RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592385.5

HDAC5-211, Transcript of histone deacetylase 5, humanhuman

TSL 5

Gene HDAC5, Length 2,601 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC5-211ENST00000592385 SFSWAPQ12872 951 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
HDAC5-211ENST00000592385 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP14.54□□□□□ -0.08
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HDAC5-211ENST00000592385 C11orf49Q9H6J7 331 aa14.53□□□□□ -0.08
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HDAC5-211ENST00000592385 ANKRD53Q8N9V6 530 aa14.53□□□□□ -0.08
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HDAC5-211ENST00000592385 ZNF697Q5TEC3 545 aa14.52□□□□□ -0.08
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HDAC5-211ENST00000592385 C19orf48Q6RUI8 117 aa14.52□□□□□ -0.08
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HDAC5-211ENST00000592385 NDOR1Q9UHB4 597 aa14.52□□□□□ -0.08
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HDAC5-211ENST00000592385 RPS26P11Q5JNZ5 115 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
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HDAC5-211ENST00000592385 LRRTM4Q86VH4 590 aa14.52□□□□□ -0.09
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HDAC5-211ENST00000592385 PLA2G15Q8NCC3 412 aa14.52□□□□□ -0.09
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HDAC5-211ENST00000592385 ZBED6CLQ96FA7 236 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
HDAC5-211ENST00000592385 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
HDAC5-211ENST00000592385 OR51E2Q9H255 320 aa14.52□□□□□ -0.09
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