RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000288022.1

PDF-201, Transcript of peptide deformylase, mitochondrial, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PDF, Length 1,158 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDF-201ENST00000288022 CHN1P15882 459 aa23.46■■□□□ 1.35
PDF-201ENST00000288022 CREB1P16220 341 aa23.46■■□□□ 1.35
PDF-201ENST00000288022 ST13P50502 369 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
PDF-201ENST00000288022 TNFSF10P50591 281 aa23.46■■□□□ 1.35
PDF-201ENST00000288022 GALNT1Q10472 559 aaPredicted RBP23.46■■□□□ 1.35
PDF-201ENST00000288022 SCIMPQ6UWF3 145 aa23.46■■□□□ 1.35
PDF-201ENST00000288022 ATCAYQ86WG3 371 aa23.46■■□□□ 1.35
PDF-201ENST00000288022 C1orf52Q8N6N3 182 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
PDF-201ENST00000288022 GBP7Q8N8V2 638 aaPredicted RBP23.46■■□□□ 1.35
PDF-201ENST00000288022 APCDD1LQ8NCL9 501 aa23.46■■□□□ 1.35
PDF-201ENST00000288022 OR14A16Q8NHC5 309 aa23.46■■□□□ 1.35
PDF-201ENST00000288022 ZIM3Q96PE6 472 aa23.46■■□□□ 1.35
PDF-201ENST00000288022 NPAS2Q99743 824 aa23.46■■□□□ 1.35
PDF-201ENST00000288022 ACPTQ9BZG2 426 aa23.46■■□□□ 1.35
PDF-201ENST00000288022 TEX10Q9NXF1 929 aaPredicted RBP23.46■■□□□ 1.35
PDF-201ENST00000288022 GUCY1B2O75343 617 aa23.45■■□□□ 1.34
PDF-201ENST00000288022 ALDH3A1P30838 453 aa23.45■■□□□ 1.34
PDF-201ENST00000288022 FOXA1P55317 472 aa23.45■■□□□ 1.34
PDF-201ENST00000288022 PLIN5Q00G26 463 aa23.45■■□□□ 1.34
PDF-201ENST00000288022 TBL3Q12788 808 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.34
PDF-201ENST00000288022 OR52E8Q6IFG1 317 aa23.45■■□□□ 1.34
PDF-201ENST00000288022 THAP3Q8WTV1 239 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.34
PDF-201ENST00000288022 PTPMT1Q8WUK0 201 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.34
PDF-201ENST00000288022 SNRNP40Q96DI7 357 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.34
PDF-201ENST00000288022 RBM18Q96H35 190 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.34
PDF-201ENST00000288022 UTP23Q9BRU9 249 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.34
PDF-201ENST00000288022 MECRQ9BV79 373 aa23.45■■□□□ 1.34
PDF-201ENST00000288022 GATA5Q9BWX5 397 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.34
PDF-201ENST00000288022 OR8D2Q9GZM6 311 aa23.45■■□□□ 1.34
PDF-201ENST00000288022 ANKRD10Q9NXR5 420 aa23.45■■□□□ 1.34
PDF-201ENST00000288022 PPIEQ9UNP9 301 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.34
PDF-201ENST00000288022 COPG1Q9Y678 874 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.34
PDF-201ENST00000288022 WASHC1A8K0Z3 465 aa23.44■■□□□ 1.34
PDF-201ENST00000288022 GABRR3A8MPY1 467 aa23.44■■□□□ 1.34
PDF-201ENST00000288022 VPS4BO75351 444 aa23.44■■□□□ 1.34
PDF-201ENST00000288022 GPR75O95800 540 aa23.44■■□□□ 1.34
PDF-201ENST00000288022 ALOX15P16050 662 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
PDF-201ENST00000288022 STT3AP46977 705 aa23.44■■□□□ 1.34
PDF-201ENST00000288022 IGLV3-21P80748 117 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
PDF-201ENST00000288022 HMGCS1Q01581 520 aa23.44■■□□□ 1.34
PDF-201ENST00000288022 OC90Q02509 493 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
PDF-201ENST00000288022 BIKQ13323 160 aa23.44■■□□□ 1.34
PDF-201ENST00000288022 NDUFAF5Q5TEU4 345 aa23.44■■□□□ 1.34
PDF-201ENST00000288022 LGI4Q8N135 537 aa23.44■■□□□ 1.34
PDF-201ENST00000288022 MORN4Q8NDC4 146 aa23.44■■□□□ 1.34
PDF-201ENST00000288022 UCN3Q969E3 161 aa23.44■■□□□ 1.34
PDF-201ENST00000288022 PPWD1Q96BP3 646 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
PDF-201ENST00000288022 C19orf60Q96EN9 201 aa23.44■■□□□ 1.34
PDF-201ENST00000288022 VPS4AQ9UN37 437 aa23.44■■□□□ 1.34
PDF-201ENST00000288022 PGRMC2O15173 223 aa23.43■■□□□ 1.34
PDF-201ENST00000288022 DYRK3O43781 588 aa23.43■■□□□ 1.34
PDF-201ENST00000288022 OR10H2O60403 315 aa23.43■■□□□ 1.34
PDF-201ENST00000288022 SERPINB3P29508 390 aa23.43■■□□□ 1.34
PDF-201ENST00000288022 KCNC4Q03721 635 aa23.43■■□□□ 1.34
PDF-201ENST00000288022 BTKQ06187 659 aa23.43■■□□□ 1.34
PDF-201ENST00000288022 TUBA3CQ13748 450 aa23.43■■□□□ 1.34
PDF-201ENST00000288022 IMPG1Q17R60 797 aa23.43■■□□□ 1.34
PDF-201ENST00000288022 TUBA3EQ6PEY2 450 aa23.43■■□□□ 1.34
PDF-201ENST00000288022 CROCCP2Q86T23 111 aa23.43■■□□□ 1.34
PDF-201ENST00000288022 CHTF18Q8WVB6 975 aa23.43■■□□□ 1.34
PDF-201ENST00000288022 SREK1Q8WXA9 508 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
PDF-201ENST00000288022 ASF1BQ9NVP2 202 aa23.43■■□□□ 1.34
PDF-201ENST00000288022 ZNF223Q9UK11 482 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
PDF-201ENST00000288022 FCHO1O14526 889 aa23.42■■□□□ 1.34
PDF-201ENST00000288022 CTIFO43310 598 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
PDF-201ENST00000288022 ZFAND5O76080 213 aa23.42■■□□□ 1.34
PDF-201ENST00000288022 PIK3R1P27986 724 aa23.42■■□□□ 1.34
PDF-201ENST00000288022 CD96P40200 585 aa23.42■■□□□ 1.34
PDF-201ENST00000288022 GPR143P51810 404 aa23.42■■□□□ 1.34
PDF-201ENST00000288022 MLF1P58340 268 aa23.42■■□□□ 1.34
PDF-201ENST00000288022 ACSM2AQ08AH3 577 aa23.42■■□□□ 1.34
PDF-201ENST00000288022 SPIN4Q56A73 249 aa23.42■■□□□ 1.34
PDF-201ENST00000288022 SPDYAQ5MJ70 313 aa23.42■■□□□ 1.34
PDF-201ENST00000288022 ACSM2BQ68CK6 577 aa23.42■■□□□ 1.34
PDF-201ENST00000288022 SLC2A12Q8TD20 617 aa23.42■■□□□ 1.34
PDF-201ENST00000288022 PELOQ9BRX2 385 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
PDF-201ENST00000288022 TRMOQ9BU70 441 aa23.42■■□□□ 1.34
PDF-201ENST00000288022 TNFRSF12AQ9NP84 129 aa23.42■■□□□ 1.34
PDF-201ENST00000288022 COPS7AQ9UBW8 275 aa23.42■■□□□ 1.34
PDF-201ENST00000288022 TYROBPO43914 113 aa23.41■■□□□ 1.34
PDF-201ENST00000288022 PRAMEF2O60811 474 aa23.41■■□□□ 1.34
PDF-201ENST00000288022 DDAH2O95865 285 aa23.41■■□□□ 1.34
PDF-201ENST00000288022 MYZAPP0CAP1 466 aa23.41■■□□□ 1.34
PDF-201ENST00000288022 UROSP10746 265 aa23.41■■□□□ 1.34
PDF-201ENST00000288022 OR1C1Q15619 314 aa23.41■■□□□ 1.34
PDF-201ENST00000288022 CLEC6AQ6EIG7 209 aa23.41■■□□□ 1.34
PDF-201ENST00000288022 LRIG3Q6UXM1 1119 aa23.41■■□□□ 1.34
PDF-201ENST00000288022 HSDL2Q6YN16 418 aa23.41■■□□□ 1.34
PDF-201ENST00000288022 ST13P4Q8IZP2 240 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
PDF-201ENST00000288022 ZNF321PQ8N8H1 164 aa23.41■■□□□ 1.34
PDF-201ENST00000288022 AGPAT4Q9NRZ5 378 aa23.41■■□□□ 1.34
PDF-201ENST00000288022 MCM8Q9UJA3 840 aa23.41■■□□□ 1.34
PDF-201ENST00000288022 FIS1Q9Y3D6 152 aa23.41■■□□□ 1.34
PDF-201ENST00000288022 GNG14A0A1W2PPG7 69 aa23.4■■□□□ 1.34
PDF-201ENST00000288022 PCDH7O60245 1069 aa23.4■■□□□ 1.34
PDF-201ENST00000288022 EXOC3L1Q86VI1 746 aa23.4■■□□□ 1.34
PDF-201ENST00000288022 HORMAD2Q8N7B1 307 aa23.4■■□□□ 1.34
PDF-201ENST00000288022 OR4K14Q8NGD5 310 aa23.4■■□□□ 1.34
PDF-201ENST00000288022 DOK4Q8TEW6 326 aa23.4■■□□□ 1.34
PDF-201ENST00000288022 TM4SF18Q96CE8 201 aa23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53.4 ms