RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000298454.3

VSTM4-201, Transcript of V-set and transmembrane domain containing 4, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene VSTM4, Length 2,170 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM4-201ENST00000298454 PGM3O95394 542 aa21.52■■□□□ 1.04
VSTM4-201ENST00000298454 HPRP00739 348 aa21.52■■□□□ 1.04
VSTM4-201ENST00000298454 ALBP02768 609 aa21.52■■□□□ 1.04
VSTM4-201ENST00000298454 NME1P15531 152 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
VSTM4-201ENST00000298454 TNFRSF1BP20333 461 aa21.52■■□□□ 1.04
VSTM4-201ENST00000298454 FEN1P39748 380 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
VSTM4-201ENST00000298454 RACK1P63244 317 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
VSTM4-201ENST00000298454 DEFB134Q4QY38 66 aa21.52■■□□□ 1.04
VSTM4-201ENST00000298454 CEP68Q76N32 757 aa21.52■■□□□ 1.04
VSTM4-201ENST00000298454 OOSP2Q86WS3 158 aa21.52■■□□□ 1.04
VSTM4-201ENST00000298454 CCDC116Q8IYX3 515 aa21.52■■□□□ 1.04
VSTM4-201ENST00000298454 GJD3Q8N144 294 aa21.52■■□□□ 1.04
VSTM4-201ENST00000298454 LMX1AQ8TE12 382 aa21.52■■□□□ 1.04
VSTM4-201ENST00000298454 SERHL2Q9H4I8 314 aa21.52■■□□□ 1.04
VSTM4-201ENST00000298454 MYO1GB0I1T2 1018 aa21.51■■□□□ 1.03
VSTM4-201ENST00000298454 H0YGG7 62 aa21.51■■□□□ 1.03
VSTM4-201ENST00000298454 EIF2S1P05198 315 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
VSTM4-201ENST00000298454 SMIM10L1P0DMW3 83 aa21.51■■□□□ 1.03
VSTM4-201ENST00000298454 PCBP3P57721 371 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
VSTM4-201ENST00000298454 ARF3P61204 181 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
VSTM4-201ENST00000298454 PIWIL3Q7Z3Z3 882 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
VSTM4-201ENST00000298454 PJA1Q8NG27 643 aa21.51■■□□□ 1.03
VSTM4-201ENST00000298454 SPPL2AQ8TCT8 520 aa21.51■■□□□ 1.03
VSTM4-201ENST00000298454 SMIM10Q96HG1 83 aa21.51■■□□□ 1.03
VSTM4-201ENST00000298454 MAGED4Q96JG8 741 aa21.51■■□□□ 1.03
VSTM4-201ENST00000298454 RBM4BQ9BQ04 359 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
VSTM4-201ENST00000298454 RBM4Q9BWF3 364 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
VSTM4-201ENST00000298454 CD320Q9NPF0 282 aa21.51■■□□□ 1.03
VSTM4-201ENST00000298454 LYARQ9NX58 379 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
VSTM4-201ENST00000298454 USE1Q9NZ43 259 aa21.51■■□□□ 1.03
VSTM4-201ENST00000298454 DNAJB6O75190 326 aa21.51■■□□□ 1.03
VSTM4-201ENST00000298454 SEC24DO94855 1032 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
VSTM4-201ENST00000298454 DCNP07585 359 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
VSTM4-201ENST00000298454 ELOCQ15369 112 aa21.51■■□□□ 1.03
VSTM4-201ENST00000298454 CRB2Q5IJ48 1285 aa21.51■■□□□ 1.03
VSTM4-201ENST00000298454 SHQ1Q6PI26 577 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
VSTM4-201ENST00000298454 HIPK1Q86Z02 1210 aa21.51■■□□□ 1.03
VSTM4-201ENST00000298454 SLC44A2Q8IWA5 706 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
VSTM4-201ENST00000298454 CAMKVQ8NCB2 501 aa21.51■■□□□ 1.03
VSTM4-201ENST00000298454 SLC38A5Q8WUX1 472 aa21.51■■□□□ 1.03
VSTM4-201ENST00000298454 TBC1D20Q96BZ9 403 aa21.51■■□□□ 1.03
VSTM4-201ENST00000298454 TOR3AQ9H497 397 aa21.51■■□□□ 1.03
VSTM4-201ENST00000298454 ANGPT4Q9Y264 503 aa21.51■■□□□ 1.03
VSTM4-201ENST00000298454 MRPS2Q9Y399 296 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
VSTM4-201ENST00000298454 BCHEP06276 602 aa21.5■■□□□ 1.03
VSTM4-201ENST00000298454 BIRC2Q13490 618 aa21.5■■□□□ 1.03
VSTM4-201ENST00000298454 SUZ12Q15022 739 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
VSTM4-201ENST00000298454 CYP27C1Q4G0S4 372 aa21.5■■□□□ 1.03
VSTM4-201ENST00000298454 RPS26P11Q5JNZ5 115 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
VSTM4-201ENST00000298454 TSEN54Q7Z6J9 526 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
VSTM4-201ENST00000298454 SMYD1Q8NB12 490 aa21.5■■□□□ 1.03
VSTM4-201ENST00000298454 KLHL6Q8WZ60 621 aa21.5■■□□□ 1.03
VSTM4-201ENST00000298454 RERGQ96A58 199 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
VSTM4-201ENST00000298454 CLDN23Q96B33 292 aa21.5■■□□□ 1.03
VSTM4-201ENST00000298454 THAP11Q96EK4 314 aa21.5■■□□□ 1.03
VSTM4-201ENST00000298454 PCED1AQ9H1Q7 454 aa21.5■■□□□ 1.03
VSTM4-201ENST00000298454 ZCCHC3Q9NUD5 404 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
VSTM4-201ENST00000298454 TMEM74BQ9NUR3 256 aa21.5■■□□□ 1.03
VSTM4-201ENST00000298454 ENTPD4Q9Y227 616 aa21.5■■□□□ 1.03
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VSTM4-201ENST00000298454 HS6ST1O60243 411 aa21.5■■□□□ 1.03
VSTM4-201ENST00000298454 H6PDO95479 791 aa21.5■■□□□ 1.03
VSTM4-201ENST00000298454 C9P02748 559 aa21.5■■□□□ 1.03
VSTM4-201ENST00000298454 BCKDHBP21953 392 aa21.5■■□□□ 1.03
VSTM4-201ENST00000298454 OR1E2P47887 323 aa21.5■■□□□ 1.03
VSTM4-201ENST00000298454 ITGA1P56199 1179 aa21.5■■□□□ 1.03
VSTM4-201ENST00000298454 FOXB2Q5VYV0 432 aa21.5■■□□□ 1.03
VSTM4-201ENST00000298454 USP51Q70EK9 711 aa21.5■■□□□ 1.03
VSTM4-201ENST00000298454 RNF44Q7L0R7 432 aa21.5■■□□□ 1.03
VSTM4-201ENST00000298454 IQCHQ86VS3 1027 aa21.5■■□□□ 1.03
VSTM4-201ENST00000298454 RBM12BQ8IXT5 1001 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
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VSTM4-201ENST00000298454 DEFB123Q8N688 67 aa21.5■■□□□ 1.03
VSTM4-201ENST00000298454 ZFP28Q8NHY6 868 aa21.5■■□□□ 1.03
VSTM4-201ENST00000298454 A4GALTQ9NPC4 353 aa21.5■■□□□ 1.03
VSTM4-201ENST00000298454 RAB23Q9ULC3 237 aa21.5■■□□□ 1.03
VSTM4-201ENST00000298454 PADI2Q9Y2J8 665 aa21.5■■□□□ 1.03
VSTM4-201ENST00000298454 MSANTD3-TMEFF1A0A0A6YYJ0 341 aa21.49■■□□□ 1.03
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VSTM4-201ENST00000298454 H3BNH8 94 aa21.49■■□□□ 1.03
VSTM4-201ENST00000298454 ATP6V1B1P15313 513 aa21.49■■□□□ 1.03
VSTM4-201ENST00000298454 RUNX2Q13950 521 aa21.49■■□□□ 1.03
VSTM4-201ENST00000298454 GPR19Q15760 415 aa21.49■■□□□ 1.03
VSTM4-201ENST00000298454 REEP3Q6NUK4 255 aa21.49■■□□□ 1.03
VSTM4-201ENST00000298454 TMEFF1Q8IYR6 380 aa21.49■■□□□ 1.03
VSTM4-201ENST00000298454 ARL14Q8N4G2 192 aa21.49■■□□□ 1.03
VSTM4-201ENST00000298454 MBOAT4Q96T53 435 aa21.49■■□□□ 1.03
VSTM4-201ENST00000298454 KCMF1Q9P0J7 381 aa21.49■■□□□ 1.03
VSTM4-201ENST00000298454 IFT80Q9P2H3 777 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
VSTM4-201ENST00000298454 DOLKQ9UPQ8 538 aa21.49■■□□□ 1.03
VSTM4-201ENST00000298454 MYRFQ9Y2G1 1151 aa21.49■■□□□ 1.03
VSTM4-201ENST00000298454 URADA6NGE7 173 aa21.48■■□□□ 1.03
VSTM4-201ENST00000298454 HCRTR1O43613 425 aa21.48■■□□□ 1.03
VSTM4-201ENST00000298454 TFPTP0C1Z6 253 aa21.48■■□□□ 1.03
VSTM4-201ENST00000298454 NR2F6P10588 404 aa21.48■■□□□ 1.03
VSTM4-201ENST00000298454 CLCN2P51788 898 aa21.48■■□□□ 1.03
VSTM4-201ENST00000298454 PRKAG1P54619 331 aa21.48■■□□□ 1.03
VSTM4-201ENST00000298454 OLR1P78380 273 aa21.48■■□□□ 1.03
VSTM4-201ENST00000298454 RELAQ04206 551 aa21.48■■□□□ 1.03
VSTM4-201ENST00000298454 MAPK11Q15759 364 aa21.48■■□□□ 1.03
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