RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000598346.5

FARP1-223, Transcript of FERM, ARH/RhoGEF and pleckstrin domain protein 1, human

TSL 5

Gene FARP1, Length 756 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FARP1-223	ENST00000598346		M0R296	226 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FARP1-223	ENST00000598346	AKAP3	O75969	853 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FARP1-223	ENST00000598346	DUS4L	O95620	317 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
FARP1-223	ENST00000598346	PRKACG	P22612	351 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FARP1-223	ENST00000598346	CTNNA2	P26232	953 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FARP1-223	ENST00000598346	SERPINH1	P50454	418 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
FARP1-223	ENST00000598346	CLCN4	P51793	760 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FARP1-223	ENST00000598346	KIAA1024L	P59773	190 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FARP1-223	ENST00000598346	BTG1	P62324	171 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FARP1-223	ENST00000598346	SLC3A1	Q07837	685 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FARP1-223	ENST00000598346	SGCB	Q16585	318 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FARP1-223	ENST00000598346	MRGPRG-AS1	Q2M3A8	158 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FARP1-223	ENST00000598346	AARD	Q4LEZ3	155 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FARP1-223	ENST00000598346	PRAMEF8	Q5VWM4	474 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FARP1-223	ENST00000598346	KCTD11	Q693B1	232 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FARP1-223	ENST00000598346	TCEAL6	Q6IPX3	200 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FARP1-223	ENST00000598346	SLC22A15	Q8IZD6	547 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FARP1-223	ENST00000598346	LPCAT1	Q8NF37	534 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FARP1-223	ENST00000598346	CD99L2	Q8TCZ2	262 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FARP1-223	ENST00000598346	CHURC1	Q8WUH1	139 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FARP1-223	ENST00000598346	SEPT8	Q92599	483 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FARP1-223	ENST00000598346	FRAT1	Q92837	279 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
FARP1-223	ENST00000598346	EPSTI1	Q96J88	318 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FARP1-223	ENST00000598346	MTHFD2L	Q9H903	347 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
FARP1-223	ENST00000598346	AKIRIN1	Q9H9L7	192 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
FARP1-223	ENST00000598346	DBF4	Q9UBU7	674 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
FARP1-223	ENST00000598346	LNPEP	Q9UIQ6	1025 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FARP1-223	ENST00000598346	FBXW2	Q9UKT8	454 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FARP1-223	ENST00000598346	SHANK3	Q9BYB0	1731 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FARP1-223	ENST00000598346	PHRF1	Q9P1Y6	1649 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
FARP1-223	ENST00000598346	hCG_38984	A0A1B0GV85	526 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FARP1-223	ENST00000598346	CCDC162P	A2VCL2	907 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FARP1-223	ENST00000598346	ECE2	O60344	883 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FARP1-223	ENST00000598346	KIN	O60870	393 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
FARP1-223	ENST00000598346	LRCH4	O75427	683 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FARP1-223	ENST00000598346	CLN5	O75503	358 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FARP1-223	ENST00000598346	SBK2	P0C263	348 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FARP1-223	ENST00000598346	VDR	P11473	427 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FARP1-223	ENST00000598346	MYOG	P15173	224 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FARP1-223	ENST00000598346	SLC1A3	P43003	542 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FARP1-223	ENST00000598346	RIPK4	P57078	832 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FARP1-223	ENST00000598346	TEF	Q10587	303 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FARP1-223	ENST00000598346	MAPK11	Q15759	364 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FARP1-223	ENST00000598346	SPANXN4	Q5MJ08	99 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FARP1-223	ENST00000598346	CARNMT1	Q8N4J0	409 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FARP1-223	ENST00000598346	KRT35	Q92764	455 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FARP1-223	ENST00000598346	BPIFA2	Q96DR5	249 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FARP1-223	ENST00000598346	PDLIM5	Q96HC4	596 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
FARP1-223	ENST00000598346	CABS1	Q96KC9	395 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FARP1-223	ENST00000598346	PCDHB18P	Q96TA0	734 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FARP1-223	ENST00000598346	API5	Q9BZZ5	524 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
FARP1-223	ENST00000598346	MED20	Q9H944	212 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FARP1-223	ENST00000598346	MIS18A	Q9NYP9	233 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FARP1-223	ENST00000598346	PLCL2	Q9UPR0	1127 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FARP1-223	ENST00000598346	ZNF510	Q9Y2H8	683 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FARP1-223	ENST00000598346	BRWD3	Q6RI45	1802 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FARP1-223	ENST00000598346	FLT4	P35916	1363 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FARP1-223	ENST00000598346	KIAA0232	Q92628	1395 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FARP1-223	ENST00000598346	PXDNL	A1KZ92	1463 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FARP1-223	ENST00000598346	KIAA1217	Q5T5P2	1943 aa		4.86	□□□□□ -1.63
FARP1-223	ENST00000598346	TLX2	O43763	284 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
FARP1-223	ENST00000598346	ZSCAN5DP	P0CG00	497 aa		4.86	□□□□□ -1.63
FARP1-223	ENST00000598346	C4BPB	P20851	252 aa		4.86	□□□□□ -1.63
FARP1-223	ENST00000598346	PRKAR2B	P31323	418 aa		4.86	□□□□□ -1.63
FARP1-223	ENST00000598346	HNF4A	P41235	474 aa		4.86	□□□□□ -1.63
FARP1-223	ENST00000598346	CNTN1	Q12860	1018 aa		4.86	□□□□□ -1.63
FARP1-223	ENST00000598346	CEACAM7	Q14002	265 aa		4.86	□□□□□ -1.63
FARP1-223	ENST00000598346	ZC2HC1B	Q5TFG8	222 aa		4.86	□□□□□ -1.63
FARP1-223	ENST00000598346	KIF6	Q6ZMV9	814 aa		4.86	□□□□□ -1.63
FARP1-223	ENST00000598346	FRRS1	Q6ZNA5	592 aa		4.86	□□□□□ -1.63
FARP1-223	ENST00000598346	ZER1	Q7Z7L7	766 aa		4.86	□□□□□ -1.63
FARP1-223	ENST00000598346	ITPRIP	Q8IWB1	547 aa		4.86	□□□□□ -1.63
FARP1-223	ENST00000598346	LAX1	Q8IWV1	398 aa		4.86	□□□□□ -1.63
FARP1-223	ENST00000598346	DND1	Q8IYX4	353 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
FARP1-223	ENST00000598346	SPC24	Q8NBT2	197 aa		4.86	□□□□□ -1.63
FARP1-223	ENST00000598346	RNF149	Q8NC42	400 aa		4.86	□□□□□ -1.63
FARP1-223	ENST00000598346	NUP37	Q8NFH4	326 aa		4.86	□□□□□ -1.63
FARP1-223	ENST00000598346	SLC35C1	Q96A29	364 aa		4.86	□□□□□ -1.63
FARP1-223	ENST00000598346	CNRIP1	Q96F85	164 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
FARP1-223	ENST00000598346	NSMCE3	Q96MG7	304 aa		4.86	□□□□□ -1.63
FARP1-223	ENST00000598346	CCDC43	Q96MW1	224 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
FARP1-223	ENST00000598346	OPRPN	Q99935	248 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
FARP1-223	ENST00000598346	OVOL2	Q9BRP0	275 aa		4.86	□□□□□ -1.63
FARP1-223	ENST00000598346	MTIF3	Q9H2K0	278 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
FARP1-223	ENST00000598346	PLEKHG2	Q9H7P9	1386 aa		4.86	□□□□□ -1.63
FARP1-223	ENST00000598346	PIK3C2A	O00443	1686 aa		4.86	□□□□□ -1.63
FARP1-223	ENST00000598346	KIF1A	Q12756	1690 aa		4.86	□□□□□ -1.63
FARP1-223	ENST00000598346	FAM208A	Q9UK61	1670 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
FARP1-223	ENST00000598346	IGLV7-46	A0A075B6I9	117 aa		4.85	□□□□□ -1.63
FARP1-223	ENST00000598346	GTPBP10	A4D1E9	387 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
FARP1-223	ENST00000598346	SERINC4	A6NH21	518 aa		4.85	□□□□□ -1.63
FARP1-223	ENST00000598346	MPTX1	A8MV57	137 aa		4.85	□□□□□ -1.63
FARP1-223	ENST00000598346	CACNB4	O00305	520 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
FARP1-223	ENST00000598346	ARHGEF9	O43307	516 aa		4.85	□□□□□ -1.63
FARP1-223	ENST00000598346	PTMS	P20962	102 aa		4.85	□□□□□ -1.63
FARP1-223	ENST00000598346	FEN1	P39748	380 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
FARP1-223	ENST00000598346	GSC	P56915	257 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
FARP1-223	ENST00000598346	HUNK	P57058	714 aa		4.85	□□□□□ -1.63
FARP1-223	ENST00000598346	DHODH	Q02127	395 aa		4.85	□□□□□ -1.63
FARP1-223	ENST00000598346	ACTN3	Q08043	901 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63

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