RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000336128.11

ZNF548-201, Transcript of zinc finger protein 548, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene ZNF548, Length 2,115 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548-201ENST00000336128 HIPK1Q86Z02 1210 aa11.77□□□□□ -0.52
ZNF548-201ENST00000336128 CAMKK1Q8N5S9 505 aa11.77□□□□□ -0.52
ZNF548-201ENST00000336128 RERGQ96A58 199 aaPredicted RBP11.77□□□□□ -0.52
ZNF548-201ENST00000336128 CNRIP1Q96F85 164 aaPredicted RBP11.77□□□□□ -0.52
ZNF548-201ENST00000336128 SLC35G5Q96KT7 338 aa11.77□□□□□ -0.52
ZNF548-201ENST00000336128 HSPA12BQ96MM6 686 aa11.77□□□□□ -0.52
ZNF548-201ENST00000336128 RBM4BQ9BQ04 359 aaKnown RBP11.77□□□□□ -0.52
ZNF548-201ENST00000336128 RBM4Q9BWF3 364 aaKnown RBP11.77□□□□□ -0.52
ZNF548-201ENST00000336128 CD320Q9NPF0 282 aa11.77□□□□□ -0.52
ZNF548-201ENST00000336128 U3KQV3 271 aa11.77□□□□□ -0.52
ZNF548-201ENST00000336128 VILLO15195 856 aa11.77□□□□□ -0.53
ZNF548-201ENST00000336128 DIRAS1O95057 198 aa11.77□□□□□ -0.53
ZNF548-201ENST00000336128 LINGO3P0C6S8 592 aa11.77□□□□□ -0.53
ZNF548-201ENST00000336128 BCKDHBP21953 392 aa11.77□□□□□ -0.53
ZNF548-201ENST00000336128 ITGA1P56199 1179 aa11.77□□□□□ -0.53
ZNF548-201ENST00000336128 PCBP3P57721 371 aaKnown RBP11.77□□□□□ -0.53
ZNF548-201ENST00000336128 SELENOWP63302 87 aa11.77□□□□□ -0.53
ZNF548-201ENST00000336128 SUZ12Q15022 739 aaKnown RBP11.77□□□□□ -0.53
ZNF548-201ENST00000336128 CRB2Q5IJ48 1285 aa11.77□□□□□ -0.53
ZNF548-201ENST00000336128 CHCHD2P9Q5T1J5 151 aaPredicted RBP11.77□□□□□ -0.53
ZNF548-201ENST00000336128 SHQ1Q6PI26 577 aaKnown RBP11.77□□□□□ -0.53
ZNF548-201ENST00000336128 GKN2Q86XP6 184 aa11.77□□□□□ -0.53
ZNF548-201ENST00000336128 APLFQ8IW19 511 aaPredicted RBP11.77□□□□□ -0.53
ZNF548-201ENST00000336128 SUN3Q8TAQ9 357 aa11.77□□□□□ -0.53
ZNF548-201ENST00000336128 KLHL6Q8WZ60 621 aa11.77□□□□□ -0.53
ZNF548-201ENST00000336128 SPACA7Q96KW9 195 aa11.77□□□□□ -0.53
ZNF548-201ENST00000336128 C7orf34Q96L11 122 aa11.77□□□□□ -0.53
ZNF548-201ENST00000336128 RDH12Q96NR8 316 aa11.77□□□□□ -0.53
ZNF548-201ENST00000336128 TRAPPC9Q96Q05 1148 aa11.77□□□□□ -0.53
ZNF548-201ENST00000336128 SERINC2Q96SA4 455 aa11.77□□□□□ -0.53
ZNF548-201ENST00000336128 GABARAPL1Q9H0R8 117 aa11.77□□□□□ -0.53
ZNF548-201ENST00000336128 SERHL2Q9H4I8 314 aa11.77□□□□□ -0.53
ZNF548-201ENST00000336128 GIMAP4Q9NUV9 329 aa11.77□□□□□ -0.53
ZNF548-201ENST00000336128 IFT80Q9P2H3 777 aaPredicted RBP11.77□□□□□ -0.53
ZNF548-201ENST00000336128 POMT2Q9UKY4 750 aa11.77□□□□□ -0.53
ZNF548-201ENST00000336128 A0A1B0GTW7 788 aa11.76□□□□□ -0.53
ZNF548-201ENST00000336128 A0A1W2PS29 197 aa11.76□□□□□ -0.53
ZNF548-201ENST00000336128 URADA6NGE7 173 aa11.76□□□□□ -0.53
ZNF548-201ENST00000336128 H0YAE9 185 aa11.76□□□□□ -0.53
ZNF548-201ENST00000336128 M0QX08 132 aa11.76□□□□□ -0.53
ZNF548-201ENST00000336128 CLIC3O95833 236 aa11.76□□□□□ -0.53
ZNF548-201ENST00000336128 IFNA14P01570 189 aa11.76□□□□□ -0.53
ZNF548-201ENST00000336128 CSNK2A2P19784 350 aaPredicted RBP11.76□□□□□ -0.53
ZNF548-201ENST00000336128 PTGER1P34995 402 aa11.76□□□□□ -0.53
ZNF548-201ENST00000336128 TNFRSF17Q02223 184 aa11.76□□□□□ -0.53
ZNF548-201ENST00000336128 IQCCQ4KMZ1 466 aa11.76□□□□□ -0.53
ZNF548-201ENST00000336128 IFI44LQ53G44 452 aa11.76□□□□□ -0.53
ZNF548-201ENST00000336128 GPR153Q6NV75 609 aa11.76□□□□□ -0.53
ZNF548-201ENST00000336128 TMEM64Q6YI46 380 aa11.76□□□□□ -0.53
ZNF548-201ENST00000336128 USP51Q70EK9 711 aa11.76□□□□□ -0.53
ZNF548-201ENST00000336128 SZRD1Q7Z422 152 aa11.76□□□□□ -0.53
ZNF548-201ENST00000336128 ZNF438Q7Z4V0 828 aa11.76□□□□□ -0.53
ZNF548-201ENST00000336128 SFXN5Q8TD22 340 aa11.76□□□□□ -0.53
ZNF548-201ENST00000336128 RAB8BQ92930 207 aa11.76□□□□□ -0.53
ZNF548-201ENST00000336128 MRPS26Q9BYN8 205 aaKnown RBP11.76□□□□□ -0.53
ZNF548-201ENST00000336128 TOR3AQ9H497 397 aa11.76□□□□□ -0.53
ZNF548-201ENST00000336128 SEMA3GQ9NS98 782 aa11.76□□□□□ -0.53
ZNF548-201ENST00000336128 PHF11Q9UIL8 331 aa11.76□□□□□ -0.53
ZNF548-201ENST00000336128 DOLKQ9UPQ8 538 aa11.76□□□□□ -0.53
ZNF548-201ENST00000336128 PADI2Q9Y2J8 665 aa11.76□□□□□ -0.53
ZNF548-201ENST00000336128 C5orf58C9J3I9 102 aa11.75□□□□□ -0.53
ZNF548-201ENST00000336128 H3BNH8 94 aa11.75□□□□□ -0.53
ZNF548-201ENST00000336128 B3GALT2O43825 422 aa11.75□□□□□ -0.53
ZNF548-201ENST00000336128 HS6ST1O60243 411 aa11.75□□□□□ -0.53
ZNF548-201ENST00000336128 EIF2S1P05198 315 aaKnown RBP11.75□□□□□ -0.53
ZNF548-201ENST00000336128 BCHEP06276 602 aa11.75□□□□□ -0.53
ZNF548-201ENST00000336128 C8orf89P0DMQ9 161 aa11.75□□□□□ -0.53
ZNF548-201ENST00000336128 ALPPL2P10696 532 aa11.75□□□□□ -0.53
ZNF548-201ENST00000336128 FPR1P21462 350 aa11.75□□□□□ -0.53
ZNF548-201ENST00000336128 PRKACGP22612 351 aa11.75□□□□□ -0.53
ZNF548-201ENST00000336128 CPN2P22792 545 aa11.75□□□□□ -0.53
ZNF548-201ENST00000336128 FEN1P39748 380 aaKnown RBP11.75□□□□□ -0.53
ZNF548-201ENST00000336128 NXPH1P58417 271 aa11.75□□□□□ -0.53
ZNF548-201ENST00000336128 RUNX2Q13950 521 aa11.75□□□□□ -0.53
ZNF548-201ENST00000336128 DEFB134Q4QY38 66 aa11.75□□□□□ -0.53
ZNF548-201ENST00000336128 RPS26P11Q5JNZ5 115 aaPredicted RBP11.75□□□□□ -0.53
ZNF548-201ENST00000336128 REEP3Q6NUK4 255 aa11.75□□□□□ -0.53
ZNF548-201ENST00000336128 SLC36A4Q6YBV0 504 aa11.75□□□□□ -0.53
ZNF548-201ENST00000336128 CEP68Q76N32 757 aa11.75□□□□□ -0.53
ZNF548-201ENST00000336128 ABHD13Q7L211 337 aa11.75□□□□□ -0.53
ZNF548-201ENST00000336128 PATL1Q86TB9 770 aaKnown RBP11.75□□□□□ -0.53
ZNF548-201ENST00000336128 CCDC116Q8IYX3 515 aa11.75□□□□□ -0.53
ZNF548-201ENST00000336128 OFCC1Q8IZS5 231 aa11.75□□□□□ -0.53
ZNF548-201ENST00000336128 ARL14Q8N4G2 192 aa11.75□□□□□ -0.53
ZNF548-201ENST00000336128 AVL9Q8NBF6 648 aa11.75□□□□□ -0.53
ZNF548-201ENST00000336128 SPPL2AQ8TCT8 520 aa11.75□□□□□ -0.53
ZNF548-201ENST00000336128 SLC38A5Q8WUX1 472 aa11.75□□□□□ -0.53
ZNF548-201ENST00000336128 LZICQ8WZA0 190 aa11.75□□□□□ -0.53
ZNF548-201ENST00000336128 RMND5BQ96G75 393 aaPredicted RBP11.75□□□□□ -0.53
ZNF548-201ENST00000336128 MBOAT4Q96T53 435 aa11.75□□□□□ -0.53
ZNF548-201ENST00000336128 BARD1Q99728 777 aaKnown RBP11.75□□□□□ -0.53
ZNF548-201ENST00000336128 OR51I1Q9H343 314 aa11.75□□□□□ -0.53
ZNF548-201ENST00000336128 SEMA6CQ9H3T2 930 aa11.75□□□□□ -0.53
ZNF548-201ENST00000336128 ZCCHC3Q9NUD5 404 aaKnown RBP11.75□□□□□ -0.53
ZNF548-201ENST00000336128 RAB23Q9ULC3 237 aa11.75□□□□□ -0.53
ZNF548-201ENST00000336128 MYRFQ9Y2G1 1151 aa11.75□□□□□ -0.53
ZNF548-201ENST00000336128 MRPS2Q9Y399 296 aaKnown RBP11.75□□□□□ -0.53
ZNF548-201ENST00000336128 SAMHD1Q9Y3Z3 626 aaKnown RBP11.75□□□□□ -0.53
ZNF548-201ENST00000336128 MSANTD3-TMEFF1A0A0A6YYJ0 341 aa11.75□□□□□ -0.53
ZNF548-201ENST00000336128 EME2A4GXA9 379 aaPredicted RBP11.75□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.5 ms