RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574205.5

CTDNEP1-209, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

TSL 5

Gene CTDNEP1, Length 1,506 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-209ENST00000574205 C1orf109Q9NX04 203 aa31.09■■■□□ 2.57
CTDNEP1-209ENST00000574205 TEX10Q9NXF1 929 aaPredicted RBP31.09■■■□□ 2.57
CTDNEP1-209ENST00000574205 IGHV1-45A0A0A0MS14 117 aa31.08■■■□□ 2.57
CTDNEP1-209ENST00000574205 GNG14A0A1W2PPG7 69 aa31.08■■■□□ 2.57
CTDNEP1-209ENST00000574205 SYNDIG1LA6NDD5 238 aa31.08■■■□□ 2.57
CTDNEP1-209ENST00000574205 OCRLQ01968 901 aa31.08■■■□□ 2.57
CTDNEP1-209ENST00000574205 EEF1A2Q05639 463 aaKnown RBP31.08■■■□□ 2.57
CTDNEP1-209ENST00000574205 XKR7Q5GH72 579 aa31.08■■■□□ 2.57
CTDNEP1-209ENST00000574205 FAM76AQ8TAV0 307 aa31.08■■■□□ 2.57
CTDNEP1-209ENST00000574205 TANKQ92844 425 aa31.08■■■□□ 2.57
CTDNEP1-209ENST00000574205 LRTM1Q9HBL6 345 aa31.08■■■□□ 2.57
CTDNEP1-209ENST00000574205 LSM1O15116 133 aaKnown RBP31.08■■■□□ 2.57
CTDNEP1-209ENST00000574205 SEC22BO75396 215 aa31.08■■■□□ 2.57
CTDNEP1-209ENST00000574205 AIFM1O95831 613 aa31.08■■■□□ 2.57
CTDNEP1-209ENST00000574205 HPP00738 406 aa31.08■■■□□ 2.57
CTDNEP1-209ENST00000574205 KIAA0040Q15053 153 aa31.08■■■□□ 2.57
CTDNEP1-209ENST00000574205 NDUFAF5Q5TEU4 345 aa31.08■■■□□ 2.57
CTDNEP1-209ENST00000574205 NDUFAF7Q7L592 441 aa31.08■■■□□ 2.57
CTDNEP1-209ENST00000574205 CLEC1AQ8NC01 280 aa31.08■■■□□ 2.57
CTDNEP1-209ENST00000574205 LRRC8CQ8TDW0 803 aa31.08■■■□□ 2.57
CTDNEP1-209ENST00000574205 C19orf60Q96EN9 201 aa31.08■■■□□ 2.57
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZNF700Q9H0M5 742 aa31.08■■■□□ 2.57
CTDNEP1-209ENST00000574205 RIC8BQ9NVN3 520 aa31.08■■■□□ 2.57
CTDNEP1-209ENST00000574205 CLDN16Q9Y5I7 305 aa31.08■■■□□ 2.57
CTDNEP1-209ENST00000574205 NSG1A0A0A6YYJ2 146 aa31.07■■■□□ 2.56
CTDNEP1-209ENST00000574205 PPP2R1BP30154 601 aa31.07■■■□□ 2.56
CTDNEP1-209ENST00000574205 CPZQ66K79 652 aa31.07■■■□□ 2.56
CTDNEP1-209ENST00000574205 CLNKQ7Z7G1 428 aa31.07■■■□□ 2.56
CTDNEP1-209ENST00000574205 TM4SF18Q96CE8 201 aa31.07■■■□□ 2.56
CTDNEP1-209ENST00000574205 EBPLQ9BY08 206 aa31.07■■■□□ 2.56
CTDNEP1-209ENST00000574205 LDB3O75112 727 aa31.06■■■□□ 2.56
CTDNEP1-209ENST00000574205 PRKRAO75569 313 aaKnown RBP31.06■■■□□ 2.56
CTDNEP1-209ENST00000574205 MYO1DO94832 1006 aa31.06■■■□□ 2.56
CTDNEP1-209ENST00000574205 GSTM5P46439 218 aa31.06■■■□□ 2.56
CTDNEP1-209ENST00000574205 PCOLCEQ15113 449 aa31.06■■■□□ 2.56
CTDNEP1-209ENST00000574205 C7orf57Q8NEG2 295 aa31.06■■■□□ 2.56
CTDNEP1-209ENST00000574205 TTC9Q92623 222 aa31.06■■■□□ 2.56
CTDNEP1-209ENST00000574205 PNPOQ9NVS9 261 aa31.06■■■□□ 2.56
CTDNEP1-209ENST00000574205 LHX6Q9UPM6 363 aa31.06■■■□□ 2.56
CTDNEP1-209ENST00000574205 TGFBR3LH3BV60 316 aa31.05■■■□□ 2.56
CTDNEP1-209ENST00000574205 ANXA4P09525 319 aaPredicted RBP31.05■■■□□ 2.56
CTDNEP1-209ENST00000574205 OR4D2P58180 307 aa31.05■■■□□ 2.56
CTDNEP1-209ENST00000574205 STX4Q12846 297 aa31.05■■■□□ 2.56
CTDNEP1-209ENST00000574205 CHAF1BQ13112 559 aa31.05■■■□□ 2.56
CTDNEP1-209ENST00000574205 AIMP2Q13155 320 aaKnown RBP31.05■■■□□ 2.56
CTDNEP1-209ENST00000574205 PDCD2Q16342 344 aaPredicted RBP31.05■■■□□ 2.56
CTDNEP1-209ENST00000574205 SFT2D3Q587I9 215 aa31.05■■■□□ 2.56
CTDNEP1-209ENST00000574205 NOXRED1Q6NXP6 359 aa31.05■■■□□ 2.56
CTDNEP1-209ENST00000574205 PPP3R2Q96LZ3 170 aa31.05■■■□□ 2.56
CTDNEP1-209ENST00000574205 C3orf30Q96M34 536 aa31.05■■■□□ 2.56
CTDNEP1-209ENST00000574205 TUBB6Q9BUF5 446 aa31.05■■■□□ 2.56
CTDNEP1-209ENST00000574205 ATP13A2Q9NQ11 1180 aa31.05■■■□□ 2.56
CTDNEP1-209ENST00000574205 TMED5Q9Y3A6 229 aa31.05■■■□□ 2.56
CTDNEP1-209ENST00000574205 IGHV3-20A0A0C4DH32 117 aa31.04■■■□□ 2.56
CTDNEP1-209ENST00000574205 JUNP05412 331 aaKnown RBP31.04■■■□□ 2.56
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZNF763Q0D2J5 394 aa31.04■■■□□ 2.56
CTDNEP1-209ENST00000574205 SERTAD2Q14140 314 aa31.04■■■□□ 2.56
CTDNEP1-209ENST00000574205 GALNTL6Q49A17 601 aa31.04■■■□□ 2.56
CTDNEP1-209ENST00000574205 OR52E8Q6IFG1 317 aa31.04■■■□□ 2.56
CTDNEP1-209ENST00000574205 ARFGAP2Q8N6H7 521 aa31.04■■■□□ 2.56
CTDNEP1-209ENST00000574205 ANKRD9Q96BM1 317 aaPredicted RBP31.04■■■□□ 2.56
CTDNEP1-209ENST00000574205 LPAR4Q99677 370 aa31.04■■■□□ 2.56
CTDNEP1-209ENST00000574205 FAIM2Q9BWQ8 316 aa31.04■■■□□ 2.56
CTDNEP1-209ENST00000574205 TRIM55Q9BYV6 548 aa31.04■■■□□ 2.56
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZNF160Q9HCG1 818 aa31.04■■■□□ 2.56
CTDNEP1-209ENST00000574205 POLR3HQ9Y535 204 aaPredicted RBP31.04■■■□□ 2.56
CTDNEP1-209ENST00000574205 NBEAQ8NFP9 2946 aa31.04■■■□□ 2.56
CTDNEP1-209ENST00000574205 ATP6AP2A0A1C7CYW4 349 aa31.03■■■□□ 2.56
CTDNEP1-209ENST00000574205 C1orf226A1L170 272 aa31.03■■■□□ 2.56
CTDNEP1-209ENST00000574205 GLOD5A6NK44 160 aa31.03■■■□□ 2.56
CTDNEP1-209ENST00000574205 ERVH48-1M5A8F1 160 aa31.03■■■□□ 2.56
CTDNEP1-209ENST00000574205 ATP6AP2O75787 350 aa31.03■■■□□ 2.56
CTDNEP1-209ENST00000574205 TAS2R50P59544 299 aa31.03■■■□□ 2.56
CTDNEP1-209ENST00000574205 ACTN3Q08043 901 aaPredicted RBP31.03■■■□□ 2.56
CTDNEP1-209ENST00000574205 RFTN2Q52LD8 501 aaPredicted RBP31.03■■■□□ 2.56
CTDNEP1-209ENST00000574205 WDR77Q9BQA1 342 aaPredicted RBP31.03■■■□□ 2.56
CTDNEP1-209ENST00000574205 ARHGAP9Q9BRR9 750 aa31.03■■■□□ 2.56
CTDNEP1-209ENST00000574205 PCDHA9Q9Y5H5 950 aa31.03■■■□□ 2.56
CTDNEP1-209ENST00000574205 FGF17O60258 216 aa31.03■■■□□ 2.56
CTDNEP1-209ENST00000574205 SEC24DO94855 1032 aaPredicted RBP31.03■■■□□ 2.56
CTDNEP1-209ENST00000574205 RPL38P63173 70 aaKnown RBP31.03■■■□□ 2.56
CTDNEP1-209ENST00000574205 FOLH1Q04609 750 aa31.03■■■□□ 2.56
CTDNEP1-209ENST00000574205 LINC00303Q3SY05 128 aa31.03■■■□□ 2.56
CTDNEP1-209ENST00000574205 ATP6AP1LQ52LC2 224 aa31.03■■■□□ 2.56
CTDNEP1-209ENST00000574205 PAPD4Q6PIY7 484 aaKnown RBP31.03■■■□□ 2.56
CTDNEP1-209ENST00000574205 DNAJB14Q8TBM8 379 aa31.03■■■□□ 2.56
CTDNEP1-209ENST00000574205 C16orf78Q8WTQ4 265 aa31.03■■■□□ 2.56
CTDNEP1-209ENST00000574205 CKAP2Q8WWK9 683 aa31.03■■■□□ 2.56
CTDNEP1-209ENST00000574205 FCRL1Q96LA6 429 aa31.03■■■□□ 2.56
CTDNEP1-209ENST00000574205 ALOXE3Q9BYJ1 711 aa31.03■■■□□ 2.56
CTDNEP1-209ENST00000574205 DLGAP4Q9Y2H0 992 aa31.03■■■□□ 2.56
CTDNEP1-209ENST00000574205 ATMQ13315 3056 aa31.02■■■□□ 2.56
CTDNEP1-209ENST00000574205 MASP2O00187 686 aa31.02■■■□□ 2.56
CTDNEP1-209ENST00000574205 DNAJB5O75953 348 aa31.02■■■□□ 2.56
CTDNEP1-209ENST00000574205 POLE2P56282 527 aa31.02■■■□□ 2.56
CTDNEP1-209ENST00000574205 IGLV3-21P80748 117 aaPredicted RBP31.02■■■□□ 2.56
CTDNEP1-209ENST00000574205 BIKQ13323 160 aa31.02■■■□□ 2.56
CTDNEP1-209ENST00000574205 TUBGCP3Q96CW5 907 aa31.02■■■□□ 2.56
CTDNEP1-209ENST00000574205 IMMP1LQ96LU5 166 aa31.02■■■□□ 2.56
CTDNEP1-209ENST00000574205 MAGEB18Q96M61 343 aa31.02■■■□□ 2.56
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 69.4 ms