
MRPL28-203	ENST00000429738	GPR85	P60893	370 aa		16.43	■□□□□ 0.22
MRPL28-203	ENST00000429738	RNF4	P78317	190 aa		16.43	■□□□□ 0.22
MRPL28-203	ENST00000429738	TNFRSF17	Q02223	184 aa		16.43	■□□□□ 0.22
MRPL28-203	ENST00000429738	BIK	Q13323	160 aa		16.43	■□□□□ 0.22
MRPL28-203	ENST00000429738	CUL3	Q13618	768 aa		16.43	■□□□□ 0.22
MRPL28-203	ENST00000429738	GLE1	Q53GS7	698 aa	Known RBP	16.43	■□□□□ 0.22
MRPL28-203	ENST00000429738	CMPK2	Q5EBM0	449 aa		16.43	■□□□□ 0.22
MRPL28-203	ENST00000429738	C18orf63	Q68DL7	685 aa		16.43	■□□□□ 0.22
MRPL28-203	ENST00000429738	GPR180	Q86V85	440 aa		16.43	■□□□□ 0.22
MRPL28-203	ENST00000429738	DOLPP1	Q86YN1	238 aa		16.43	■□□□□ 0.22
MRPL28-203	ENST00000429738	MYLK4	Q86YV6	388 aa	Predicted RBP	16.43	■□□□□ 0.22
MRPL28-203	ENST00000429738	PHF10	Q8WUB8	498 aa	Known RBP	16.43	■□□□□ 0.22
MRPL28-203	ENST00000429738	ASB15	Q8WXK1	588 aa		16.43	■□□□□ 0.22
MRPL28-203	ENST00000429738	TANK	Q92844	425 aa		16.43	■□□□□ 0.22
MRPL28-203	ENST00000429738	REPS1	Q96D71	796 aa		16.43	■□□□□ 0.22
MRPL28-203	ENST00000429738	RPF2	Q9H7B2	306 aa	Known RBP	16.43	■□□□□ 0.22
MRPL28-203	ENST00000429738	DDX31	Q9H8H2	851 aa	Known RBP	16.43	■□□□□ 0.22
MRPL28-203	ENST00000429738	PHF11	Q9UIL8	331 aa		16.43	■□□□□ 0.22
MRPL28-203	ENST00000429738	RNF11	Q9Y3C5	154 aa		16.43	■□□□□ 0.22
MRPL28-203	ENST00000429738	ATG4B	Q9Y4P1	393 aa		16.43	■□□□□ 0.22
MRPL28-203	ENST00000429738	STX16-NPEPL1	H3BU86	382 aa		16.42	■□□□□ 0.22
MRPL28-203	ENST00000429738	WWP2	O00308	870 aa		16.42	■□□□□ 0.22
MRPL28-203	ENST00000429738	FOXE1	O00358	373 aa	Predicted RBP	16.42	■□□□□ 0.22
MRPL28-203	ENST00000429738	OR7A17	O14581	309 aa		16.42	■□□□□ 0.22
MRPL28-203	ENST00000429738	STX16	O14662	325 aa		16.42	■□□□□ 0.22
MRPL28-203	ENST00000429738	TFEC	O14948	347 aa	Predicted RBP	16.42	■□□□□ 0.22
MRPL28-203	ENST00000429738	PROM1	O43490	865 aa		16.42	■□□□□ 0.22
MRPL28-203	ENST00000429738	HS6ST1	O60243	411 aa		16.42	■□□□□ 0.22
MRPL28-203	ENST00000429738	ABO	P16442	354 aa		16.42	■□□□□ 0.22
MRPL28-203	ENST00000429738	TNNI3	P19429	210 aa		16.42	■□□□□ 0.22
MRPL28-203	ENST00000429738	RFC3	P40938	356 aa		16.42	■□□□□ 0.22
MRPL28-203	ENST00000429738	SERPINB9	P50453	376 aa		16.42	■□□□□ 0.22
MRPL28-203	ENST00000429738	PHEX	P78562	749 aa		16.42	■□□□□ 0.22
MRPL28-203	ENST00000429738	CPSF6	Q16630	551 aa	Known RBP eCLIP	16.42	■□□□□ 0.22
MRPL28-203	ENST00000429738	IL20RB	Q6UXL0	311 aa		16.42	■□□□□ 0.22
MRPL28-203	ENST00000429738	MEX3B	Q6ZN04	569 aa	Known RBP	16.42	■□□□□ 0.22
MRPL28-203	ENST00000429738	OR4N5	Q8IXE1	308 aa		16.42	■□□□□ 0.22
MRPL28-203	ENST00000429738	PTGR2	Q8N8N7	351 aa	Predicted RBP	16.42	■□□□□ 0.22
MRPL28-203	ENST00000429738	MNS1	Q8NEH6	495 aa		16.42	■□□□□ 0.22
MRPL28-203	ENST00000429738	OR5L2	Q8NGL0	311 aa		16.42	■□□□□ 0.22
MRPL28-203	ENST00000429738	AGAP11	Q8TF27	550 aa		16.42	■□□□□ 0.22
MRPL28-203	ENST00000429738	SENP5	Q96HI0	755 aa	Predicted RBP	16.42	■□□□□ 0.22
MRPL28-203	ENST00000429738	TREX2	Q9BQ50	279 aa	Predicted RBP	16.42	■□□□□ 0.22

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